(1.5.1)--结构模体与结构域.pdf

结构模体与结构域用途结构模体结构模体结构模体（structural motif）是蛋白质分子中具有特定空间构象和特定功能的结构成分。结构模体有特征的氨基酸序列，并发挥特殊的功能结构模体螺旋-转角-螺旋（同源结构）螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链锌指结构常见模体经常出现在DNA结合蛋白中DNADNA结合蛋白Recognition helixCoiled coilDNA识别区富含碱性氨基酸残基通常与亮氨酸拉链（Leucine Zipper）或螺旋-环-螺旋（HLH）基序中的一个联合在一起，称为碱性亮氨酸拉链（bZIP）或bHLH蛋白。蛋白的二聚作用使2个碱性结构域相邻，进而可以DNA发生作用。I和II构成螺旋-转角-螺旋结构螺旋-环（转角）-螺旋结构用途螺旋-转角-螺旋结构可以直接与DNA大沟结合环（loop）转角（turn）a a-螺旋（a a-helix）II与III构成螺旋-环-螺旋结构（HLH）bHLH二聚体与DNA结合HLH同二聚体不与DNA结合HLH/bHLH异二聚体不与DNA结合锌指结构有2种形式：C2H2zinc finger 和C4zinc finger锌指结构用途C2H2zinc finger 由12aa组成的环，通过2个Cys（C）和2个His（H）残基固定，这4个残基与Zn2+在空间上形成一个四面体结构。C4zinc finger：Zn2+与4个Cys结合（类固醇激素受体）Zn锌指（Zinc finger）至少3个C2H2型锌指才能与DNA结合亮氨酸拉链结构LLLLLLLLRecognition helixCoiled-coil亮氨酸拉链（Leucine zipper）Coiled coil unwound亮氨酸拉链的肽链上每隔7个aa残基有1个疏水的亮氨酸残基。残基位于a a-螺旋上，形成疏水表面。疏水表面的相互作用，形成了二聚体，称为卷曲的卷曲结构（Coiled-coil structure）。用途超二级结构超二级结构若干相邻二级结构中的构象单元彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合。aaaaaa主要由非极性氨基酸残基参与二级结构间的相互作用结构模体与超二级结构的关系蛋白质二级结构至三级结构层次的一种过渡态构象层次结构模体是具有特殊功能的超二级结构结构域多肽链在超二级结构的基础上进一步折叠成紧密的近似球状的结构，具有部分生物学功能，称为结构域（domain）。结构域是球状蛋白质的独立折叠单位，有较为独立的空间结构。对于较大的蛋白质分子或亚基，往往由两个以上结构域构成三级结构。结构域大多数结构域含有序列上连续的100200个aa残基。含多个结构域的蛋白质可被限制性蛋白水解酶分解出多个独立的结构域，而各结构域的构象基本不变，并保持功能。超二级结构不具备该特点感谢您的耐心观看