第四章病毒的命名和分类.ppt

第四章第四章 病毒的分类与命名病毒的分类与命名 一、病毒的分类一、病毒的分类（一）病毒分类的发展历程（一）病毒分类的发展历程n1937年年：Levadifi&Leptin根根据据病病毒毒对对组组织织的的亲亲和和性性进行分类；进行分类；n1948年年：Holmes 提提出出根根据据病病毒毒感感染染引引起起的的症症状状来来分分类；类；n1950年：国际微生物学会提出分类的八项原则；年：国际微生物学会提出分类的八项原则；n1953年：年：Andremes提出按病毒的理化特性来分；提出按病毒的理化特性来分；n1963年年：国国际际微微生生物物命命名名委委员员会会病病毒毒学学分分会会提提出出新的八项分类原则；新的八项分类原则；n1966年年成成立立国国际际病病毒毒命命名名委委员员会会（international committee on nomenclature of virus,ICNV）；1971年年发发表表第第一一份份报报告告：500多多种种病病毒毒分分成成43个个病毒属（组）；病毒属（组）；n1973年年 更更 名名 为为 国国 际际 病病 毒毒 分分 类类 委委 员员 会会（international committee on taxonomy of virus,ICTV）；）；n最新的病毒分类报告：第六次报告（最新的病毒分类报告：第六次报告（1995年）年）n现现在在已已知知的的病病毒毒有有3600多多种种，它它们们分分别别属属于于71个病毒科个病毒科;n其其中中动动物物病病毒毒（包包括括脊脊椎椎动动物物病病毒毒和和无无椎椎脊脊动动物病毒）有物病毒）有2000余种，分属余种，分属27个病毒科个病毒科;（二）分类依据（二）分类依据1 1病毒的形态学特征病毒的形态学特征病毒粒子的大小和形状；病毒粒子的大小和形状；有无表面纤突和纤突的特征；有无表面纤突和纤突的特征；有无囊膜；有无囊膜；衣壳对称型和结构；衣壳对称型和结构；2 2理化学特性理化学特性n病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数；病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数；n对酸碱的稳定性；对酸碱的稳定性；n对热的稳定性；对热的稳定性；n对两价阳离子的稳定性；对两价阳离子的稳定性；n对去污剂的稳定性；对去污剂的稳定性；n对脂溶剂的稳定性；对辐射的稳定性。对脂溶剂的稳定性；对辐射的稳定性。3 3基因组基因组n核酸类型：核酸类型：DNADNA或或RNARNAn基因组大小；线状还是环状；基因组大小；线状还是环状；n单股还是双股单股还是双股n是是整整个个的的还还是是分分节节段段的的，节节段段的的大大小小和和数数目目4.4.基基因因组组的的复复制制策策略略、开开放放阅阅读读框框架架的的数数目目和和位位置置、转转录录特特征征、翻翻译译特特征征、翻译后加工特征。翻译后加工特征。5 5蛋白质蛋白质 结结构构蛋蛋白白的的数数目目、大大小小和和功功能能活活性性，非非结结构构蛋蛋白白的的数数目目、大大小小和和功功能能活活性性，蛋蛋白白质质的的特特殊殊功功能能活活性性（转转录录酶酶、反反转转录录酶酶、血血凝凝素素、神神经氨酸酶）经氨酸酶）6 6脂质、糖类含量和特性脂质、糖类含量和特性 7 7在细胞培养中的生长特性在细胞培养中的生长特性n对细胞种类的特异性；对细胞种类的特异性；n病毒蛋白的聚集场所；病毒蛋白的聚集场所；n病毒粒子的装配场所；病毒粒子的装配场所；n病毒粒子成熟和释放的部位和性质。病毒粒子成熟和释放的部位和性质。8 8抗原性抗原性n与其他相关病毒的血清学关系与其他相关病毒的血清学关系9 9生物学特性生物学特性n自自然然宿宿主主范范围围、传传播播方方式式、传传播播介介体体，地地理理分布、致病性及与疾病的关系；分布、致病性及与疾病的关系；n组织嗜性和组织病理学。组织嗜性和组织病理学。二病毒的命名规则二病毒的命名规则（一）一般规则：（一）一般规则：1病病毒毒的的分分类类和和命命名名应应是是国国际际性性的的，应应普普遍遍适用于所有病毒适用于所有病毒;2.通通用用的的病病毒毒分分类类系系统统采采用用目目、科科、亚亚科科、属属和和种种的的等等级级制制度度，在在种种的的命命名名尚尚不不完完善善的情况下，许多病毒可用国际通用的俗名。的情况下，许多病毒可用国际通用的俗名。3ICTV不不统统一一规规定定病病毒毒种种以以下下的的分分类类和和命命名名。关关于于血血清清型型、基基因因型型、病病毒毒株株、变变异异株等的命名由公认的国际专家组决定。株等的命名由公认的国际专家组决定。4对对人人工工产产生生的的病病毒毒和和实实验验室室杂杂交交株株不不予予分分类类考考虑虑，这这些些病病毒毒的的命命名名也也同同样样由由公公认认的的国际专家组决定。国际专家组决定。n5当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表的文献上描述后，才能建立一个类，以便的文献上描述后，才能建立一个类，以便与相似的类区别。同样，命名一个病毒时，与相似的类区别。同样，命名一个病毒时，该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表以明确区别于相似的病毒以明确区别于相似的病毒（二）关于类和病毒的命名原则（二）关于类和病毒的命名原则6现现有有的的类类和和病病毒毒的的名名称称无无论论是是否否适适用用均均应应予保留。予保留。7在类和病毒的命名中不遵守优先率。在类和病毒的命名中不遵守优先率。8不使用人名。不使用人名。9类类和和病病毒毒的的名名称称应应便便于于使使用用，容容易易记记忆忆，最好使用听起来悦耳的名称。最好使用听起来悦耳的名称。10不不使使用用上上标标、下下标标、连连字字符符、斜斜杠杠和和希希腊腊字字母。母。11新新名名称称不不应应与与已已通通过过的的名名称称有有重重复复，应应选选用用与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。12如如果果缩缩拼拼词词对对病病毒毒学学家家有有意意义义，且且得得到到公公认认的国际专家组的推荐，可以接受作为类的名称。的国际专家组的推荐，可以接受作为类的名称。关于类和病毒的命名原则关于类和病毒的命名原则13由一个类或病毒的名称所由一个类或病毒的名称所隐含的任何意隐含的任何意义义都会因在名称中涉及不是所有成员或潜都会因在名称中涉及不是所有成员或潜在成员所具有的特征，以及不是均等地适在成员所具有的特征，以及不是均等地适用于不同类的特征而排斥该类中的合适成用于不同类的特征而排斥该类中的合适成员病毒，员病毒，这种情况应当避免。这种情况应当避免。14新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的工应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的工作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础，作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础，此时可不必考虑国家来源；在有一个以上的候此时可不必考虑国家来源；在有一个以上的候选名称时，相应的研究组或分委员会向选名称时，相应的研究组或分委员会向ICTV执执行委员会提出建议，由执行委员会决定取哪一行委员会提出建议，由执行委员会决定取哪一个名称。个名称。15新的名称和名称的变更应以分类建议格式提新的名称和名称的变更应以分类建议格式提交交ICTV。16病病毒毒种种是是组组成成一一个个复复制制系系并并占占有有一一个个特特定定生生态环境的一类多原则病毒。态环境的一类多原则病毒。17种名应由少而实用的字组成种名应由少而实用的字组成 18种种名名，通通常常与与株株名名一一起起，必必须须表表示示明明确确的的特特征，不涉及属名或科名。征，不涉及属名或科名。19已经广泛应用的数字、字母及其组合可用作已经广泛应用的数字、字母及其组合可用作种名性质形容词。但新提出的连续数字、字母种名性质形容词。但新提出的连续数字、字母或其组合不单独接受作为种名性质形容词。或其组合不单独接受作为种名性质形容词。n20ICTV通过新提议的种、种名和型名的通过新提议的种、种名和型名的程序分两步：首先，给予暂时性通过，这程序分两步：首先，给予暂时性通过，这样的建议将发表在样的建议将发表在ICTV报告中；然后，经报告中；然后，经过三年的等候期，如果不撤销或修正，该过三年的等候期，如果不撤销或修正，该建议将得到最后通过。建议将得到最后通过。（三）关于属的规则（三）关于属的规则n21属是一组具有某些共同特性的种。属是一组具有某些共同特性的种。n22属名应是一个以属名应是一个以“Virus”结尾的单词。结尾的单词。n23通过一个属名的同时需通过一个代表种。通过一个属名的同时需通过一个代表种。n瘟病毒属：瘟病毒属：Pestivirusn冠状病毒属：冠状病毒属：Coronavirus（四）关于亚科的规则（四）关于亚科的规则n24亚亚科科是是一一组组具具有有某某些些共共同同特特性性的的属属。只只有有当需要处理复杂等级结构问题时才使用亚科。当需要处理复杂等级结构问题时才使用亚科。n25亚亚科科名名应应是是一一个个以以“Virinae”结结尾尾的的单单词。词。E.g.Retrovirinae：反转录病毒亚科反转录病毒亚科 Spumavirinae：泡沫病毒亚科泡沫病毒亚科（五）关于科的规则（五）关于科的规则 n26科科是是一一组组具具有有某某些些共共同同特特性性的的属属（不不管这些属是否组成了亚科）。管这些属是否组成了亚科）。n27科科名名应应是是一一个个以以“Viridae”结结尾尾的的单单词。词。n28通过一个科名的同时需通过一个属名。通过一个科名的同时需通过一个属名。疱疹病毒科：疱疹病毒科：Herpesviridae腺病毒科：腺病毒科：Adenoviridae（六）关于目的规则（六）关于目的规则 n29目是一组具有某些共同特性的科。目是一组具有某些共同特性的科。n30目目名名应应是是一一个个以以“Virales”结结尾尾的的单单词。词。动物病毒的命名现状：动物病毒的命名现状：1 1、种的命名、种的命名1 1）大大多多用用其其所所引引起起疾疾病病的的名名称称，后后加加“病病毒毒”两两字字 脊脊髓髓灰灰质质炎炎病病毒毒、猪猪瘟瘟病病毒毒、流流感感病病毒毒2 2）在病名前加上最初发现该病毒的地名）在病名前加上最初发现该病毒的地名日本乙型脑炎病毒、东方型马脑炎病毒日本乙型脑炎病毒、东方型马脑炎病毒3 3）直接用地名称呼病毒）直接用地名称呼病毒新城疫病毒新城疫病毒（Newcastle disease virus)Newcastle disease virus)4 4）用人名称呼）用人名称呼马马 立立 克克 氏氏 病病 病病 毒毒(Mareks Mareks disease disease virus)virus)2 2、科、属的命名科、属的命名1 1）依据病毒粒子的形态和理化学特性）依据病毒粒子的形态和理化学特性小小RNARNA病毒科、反转录病毒科、轮状病毒属病毒科、反转录病毒科、轮状病毒属2 2）依据病毒所引起的病变的性质）依据病毒所引起的病变的性质疱疹病毒科、痘病毒科疱疹病毒科、痘病毒科3 3）以病毒酶作用的基质）以病毒酶作用的基质正粘病毒科、副粘病毒科正粘病毒科、副粘病毒科4 4）以病毒的最初分离部位）以病毒的最初分离部位腺病毒科腺病毒科5 5）感染宿主的部位）感染宿主的部位鼻病毒属、肠道病毒属鼻病毒属、肠道病毒属6 6）以几个属的缩拼词作为科名）以几个属的缩拼词作为科名乳多空病毒科乳多空病毒科流感病毒的命名方法流感病毒的命名方法1.国际上通用的流感病毒命名方法国际上通用的流感病毒命名方法 型型别别/分分离离地地点点/分分离离序序号号/分分离离时时间间（年年代代）（血凝素和神经氨酸酶序号）（血凝素和神经氨酸酶序号）e.g A/Hongkong/1/68（H3N2）A/京科京科/1/56（H1N1）H：hemagglutinin 血凝素血凝素N：neuraminidase 神经氨酸酶神经氨酸酶流感病毒的命名方法流感病毒的命名方法2.动动物物流流感感病病毒毒的的命命名名则则在在型型别别与与分分离离地地点点之之间加上动物宿主名称间加上动物宿主名称 e.g 甲甲/马马/布拉格布拉格/1/56（H1N1）三、三、Baltimore 的分类系统的分类系统n以以mRNA为核心：根据病毒的为核心：根据病毒的DNA或或RNA是是与与mRNA互补互补(-）和不互补）和不互补（+)而将病毒分而将病毒分为为6类。类。II类（+DNA）I类（DNA）mRNAIII类（RNA）V类（-RNA）VI类IV类+RNA一一 DNA病毒病毒（一）单链（一）单链DNA病毒病毒 细小病毒科（细小病毒科（Parvoviridae)：猪细小病毒猪细小病毒（PPV）圆环病毒科（圆环病毒科（Circoviridae)：猪圆环病毒猪圆环病毒（PCV）四、动物病毒的分类现状四、动物病毒的分类现状（二）二）双链双链DNA病毒病毒 痘病毒科（痘病毒科（Poxviridae)：痘苗病毒、天花病毒痘苗病毒、天花病毒 疱疹病毒科（疱疹病毒科（Herpesviridae)：伪狂犬病病毒伪狂犬病病毒（PRV）、）、马立克氏病病毒（马立克氏病病毒（MDV）、）、鸡传染性鸡传染性喉气管炎病毒（喉气管炎病毒（ILTV）、）、鸭瘟病毒（鸭瘟病毒（DPV）、）、牛牛传染性鼻气管炎病毒（传染性鼻气管炎病毒（IBRV）腺病毒科（腺病毒科（Adenoviridae)：减蛋综合症病毒减蛋综合症病毒（EDS76）乳多空病毒科（乳多空病毒科（Papovaviridae)：猴空泡病猴空泡病毒毒40(SV40)非洲猪瘟病毒科（非洲猪瘟病毒科（Asfarviridae)：非洲猪瘟非洲猪瘟病毒病毒 嗜肝嗜肝DNA病毒科（病毒科（Hepadnaviridae)：人乙人乙型肝炎病毒（型肝炎病毒（HBV）虹彩病毒科（虹彩病毒科（Iridoviridae)：杆状病毒科（杆状病毒科（Baculoviridae)：二二 RNA反转录病毒反转录病毒 反转录病毒科（反转录病毒科（Retroviridae)：马传马传染性贫血病毒（染性贫血病毒（EIAV）、）、人免疫缺陷病人免疫缺陷病病毒（病毒（HIV）三三 RNA病毒病毒（一）双股（一）双股RNA病毒病毒 呼肠孤病毒科（呼肠孤病毒科（Reoviridae)：蓝舌病病蓝舌病病毒（毒（BTV）、）、轮状病毒轮状病毒 双双RNA病毒科（病毒科（Birnaviridae)：鸡传染鸡传染性法氏囊病病毒（性法氏囊病病毒（IBDV）（二）单股负链（二）单股负链RNA病毒（不分节段）病毒（不分节段）副粘病毒科（副粘病毒科（Paramyxoviridae)：新城疫病毒新城疫病毒（NDV）弹状病毒科（弹状病毒科（Rhabdoviridae)：狂犬病病毒狂犬病病毒（RV）、）、水疱性口炎病毒（水疱性口炎病毒（VSV）丝状病毒科（丝状病毒科（Filoviridae)：埃博拉病毒（埃博拉病毒（EBV）(三）单股负链三）单股负链RNA病毒（分节段）病毒（分节段）正粘病毒科（正粘病毒科（Orthomyxviridae)：流感病毒流感病毒（IFV）布尼病毒科（布尼病毒科（Bunyaviridae)：嵌砂病毒科（嵌砂病毒科（Arenaviridae)：（四）单股正链（四）单股正链RNA病毒病毒微微RNA病毒科（病毒科（Picornaviridae)：口蹄疫口蹄疫病毒（病毒（FMDV）、）、猪水疱病病毒（猪水疱病病毒（SVDV）、）、鸭肝炎病毒（鸭肝炎病毒（DHV）、）、甲肝病毒（甲肝病毒（HAV）披膜病毒科（披膜病毒科（Togaviridae)：黄病毒科（黄病毒科（Flaviviridae)：流行性乙型脑流行性乙型脑炎病毒（炎病毒（JEV）、）、猪瘟病毒（猪瘟病毒（HCV）、）、丙丙型肝炎病毒（型肝炎病毒（HCV）动脉炎病毒科（动脉炎病毒科（Arteriviridae)：猪繁殖与呼吸综猪繁殖与呼吸综合征病毒（合征病毒（PRRSV）冠状病毒科（冠状病毒科（Coronaviridae)：传染性支气管炎传染性支气管炎病毒（病毒（IBV）、）、猪流行性胃肠炎病毒（猪流行性胃肠炎病毒（TGEV）、）、猪流行性腹泻病毒（猪流行性腹泻病毒（PEDV）杯状病毒科（杯状病毒科（Caliciviridae)：猪水疱疹病毒猪水疱疹病毒（SVEV）思考题思考题1.动物病毒的分类原则是什么？动物病毒的分类原则是什么？2.目、科、亚科、属的词尾分别是什么？目、科、亚科、属的词尾分别是什么？3.请举例说明国际流感病毒的命名方法？请举例说明国际流感病毒的命名方法？4.一些主要的病毒分属于哪个科？一些主要的病毒分属于哪个科？