微生物的分类与鉴定学习教案.pptx
微生物的分类微生物的分类(fn li)与鉴定与鉴定第一页，共38页。Chap.11微生物的分类(fnli)和鉴定微生物分类学（microbialtaxonomy）分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元(dnyun)中，制定出检索表。鉴定：运用现代分类系统，通过具体(jt)菌株描述，给未知物一个具体(jt)的分类位置。命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。第1页/共38页第二页，共38页。（一）种的概念(ginin)种(species)：微生物的基本分类单位，具有(jyu)许多共同特征的菌株的集合。典型(dinxng)菌株（typestrain）模式种（typespecies）亚种型、菌株.1通用分类单元第2页/共38页第三页，共38页。细菌新种发表的要求1）在IJSB上发表2）国内发表应送副本给IJSB编辑，以获有效目录公布3）提供(tgng)模式种4）符合命名法规要求5）符合优先律第3页/共38页第四页，共38页。菌种保藏中心与菌种目录ATCC：美国(miu)典型菌种保藏中心CCTCC：中国典型菌种保藏中心：-下设：CCGMC、ACCC、CICC、CMCC等6个中心-菌种目录及菌种保藏和购买第4页/共38页第五页，共38页。二、学名的命名(mngmng)及有关法规 双名法：Bacillussubtilis三名法：Acetobacterpasteurianussubsp.pasteurianus名字的应用(yngyng)：BacillussubtilisCMCC63501BacillussubtilisCohn1874Bacillussp.Bacillusspp.缩写：B.subtilis第5页/共38页第六页，共38页。.2微生物在生物界的地位(dwi)五界系统：第6页/共38页第七页，共38页。三域学说(xushu)第7页/共38页第八页，共38页。第8页/共38页第九页，共38页。真核生物起源(qyun)的内共生学说第9页/共38页第十页，共38页。古细菌生物学特征(tzhng)：第10页/共38页第十一页，共38页。.3各大类微生物的分类系统(xtng)纲要一、细菌、古生菌分类(fnli)系统纲要BergeysManualofSystematicBacterialogy1,2版BergeysManualofDeterminativeBacterialogy19版1.古生菌：系统手册（二版）原核(yunh)生物-古生菌界（2门63属208种）-泉古生菌门-广古生菌门-细菌界第11页/共38页第十二页，共38页。第12页/共38页第十三页，共38页。2.细菌的分类系统手册（一版，19841989年，共4卷）卷类型(lixng)群（Section）主要代表Vol.1G-111section肠杆菌，假单孢菌，Vol.2G+1217section芽孢杆菌，梭菌，Vol.3古生菌等1825section甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌Vol.4产孢放线菌2633section链霉菌第13页/共38页第十四页，共38页。BergeysManualofSystematicBacteriology(2ed)Vol.1:TheArchaea&theDeeplyBranching&PhototrophicBacteria,(2001)Vol.2:Proteobacteria(2004)Vol.3:TheLowG+CGramPositives(2000)Vol.4:TheHighG+CGramPositives(2000)Vol.5ThePlanctomycetes,Spirochetes,Fibrobacters,Bacteriods&Fusobacteria(2001)第14页/共38页第十五页，共38页。3.真菌（Fungi）的分类(fnli)系统Ainsworth系统Thefungi,Ainsworth,1973AinsworthandBisbysDictionaryoftheFungi-7版，1983年，Hawksworth-8版，1995年，Hawksworth第15页/共38页第十六页，共38页。书355第16页/共38页第十七页，共38页。第17页/共38页第十八页，共38页。一、经典分类鉴定方法(fngf)（生理生化为主，形态为辅）通常(tngchng)指长期以来，在常规鉴定中普遍采用的（形态、生理、生化、生态、生活史、血清学反应等指标）第18页/共38页第十九页，共38页。传统分类的细菌(xjn)鉴定程序第19页/共38页第二十页，共38页。细菌自动鉴定(jindng)系统API数值鉴定(jindng)系统BBL鉴定(jindng)系统Biolog鉴定(jindng)系统程序(chngx)：1、辅助特征2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描自动鉴定打印结果第20页/共38页第二十一页，共38页。第21页/共38页第二十二页，共38页。二、现代分类鉴定(jindng)方法细菌(xjn)化石第22页/共38页第二十三页，共38页。二、现代分类鉴定(jindng)方法1微生物遗传型的鉴定(jindng)（1）DNA碱基比例(bl)的测定（G+C）mol%：(G+C)mol%值只能做否定判断；（G+C）mol%值差别5，属不同的种；差别10，属不同的属。（2）核酸分子杂交法第23页/共38页第二十四页，共38页。DNA-DNA分子(fnz)杂交原理：DNA分子(fnz)解链的可逆性和碱基配对的专一性。第24页/共38页第二十五页，共38页。DNA-DNA杂交(zjio)（固相杂交(zjio)法）单链DNA（待测菌株）转硝酸纤维素膜加入(jir)放射性标志参照菌DNA（单链）洗去未杂交DNA闪烁计数器计数测定放射强度第25页/共38页第二十六页，共38页。结论：1.DNA同源性60%（同种(tnzhn)）2.DNA同源性70%（同亚种）3.DNA同源性6070%（不同亚种）4.DNA同源性2060%（同属）第26页/共38页第二十七页，共38页。16srRNA作为细菌(xjn)进化的计时器生物共有(nyu)的一定的信息量（1542个核苷酸）一定的保守性便于比较研究第27页/共38页第二十八页，共38页。（4）16srRNA核苷酸序列(xli)分析DNA-PCR法提取(tq)DNAPCR扩增16SrRNAPCR产物纯化分析16SrRNA序列测定递交Genbank 检索第28页/共38页第二十九页，共38页。相似性结果的一般(ybn)判断：1.SAB95%同种2.SAB为8595%同属(tnsh)3.SAB85%不同属(tnsh)第29页/共38页第三十页，共38页。2细胞化学(huxu)组分的鉴定（放线菌）细胞结构成分壁肽聚糖、化学组分膜枝菌酸（棒杆菌酸；分枝菌酸）甲基萘醌全细胞水解(shuji)糖类第30页/共38页第三十一页，共38页。1.细胞壁化学类型(lixng)（分为9种类型(lixng)）-氨基(nj)酸：DAP（二氨基(nj)庚二酸）、Gly、Lys、Asp、Orn-糖类：阿拉伯糖、半乳糖第31页/共38页第三十二页，共38页。（2）全细胞(xbo)水解液的糖型糖类型特征(tzhng)糖类A半乳糖、阿拉伯糖、B马杜拉糖C无特征(tzhng)糖类D木糖、阿拉伯糖E半乳糖第32页/共38页第三十三页，共38页。3数值(shz)分类法（统计分类法）-相似(xins)系数的计算；（1）菌株选择(xunz)（OUT操作分类单位）（2）选择(xunz)实验项目（3）数字编码（4）计算机分析第33页/共38页第三十四页，共38页。-列出相似(xins)度矩阵第34页/共38页第三十五页，共38页。-将矩阵(jzhn)图转换成树状谱第35页/共38页第三十六页，共38页。结果分析：1.S（相似值）85%（同种）2.S（相似值）65%（同属(tnsh)）3.S（相似值）65%（亲缘关系较远）第36页/共38页第三十七页，共38页。数值(shz)分类法与传统分类法的比较。第37页/共38页第三十八页，共38页。
