【图文】更换体系进行计算的流程精品文档7页.doc

如有侵权，请联系网站删除，仅供学习与交流【图文】更换体系进行计算的流程【精品文档】第 7 页【图文】更换体系进行计算的流程一、 寻找体系1. 双击，打开软件。在此处输入体系中所含的元素2. 点击左边按钮中的，出现如下对话框点击Search若不允许其他元素出现，可不勾选该项3. 出现如下对话框点击该处4. 出现如下对话框在此处选择所需的体系点击蓝色数字链接点击“Author/Journal”点击OK选择该项随便输入信息点击该项，下载得到一个cif文件点击此处在出现的网页中输入CCDC号出现如下页面随便输入信息勾选该项（另法：打开Conquest1.8，单击Author/Journal,在Authors Names一栏输入Cotton，单击search； start search后找到IZOYAX；单击菜单栏File, Export Entries as，点File Popup）二、 文件间的转换1. 下载的文件用软件“mercury.exe”打开（图标为Hg的软件）。2. 单击filesave as，选择文件类型为Mol2 files (*xmol2)，保存3. 用Gauss View打开保存的文件，右键选择Builder，单击Delete Atom，删除不需要的原子，然后Save(gjf)。4. 用Chemcraft打开保存文件，单击save point group ，选择Cn-C4,单击Choose；单击 Coord +show in format + Molpro format,然后复制坐标到gjf文件5. 用Gauss view打开gjf文件，单击Edit,点Point Group,勾选Enable*,选择C4,然后save。得到该体系的gjf文件。 将该段文件复制至1CrCrZn-b3pw91.gjf文件中取代原先的关键字三、gjf文件的修改1.将保存的gjf文件重命名，例：1CrCrZn-b3pw91.gjf。2.登陆学校机群下载之前成功算出的CrCrFe的gjf、pbs文件3.打开CrCrFe的gjf文件将所用泛函复制1CrCrZn-b3pw91.gjf文件中取代坐标以下的文字，将Fe均修改Zn，最后空两行以上四、pbs文件的修改将此处修改跟gjf文件相同即可保存最后提交机群计算即可。在此菜单中修改文件格式保存重点修改这两处，需与文件名相同