2022年完整word版,Trizol法提取RNA实验步骤及原理 .pdf

Trizol法使用步骤一、分离纯化的基本原理研究基因的表达和调控时常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA 。RNA 质量的高低常常影响 cDNA 库，RT-PCR 和Northern Blot 等分子生物学实验的成败。 Trizol 是一种新型总 RNA 抽提试剂，内含异硫氰酸胍等物质， 能迅速破碎细胞， 抑制细胞释放出的核酸酶。二、用户需自备的试剂和材料无水乙醇、 氯仿、Glycogen（可能需要） 、 1.5ml Eppendorf 管（RNase-free ）、Tips （RNase-free ）三、准备工作RNase 酶非常稳定，是导致 RNA 降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活，但限制因素去除后有迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是 RNase 完全失活。它广泛存在于人的皮肤上，因此，在与RNA 制备有关的分子生物学实验时，必须戴手套。RNase 的又一污染源是取液器， 根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用用 DEPC (焦炭酸二磷脂，一种 RNase 抑制剂 ) 配制的 70% 乙醇擦洗取液器的内部和外部，基本达到要求。取RNase-free 的物品时必须戴手套。1、 料制品的处理尽可能使用无菌，一次性塑料制品，已标明RNase-Free 的塑料制品，如没有开封使用过通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品， 原则上都必须处理方可使用。处理步骤如下：1）在玻璃烧杯中注入去离子水，加入DEPC 使DEPC 的终浓度为 0.1%。注意：DEPC 为剧毒物，活性很强，小心在通风柜中使用。2）处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中，注入DEPC 水溶液，使塑料制品名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 1 页，共 5 页 - - - - - - - - - 的所有部分都浸泡到溶液中。3）在通风柜中室温处理过夜。4） 将DEPC 水溶液小心倒到废液瓶中， 用铝箔封住含已 DEPC 水处理过的塑料制品的烧杯，高温高压蒸气灭菌至少30分钟。5）烘箱用合适的温度烘拷至干燥。置于干净处备用。2、 璃玻和金属物品250C 烘烤3小时以上。四、从组织中提取总 RNA 1) 液氮研磨：组织块直接放入研钵中，加入少量液氮，迅速研磨，待组织变软，再加少量液氮，再研磨，如此三次，按50-100mg组织/ml Trizol加入Trizol ，转入离心管进行第 2步操作。（液氮既能使各种组织成分不易被破坏或降解, 又能使组织变硬 , 脆性增加易于磨碎。终止细胞内外一切生物反应，防止RNA 酶的降解反应）2) 匀浆：组织样品按 50-100mg/mlTrizol 加入Trizol 。另外，组织体积不能超过Trizol 体积的 10% ，否则匀浆效果会不好，用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。五、从细胞中提取总 RNA 1) 培养贴壁细胞：不须消化，可直接用Trizol进行消化、裂解，Trizol体积按10cm2/ml 比例加入。2) 悬浮细胞可直接收集、 裂解，每1ml Trizol 可裂解 5106动物、植物或酵母细胞，或107细菌细胞。六、操作步骤1、细胞或组织加 Trizol 后，室温放置 5min，使其充分裂解。注：此时可放入-70长期保持。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 2 页，共 5 页 - - - - - - - - - 2、12,000rpm 离心5min，弃沉淀。3、按200ul 氯仿/ml Trizol 加入氯仿，振荡混匀后室温放置15min。注：禁用漩涡振荡器，以免基因组 DNA 断裂。（氯仿为有机溶剂，有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合，从而使得蛋白和 RNA 脱离， RNA 进入水相）4、4 12,000g 离心15min。5、吸取上层水相，至另一离心管中。注：千万不要吸取中间界面；若同时提取DNA和蛋白质，则保留下层酚相存于4冰箱 , 若只提 RNA ，则弃下层酚相。6、按0.5ml 异丙醇 /ml Trizol 加入异丙醇 （沉淀 RNA ）混匀，室温放置 5-10min。7、4 12,000g 离心10min，弃上清， RNA 沉于管底。8、按1ml 75%乙醇/ml Trizol加入75% 乙醇（沉淀 RNA ），温和振荡离心管，悬浮沉淀。9、 4 8,000g 离心5min，尽量弃上清。10、室温晾干或真空干燥 5-10min。 注：RNA 样品不要过于干燥，否则很难溶解。11、可用 50ul H2O ，TE buffer 或0.5%SDS 溶解RNA 样品， 55-60,5-10min 。注： H2O 、TE或0.5%SDS 均须用DEPC 处理并高压。（TE 缓冲液由 Tris 和EDTA 配制而成，主要用于溶解核酸，能稳定储存DNA 和RNA 。用于酶切反应不能使用 SDS ）12、测 O.D值定量 RNA 浓度。注：此方法提取RNA A260/A280值在 1.6-1.8之间；产率估计：组织标本：（ug RNA/mg 组织）1-10ug，培养细胞（ug RNA/106 Cell ）：5-15ug。注：组织或细胞量过少，可酌情减少Trizol用量；组织或细胞用量过多，会引起DNA 对 RNA 的污染；高蛋白、脂肪或多糖类组织，肌肉组织或块状植物组织等，组织匀浆或液氮研磨后须 4 12,000g 离心 10min 去掉不溶物，再进行下面操作，若顶层有脂肪物，则也须去掉；热天提 RNA ，带手套是必须的，手是RNase的主要来源；名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 3 页，共 5 页 - - - - - - - - - 组织块用液氮研磨，效果最好，若没有液氮或电动匀浆器，可用手动匀浆器代替，此时组织块不宜过大，且需先用眼科剪刀将组织碱碱剪碎，然后再充分研磨。6.1.2.1 肝脏、肠道、肌肉总RNA 提取方法使用已高温蒸汽灭菌的手术刀和镊子从鱼的腹部解剖开，从中取出完整的肝脏、肠、肌肉等组织，置于离心管后立即放入液氮中；组织在液氮下研磨成粉，取少量至加有1mLTrizol 的 1.5ml 离心管中，充分混合后于 4，12,000rpm离心 15min；取上清移至新 1.5ml 离心管中，加入 200ul 氯仿，剧烈震荡直至呈乳白色， 于 4，12,000rpm离心 15min；取上清移至新 1.5ml 离心管中，加入500ul 异丙醇，轻轻颠倒10次，冰上放置20mins，于 4，12,000rpm离心 15min；弃上清，加入 1ml75%乙醇（用 DEPC 水现配现用）， 于 4，12000rpm离心 5min，重复此步骤一次；弃上清后，室温干燥5-7mins；加入适量（ 20-30ul）的 DEPC 水溶解沉淀 65溶解， -20（最好 -80）保存，检测 RNA 浓度，并电泳检测。6.1.2.2 RNA 浓度测定和电泳检测取 2ul 提取好的 RNA 溶液，于 Nanodrop 2000 Spectrophptpmeter测定 RNA 浓度及 A260/A280 的相对吸光度，纯净RNA 的 A260/A280 应在 1.8-2.2 之间。电泳检测： 1%琼脂糖， 1ATE 缓冲液， 90V 电泳 30min，凝胶成像系统观察，分析结果。6.1.2.3 肝脏、肌肉、肠道样品cDNA 的合成反应按照 TaKaRa公司的 PrimeScript? RT reagent Kit With gDNA Eraser （Perfect Real Time) 反转录试剂盒说明书进行，合成cDNA 模板。（残存的） 基因组 DNA 的除去反应，在 PCR 管中配置如下缓冲液。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 4 页，共 5 页 - - - - - - - - - 试剂用量5 gDNA Eraser Buffer 2.0 lgDNA Eraser 1.0 lTotal RNA X* ul RNase Free dH2O up to 10 l（gDNA 、genomic DNA 、基因组 DNA ：是指有机体在单倍体状态下的DNA 全部含量，是染色体 DNA ，与质粒等染色体外DNA 区别。 ）X* ：根据检测到的 RNA 浓度来配置；混合均匀后，室温放置20-30min 反转录反应，在 PCR 管中配置如下缓冲液（ 20ul system） ，反应液配制在冰上进行。为了保证反应液配制的准确性，进行各项反应时，先按反应数+1 的量配制Master Mix ，然后再分装到每个反应管中。试剂使用量5 PrimeScript? Buffer 2 （for Real Time）4.0 ul PrimeScript? RT Enzyme Mix I 1.0 lRT Primer Mix 1.0 l的反应液10.0 ul RNase Free dH2O up to 20 l混合均匀后，在PCR 仪上进行逆转录反应，反应条件为：3715 min 855 sec 然后将得到的 cDNA 存放于 -20冰箱保存待用。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 5 页，共 5 页 - - - - - - - - -