人体正常菌群与常见致病菌.ppt

人体正常菌群与常见致病菌 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望一、人体正常菌群一、人体正常菌群 (一）正常菌群一）正常菌群 1.概念：寄居在正常人体开放性部位的微生物群，正常时对人体有益无害，并与宿主保持动态平衡的生态体系 与外界接触和相通的腔道与外界接触和相通的腔道-体表、口腔、体表、口腔、鼻咽、眼结膜、肠道、泌尿生殖道等鼻咽、眼结膜、肠道、泌尿生殖道等2.分布：凡与外界接触和相通的部位均有其寄居，尤以肠道、口腔、阴道和皮肤量最多，称为四大“菌库”。3.特点：不同组织部位其种类不同 同一部位不同层次其种类不同 A.深层原籍菌（常住菌）是有益的 如：结肠中的大肠杆菌、双歧杆菌 B.表层外籍菌（暂住菌）可能是 有害的 如：大肠埃希菌侵入到泌尿道、胆道、腹腔及血液中，会引起化脓性炎症或败血症结肠腔内正常菌群（电镜扫描图）4.生理作用：生物拮抗(antagonism)营养作用 免疫作用 抗衰老作用 抑癌作用生物拮抗(antagonism)生物拮抗机制A.竞争黏附（占位性保护）作用 竞争上皮细胞表面受体，形成生物膜，使外来菌不能定植而入侵机体，发挥屏障和占位性保护作用B.产生有害代谢产物：酸类、H2O2 C.竞争营养物质 通过竞争营养，大量繁殖，处于优势地位营养作用 正常菌群参与机体的物质代谢、营养物质转化及合成 如：氮的利用 糖代谢 维生素的合成免疫作用正常菌群作为抗原：肠道菌群会刺激人体肠道免疫系统的发育，并且不断“训练”它，让它增加“分辨敌我”的能力。正常菌群释放的内毒素等物质可刺激机体免疫系统保持活跃状态，是机体非特异免疫功能的重要组成部分。促进机体免疫器官发育刺激免疫系统产生免疫应答，产生免疫效应物质抗衰老作用 科学家通过对30位长寿老人的取样分析发现，这些老人体内的厌氧菌群所占的比例特别大，尤其是厌氧菌群中的双歧杆菌远远高于一般人体内双歧杆菌的含量。有人将体内双歧杆菌的数量作为健康长寿的标志之一。通过产生SOD，清除O2-，保护组织细胞 如：双歧杆菌、乳杆菌、肠球菌等抑癌作用自身产生的多种酶类，使致癌物转化为 无害物质激活巨噬细胞等发挥免疫功能，抑制肿瘤5.影响正常菌群组成的因素饮食结构年龄环境（卫生条件）药物（抗菌药物）疾病（消化道疾病）气侯生活习惯精神状态饮食结构的影响饮食结构的影响饮食结构是决定肠道菌群组成的最重要的饮食结构是决定肠道菌群组成的最重要的因素因素。多食蛋白质的人，大肠埃希氏菌生长旺盛；以吃淀粉为主的人，乳杆菌较多。吃什么饭，养什么菌。动物实验表明：长期食用大量高脂饲料，动物肠道中的有益菌如双歧杆菌数量会下降，一些病菌如硫酸盐还原菌的数量会增加。饮食结构的影响新几内亚人食物的96.4是白薯，他们的肠道中有固氮菌，且是肠道菌群的恒定成员。使得足够的氮素被固定下来，通过肠壁进入血液。因此，新几内亚人就能依赖营养成分不全的食物为生。日本人的大肠里存在消化海藻的细菌。原因日本人日常饮食中每天要摄入一定量的海藻。这使得肠道细菌具有了消化海藻的能力。年龄的影响新生儿出生时，肠道是无菌的。出生2小时内，在胎便内就可找到双歧杆菌，约4天后成为优势菌。中年，有益菌双歧杆菌与有害菌在正常情况下保持一个衡定水平。老年，肠道中双歧杆菌明显减少，有害菌梭状芽孢杆菌相对增加。肥胖症也和肠道细菌有关 在“人体肠道菌群元基因组研究”选中的124个样品提供者中，就有患有肠炎和肥胖症的病人。通过第一阶段的研究，已经发现病人肠道菌群的基因组成和正常人有很大不同 2009年自然题为“导致肥胖的细菌群”的论文：研究者从肥胖的老鼠体内取出其肠内细菌群，然后移植到瘦小的无菌老鼠体内。结果，在生活和饮食维持原状的情况下，无菌老鼠居然也发福了。肠道细菌与代谢综合征研究发现，缺乏先天性免疫因子TLR5的突变小鼠会产生代谢综合症的标志性特征，如伴有肠道微生物系变化的脂肪积聚的增加及胰岛素抵抗。这些突变的小鼠还会比它们的对应正常小鼠进食更多的食物。将这些突变小鼠的肠道内微生物转移到无菌小鼠的肠道之中，则无菌小鼠出现代谢综合征的特征，这提示：肠道微生物系的变化可能是代谢综合症的一个原因，肠道微生物系的变化可能是代谢综合症的一个原因，而不是其后果而不是其后果（三）人体各部位的正常菌群（三）人体各部位的正常菌群正常菌群在人体中的分布部位 常见菌皮肤 表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、绿脓杆菌、痤疮丙酸杆菌、白色念珠菌、粉刺棒状杆菌、白色葡萄球菌等 口腔表皮葡萄球菌、甲型和丙型链球菌、类杆菌、梭杆菌等鼻咽腔甲型链球菌、卡他球菌、肺炎球菌、流感杆菌、乙型链球菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、变形杆菌等 眼结膜皮表葡萄球菌、结膜干燥杆菌、类白喉杆菌等 胃正常一般无菌 肠道类杆菌、双双歧歧杆杆菌菌、大肠杆菌、厌氧性链球菌、粪链球菌、葡萄球菌、白色念球菌、乳乳酸酸杆杆菌菌、变形杆菌、破伤风杆菌、产气荚膜杆菌等阴道乳酸杆菌、白色念球菌、类白喉杆菌、大肠杆菌等 尿道表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、耻垢杆菌等1、皮肤、皮肤 皮肤上的细菌以汗液、皮脂、角质(皮屑)为营养来源，容易在潮湿的部位滋生。另外皮肤面积大，暴露在外，正常菌群数量多。科学（2009年5月29日）一项研究表明：采集了l0名研究对象全身20处不同部位皮肤上的细菌样本，对细菌种类和数量进行调查。细菌种类最多的部位是手腕最多的部位是手腕(44种)，最少的部位最少的部位是耳后是耳后(15(15种种)。（1）皮肤的正常菌群来源 羊膜破水后、生产中产道菌群 生产后皮肤接触外环境（2）皮肤的正常菌群种类 11凝固酶阴性葡萄球菌凝固酶阴性葡萄球菌 表皮葡萄球菌表皮葡萄球菌 头状葡萄球菌头状葡萄球菌 瓦氏葡萄球菌瓦氏葡萄球菌 溶血性葡萄球菌溶血性葡萄球菌 耳葡萄球菌耳葡萄球菌 中间葡萄球菌中间葡萄球菌 模仿葡萄球菌模仿葡萄球菌22滕黄微球菌：多见于妇女、儿童；滕黄微球菌：多见于妇女、儿童；33不动杆菌属：不动杆菌属：25%25%皮肤带有该菌，多见于皮肤带有该菌，多见于 脚趾间、腋窝、腹股沟、肘前窝；脚趾间、腋窝、腹股沟、肘前窝；44其它革兰氏阴性菌：包括变形杆菌、绿脓其它革兰氏阴性菌：包括变形杆菌、绿脓 杆菌、克雷伯氏菌、肠杆菌，较少见。杆菌、克雷伯氏菌、肠杆菌，较少见。55丙酸杆菌：性成熟后丙酸杆菌：性成熟后1-31-3年数量逐渐增加年数量逐渐增加皮肤，表面正常栖居的微生物对外来微生物具有排斥作用，可以防止外来微生物和病原微生物的侵染，有保护作用痤疮丙酸杆菌、粉刺棒状杆菌、白色葡萄球菌暂居在皮脂腺分泌较活跃的皮肤上，给步入青春期的男女面部和胸背部留下痤疮。内分泌失调 皮脂腺分泌旺盛 油脂过多 毛孔粗大/堵塞角质层增厚 细菌在毛孔里和油脂搅和在一起 痤疮痤疮丙酸杆菌在缺氧情况下丙酸杆菌在缺氧情况下大量繁殖大量繁殖 导致炎症细菌侵入，整个毛囊变红、发炎 细菌扩散到附近的皮肤组织，变得更大，进而形成痤疮。痤疮丙酸杆菌痤疮丙酸杆菌：专性厌氧菌：专性厌氧菌(3)表皮的正常菌群对检验结果的表皮的正常菌群对检验结果的干扰干扰血培养 凝固酶阴性葡萄球菌检出率在血培养阳性结果中占第一位 采血前皮肤充分消毒和多套血培养采集可排除部分污染干扰体表伤口分泌物或脓液培养 送检脓肿表面标本会培养出非感染性的定植细菌。应尽量采集伤口深部分泌物，用拭子深入损伤部位并旋转抹取脓肿壁，损伤基底部和脓肿壁最有培养价值。2、呼吸道正常菌群、呼吸道正常菌群 人出生大致人出生大致1215h后，鼻、咽、喉部（即上呼吸道）出现后，鼻、咽、喉部（即上呼吸道）出现正常菌群。先是需氧菌如表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌、链正常菌群。先是需氧菌如表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌、链球菌和汉森氏球菌、韦荣球菌、嗜血杆菌等，继而也出现厌氧球菌和汉森氏球菌、韦荣球菌、嗜血杆菌等，继而也出现厌氧菌如普氏杆菌、卟啉单胞菌和韦荣球菌。菌如普氏杆菌、卟啉单胞菌和韦荣球菌。（1）来源：正常呼吸过程中定植于上呼吸道）来源：正常呼吸过程中定植于上呼吸道 （2）种类：细菌、真菌）种类：细菌、真菌 鼻咽腔鼻咽腔短暂定植，不能长期共生短暂定植，不能长期共生 主要细菌种类：主要细菌种类：葡葡 萄萄 球球 菌菌 甲、丙型链球菌甲、丙型链球菌 肺肺 炎炎 链链 球球 菌菌 奈奈 瑟瑟 氏氏 菌菌 流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌 （3）对检验结果的影响口腔正常菌群对痰培养标本的污染培养结果干扰医生对病情的判断3、消化道正常菌群出生后口腔即有细菌定植出生后口腔即有细菌定植6-106-10小时后细菌数量快速增加小时后细菌数量快速增加(1)(1)口腔口腔表皮葡萄球菌表皮葡萄球菌;甲、丙型链球菌甲、丙型链球菌;肺炎链球菌肺炎链球菌;奈瑟氏菌奈瑟氏菌;流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌;类白类白喉杆菌喉杆菌;螺旋体螺旋体;白色念珠菌白色念珠菌;放线菌。放线菌。(2)(2)食管食管研究较少研究较少,不能确定短暂定植或不能确定短暂定植或微生态微生态 。常见有嗜盐菌如葡萄球菌。常见有嗜盐菌如葡萄球菌。(3)胃-胃酸pH 1.82.5,细菌通常极少(103CFU/ml)。由于胃内酸度高、含大量消化酶,不适合细菌生长,胃内菌量很少,98,菌种达400多种,主要菌种为类杆菌、乳酸杆菌、双歧杆菌及厌氧的G+球菌,粪便重量的40%由细菌组成。正常菌群和防止人体过敏有关，经过肠道菌群合理“训练”的人体免疫系统不易让人“过敏”。瑞典50%的人患有过敏症；而离瑞典不远的爱沙尼亚却只有10%的人患有过敏症，原因是肠道内正常菌群构成原因是肠道内正常菌群构成不同不同。后者的社会经济发达程度远不如前者。这或许说明卫生条件（太好）和过敏症有关。不干不净，吃了没病？4、阴道正常菌群 女性生殖器从幼稚到成熟过程中就有微生物栖居和定植，大致上包括产黑色素类杆菌、卟啉单胞菌、普氏杆菌、类杆菌、乳杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌等十几种细菌为正常菌群。乳 杆 菌 大肠埃希氏菌 拟杆菌属 肠 球 菌 属 奈瑟氏菌属 厌 氧 球 菌 5、前尿道正常菌群 表皮葡萄球菌 JK群棒状杆菌 肠 球 菌 奈 瑟 菌二.不同系统的常见致病菌（一）呼吸系统常见病原菌常见呼吸道重要致病菌链球菌苛养革兰阴性菌革兰阴性双球菌革兰阴性杆菌葡萄球菌革兰阳性杆菌链球菌链球菌Beta-溶血、触酶阴性呈链状或成对排列的球菌l化脓链球菌（PYR+）任何数量都要报告l患儿标本患儿标本检查有小溶血环并鉴定B群-溶血链球菌，任何数量都要报告l优势菌时，有意义数量的Beta-溶血链球菌l不要报告不要报告小菌落的beta-溶血链球菌或F群链球菌，因为这些菌是上呼吸道正常菌群链球菌链球菌Alpha-溶血链球菌lOptochin敏感实验l胆汁溶菌实验（联合上述两个实验进行鉴定）药敏实验，贴OP纸片确认纯度以检查药敏结果是否有污染苛养革兰阴性杆菌苛养革兰阴性杆菌流感嗜血杆菌，卫星现象，ALA实验确认鉴定并作beta-内酰胺酶试验。百日咳博德特菌 触酶和尿素酶阳性，培养48h出现肉眼可见菌落巴斯德菌 吲哚和氧化酶阳性，动物口腔正常菌群侵蚀艾肯菌 上呼吸道正常菌群，无需鉴定革兰阴性双球菌革兰阴性双球菌卡他莫拉菌 G-双球菌，氧化酶阳性，血平板上可推动，丁酸盐试验阳性淋病奈瑟菌和脑膜炎奈瑟菌？需检验并报告，不需做药敏试验u当培养达到有意义数量时，即使不是优势菌，当培养达到有意义数量时，即使不是优势菌，也报告也报告在麦康凯或伊红美兰平板生长良好的革兰阴性杆菌在麦康凯或伊红美兰平板生长良好的革兰阴性杆菌革兰阴性杆菌 鉴定和药敏试验对于住院患者，不管是否有其他病原菌，检查有意义数量的铜绿假单胞菌、不动杆菌、伯克霍尔德菌和嗜麦芽菌肠球菌肠球菌不要报告肠球菌，除非达到90%纯培养 很多革兰阳性球菌都是呼吸道正常菌群革兰阳性杆菌革兰阳性杆菌排除任何数量来自免疫抑制患者的奴卡菌和马红球菌（粘液样并尿素酶阳性）马、猪等动物致病菌，可条件致病，可以导致免疫抑制患者的肺炎大芽孢革兰阳性菌，则需排除炭疽芽孢杆菌和腊样芽孢杆菌快速尿素酶阳性（假白喉棒状杆菌），或标本来自ICU插管患者时，鉴定大量优势的棒状杆菌其他革兰阳性杆菌不会引起肺炎，无需鉴定其他革兰阳性杆菌不会引起肺炎，无需鉴定霉菌霉菌念珠菌不能引起肺炎，除非肿瘤患者、肺移植患者或新生儿。酵母菌是口腔正常菌群。如果如果涂片时见到细菌但培养不生长，扩大培养，可能存在军团菌、百日咳博德特菌和分枝杆菌。局限性l常规培养方法不生长l假阴性培养可能由正常菌群污染或事先使用了抗生素l假阳性结果可能会对培养结果过度解释（二）泌尿系统常见的病原菌表表 尿路感染的原因及常见病原菌尿路感染的原因及常见病原菌 感染原因感染原因 主要致病菌主要致病菌 感染特点感染特点 上行感染上行感染大大肠肠埃埃希希菌菌、克克雷雷伯伯菌菌、变形杆菌、淋病奈瑟菌变形杆菌、淋病奈瑟菌主主要要为为肠肠道道菌菌群群或或会会阴阴部部细细菌菌逆逆行行感感染染，多多见见于于女女性性，多多为为单单一一细细菌菌感感染染，以以大大肠肠埃希菌感染最常见埃希菌感染最常见泌泌尿尿系系统统解解剖剖结结构构和和生生理理功功能能改改变引起的感染变引起的感染大大肠肠埃埃希希菌菌、克克雷雷伯伯菌菌、变变形形杆杆菌菌、肠肠杆杆菌菌、普普罗罗威威登登菌菌、沙沙雷雷菌菌、不不动动杆杆菌菌、假假单胞菌、葡萄球菌、肠球菌单胞菌、葡萄球菌、肠球菌多多见见于于留留置置导导尿尿管管、肾肾盂盂造造瘘瘘术术、尿尿路路结结石石、尿尿路路重重建建、前前列列腺腺肥肥大大、膀膀胱胱排排空空能能力力受受损损的的患患者者，容容易易发发生生多多种种微微生生物物的的混混合合感感染染，易易被被误误认为标本污染认为标本污染发发生生于于菌菌血血症症的的患患者者，血血液液中中的的细细菌菌通通过过血血流流进进入入肾脏引起感染，比较少见肾脏引起感染，比较少见血行感染血行感染葡葡萄萄球球菌菌、结结核核分分枝枝杆杆菌、沙门菌菌、沙门菌直接感染直接感染大大肠肠埃埃希希菌菌、葡葡萄萄球球菌、链球菌、肠杆菌菌、链球菌、肠杆菌外外伤伤或或肾肾周周围围器器官官发发生生感感染染时时，细细菌菌直直接接侵侵入入肾肾脏脏引起感染，非常少见引起感染，非常少见表表 不同方法采集的尿标本培养结果评价不同方法采集的尿标本培养结果评价 标本来源标本来源 菌落数菌落数CFU/ml CFU/ml 结果评价结果评价 清洁中清洁中段尿段尿5 510104 4无无意意义义，仅仅报报告告菌菌落落数数及及革革兰兰染染色色特特征征，并注明是纯培养或是混合菌生长并注明是纯培养或是混合菌生长纯纯培培养养有有意意义义，报报告告菌菌落落计计数数和和菌菌种种鉴鉴定定及及药药敏敏试试验验结结果果；混混合合菌菌生生长长无无意意义义，仅做革兰染色镜检，并报告镜检结果仅做革兰染色镜检，并报告镜检结果(5(510)10)10104 4纯纯培培养养或或混混合合菌菌生生长长，其其中中某某种种细细菌菌数数10105 5者者有有意意义义，需需进进行行细细菌菌鉴鉴定定及及药药敏敏试试验验；4 4种及以上细菌生长无意义，报告标本污染种及以上细菌生长无意义，报告标本污染10105 53 3种种以以内内细细菌菌生生长长都都有有意意义义，对对2 2种种主主要要生生长长菌菌需需进进行行菌菌种种鉴鉴定定及及药药敏敏试试验验；4 4 种种及及以上细菌生长无意义，报告标本污染以上细菌生长无意义，报告标本污染10103 3导尿导尿都都有有意意义义，所所有有细细菌菌均均需需做做菌菌种种鉴鉴定定及及药药敏试验敏试验任意数目任意数目耻骨上膀耻骨上膀胱穿刺胱穿刺（三）消化系统常见的病原菌1.1.感染性腹泻的主要病原体种类感染性腹泻的主要病原体种类种类主要病原体所致疾病细菌弧菌属O1群和O139群霍乱弧菌霍乱其他致泻性弧菌（如其他非O1群霍乱弧菌，副溶血性弧菌弧菌性肠炎 拟态弧菌，河弧菌，霍利斯弧菌，弗尼斯弧菌等）志贺菌属痢疾志贺菌，福氏志贺菌，鲍氏志贺菌，宋内志贺菌细菌性痢疾沙门菌属鼠伤寒沙门菌，肠炎沙门菌，猪霍乱沙门菌等沙门菌肠炎埃希菌属(如大肠埃希菌，即大肠杆菌)肠产毒性大肠杆菌(ETEC)旅行者腹泻，婴幼儿腹泻肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)痢疾样腹泻肠致病性大肠杆菌(EPEC)婴儿腹泻肠出血性大肠杆菌(EHEC)出血性肠炎弯曲菌属(如空肠弯曲菌，结肠弯曲菌等)弯曲菌肠炎葡萄球菌属(如金黄色葡萄球菌)急性胃肠炎、假膜炎肠炎厌氧芽孢梭菌属(如产气荚膜梭菌，艰难梭菌等)腹泻、伪膜性肠炎等耶尔森菌属(如小肠结肠炎耶氏杆菌等)小肠结肠炎芽孢杆菌属(如蜡样芽孢杆菌等)感染性腹泻其他菌属(如变形杆菌，土拉弗氏菌，亲水气单胞菌感染性腹泻 类志贺毗邻单胞菌等)病毒轮状病毒，诺瓦克病毒，星状病毒，杯状病毒，冠状病毒病毒性腹泻肠腺病毒，小圆病毒等，诺如病毒寄生虫 溶组织阿米巴原虫阿米巴痢疾隐孢子虫，兰氏贾第鞭毛虫，类圆线虫，结肠小袋虫等感染性腹泻霍乱弧菌(Viobrio cholerae)志贺菌(Shigella)或痢疾杆菌(dysentery bacteria)沙门菌(Salmonella)埃希菌(Escherichia)弯曲菌(Campylobacter)2.2.主要病原菌特征主要病原菌特征第一节第一节 病原学病原学1 5噬菌体型，且为af生物型的菌株称为流行株按霍乱病原菌第一节第一节 病原学病原学霍乱弧菌霍乱的病原菌139血清群1血清群古典生物型埃尔托生物型小川型稻叶型彦岛型小川型稻叶型彦岛型血清学分型生物学分型1群菌株32个噬菌体型(132)12个生物型(al)噬菌体-生物分型 细菌性痢疾的病原菌依抗原可以将志贺菌分类 A群：痢疾志贺菌(S.dysenteriae)B群：福氏志贺菌(S.flexneri)C群：鲍氏志贺菌(S.boydii)D群：宋内志贺菌(S.sonnei)第一节第一节 病原学病原学志贺菌是一大群寄生于人类和动物肠道中、生化反应和抗原构造相似的革兰氏阴性杆菌有诊断意义的抗原有三类：、；伤寒沙门菌(S.typhi)伤寒 副伤寒沙门菌(S.paratyphi)副伤寒 其他沙门菌（如鼠伤寒沙门菌）一般腹泻第一节第一节 病原学病原学沙门菌 包括5个种，其中大肠埃希菌(E.coli)通称大肠杆菌 埃希菌属的模式种(type species)最为重要 大肠杆菌主要有菌体抗原()、鞭毛抗原(H)和荚膜抗原(K)大肠杆菌分型按:K:H排列，如111:K58:H2致泻的大肠杆菌 肠产毒性大肠杆菌(ETEC)肠侵袭性大肠杆菌(enteroinvasive E.coli,EIEC)肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic E.coli,EPEC)肠出血性大肠杆菌(enteroheamorrhagic E.coli,EHEC)第一节第一节 病原学病原学埃希菌空肠弯曲菌(C.jejuni)结肠弯曲菌(C.coli)第一节第一节 病原学病原学弯曲菌艰难梭菌假膜性肠炎主要由艰难梭菌引起。艰难梭菌是人体肠道的正常菌群。因使用抗生素不当，耐药的艰难梭菌大量繁殖，释放毒素A和B，引起肠液分泌，黏膜损伤和假膜的形成。