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    基因分子生物学原理复习题及答案djrw.docx

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    基因分子生物学原理复习题及答案djrw.docx

    分子生物物学原理理复习题题及答案案好好复习习,仅供供参考。 王连连庆The conntrool oof pprokkaryyotiic ggenee exxpreessiion名词解解释1.Opperoon操纵纵子,指指包含结结构基因因、操纵纵基因及及调节基基因的一一些相邻邻基因组组成的DDNA片片段,其其中结构构基因的的表达受受到操纵纵基因的的调控。它它是细菌菌基因转转录调控控的基本本模型。2.Innducciblle ooperron可可诱导操操纵子,诱导物所诱导的操纵子为可诱导操纵子,如lac操纵子,在诱导物作用下可产生本身代谢所需要的酶。3.Opperaatorr操纵基基因,是是操纵子子结构基基因编码码区之前前的DNNA区段段,可以以结合阻阻遏物或或活化物物。它位位于基因因启动子子的后面面或与启启动子重重叠,可可控制一一个临近近基因或或基因群群的表达达。4. CCoreepreessoor共阻遏物物,一类类小分子子,能阻阻止产生生合成它它们的酶酶,如TTrp操操纵子结结构基因因编码的的酶所合合成的TTrp。5.Reepreessiiblee opperoon 可可抑制操操纵子,共阻遏物所抑制的操纵子为可阻遏操纵子,即共阻遏物的存在可以抑制结构基因所编码酶的表达,如trp操纵子。6.Atttennuattor衰衰减子,E. coli Trp操纵子上游位于启动子与第一个结构基因之间的序列转录后产物配对形成的终止结构。该结构有前导肽序列的转录产物3和4互补配对形成。7. AAlarrmonnes信信号素,原核核生物应应急反应应中所产产生的信信号分子子,它们们通过与与靶蛋白白的结合合来改变变其活性性即刻产产生调控控作用,从从而使自自身对代代谢做出出调节。8.Prrophhagee 原噬噬菌体,某些温和噬菌体侵染细菌后,其DNA整合到宿主染色体上,处于整合状态的噬菌体DNA为原噬菌体。它是繁殖和传递噬菌体本身遗传信息的一种重要方式。9.Riibosswittch核核糖开关关,是原原核生物物中一类类调节RRNA元元件,它它可以直直接感受受小分子子的代谢谢来控制制转录和和翻译,是是不依赖赖调控蛋蛋白的一一种调节节方式。10.ssRNAAs 细细菌内小小RNAA,sRRNAss是细菌菌内长8801100 nt的的RNAA调控序序列。它它们一般般不由大大的dssRNAA前体形形成,而而使被小小基因所所编码。大大多数的的sRNNA通过过与靶mmRNAA配对来来抑制转转录,有有些情况况也也促促进转录录。11.AAntiisennse RNAAs反义义RNAA,是一一类小分分子RNNA,一一般通过过与mRRNA配配对来抑抑制mRRNA的的翻译,主主要在翻翻译水平平上调节节基因表表达的一一种RNNA(少少数可调调节其转转录)。简答1. 简简述laac ooperron的的调控机机制。Lac操操纵子由由操纵基基因O、结结构基因因Z、AA、Y及调调节基因因组成。lac操纵子在启动子的-35区缺乏UP元件,为弱的启动子。CAP和Lac抑制子分别通过影响RNAP与启动子的结合来对lac基因进行调控。1)乳糖糖存在,葡葡萄糖不不存在:CAPP以二聚聚体形式式结合到到操纵基基因上,与与RNAAP相互互作用,将将其募集集到启动动子出并并与之结结合;22)乳糖糖不存在在,葡萄萄糖存在在:Laac抑制制子与操操纵基因因结合,不不论CAAP是否否存在,它它都排斥斥RNAAP,使使其不能能跟启动动子结合合而抑制制转录。乳乳糖存在在的情况况下抑制制子会失失去活性性而无法法与操纵纵基因结结合。2.如何何利用实实验证明明CAPP蛋白的的作用机机制。 CAPP蛋白的的作用机机制是募募集RNNAP到到启动子子上,可可以用活活化子旁旁路实验验来证明明。1)用用蛋白与与蛋白的的相互作作用取代代CAPP跟RNNAP的的相互作作用:一一个蛋白白与DNNA结合合域耦联联,另一一个蛋白白取代RRNAPP的-CTTD,RRNAPP可以被被激活。22)-CTTD被DDNA结结合域取取代,RRNAPP可以被被激活。33)无任任何活化化子,但但RNAAP是高高浓度的的,基因因以激活活水平表表达。这这三个实实验说明明CAPP蛋白只只是募集集RNAAP到启启动子上上。3. 为为什么常常利用llacZZ作为rrepoortoors?在乳糖类类似物IIPTGG的诱导导下,LLacZZ编码-半乳糖糖苷酶,它可以跟X-gal反应生成蓝色物质。LacZZ具有操操作简单单、准确确度高、分分辨率高高、直接接反映蛋蛋白表达达水平等等优点,因因此适合合做报告告基因。4. LLac reppresssorr如何结结合于ooperratoors?Lac阻阻遏蛋白白的DNNA结合合结构域域为HTTH模体体,其中中一个螺旋适适合插入入DNAA的大沟沟,与其其中的特特异碱基基结合。另另一个螺旋横横跨DNNA大沟沟与DNNA主链链相联系系,以保保证第一一个螺旋旋出现在在正确的的位置,同同时也增增加蛋白白质-DDNA相相互作用用的结合合能。Laz阻阻遏物可可以使DDNA弯弯曲,使使作用的的区段在在有效范范围之内内。Laaz阻遏遏物以四四聚体而而不是二二聚体结结合,但但是,每每一个操操纵基因因只与44个亚基基中的两两个接触触。Laaz阻遏遏物含有有两个作作用位点点,一个个与操纵纵基因作作用,另另一个与与诱导子子作用。当当阻遏物物与诱导导子结合合时,其其结构发发生变化化,二聚聚体不能能同时结结合DNNA使活活性降低低。5. 举举例说明明原核aactiivattorss的主要要作用机机制。 原核活活化子作作用的主主要机制制有二:1)通通过募集集RNAA聚合酶酶激活转转录,如如lacc操纵子子的活化化子;22)通过过变构作作用激活活RNAAP:改变RRNAPP的构象象使启动动活化,如如glnnA启动动子的NNtrCC活化子子;诱导启启动子DDNA构构象改变变,如mmerTT启动子子的MeerR活活化子。6.举例例说明原原核reepreessoors的的主要作作用机制制。原核阻遏遏蛋白的的作用机机制有二二:1)抑抑制RNNAP跟跟启动子子的结合合,由于于该位点点与RNNAP的的结合位位点重复复,因此此RNAAP被排排斥,如如lazz操纵子子中的LLac阻阻遏蛋白白;2)阻阻遏蛋白白结合到到非启动动子位点点,与RRNAPP相互作作用,从从而抑制制转录起起始,如如E. colli的GGal阻阻遏蛋白白。7.简述述lacc opperoon的调调控机制制(该题题与1重重复)。8. 简简述trrp ooperron的的调控机机制。Try操操纵子(typ operon)负责Try的生物合成,当培养基中有足够的Try时,这个操纵子自动关闭,缺乏Try时操纵子被打开,trp基因表达,Trp或与其代谢有关的某种物质在阻遏过程中起作用。Trp操操纵子的的调控机机制主要要有两种种:1)阻阻遏作用用:trrp操纵纵子转录录起始的的调控是是通过阻阻遏蛋白白Trpp实现的的。在配配体Trry的存存在下,TTrP二二聚体构构象改变变,结合合于操纵纵基因,抑抑制结构构基因的的表达。22)衰减减作用:trpp操纵子子转录终终止的调调控是通通过衰减减作用实实现的。如如果E. cooli中中Trpp水平较较高,核核糖体迅迅速地翻翻译出前前导序列列中的序序列1,生生成十四四肽,并并在序列列3转录录以前占占据序列列2转录录产物,使使前导序序列转录录产物33和4互互补,形形成类似似终止子子的衰减减子结构构;如果果Trpp水平较较低,核核糖体在在序列11的Trrp密码码子暂停停,使得得序列22和3互互补,从从而阻止止衰减子子的形成成,使翻翻译继续续进行。9.细菌菌营养环环境极差差(如缺缺乏氨基基酸)时时如何进进行应急急反应?在缺乏氨氨基酸的的环境下下,细菌菌会停止止大部分分活动,应应急反会会使应会会RNAA水平降降低510%,使两两种信号号素pppGppp及ppppGppp聚集集,它们们通过与与靶蛋白白的结合合来改变变其活性性。未负负载的ttRNAA与A位位点结合合,触发发应急反反应,RRelAA被活化化,合成成(p)pppGppp,它它们降低低了某些些基因如如rDNNA的转转录增加加另一些些基因的的转录,部部分是因因为改变变了与RRNAPP的结合合及改变变RNAAP启动动子的特特异性。10.细细菌如何何利用RRibooswiitchh调控基基因表达达?核糖开关关调控基基因的机机制:核核糖开关关是通过过对小分分子浓度度的改变变进行应应答来调调控基因因的表达达。这些些调控元元件特异异地存在在它们所所调控基基因的55-UTTR,可可以在转转录或翻翻译水平平来调控控基因的的表达,该该调控是是通过改改变RNNA的二二级结构构来完成成的。概括地说说,存在在两种机机制:核核糖开关关的作用用域由11-4四四部分组组成1)在在SAMM存在的的状况下下,区域域3和44形成柄柄环结构构,产生生了一个个终止子子,使RRNAPP在此终终止转录录;如果果SAMM不存在在,则区区域2和和3形成成柄环结结构,转转录得以以进行。22)在SSAM存存在的前前提下,区区域3和和4形成成柄环结结构封闭闭了核糖糖体的结结合位点点而使翻翻译起始始阻止;没有SSAM,则则区域22和3形形成柄环环,翻译译起始继继续进行行。11.细细菌如何何调控ttrannslaatioon iinittiattionn?简言之,细细菌在转转录起始始主要通通过调控控蛋白对对其调控控,包括括活化子子和抑制制子。活活化子主主要通过过募集RRNA聚聚合酶激激活转录录及改变RRNAPP的构象象使启动动活化来来对转录录进行正正调控;而抑制制子则通通过排斥斥RNAPP及与RNNAP相相互作用用,从而而抑制转转录起始始。12.简简述 reepreessoor && Crro pprotteinn的作用用(acctioon)。抑制子子由cII基因编编码,由由两个结结构域组组成,NN端含DDNA结结合区,以以二聚化化的形式式结合DDNA,抑制子既可以激活也可以抑制转录。当作为抑制子起作用时,它结合到与启动子有重合的位点而排斥RNAP;当作为活化子时,抑制子类似于CAP,通过募集RNAP到启动子上使其活化。Cro蛋蛋白只抑抑制转录录,类似似于Laac抑制制子,它它也是以以二聚体体形式与与DNAA结合,对对RNAAP排斥斥。13.简简述细菌菌sRNNAs的的结构特特征、产产生机制制及功能能。特点:其其sRNNA比真真核生物物的调控控RNAA大很多多,为8801110 nt;产生机制制:小基基因直接接编码形形成其最最终产物物,而不不是由大大分子RRNA的的前体加加工而成成;功能:大大多数ssRNAA与靶mmRNAA互补使使其降解解从而抑抑制翻译译,也有有促进翻翻译的报报道。14.简简述噬菌体体Esttabllishhmennt oof llysoogenny的过过程。当建立了了溶源性性时,cc基因从从PREE开始转转录,当当这一状状态得以以维持时时,c基因从从PRMM开始转转录。结结合在OOR1和OOR2上的的抑制子子不但激激活了维维持模式式的表达达并且关关闭了建建立模式式的表达达。同时时,PRR控制了了裂解基基因和cc的表达达,c的表表达可控控制抑制制子的转转录使噬噬菌体进进入溶源源状态。而而PL控制制了许多多裂解基基因的同同时也控控制协助助建立溶溶源性的的c基因因。15. 简述NN蛋白和和Q蛋白白的抗终止机机制。N蛋白调调控早期期的基因因表达,作作用于33个终止止子,它它阻止在在早期操操纵子的的终止,其其作用的的位点为为nutt。RNNAP一一通过nnut位位点,NN蛋白即即结合到到RNAA上,并并通过RRNA装装载到RRNAPP上。在在这种状状态下,RRNAPP可以抵抵抗N和和croo以外的的终止子子。N与与nuss基因的的产物一一起起作作用,但但如果NN有较高高的浓度度,它也也有这样样的作用用,表明明N蛋白白自身具具有促进进抗终止止的作用用。Q蛋白识识别于晚晚期启动动子PRR-100和-335区之之间的DDNA序序列QBBE。无无Q时,RRNAPP结合并并起始转转录,但但在进行行仅166或177 ntt后暂停停,然后后终止于于下游约约2000 bpp的终止止子tR;如果QQ存在,RRNAPP一离开开启动子子,Q就就结合QQBE,并并移动到到在附近近停留的的RNAAP,RRNAPP装载了了Q蛋白白就能通通过tRR。Genee reegullatiion in eukkaryyotees复习题(一一)名词解解释1.Chhrommosoome(略略,与染染色体部部分同)2. CChroomattin(略略,与染染色体部部分同)3. TTwo-hybbridd asssayy 双杂杂交法,用用来判断断蛋白是是否相互互作用的的方法,基基因A表表达的蛋蛋白与DDNA结结合结构构域融合合,基因因B表达达的蛋白白与活化化结构域域融合,如如果二者者相互作作用,则则它们相相当于一一个活化化子,报报告基因因的表达达将被启启动。4. CChroomattin Immmunoopreecippitaatioon (ChIIP) 染色质质免疫沉沉淀,用用来判断断给定蛋蛋白是否否与基因因组DNNA结合合的方法法。简单单的说,加加入交联联剂使检检测蛋白白跟目的的DNAA结合,将将DNAA切割成成小片段段,然后后用抗体体将与检检测蛋白白结合的的DNAA回收,并并用PCCR的方方法确定定结合的的位点。5. RRrommodoomaiin 布布罗莫结结构域,实实际上是是真核生生物中的的一种蛋蛋白模体体,发现现于果蝇蝇brmm基因的的表达产产物而命命名,它它存在于于参与染染色质活活化或促促进有丝丝分裂信信号作用用的核蛋蛋白,识识别并结结合乙酰酰化的LLys,介介导蛋白白质间的的相互作作用,并并募集重重要的功功能复合合物。6. CChroomoddomaain 克罗莫莫结构域域,即染染色质结结构修是是结构域域,是一一种真核核生物的的蛋白模模体,高高度保守守含300500个氨基基酸,结结合甲基基化的LLys,存存在与核核内参与与调节染染色质结结构的蛋蛋白质中中。7. IInsuulattorss 绝缘缘子,是是长约几几百个核核苷酸对对的DNNA序列列,通常常位于启启动子同同正(或或负)调调控元件件之间,其其本身对对基因的的表达没没直接有有效应,其其作用使使抑制其其它调控控元件对对基因的的活化或或失活起起作用。8.Loocuss coontrrol reggionn 基因因座控制制区,有有许多增增强子或或绝缘子子元件组组成,它它可以控控制个体体基因的的有序表表达,但但机制未未知。9. GGenee cllustter 基因簇簇,一组组紧密连连锁并且且功能上上相关的的结构基基因,位位于染色色体的特特殊区域域。10. Hypperssenssitiive sittes 超敏位位点,指指-珠蛋蛋白基因因簇染色色质区域域两侧的的DNAA序列,该该区域易易被DNNAasse II所酶切切。11. Houusekkeeppingg geeness 管家家基因,理理论上说说,是所所有细胞胞都表达达的基因因,它们们为所有有类型的的细胞提提供基本本的功能能需求。12.CCombbinaatioonall coontrrol 组合调调控,多多个活化化子的协协同作用用或活化化子跟抑抑制子的的相互作作用对转转录的调调控为组组合调控控。13.CCoacctivvatoor && Cooreppresssorr 辅激激活(阻阻遏)蛋蛋白,是是一类辅辅助蛋白白,它们们不是转转录机器器的一部部分,本本身也不不是DNNA结合合的调节节蛋白,但但是跟转转录调节节有关,可可能是组组蛋白甲甲基化酶酶或者其其它的核核小体修修饰复合合物。简答1.真核核与原核核的acctivvatoor的募募集作用用有何区区别? 区别有有三:原原核的活活化子通通常一个个表面与与DNAA结合,另另一个表表面跟RRNAPP结合,将将其募集集到基因因,从而而激活基基因的转转录。在在真核中中1)活活化子与与转录机机器上聚聚合酶以以外的其其它部分分相互作作用,通通过募集集这些部部分也就就募集到到了RNNAP;2)活活化子能能募集核核小体修修饰成分分来改变变基因附附近染色色质的性性质,帮帮助起始始转录;3)活活化子可可以募集集聚合酶酶进行转转录起始始或延伸伸所需要要的因子子。在这这些功能能中,活活化子将将蛋白募募集到启启动子上上。2. DDNA binndinng mmotiif的rrecoogniitioon sstraateggy是如如何进化化的?举举例说明明。 蛋白以以二聚体体与DNNA结合合,并以以螺旋嵌嵌入大沟沟来识别别特定的的DNAA序列(同同源结构构域、ZZn指结结构域、LLeu拉拉链、HHLH)双链折叠(如SAM)使用突出的环识别DNA(如p53)3.简述述acttivaatorrs如何何指导LLocaal aalteerattionns iin cchroomattin。 两种模模型:11)活化化子募集集组氨酸酸乙酰转转移酶(HHAT),该该酶在HHis末末端添加加乙酰基基团使组组蛋白乙乙酰化,改改变了其其紧凑的的结构,并并为携带带合适识识别域的的蛋白创创造了结结合位点点;2)活活化子募募集染色色质重塑塑复合物物,改变变启动子子附近的的核小体体结构,使使其变得得可接近近并且能能同转录录机器结结合。4. CChroomattin remmodeelinng ccompplexxes改改变nuucleeosoome orgganiizattionn的主要要方式有有哪些? 方式有有三:11)核小小体滑动动,使DDNA序序列位置置改变;2)调调整核小小体的空空间位置置,DNNA改变变序列的的间隙;3)核核小体被被取代,DDNA序序列之间间形成核核小体的的缺口。5. 简简述Hiistoone moddifyyingg ennzymmes的的主要作作用方式式及其效效应。 主要是是对核小小体N端端的修饰饰,方式式有三效效应有二二:1)组组蛋白乙乙酰化(活活化)去去乙酰化化(失活活);22)组蛋蛋白甲基基化(失失活)去去甲基化化(活化化);33)DNNA甲基基化(失失活)去去甲基化化(DNNA去甲甲基化酶酶存在与与否存疑疑)。6.在真真核基因因转录前前如何改改变(活活化)染染色质结结构? 简言之之,染色色质重塑塑蛋白及及组蛋白白修饰复复合体的的协同作作用使染染色质活活化。基基因活化化蛋白与与染色质质(300 nmm纤维)结结合募集组组蛋白修修饰酶(如如HATT)10 nm的的染色质质纤维募集核核小体重重塑复合合物,染染色质结结构进一一步松散散核小体体滑动,染染色质活活化募集其其它活化化蛋白起始转转录7. 何何谓真核核acttivaatorrs的“synnerggy”? 简单的的说,就就是多种种活化子子通过协协同作用用,共同同使基因因打开,增增效作用用对活化化子引发发的信号号整合是是至关重重要的。在在该过程程中,每每个活化化子可以以募集转转录机器器中一种种或几种种成分,彼彼此帮助助结合到到各自的的位点,其其协同结结合体现现在三个个方面:1)两两者直接接相互作作用;22)两者者与第三三者作用用;3)间间接作用用,A的的结合可可以帮助助B结合合。8.何谓谓“enhhancceossomee”?举例例说明。 活化子子以协同同作用结结合在增增强子上上形成的的结构被被称为增增强体,如如人类干扰素素增强体体。3个个活化子子协同结结合,与与结构蛋蛋白HMMGA11一起激激活干扰素素基因。9. 简简述真核核与原核核Reppresssorrs作用用方式的的主要区区别。原核中抑抑制子的的作用方方式:11)与启启动子的的重合位位点结合合以排斥斥RNAAP;22)结合合在启动动子附近近与RNNAP相相互作用用抑制转转录起始始;3)干干扰活化化子的功功能。真核中,没没有原核核中的第第一种调调控方式式,但它它有另外外的作用用方式:抑制子子募集核核小体修修饰酶,从从而使染染色质变变得更紧紧凑或是是去除能能够被转转录机器器所识别别的基因因。10. 举例说说明调控控真核与与原核ttrannscrripttionn reegullatoors活活性方式式的主要要区别。原核的调调控主要要控制转转录调控控因子与与DNAA结合的的水平上上,如乳乳糖抑制制子在缺缺乏乳糖糖时才跟跟DNAA结合。真核的调调控有两两种方式式:1)活活性区的的暴露:通过与与DNAA结合的的活化子子构象的的改变或或者释放放隐蔽蛋蛋白,如如酵母GGal44的调控控,它被被Gall80的的蛋白所所隐蔽,只只有Gaal800去除时时,Gaal400才能被被活化;2)运运输出入入细胞核核:通过过与抑制制性蛋白白相互作作用,或或者与细细胞膜相相互作用用,或者者以某种种构象存存在,调调控因子子被限制制在核内内,如果果蝇胚胎胎背轴的的形成,CCacttus是是抑制蛋蛋白,在在细胞质质中与调调控因子子Dorrsall结合,对对于特定定信号应应答,CCacttus磷磷酸化后后被降解解,Doorsaal得以以入核行行使功能能。11.简简述coontrrol of celll ccyclle的tthreee cchecckpoointts。 细胞周周期调控控的三个个关卡:1)起起始关卡卡位于GG1末期,这这是一个个限制点点,正要要进入DDNA复复制的SS期;22)G22/M,在在该期要要检测DDNA是是否完全全复制,环环境是否否合适;3)中中期向后后期的过过渡关卡卡,此点点检测是是否所有有染色体体已跟纺纺锤体连连接。复习题(二二)名词解解释1. PPc (or Pc-G) prooteiinPolyycombb (GGrouup)蛋蛋白,是是最早发发现于果果蝇中的的一个蛋蛋白家族族,它可可以使染染色质重重塑使转转录因子子无法跟跟DNAA序列中中的启动动子结合合。通过过使染色色质重塑塑,它可可以使果果蝇的hhox沉沉寂。2.Immpriintiing 印记,指指在配子子或合子子发生期期间,来来自一个个亲本的的等位基基因或染染色体在在发育过过程中产产生特异异性的加加工修饰饰(一般般为甲基基化),导导致后代代体细胞胞中两个个亲本来来源的等等位基因因有不同同的表达达方式,是是一种 DNAA序列不不改变的的表观修修饰。3. CCpG isllandds (CG isllandds) CpGG岛,是是哺乳动动物基因因组中长长度为112 kb富富含非甲甲基化的的CG二二核苷酸酸DNAA序列,一一般位于于启动子子和第一一个外显显子区。4.Eppigeenettic reggulaatioon 表表观遗传传调控,表观遗传调控是指转录前基因在染色质水平上的结构调整,包括DNA甲基化和核小体的修饰,它是真核基因组一种独特的调控机制。5.Allterrnattivee sppliccingg 选择择性剪接接,指选选择性地地对prre-mmRNAA不同的的剪接位位点的组组合剪接接方式,通通过选择择性剪接接,由一一条prre-mmRNAA可生成成多条的的成熟mmRNAA。某些些基因的的选择性性剪接具具有组织织特异性性或受发发育调节节。6.trranss-sppliccingg 反式式剪接,指两条不同的mRNA的外显子连接到一起。与正常的剪接方式相比,反式剪接的两段外显子来自不同的mRNA,但可能是来自同一基因。7. eedittingg RNNA编辑,基基因转录录产生的的mRNNA分子子中,由由于核苷苷酸的缺缺失,插插入或置置换,导导致RNNA中的的编码信信息发生生改变,使使翻译生生成的蛋蛋白质的的氨基酸酸组成,这这种现象象称为RRNA编编辑。8. gguidde RRNA 引导RRNA,真核生物中参与RNA编辑的具有与mRNA互补序列的RNA。9.P boddiessProccesssingg boodiees 加加工体,真真核生物物体细胞胞内的细细胞质颗颗粒,主主要起储储存和降降解mRRNA的的作用,不不过也有有P小体体保护mmRNAA的报道道(蠕虫虫卵细胞胞)。PP小体是是细胞质质中不连连续的区区域,当当中存在在很多参参与转录录后调控控的细胞胞因子。10.LLinccRNAAsLargge IInteerveeninng NNoncodiing RNAAs 大大的可插插入非编编码RNNA,是是真核生生物中一一类进化化保守的的非编码码RNAA,其长长度从几几千到上上万ntt,它可可能起到到结合并并引导抑抑制子蛋蛋白与启启动子结结合,从从而使基基因沉默默。 简答1. 简简述Buuddiing yeaast的的端粒hheteerocchroomattin发发生siilenncinng的过过程。 简言之之,芽殖殖酵母端端粒异染染色质发发生沉寂寂是其去去乙酰化化。首先先,Raap1募募集SIIR复合合体至端端粒。SSIR中中的SIIR2使使临近的的核小体体去乙酰酰化,去去乙酰化化的尾部部与SIIR3跟跟SIRR4结合合,然后后募集更更多的SSIR复复合体,从从而允许许SIRR2作用用于更远远的核小小体,循循环往复复,使其其核小体体去乙酰酰化,端端粒的异异染色质质得以沉沉默。2.Iss thheree a hisstonne ccodee? Aree yoou kkidddingg mee? 的的确,在在一个特特定的基基因座上上复杂的的组蛋白白修饰产产生一个个高度特特异的信信息。但但是,在在一个基基因上看看到的许许多修饰饰可能仅仅仅是一一个基因因在被活活化或被被抑制过过程的一一部分,而而不是作作为起始始信号,即即它们是是基因正正在开启启或关闭闭的结果果,而不不是原因因。当特特定基因因表达时时,位点点特异性性结合蛋蛋白(或或小RNNA)对对其特异异性起主主导作用用。3. 在在哺乳动动物基因因组中,如如何实现现staablee geene exppresssioon或ggenee fiirmlly sshutt offf?在未修饰饰状态,如如果活化化子和转转录机器器都存在在,真核核基因很很容易在在表达状状态和非非表达状状态转换换,在这这种状态态下,表表达并不不能完全全关闭。基因的完完全关闭闭需要DDNA的的甲基化化和局部部核小体体的修饰饰来完成成。当基基因不表表达时,DDNA甲甲基转移移酶可以以靠近并并使启动动子序列列、基因因本身及及上游活活化子位位点序列列CG中中的C甲甲基化,甲甲基化的的C易于于跟含CC-Meet DDNA的的蛋白结结合,这这些蛋白白可以募募集重塑塑和修饰饰核小体体的复合合物,从从而使基基因表达达完全关关闭。4.何谓谓impprinntinng?iimprrinttingg是如何何发生的的? 基因印印记,指指在配子子或合子子发生期期间,来来自一个个亲本的的等位基基因或染染色体在在发育过过程中被被甲基化化,导致致后代体体细胞中中两个亲亲本来源源的等位位基因有有不同的的表达方方式,是是一种 DNAA序列不不改变的的表观修修饰。5. 为为什么iidennticcal Twiins可可能一个个健康,另另一个患患遗传性性疾病?举例说说明。 比如,RRettt综合征征。它是是一种严严重影响响儿童精精神运动动发育的的神经遗遗传性疾疾病,由由X染色色体连锁锁的编码码抑制蛋蛋白MeeCP22的基因因突变所所致。对对于同卵卵双生的的男孩,在在胚胎发发育过程程中,如如果其中中之一MMeCPP2被甲甲基化,则则表现为为Rettt综合合征,另另一个则则正常。简简言之,是是表观遗遗传修饰饰的改变变,而不不是DNNA序列列的改变变。6. CCpG isllandds在进进化过程程中是如如何产生生的? 在古代代脊椎动动物的DDNA中中,CGG的分布布是随机机的。这这样C被被甲基化化,由于于C-MMet脱脱氨基形形成T,这这样有些些CG中中的C在在漫长的的进化过过程中变变成T。而而另一些些CG中中的C如如果最终终形成TT,对于于生物本本身来说说,这种种突变是是致命的的,因此此被保留留下来,最最终形成成CpGG岛。7.Euukarryottic genne eexprresssionn可能有有哪些阶阶段(sstepps)受受到调控控?为什什么说这这些阶段段之间相相耦联?有六个阶阶段:转转录、RRNA加加工、RRNA转转运和定定位、翻翻译、RRNA降降解及蛋蛋白的活活性。对于mRRNA来来说,其其不同阶阶段的加加工再不不同水平平上相互互联系,转转录、RRNA加加工及mmRNAA的运输输等过程程是相耦耦联的;同时,许许多mRRNA的的加工因因子是共共转录的的,转录录的完成成需要不不同的成成分,跟跟mRNNA加工工的不同同阶段相相耦联。8.组织织(细胞胞)特异异的Allterrnattivee sppliccingg是如何何发生的的?首先,选选择性剪剪接存在在多种形形式:可可选的外外显子、可可选的内内含子、外外显子的的相互排排斥及内内在的剪剪接位点点(如一一个外显显子内存存在的剪剪接位点点);其次,选选择性剪剪接是受受到调控控的。其其调控有有两类:1)可可变剪接接的外显显子总是是在成熟熟的mRRNA中中出现,除除非受到到阻遏蛋蛋白的抑抑制;22)只有有某种激激活因子子发挥作作用,可可变剪接接的外显显子才能能出现在在成熟的的mRNNA中。9. 人人类蛋白白质编码码基因数数和细胞胞内蛋白白质种类类数是否否大致相相当?为为什么? 并不相相当,最最主要的的原因是是RNAA剪接的的存在。可可变剪接接产生多多种剪接接方式,导导致成熟熟mRNNA的多多样性;RNAA编辑则则导致了了遗传信信息发生生改变;进化过过程中,由由RNAA剪接造造成的外外显子重重排,则则造成了了蛋白的的多样性性;同时时,不同同的基因因间可发发生重组组,产生生新的蛋蛋白(VV(D)JJ重组)。还有另一个原因是,存在翻译后加工的机制,即蛋白剪接(protein splicing)(见上半学期分子生物学原理课件第三章“Regulatory Strategies”)10. 真核蛋蛋白质分分子如何何跨膜转转运(注注:此题题本意想想问mRRNA的的跨膜转转运)? mRNNA的转转运通过过核膜上上的核孔孔复合体体(NPPC)来来完成,这这是一个个主动运运输的过过程,需需要GTTP水解解提供能能量,该该反应由由Rann催化完完成。只只有合适适的mRRNA才才能被转转运,它它们特异异地结合合正确的的蛋白质质,把那那些必须须留在核核内及被被降解的的mRNNA区分分开。被被转运的的RNAA携带了了细胞核核跨膜转转运信号号,转运运受体识识别这些些信号后后指导RRNA通通过核孔孔离开细细胞核。一一旦进入入细胞质质,蛋白白质组分分便解离离下来,被被识别后后运回细细胞核;然后再再与mRRNA结结合,重重复下一一次运输输。11.真真核mRRNA分分子在细细胞质中中loccaliizattionn的方式式有哪些些?真核mRRNA在在细胞质质中的定定位有三三种方式式:1)在在ATPP水解提提供能量量的前提提下,mmRNAA被指引引运输到到细胞骨骨架上;2)随随机散在在分布被被“捕获”;3)除除非跟停停泊蛋白白结合,否否则被捕捕获后与与所在蛋蛋白结合合后发生生降解。12.为为什么说说ediitinng的发发现是对对中心法法则的补补充?如如何评价价ediitinng在进进化中的的地位?所谓的RRNA编编辑,是是在RNNA水平平上改变变遗传信信息的加加工过程程,导致致成熟的的RNAA编码的的序列跟跟它的转转录模板板DNAA序列不不再匹配配,即DDNA遗遗传信息息不再真真实地反反应在RRNA序序列中。因因此,它它是对中中心法则则的补充充。RNA编编辑可能能发生在在细胞进进化早期期阶段的的RNAA合成过过程的“分子化化石”,即生生命早期期RNAA复制中中的一种种误差校校正机制制残留的的痕迹。在在生命起起源过程程中可能能出现的的RNAA师姐,由由于RNNA复制制误差较较大,可可能需要要RNAA编辑作作为一种种校正机机制,以以维持遗遗传信息息的忠实实性。13.TTrannslaatioonall coontrrol of eukkaryyotiic ggenee exxpreessiion主主要有哪哪些方式式?举例例说明。 方式有有四:11)转录录抑制蛋蛋白跟调调控序列列结合,使使翻译关关闭;22)通过过核糖开开关来调调控,SSAM与与其结合合则翻译译关闭,SSAM的的去除则则翻译打打开;33)温度度的升高高,破坏坏了RNNA的二二级结构构使翻译译进行;4)反反义RNNA的调调控。如如,铁离离子对转转铁蛋白白的调控控:转铁铁蛋白基基因5-UTTR有一一个铁离离子调控控元件的的颈环结结构IRRE。当当Fe22+不存存在时,IIRE与与铁调控控蛋白IIRP结结合,抑抑制翻译译;当FFe2+存在时时,它与与IREE结合,阻阻止了IIRP的的结合,使使翻译顺顺利进行行。这属属于第一一种方式式。14. Eukkaryyotiic mmRNAA deecayy主要有有哪些方方式? 主要有有两种:首先,ppolyy-A逐逐渐缩短短,然后后:1)55脱帽,然然后从553降解;2)迅迅速从335降解。15.拟拟南芥细细胞中的的RNAAP IIV和RRNAPP V的的主要功功能是什什么? RNAAP IIV:可可以使用用甲基化化的DNNA做模模板转录录RNAA;RNNAP V:可可以转录录RNAA模板。16.以以“美臀羊羊”表型的的基因表表达调控控模式为为例,解解释“中心法法则已经经过时”的原因因。中心法则则过于简简单:DDNA转转录RNNA,RRNA翻翻译蛋白白,蛋白白完成几几乎所有有的工作作。中心心法则给给人以错错误的暗暗示,往往往把表表达蛋白白的DNNA才叫叫做基因因,然而而实际上上,编码码蛋白的的DNAA只占人人类基因因组的22%,越越来越多多的调控控RNAA被发现现,而它它们本身身并不翻翻译蛋白白。同时时,DNNA,RRNA及及表观遗遗传的标标记形成成链锁,并并且存在在自我调调控的系系统,显显然需要要新的理理论来取取代中心心法则。拿美臀羊羊来说,即即便美臀臀羊(雌雌)含有有美臀基基因c®®遗传给给子代,子子代表型型依然正正常,并并且携带带双突变变等位基基因c®®的绵羊羊表型正正常。显显然,这这用中心心法则很很难解释释。研究发现现,绵羊羊18号号染色体体靠近端端粒区的的高度保保守结构构域DIIK1-GtII2印记记结构域域内,出出现了AAG突变变,这是是野生绵绵羊跟美美臀羊的的唯一区区别。该该区域存存在很多多编码基基因及非非编码基基因,在在正常状状态下,DDIK11-GttI2印印记结构构域父源源(表达达蛋白DDlk11)跟母母源基因因(表达达Gtll2、MMeg

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