色谱定性分析方法.ppt
第七章定性分析本章将学到:数据分析主菜单的特征熟练处理数据的性能积分参数利用反检索(PBM)进行定性分析自动谱库检索及报告参数恢复如何自建库定性分析加载数据文件放大缩小 获得质谱图扣除本底谱图检查峰纯度库检索常用的定性程序数据分析中鼠标的功能按相对丰度显示质谱图选用命令行选用命令行tools/option/command linetools/option/command line输入输入normal 100normal 100按按enterenter键键从从spectrum/spectrum/tabulatetabulate可列出相对丰度表可列出相对丰度表继续键入继续键入drawdraw按按enterenter键键.即可按相对丰度显示质谱图即可按相对丰度显示质谱图测定信噪比的方法(仅对5973A)调用相应的数据文件选用命令行键入macro,回车从load macro 栏目中选择sig_n.mac,双击在命令行键入sig_n.mac当被问到是否使用当前文件时回答yes键入目标离子或输入0表示用总离子流图拖住左键指定信号范围拖住左键指定噪音范围工作站自动从打印机输出报告用于设置 RTE 积分参数用于保存当前 RTE 积分参数用于加载,修复,保存 RTE积分参数RTE 积分参数峰起点与终点丰度差与峰高相比基线位置。分离相邻两峰的最少扫描次数基线落下或切线峰位置(顶点或峰重心最小峰面积最多峰数目RTE积分文件扩展名为.P关于RTE积分的说明Data point sampling:。采样点数 默认值为默认值为1。,即每个点都用,选择 2则每隔一点取一个点,选择 3 每隔 2 点取一个点等等,其范围从 1-9,负值是不允许的。对毛细管色谱柱在扫描方式(Scan)采集的数据通常采样点数设为 1,在 SIM 采集的数据或噪音大的数据(任何时候积分器都显示是分叉的峰)一般设为 2 或 3。这个参数在早期版本的PTINT 中称作束(bench)。扫描方式采集选1;SIM方式可以选2或3smoothing:默认值为不选,即不做平滑处理默认值为不选,即不做平滑处理detection filtering:用来改善色谱噪音用来改善色谱噪音start threshold:默认值为默认值为0.2,很少,很少 改变改变stopthreshold;用于改善拖尾峰的积分情况,阈值越大,拖尾峰的面积越大用于改善拖尾峰的积分情况,阈值越大,拖尾峰的面积越大baseline reset(#points):是分开两个相邻色谱峰的最小扫描数。如果相邻两个峰之间的扫描数小于该值,划出的基是分开两个相邻色谱峰的最小扫描数。如果相邻两个峰之间的扫描数小于该值,划出的基线会低于峰起点或终点线会低于峰起点或终点if leading or trailing edgeAbundanceAverage of 9.739 to 9.796 min.:EVALDEMO.D(*)2943557487101115129143157171 185 1992132272392702040608010012014016018020022024026028002000400060008000m/z-Abundance#153629:Hexadecanoic acid,methyl ester(CAS)$Methyl pal(*)4355748797115129143157171 185 19921322723927027230319818215012294824240801201602002402801.0E50.0E52.0E53.0E582182303941982723.0E52.0E51.0E50.0E54080120160200240280检索步骤检索步骤未知物谱未知物谱简化为简化为10个最有意义的峰个最有意义的峰与谱库比较与谱库比较谱库中是否有这些峰?丰度比是否正确?评价对比结果评价对比结果显示检索结果显示检索结果Significance=Mass x Abundance Am x am=110 (Am)2 x (am)21/2=11010=1相似指数相似指数=Perfect match=1,Perfect mismatch=0Reports SI x 10,000验证手段分子式计算分子式计算氮规则氮规则同位素簇摸样同位素簇摸样合理丢失合理丢失丢失中性碎片丢失中性碎片PBM 检索结果检索结果注意注意:没有一个检索程式,或一种经验保证没有一个检索程式,或一种经验保证100%的正确检索结果的正确检索结果.很多因素会影响检索的质量很多因素会影响检索的质量检索统计表检索统计表说明检索统计表说明(续)检索报告作为方法的一部分选择 Method/Edit Method.选择 LibSearch Report设置所需报告格式 和目的文件自动库检索谱库检索报告在谱库中是否包含该化合物?检索策略的选择.库检索.未知谱的状况.适当的扫描范围,扫描阈值 在 GC 峰中的位置 混合物谱图 平均/背景扣除影响检索的因素 参数检索参数检索结果选用分子结构数据库步骤点击Add new file在molstruc处双击左键在molstruc.sdb处双击左键点击OK从view/standard menu 转回原窗口较好的匹配快速检索了解参考谱图的质量可以编辑和修改用户自建库建立自建库添加和编辑信息(将用户当前数据文件中的一张质谱图放入自建库)把商品谱库中的一张放入自建库(连同结构式)自动化工具:DOSCAN将光标放在总离子流图中目标化合物处,同时点击鼠标左右键NIST检索检索标准谱局部放大命中者丰度表未知谱比较标准谱化合物名字检索从tools菜单下选择Mass Spectrum Interpreter进入谱图解析谱图解析同位素计算结构信息可能含Cl、Br数目通过化合物名称、CAS号、分子式等信息检索AMDISAutomatic Mass spectral Deconvolution and Identification System专为GC/MS设计进入路径:data analysis/spectrum/AMDIS点击RUN总离子流单一色谱峰及提取离子保留时间峰形、纯度、信噪比、特征峰等质谱图(包括自然图和重叠性)数据采集l采集方式l调谐文件lGC 参数lMS 参数l注射器参数定性数据分析l数据库l检索策略l报告选项l为自动检索报告选择报告格式方法流程