实验步骤.ppt
实验操作陈韵琳农杆菌电转法开电源按STE设电压(E.coli 1500v 农杆菌18000v)用无水乙醇洗3次点转杯在冰上晾干100ul感受态+1l质粒,提前混入放于电转杯中Push2两下时间在5-6s将1mlLB液体培养基加入电转杯中轻吸打1-2次,吸出放入离心管中28摇菌1h4000rpm 2min 100l涂平板28过夜培养挑单克隆,摇菌,进行PCR检测平板制备农杆菌平板的制备:LB100ml+kam(50mg/ml)100l+RFP利福平(50mg/ml)100l潮霉素(Hyg)RFP利福平(50mg/ml):0.05g用1ml甲醇溶解,过滤灭菌50mg/ml卡那霉素(Kan):1g卡那霉素+20ml灭菌水(过滤灭菌)胶回收/纯化1.2%琼脂糖凝胶电泳电泳-上样-切胶-称重+同体积mem bind55-65水浴溶胶倒入小柱-静止1min-12000rcf1min700l men wash 12000rcf 1min500l men wash 12000rcf 1min空管离心12000rcf2min 换新离心管小柱中加入50l去离子水静止1min-12000rcf 1min拟南芥的种植方法种子放入1.5ml的离心管中+20漂水1ml强烈震动20min,灭菌水冲洗6次0.1的琼脂糖悬浮种子,接种于1/2MS平板上,正放,在组培室培养7天,当种子长到2叶一心时,种于土中(蛭石和土等体积,于20min,121高压灭菌),第1,2天用保鲜膜将培养钵的口封上,在其上留有通风孔,8小时日照下进行营养生长15-20天,之后在12小时日照下进行生殖生长。质粒大肠杆菌热激法的转化(1)将质粒转入装有100l感受态细胞的小离心管中,轻弹管壁混匀,冰浴30min;(2)42度水浴热击60s,迅速置于冰浴2min(3)加入室温的液体LB培养基1000l,混匀,37度,150rpm摇床培养lh;4500rpm离心5min(4)取200L培养液涂布于含卡那霉素50mg/L的LB平板上,37度培养16h,直至单菌落产生大肠杆菌质粒的提取大肠杆菌质粒的提取(l)挑取在卡那霉素的LB平板上的单菌落,接种于10ml含有相应抗生素的LB液体培养基中,37度,200rpm,震荡培养过夜(8-12h);(2)取4.5ml的过夜培养菌液,12000rpm离心2min,弃上清;(3)用250ul的Solutionl(含RNaseAI)充分悬浮细菌沉淀;(4)加入250ul的Solution11轻轻的上下翻转混合5一6次,使菌体充分裂解,形成透明溶液;静止2min(5)加入350ul的SolutionIII,轻轻上下翻转混合5一6次,室温静置2min;(6)室温12000 rpm离心10min,取上清;转移至SpinColumn中,12000rpm离心lmin,弃滤液(将试剂盒中的SpinColunm安置于eoxlection管上)(7)500l的HB buffer转移至SpinColumn中,12000rpm离心lmin,弃滤液;(8)将700l的wash buffer加入SpinColumn中,12000rpm离心lmin,弃滤液;重复操作此步骤(9)将SPinColulnn安置于新的1.5ml的离心管上,在SPincofulnn膜的中央处加入50l的灭菌蒸馏水,室温静置1min;(10)12000rpm离心1min洗脱DNA农杆菌感受态细胞的制备(l)农杆菌菌株划线培养,在农杆菌平板中进行(2)取单克隆,于50ml LB液体中加入利福平,28度180rpm,培养过夜;使OD达到0.5;(3)菌夜转入50ml离心管中,4度,4000rpm,离心10min,弃上清液;(4)弃上清,10ml无菌甘油(20)悬浮细胞,4度,4000rpm,离心10min,液;重复3遍(5)弃上清,1ml无菌甘油(20)悬浮细胞,每50l分装为一管;-80度冰箱贮存各备用根癌农杆菌介导的杨树遗传转化程序(1)工程菌液的制备 挑取单菌落,接种到10ml相应抗生素的LB液体培养基中,于28度,180-220rpm过夜培养晨,OD600值为0.5-1,4000rpm,离心5min,收集菌体,用不含抗生素的l/2MS液体培养基或无菌水悬浮,所得菌液用于侵染,即为工程菌液,(2)侵染将工程菌液倒入无菌培养皿中,选取叶片,浸入工程菌液中,剪去叶片的四周,侵染45min(3)共培养取出侵染后的叶片用无菌滤纸吸干菌液后,转入到共培养基上,暗培养(4)脱菌将共培养的外植体放入50mg/L的cef水中进行脱菌,1-4次中每次头孢水中洗5min,其后头孢水洗20min,知道没有菌丝为止。(5)选择培养将经过脱菌的外植体转移到筛选培养基上进行筛选培养,筛选出抗性芽(6)抗性芽的获得选择培养一周后会有芽的产生,这时要使芽充分接触到培养基,在选择性培养基上正常分化生长的芽即为抗性芽,待芽长至3cm左右时,剪下来放置装有分化筛选培养基的培养瓶中,一周后在转入生根筛选培养基中。(7)抗性芽的生根将获得的抗性芽进行生根筛选,能够在选择生根培养基上生长!生根的抗性芽,可以进一步确定为转化芽。带真菌的植株消毒茎段于7530s灭菌水冲洗3次过氧化氢原液30min(前15分钟为原液,后15分钟加入同体积水)1次氯酸钠10min灭菌水冲洗3次放入平板上晾干1%次氯酸钠:1ml次氯酸钠+9ml水75酒精(消毒):100ml酒精+24ml水总DNA的提取 (l)取适量新鲜幼嫩叶片放入预冷的研钵中,迅速加入液氮研磨成粉末,将其转入提前预热的装有700ulCTAB提取缓冲液的1.5而的离心管中,65度恒温水浴30min,其间不时轻轻摇动离心管,使叶片粉末均匀的分散在提取液中;取出放至室温后,12000rpm离心5min(2)加入350l酚:氯仿(体积比1:l),上下缓慢颠倒混匀,酚与氯仿配合使用可以增强除蛋白的效果;12000rpm离心5min;将上清转入另一离心管中,弃下层(不要将中间蛋白层吸出):重复步骤两次,直至中间层透明,取DNA相;(3)加入与上清液等体积的氯仿上下缓慢颠倒混匀,12000rpm离心5min;将上清转入另一离心管中,弃下层(不要将中间蛋白层吸出):重复步骤两次,直至中间层透明,取DNA相;(4)吸取上清液加入1.5ml离心管中,加入1/10体积的3mol/LNaAc和3倍体积的无水乙醇,混匀后,室温静置20分钟,12000rpm,离心15min,弃上清;75酒精洗沉淀,20l去离子水,溶解DNA沉淀:(5)加入1.5ulRNase,37放置30min;(6)加入离子水到300ul,加300ul氯仿:酚(1:1)抽提一次:(7)吸取上清液加入1.5ml离心管中,加入l/10体积的3mol/LNaAc,3倍体积的无水乙醇混匀后,室温静置20分钟,12000rpm,离心15min,弃上清;75酒精洗沉淀,20l去离子水,溶解DNA沉淀,电泳检测,测浓度试剂CTAB法提取DNA:CTAB5g+NaCl(0.5M)20.47g+EDTA(0.5M)10ml+TrisBase(1M)25ml定容到250mlEDTA(0.5M):18.2g定容到100mlTrisBase(1M):12.11g定容到100ml利用CTAB法提取毛果杨总RNA1,将液氮快速研磨,待液氮蒸干后,立即将样品转入已加好提取液并冰浴好的1.5毫升离心管内(700微升CTAB),加样过程易降解,所以加完样品应立即振荡后于65度水浴锅水浴5分钟,之后冰上静置2分钟,随后4离心机中12000 r min-1离心2min。2,上步骤处理后所得的上清液转入在冰上预冷好的1.5毫升离心管中(离心管中加入350微升氯仿+350微升水饱和酚),振荡后,4离心机中12000 r min-1离心2min,重复两次。3,取上清转入预冷好的600微升氯仿中,振荡后,4离心机中12000 r min-1离心2min,重复两次。4,1.5毫升离心管中加入350微升乙醇+350微升氯化锂(8 mol l-1)混匀,预冷。将上述上清加入其中,混匀。冰上沉淀20min。4离心机中12000 r min-1离心20min。弃上清,用75%乙醇洗涤2次。待沉淀表面乙醇蒸干(一直冰上),用40微升DEPC水溶解。电泳检测。用1%琼脂糖凝胶电泳,电泳液换新的并且用之前最好冰浴。5,40微升RNA溶液+5微升10buffer+8毫升DNase,37水浴30 min。6,加DEPC水稀释总体积至300微升,加300微升氯仿抽提一次7,取上清,加入预冷的900微升无水乙醇(上清体积3倍)+120微升3 mol l-1醋酸钠(上清体积的1/10),冰上静置15 min,4离心机中12000 r min-1离心15min。8,75乙醇洗涤2次,气干,20微升DEPC水溶解,电泳检测,同(4)试剂CTAB法提取RNA:硼砂(0.01M)0.38137g用去离子水定容到10ml,用盐酸调PH到8.5+EDTA(0.5M)1ml+CTAB2g+NaCl(1.6M)9.36g+DEPC水100ml用去离子水定容到100ml(37烘箱过夜,在高压灭菌)Licl(8M):13.56g定容到40ml+DEPC水40ml 过滤灭菌NaAc(3M):20.412g定容到50ml,用冰乙酸调PH到5.2+DEPC水50mlDEPC水:100ml水+DEPC水100ml75酒精:75ml无水乙醇+25ml水反转录成CDNA反转录第一链cDNA的合成,得到的RNA为模板,利用DRR037A反转录试剂盒(大连宝生物),按照说明书操作如下:(1)按下列组份配制RT反应液(反应液配制请在冰上进行)。试剂 使用量 终浓度 5 PrimeScript Buffer(for Real Time)2.0 l 1 PrimeScript RT Enzyme Mix I 0.5 l Oligo dT Primer(50 M)*1 0.5 l25 pmol Random 6 mers(100 M)*1 0.5 l50 pmol Total RNA RNase Free dH2O up to 10 l 注:反应体系可按需求相应放大,10 l反应体系可最大使用500 ng的Total RNA。(2)反转录反应条件如下:37 15 min(反转录反应)85 5 sec(反转录酶的失活反应)(3)稀释:将得到的10 l cDNA中加入90 l的去离子水,即稀释10倍。-20保存备用。逆转录PCR反应取稀释后的反转录得到的cDNA 1 l,作为RT-PCR反应的模板,RT-PCR反应体系,反应结束后用琼脂糖凝胶电泳检测RT-PCR结果。T载体的链接转入大肠杆菌中扩增 得到的PCR产物,利用A1360 pGEM-T Easy 载体系统(Promega)生产,按照说明书操作如下:(1)按下列组份配制T-载体反应液(反应液配制请在冰上进行),于4过夜链接A1360 pGEM-T Easy 载体系统 试剂 使用量 2Rapid Ligation Buffer,T4 DNA Ligase 5l pGEM-T Easy Vector(50ng/l)1l PCR product 2 lT4 DNA Ligase 1 l Nuclease-free water to a final volume of to 10 l (2)取T-载体连接产物10l于100l大肠杆菌感受态中放于冰上静止30min.(3)42热激60s,于冰上静止2min,加入1000lLB液体培养基于37摇箱复苏一小时。(4)4000rpm离心5min,涂布于LB平板中于37烘箱过夜培养,看蓝白斑生长状况。挑白斑于加有氨苄的LB液体培养基中,37摇箱培养2h后进行PCR检测,测序检测Ampicillin(50mg/ml):1g用20ml的灭菌水定容在过滤灭菌IPTG(24mg/ml):0.24g用10ml的灭菌水定容在过滤灭菌X-Gal(20mg/ml):0.1g用1ml的DMF(二甲基甲酰胺)溶解,用DMF定容到5mlT载体链接平板的制备:LB100ml+Ampicillin(50mg/ml)100l+IPTG(24mg/ml)100l+X-Gal(50mg/ml)200l培养基配方1/2MS培养基:2.2gMS+蔗糖25g/L+琼脂5.5g/L小黑杨生根培养基:1/2MS培养基+IBA0.2mg/l小黑杨分化培养基:1/2MS培养+NAA0.05mg/l+6-BA0.5mg/l大青杨生根培养基:2.2gMS+蔗糖20g/L+琼脂6.0g/L大青杨分化培养基:2.2gMS+蔗糖20g/L+琼脂6.0g/L+NAA0.1mg/l+6BA0.5mg/lLB培养基:5g/L酵母提取物10g/LNaCl 10g固体培养基加1.5%琼脂,液体培养基不加琼脂,PH 7.0固体:琼脂900g/cm212g 1300g/cm28.3g 1100g/cm29.8g6-BA:用lmol/LNaoH溶解后,配成0.5mg/ml母液NAA:用lmol/LNaOH溶解后,配成0.lmg/ml母液200mg/ml头抱霉素(Cef):一瓶+5ml灭菌水1MHCL:8.4mlHCL+91.6ml灭菌水1MHCL:8.4mlHCL+91.6ml灭菌水