生物化学核酸化学.pptx

第一节 概 述核酸核酸(nucleic acid)(nucleic acid)以以以以核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。DNADNADNADNA（D D D Deoxyriboeoxyriboeoxyriboeoxyribon n n nucleic ucleic ucleic ucleic a a a acid)cid)cid)cid)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 RNARNARNARNA（R R R Riboiboiboibon n n nucleic ucleic ucleic ucleic a a a acid)cid)cid)cid)核糖核酸核糖核酸核糖核酸核糖核酸第1页/共195页1868年年 Fridrich Miescher从脓细胞中提取从脓细胞中提取“核素核素”1944年年 Avery等人等人证实证实DNA是遗传物质是遗传物质1953年年 Watson和和Crick发现发现DNA的双螺旋结构的双螺旋结构1968年年 Nirenberg发现发现遗传密码遗传密码1975年年 Temin和和Baltimore发发现现逆转录酶逆转录酶1981年年 Gilbert和和Sanger建建立立DNA 测序方法测序方法1985年年 Mullis发明发明PCR 技术技术1990年年 美国启动美国启动人类基因组计划人类基因组计划(HGP)1994年年 中国人类基因组计划启动中国人类基因组计划启动2001年年 美、英等国美、英等国完成人类基因组计划基本框架完成人类基因组计划基本框架一、核酸的发现和研究工作进展 第2页/共195页18681868年的某天瑞士的生物化学家米歇尔(Miescher)(Miescher)研究一个病人的绷带，小心地将绷带上粘着的病人伤口处的物质洗下来。洗脱物中含有许多脓细胞。他向其中加入酒精，将细胞中的脂肪类物质除去，之后又加入含有胃蛋白酶的提取液清除各种杂蛋白，这样，他就可以拿到纯的浓细胞的细胞核了。于是米歇尔开始研究这些核。结果他意外地发现核中有一种从未认识到的新物质，并起名为“核素”。这就是现在我们知道的DNADNA。经过后人的研究，核素为酸性物质，含有三种成分：糖、磷酸、有机碱。又发现糖少了一个氧。称之为脱氧核糖。米歇尔的发现第3页/共195页哪些人用什么方法最终证明了遗传的物质基础是DNA呢？1.1.格里菲斯经典转化实验（19281928）及埃弗里、麦克劳德、麦卡蒂等人的转化补充实验（19411941）。2.2.赫西和蔡斯大肠杆菌T2T2噬菌体感染大肠杆菌实验。第4页/共195页R型菌型菌（粗糙、（粗糙、无毒性）无毒性）S型菌型菌（光滑、（光滑、有毒性）有毒性）多多糖糖类类荚荚膜膜格里菲斯肺炎双球菌转化实验第5页/共195页将将R型活菌注入小鼠体内型活菌注入小鼠体内一段时间后一段时间后第6页/共195页将将S型活菌注入小鼠体内型活菌注入小鼠体内一段时间后一段时间后第7页/共195页将杀死的将杀死的S型菌注入小鼠体内型菌注入小鼠体内一段时间后一段时间后第8页/共195页将将R型活菌与杀死的型活菌与杀死的S型菌注入小鼠体内型菌注入小鼠体内一段时间后一段时间后细菌发生转化，性状的转化可以遗传。细菌发生转化，性状的转化可以遗传。第9页/共195页埃弗里、麦克劳德、麦卡蒂转化补充实验从S型肺炎球菌活体上取得蛋白质、荚膜、DNA、RNA，分别与R型肺炎球菌混合后注入到小白鼠体内，结果被注入DNA的小白鼠死亡，其它小白鼠存活。第10页/共195页DNA蛋白质蛋白质多糖多糖RNADNA是是遗遗传传物物质质只有DNA引起R型肺炎球菌转化第11页/共195页 赫西和蔡斯实验赫西和蔡斯实验噬菌体侵染细菌的实验噬菌体侵染细菌的实验（含（含S）（含（含P）第12页/共195页用放射性同位素用放射性同位素35S标记外壳蛋白质标记外壳蛋白质细菌内无放射性细菌内无放射性第13页/共195页用放射性同位素用放射性同位素32P标记内部标记内部DNA细菌内有放射性细菌内有放射性DNA是是真真正正的的遗遗传传物物质质第14页/共195页DNA主要的遗传物质主要的遗传物质注：DNA不是唯一的遗传物质，较少的微生物也靠RNA进行遗传。第15页/共195页二、核酸的分类及分布、功能二、核酸的分类及分布、功能(deoxyribonucleic acid,DNA)(ribonucleic acid,RNA)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 核糖核酸核糖核酸 90%90%以以上上分分布布于于细细胞胞核核，其其余余分分布布于于核外核外如线粒体，叶绿体，质粒等。如线粒体，叶绿体，质粒等。主要存在于细胞质中携带遗传信息，决定细胞和个携带遗传信息，决定细胞和个体的基因型体的基因型(genotype)。从从DNA转录遗传信息，并指导转录遗传信息，并指导蛋白质的合成。蛋白质的合成。某些病毒某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。也可作为遗传信息的载体。第16页/共195页第二节 核酸的组成第17页/共195页元素组成主要元素组成：主要元素组成：C、H、O、N、P(911%)与蛋白质比较，核酸与蛋白质比较，核酸一般不含一般不含S，而，而P的含量较的含量较为稳定，占为稳定，占9-11%。基本构成单位：核苷酸基本构成单位：核苷酸(nucleotide)核苷酸由核苷酸由戊糖、磷酸和含氮碱基戊糖、磷酸和含氮碱基三部分构成三部分构成第18页/共195页5-磷酸核苷酸的基本结构OO（N=A、G、C、U、T）HH(O)H12NOHCH2HH543PO-OOO-核糖核糖磷酸磷酸碱基碱基第19页/共195页 组成核酸的戊糖有两种。组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为所含的糖为 -D-2-脱氧核糖；脱氧核糖；RNA所含的糖则为所含的糖则为-D-核糖。核糖。(一一)、戊糖、戊糖RiboseRiboseDeoxyriboseDeoxyribose第20页/共195页第21页/共195页(二二)组成核酸的碱基组成核酸的碱基腺嘌呤腺嘌呤Adenine第22页/共195页组成核酸的碱基组成核酸的碱基鸟嘌呤鸟嘌呤guanine第23页/共195页组成核酸的碱基组成核酸的碱基尿嘧啶尿嘧啶uracil第24页/共195页组成核酸的碱基组成核酸的碱基胞嘧啶胞嘧啶cytosine第25页/共195页组成核酸的碱基组成核酸的碱基胸腺嘧啶胸腺嘧啶thymine第26页/共195页碱碱 基基第27页/共195页第28页/共195页碱基的结构特征碱基的结构特征碱碱基基都都具具有有芳芳香香环环的的结结构构特特征征。嘌嘌呤呤环环和和嘧嘧啶啶环环均均呈呈平平面面或或接接近近于于平平面面的的结结构。构。碱基的芳香环与环外基团可以发生酮式碱基的芳香环与环外基团可以发生酮式烯醇式或胺式烯醇式或胺式亚胺式互变异构。亚胺式互变异构。第29页/共195页酮酮式式烯烯醇醇式式互互变变异异构构第30页/共195页胺胺式式亚亚胺胺式式互互变变异异构构第31页/共195页第32页/共195页(三三)、核苷（、核苷（nucleoside）核苷核苷 戊糖戊糖+碱基碱基 糖与碱基之间的糖与碱基之间的C-NC-N键，称为键，称为C-NC-N糖苷键糖苷键1122334455(OH)1122334455(OH)第33页/共195页OHOH2COHOHOH12345核 糖NNNNHHHH9腺嘌呤腺 苷第34页/共195页OHOH2COHOHOH12345核 糖OHOH2COHOH12345核 糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷（）第35页/共195页假尿苷（假尿苷（）次黄苷（肌苷）I黄嘌呤核苷 X二氢尿嘧啶核苷 D取代核苷的表示方式7-甲基鸟苷 m7G5 5OHAdenosine Guanosine Cytidine Uridine第36页/共195页 2、稀有核苷酸：稀有碱基、稀有核苷酸：稀有碱基/核苷核苷/核苷酸核苷酸 3、核苷酸的其他形式、核苷酸的其他形式n多磷酸核苷（多磷酸核苷（NDP、NTP)n环化核苷酸（环化核苷酸（cAMP、cGMP等）等）n辅酶或辅基（辅酶或辅基（NAD、NADP、FAD、CoA等，均含有等，均含有AMP），），n活性代谢物（活性代谢物（UDPG、CDP-胆碱，等）胆碱，等）1、核苷酸的组成：含氮碱基、戊糖和磷酸。、核苷酸的组成：含氮碱基、戊糖和磷酸。（四）核苷酸（四）核苷酸nucleotidenucleotide第37页/共195页核苷酸是核苷的磷酸酯核苷酸是核苷的磷酸酯。作为作为DNADNA或或RNARNA结构单元的结构单元的核苷酸分别是核苷酸分别是5-5-磷酸磷酸-脱氧核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸和5-5-磷酸磷酸-核糖核苷酸。核糖核苷酸。核苷酸核苷酸 核苷核苷+磷酸磷酸 戊糖戊糖+碱基碱基+磷酸磷酸1 1 核苷酸的组成核苷酸的组成第38页/共195页PPPPPPPP常见（脱氧）核苷酸的结构和命名鸟嘌呤核苷酸鸟嘌呤核苷酸（GMP）尿嘧啶核苷酸尿嘧啶核苷酸（UMP）胞嘧啶核苷酸胞嘧啶核苷酸（CMP）腺嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸（AMP）脱氧腺嘌呤核苷酸脱氧腺嘌呤核苷酸（dAMP）脱氧鸟嘌呤核苷酸脱氧鸟嘌呤核苷酸（dGMP）脱氧胞嘧啶核苷酸脱氧胞嘧啶核苷酸（dCMP）脱氧胸腺嘧啶核苷酸脱氧胸腺嘧啶核苷酸（dTMP）第39页/共195页2.2.稀有核苷酸稀有核苷酸修饰成分修饰成分l核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多，大部分是上述碱稀有碱基的种类很多，大部分是上述碱基的甲基化产物。基的甲基化产物。第40页/共195页3 3 核苷酸的其他形式核苷酸的其他形式ATP是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它的结构如下：（1）ATP(腺嘌呤核糖核苷三磷酸)第41页/共195页OHOH2COHOHOH12345核 糖NNNNHHHH9腺嘌呤腺 苷PO-OO腺苷-5-磷酸AMPOP O-OOADPATPP O-OO第42页/共195页ATPATP的性质的性质ATP ATP 分子的最显著特点是含有分子的最显著特点是含有两个高能磷酸键。两个高能磷酸键。ATPATP水解时水解时,可以释放出大量自由能。可以释放出大量自由能。ATP ATP 是生物体内最重要的能量是生物体内最重要的能量转换中间体。转换中间体。ATP ATP 水解释放出水解释放出来的能量用于推动生物体内各来的能量用于推动生物体内各种需能的生化反应。种需能的生化反应。ATP ATP 也也是是一一种种很很好好的的磷磷酰酰化化剂剂。磷磷酰酰化化反反应应的的底底物物可可以以是是普普通通的的有有机机分分子子，也也可可以以是是酶酶。磷磷酰酰化化的的底底物物分分子子具具有有较较高高的的能能量量（活活化化分分子子），是是许许多多生生物物化学反应的激活步骤。化学反应的激活步骤。第43页/共195页 GTP(GTP(鸟嘌呤核糖核苷三磷酸鸟嘌呤核糖核苷三磷酸)GTPGTP是是生生物物体体内内游游离离存存在在的的另另一一种种重重要要的的核核苷苷酸酸衍衍生生物物。它它具具有有ATP ATP 类类似似的的结结构构,也也是是一一种种高高能化合物。能化合物。GTPGTP主主要要是是作作为为蛋蛋白白质质合合成成中中磷磷酰酰基基供供体体。在在许许多情况下多情况下,ATP,ATP 和和 GTP GTP 可以相互转换。可以相互转换。第44页/共195页（2 2）cAMP cAMP 和和 cGMPcGMPcAMP(3cAMP(3,5,5-环环腺腺嘌嘌呤呤核核苷苷一一磷磷酸酸)和和 cGMPcGMP(3 3,5,5-环环鸟鸟嘌嘌呤呤核核苷苷一一磷磷酸酸)的的主主要要功功能是作为细胞的第二信使。能是作为细胞的第二信使。cAMP cAMP 和和 cGMP cGMP 的的环环状状磷磷酯酯键键是是一一个个高高能能键键。在在 pH pH 7.4 7.4 条条件件下下,cAMP cAMP 和和 cGMP cGMP 的的水水解解能能约约为为43.9 43.9 kj kj/mol/mol，比比 ATP ATP 水水解解能能高高得得多。多。第45页/共195页环化磷酸化环化磷酸化l cAMPl cGMP第46页/共195页（3 3）辅酶或辅基辅酶或辅基第47页/共195页作为核酸的单体作为核酸的单体:各种核苷三磷酸和脱氧核苷三磷酸是各种核苷三磷酸和脱氧核苷三磷酸是体内合成体内合成RNA和和DNA合成的直接原料。合成的直接原料。在体内能量代谢中的作用在体内能量代谢中的作用：ATP能量能量“货币货币”UTP参加糖的互相转化与合成参加糖的互相转化与合成CTP参加磷脂的合成参加磷脂的合成GTP参加蛋白质和嘌呤的合成参加蛋白质和嘌呤的合成第二信使第二信使cAMP酶的辅助因子的结构成分（如NAD）第48页/共195页(五五)核苷酸的连接方式核苷酸的连接方式多多聚聚核核苷苷酸酸是是通通过过一一个个核核苷苷酸酸的的C C3 3-OH-OH 与与另另一一分分子子核核苷苷酸酸的的5 5-磷磷酸酸基基形形成成3 3,5,5-磷磷酸酸二二酯酯键键相相连连而而成的链状聚合物。成的链状聚合物。由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为DNADNA链；链；由核糖核苷酸聚合而成的则称为由核糖核苷酸聚合而成的则称为RNARNA链。链。第49页/共195页5 5 3 3 核酸分子中核苷酸之间的共价键3 -5 磷酸二酯键磷酸二酯键第50页/共195页第51页/共195页l5-5-磷酸端（常用磷酸端（常用5 5-P-P表示）；表示）；3-3-羟基端（常用羟基端（常用3 3-OH-OH表表示）示）l多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是注明它的方向是5353或是或是3535。多聚核苷酸的表示方式多聚核苷酸的表示方式DNA RNAT53OH U53OH OH OH OH OH 第52页/共195页在多聚核苷酸（在多聚核苷酸（DNADNA或或RNARNA）链中，由于构成核苷酸）链中，由于构成核苷酸单元的戊糖和磷酸基是相同的，体现核苷酸差别的单元的戊糖和磷酸基是相同的，体现核苷酸差别的实际上只是它所带的碱基，所以多聚核苷酸链结构实际上只是它所带的碱基，所以多聚核苷酸链结构也可表示为：也可表示为：在在讨讨论论有有关关核核酸酸问问题题时时，一一般般只只关关心心其其中中碱碱基基的的种种类和顺序，所以上式可以进一步简化为：类和顺序，所以上式可以进一步简化为：5PAPCPGPCPTPGPTPA3或5ACGCTGTA3 第53页/共195页HO-O OCH2 TO=PO-35OHHO-O OCH2 GO=PO-35OHO OCH2OHH AO=POO-35351PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTA第54页/共195页概 述核酸核酸(nucleic acid)(nucleic acid)以以以以核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携为基本组成单位的生物大分子，携带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。带和传递遗传信息。DNADNADNADNA（D D D Deoxyriboeoxyriboeoxyriboeoxyribon n n nucleic ucleic ucleic ucleic a a a acid)cid)cid)cid)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 RNARNARNARNA（R R R Riboiboiboibon n n nucleic ucleic ucleic ucleic a a a acid)cid)cid)cid)核糖核酸核糖核酸核糖核酸核糖核酸第55页/共195页元素组成主要元素组成：主要元素组成：C、H、O、N、P(911%)与蛋白质比较，核酸与蛋白质比较，核酸一般不含一般不含S，而，而P的含量较的含量较为稳定，占为稳定，占9-11%。基本构成单位：核苷酸基本构成单位：核苷酸(nucleotide)核苷酸由核苷酸由戊糖、磷酸和含氮碱基戊糖、磷酸和含氮碱基三部分构成三部分构成第56页/共195页核苷（核苷（nucleoside）核苷核苷 戊糖戊糖+碱基碱基 糖与碱基之间的糖与碱基之间的C-NC-N键，称为键，称为C-NC-N糖苷键糖苷键1122334455(OH)1122334455(OH)第57页/共195页OHOH2COHOHOH12345核 糖OHOH2COHOH12345核 糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷（）第58页/共195页核苷酸是核苷的磷酸酯核苷酸是核苷的磷酸酯。作为。作为DNADNA或或RNARNA结构单元的结构单元的核苷酸分别是核苷酸分别是5-5-磷酸磷酸-脱氧核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸和5-5-磷酸磷酸-核糖核苷酸。核糖核苷酸。核苷酸核苷酸 核苷核苷+磷酸磷酸 戊糖戊糖+碱基碱基+磷酸磷酸核苷酸的组成核苷酸的组成第59页/共195页核苷酸的连接方式核苷酸的连接方式多多聚聚核核苷苷酸酸是是通通过过一一个个核核苷苷酸酸的的C C3 3-OH-OH 与与另另一一分分子子核核苷苷酸酸的的5 5-磷磷酸酸基基形形成成3 3,5,5-磷磷酸酸二二酯酯键键相相连连而而成的链状聚合物。成的链状聚合物。由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为DNADNA链；链；由核糖核苷酸聚合而成的则称为由核糖核苷酸聚合而成的则称为RNARNA链。链。第60页/共195页l5-5-磷酸端（常用磷酸端（常用5 5-P-P表示）；表示）；3-3-羟基端（常用羟基端（常用3 3-OH-OH表表示）示）l多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是注明它的方向是5353或是或是3535。多聚核苷酸的表示方式多聚核苷酸的表示方式DNA RNAT53OH U53OH OH OH OH OH 第61页/共195页第三节 核酸的分子结构第62页/共195页一、一级结构（一、一级结构（primary structure）一级结构是指一级结构是指DNA分子中脱氧核苷酸的排列顺分子中脱氧核苷酸的排列顺序。核苷酸的排列顺序代表了遗传信息。序。核苷酸的排列顺序代表了遗传信息。1、核苷酸的连接方式：、核苷酸的连接方式：3,5 磷酸二酯键磷酸二酯键2、核酸的基本结构形式：多核苷酸链、核酸的基本结构形式：多核苷酸链n信息量：信息量：4nn末端：末端：5 端、端、3 端端n多核苷酸链的方向：多核苷酸链的方向：5端端3端端(由左至右由左至右)3、表示方法：结构式、线条式、文字缩写、表示方法：结构式、线条式、文字缩写DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。第63页/共195页字母式线条式结构式DNADNA一级结构的表示法第64页/共195页二、二、DNA的二级结构的二级结构双螺旋模型双螺旋模型(double helix model)19531953年年，J.J.WatsonWatson和和F.F.Crick Crick 在在前前人人研研究究工工作作的的基基础础上上，根根据据DNADNA结结晶晶的的X-X-衍衍射射图图谱谱和和分分子子模模型型，提提出出了了著著名名的的DNADNA双双螺螺旋旋结结构构模模型型，并并对对模模型型的的生生物物学学意意义义作作出出了了科学的解释和预测。科学的解释和预测。在在DNADNA分分子子中中，嘌嘌呤呤碱碱基基的的总总数数与与嘧嘧啶啶碱碱基基的的总总数相等。数相等。第65页/共195页 碱基组成分析碱基组成分析Chargaff 规规则：则：A=T；G C电位滴定证明，嘌呤与嘧啶的可解电位滴定证明，嘌呤与嘧啶的可解离基团由氢键连接。离基团由氢键连接。DNA纤维的纤维的X-线衍射图谱分析线衍射图谱分析 1.DNA双螺旋结构的研究背景双螺旋结构的研究背景WilkinsWilkins和和FranklinFranklin发现不同来源的发现不同来源的DNADNA纤维具有纤维具有相似的相似的X X射线衍射图谱。射线衍射图谱。第66页/共195页碱基组成规则碱基组成规则(Chargaff规则规则)nA=T，G=C；A+G=T+C(嘌呤与嘧啶的总数相等嘌呤与嘧啶的总数相等)n不受年龄、营养、性别及其他环境等影响不受年龄、营养、性别及其他环境等影响 ChargaffChargaff首先注意到首先注意到DNADNA碱基组成的某些规律性，在碱基组成的某些规律性，在年总结出年总结出DNADNA碱基组成的规律：碱基组成的规律：第67页/共195页沃森（左）和克里克与DNA分子双螺旋结构模型(1953年)第68页/共195页2.DNA2.DNA双螺旋结构的要双螺旋结构的要点点（1 1）DNADNA分分子子由由两两条条多多聚聚脱脱氧氧核核糖糖核核苷苷酸酸链链(简简称称DNADNA单单链链)组组成成。两两条条链链沿沿着着同同一一根根轴轴平平行行盘盘绕绕，形形成成右右手手双双螺螺旋旋结结构构。螺螺旋旋中中的的两两条条链链方方向向相相反反，即即其其中中一一条条链链的的方方向向为为5 5 端端3 3 端，而另一条链的方向为端，而另一条链的方向为3 3 端端5 5 端。端。第69页/共195页（2 2）嘌嘌呤呤和和嘧嘧啶啶碱碱基基位位于于螺螺旋旋的的内内侧侧，磷磷酸酸和和脱脱氧氧核核糖糖基基位位于于螺螺旋旋外外侧侧。碱碱基基平平面面与与螺螺旋旋轴轴垂垂直直，糖糖环环平平面面与与螺螺旋轴基本平行。旋轴基本平行。第70页/共195页（3 3）螺螺旋旋直直径径约约为为 2nm2nm，每每 1010个个核核苷苷酸酸形形成成一一个个螺螺旋旋，其其螺螺矩矩（即即螺螺旋旋旋旋转转一一圈圈的的高高度度）为为3.4 3.4 nm nm，每每条条链链相相邻邻两两个个碱碱基基平平面面之之间间的的距距离离为为0.34 0.34 nmnm。第71页/共195页（4 4）维持两条）维持两条DNADNA链相互结合的力是链间碱链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律规律:A:A与与T T结合，结合，G G与与C C结合，这种配对关系，结合，这种配对关系，称为碱基互补。称为碱基互补。A A和和T T之间形成两个氢键，之间形成两个氢键，G G与与C C之间形成三个氢键。之间形成三个氢键。在在DNADNA分分子子中中，嘌嘌呤呤碱碱基基的的总总数数与与嘧嘧啶啶碱碱基基的总数相等。的总数相等。第72页/共195页（5 5）螺旋表面形成大螺旋表面形成大沟沟(major groove)(major groove)及及小沟小沟(minor groove)(minor groove)，彼此相间排列。小，彼此相间排列。小沟较浅；大沟较深，沟较浅；大沟较深，是蛋白质识别是蛋白质识别DNADNA碱碱基序列的基础。基序列的基础。（6 6）氢键）氢键维持双链维持双链横横向稳定性向稳定性，碱基堆积碱基堆积力力维持双链维持双链纵向稳定纵向稳定性性。第73页/共195页碱基堆积力 是碱基对之间在垂直方向上的相互作用，可以使DNA分子层层堆积，分子内部形成疏水核心第74页/共195页双螺旋结构模型(B-DNA)（1）反平行双链：右手螺旋,脱氧核糖-磷酸骨架位于外侧，碱基对位于内侧,碱基对平面垂直纵轴（2）碱基互补配对：AT配对（两个氢键），GC配对（三个氢键）（3）右手双螺旋：螺距为3.4 nm，直径为2.0 nm，10bp/圈（4）表面功能区：小沟较浅；大沟较深，是蛋白质识别DNA碱基序列 的基础（5）维持结构稳定的力量：氢键维持双链横向稳定，碱基堆积力维持 螺旋纵向稳定第75页/共195页DNA的双螺旋结构的形成53535353磷酸磷酸核糖核糖碱基碱基T-A碱基对碱基对C-G碱基对碱基对第76页/共195页3.DNA双螺旋的构象类型双螺旋的构象类型B-DNA：92%相对湿度，接近细胞内的相对湿度，接近细胞内的DNA构象，与构象，与Watson 和和Crick提出的模型相似。提出的模型相似。A-DNA：75%相相对对湿湿度度，与与溶溶液液中中DNA-RNA杂杂交交分分子子的的构构象象相相似似，推推测测转转录录时时发发生生BA。其其碱碱基基平平面面倾倾斜斜20，螺螺距距与每一转碱基对数目都有变化。与每一转碱基对数目都有变化。Z-DNA：主主链链呈呈锯锯齿齿型型左左向向盘盘绕绕，直直径径约约1.8nm，螺螺距距4.5nm，每每一一转转含含12个个bp，只只有有小小沟沟。B-DNA与与Z-DNA的的相相互转换可能和基因的调控有关。互转换可能和基因的调控有关。第77页/共195页C-DNA：4446%相相对对湿湿度度，螺螺距距3.09nm，每每转转螺螺旋旋9.33个个碱碱基基对对，碱碱基基对对倾倾斜斜6。可可能能是是特特定定条条件件下下B-DNA和和A-DNA的的转化中间物。转化中间物。D-DNA：60%相相对对湿湿度度，DNA中中A、T序序列列交交替替的的区区域域。每每个个螺旋含螺旋含8个个bp，螺距，螺距2.43nm，碱基平面倾斜，碱基平面倾斜16。第78页/共195页DNA双螺旋的不同构象第79页/共195页第80页/共195页双螺旋双螺旋DNADNA的结构参数的结构参数类型类型旋转方向旋转方向螺旋直径螺旋直径（nm）螺距螺距（nm）每转碱基每转碱基对数目对数目碱基对间垂直碱基对间垂直距离（距离（nm）碱基对与水碱基对与水平面倾角平面倾角ADNABDNAZDNA右右右右左左2.32.01.82.83.44.51110120.2550.340.272007第81页/共195页DNA的双螺旋结构的意义 该该模模型型揭揭示示了了DNA作作为为遗遗传传物物质质的的稳稳定定性性特特征征，最最有有价价值值的的是是确确认认了了碱碱基基配配对对原原则则，这这是是DNA复复制制、转转录录和和反反转转录录的的分分子子基基础础，亦亦是是遗遗传传信信息息传传递递和和表表达达的的分分子子基基础础。该该模模型型的的提提出出是是本本世世纪纪生生命命科科学学的的重重大大突突破破之之一一，它它奠奠定定了了生生物物化化学学和和分分子子生生物物学学乃乃至至整整个个生生命命科科学学飞飞速发展的基石。速发展的基石。第82页/共195页DNA分子内分子内的三链结构的三链结构 多聚嘌呤多聚嘌呤多聚嘧啶多聚嘧啶DNA分子间的三链结构DNA三链间三链间的碱基配对的碱基配对T-A-TC-G-CDNA二级结构的多样性第83页/共195页DNA回文序列及几种结构形式回文序列回文序列发夹式结构发夹式结构十字形结构十字形结构中心区域中心区域第84页/共195页夫妻相思宋朝.李禺夫想妻（顺读）妻想夫（倒读）枯眼望遥山隔水，儿忆父兮妻忆夫，往来曾见几心知。寂寥长守夜灯孤。壶空怕酌一杯酒，迟回寄雁无音讯，笔下难成和韵诗。久别离人阻路途。途路阻人离别久，诗韵和成难下笔，讯音无雁寄回迟。酒杯一酌怕空壶。孤灯夜守长寥寂，知心几见曾来往，夫忆妻兮父忆儿。水隔山遥望眼枯。第85页/共195页三三 DNADNA的三级结构的三级结构双双螺螺旋旋进进一一步步扭扭曲曲,形形成成一一种种比比双双螺螺旋旋更更高高层层次次的的空空间间构构象象。包包括括：线线状状DNADNA形形成成的的纽纽结结、超超螺螺旋旋和和多多重重螺螺旋旋、环环状状DNADNA形形成成的的结结、超超螺螺旋旋和和连连环环等等,其中超螺旋是最常见的三级结构。其中超螺旋是最常见的三级结构。第86页/共195页第87页/共195页生物体内有些生物体内有些DNADNA是以双链环状是以双链环状DNADNA的形式存在，包括：的形式存在，包括：某些病毒某些病毒DNADNA某些噬菌体某些噬菌体DNADNA某些细菌染色体某些细菌染色体DNADNA细菌质粒细菌质粒DNADNA真核细胞中的线粒体真核细胞中的线粒体DNADNA、叶绿体、叶绿体DNADNA第88页/共195页环形环形DNADNA的不同构象的不同构象 松驰环、解链环、负超螺旋松驰环、解链环、负超螺旋 （1 1）松弛环形松弛环形DNADNA线形线形DNADNA直接环化直接环化（2 2）解链环形解链环形DNADNA线形线形DNADNA拧松后再环化拧松后再环化第89页/共195页（3 3）正超螺旋与负超螺旋正超螺旋与负超螺旋DNADNA线形线形DNADNA拧紧或拧松后再环化，成为超螺旋结构。拧紧或拧松后再环化，成为超螺旋结构。绳子的两股以右旋方向缠绕，如果在一端使绳子向缠紧绳子的两股以右旋方向缠绕，如果在一端使绳子向缠紧的方向旋转，再将绳子两端连接起来，会产生一个左旋的方向旋转，再将绳子两端连接起来，会产生一个左旋的超螺旋，以解除外加的旋转造成的胁变，这样的超螺的超螺旋，以解除外加的旋转造成的胁变，这样的超螺旋叫旋叫正超螺旋。正超螺旋。如果在绳子一端向松缠方向旋转，再将绳子两端连接起如果在绳子一端向松缠方向旋转，再将绳子两端连接起来，会产生一个右旋的超螺旋，以解除外加的旋转所造来，会产生一个右旋的超螺旋，以解除外加的旋转所造成的胁变，这样的超螺旋称成的胁变，这样的超螺旋称负超螺旋负超螺旋。第90页/共195页DNADNA超螺旋结构的形成第91页/共195页超螺旋状态的定量描述公式公式1 1：L=T+WL=T+W L L连环数（连环数（linking numberlinking number），），DNADNA双螺旋中一双螺旋中一条链以右手螺旋与另一条链缠绕的次数。条链以右手螺旋与另一条链缠绕的次数。T TDNADNA分子中的螺旋数（分子中的螺旋数（twisting numbertwisting number）W W超螺旋数或缠绕数（超螺旋数或缠绕数（writhing numberwrithing number）L=25,T=25,W=0松弛环形松弛环形1152010523L=23,T=25,W=2负超螺旋负超螺旋12148231613第92页/共195页L=25,T=25,W=0松弛环形松弛环形1152010523L=23,T=23,W=0解链环形解链环形15101520231510152025L=23,T=25,W=2负超螺旋负超螺旋121482316131510152023右手旋转拧松两匝后的线形右手旋转拧松两匝后的线形DNADNA超螺旋的形成超螺旋的拓超螺旋的拓扑学公式：扑学公式：L=T+W或或=+第93页/共195页DNADNA超螺旋结构形成的意义 使使DNADNA形成高度致密状态从而得以装入核中；形成高度致密状态从而得以装入核中；推推动动DNADNA结结构构的的转转化化以以满满足足功功能能上上的的需需要要。如如负负超超螺螺旋旋分分子子所所受受张张力力会会引引起起互互补补链链分分开开导导致致局局部部变性，利于复制和转录。变性，利于复制和转录。第94页/共195页DNA在真核生物细胞核内的组装在真核生物细胞核内的组装核小体(nucleosome)：由DNA和组蛋白构成。DNA：以超螺旋缠绕：以超螺旋缠绕在在组蛋白八聚体上组蛋白八聚体上组蛋白核心：组蛋白核心：H2B,H2A H2B,H2A,H3,H4,H3,H4各两分子对称聚各两分子对称聚集成组蛋白八聚体集成组蛋白八聚体 H1H1组蛋白在核小体之间组蛋白在核小体之间第95页/共195页组蛋白与DNA的结合第96页/共195页染色体包装的结构模型多级螺旋模型压缩倍数76405（8400）DNA 核小体 螺线管 超螺线管 染色单体2nm10nm30(10)nm400nm210m一级包装 二级包装 三级包装 四级包装第97页/共195页真核真核 双链线性双链线性DNA（dsDNA）第98页/共195页第99页/共195页第四节、第四节、DNA与基因组与基因组DNATranscription RNA（mRNA、tRNA、rRNA）TranslationProtein基因基因基因基因是DNA片段的核苷酸序列，DNA分子中最小的功能单位。结构基因调节基因基因组基因组（一）（一）DNA与基因与基因(gene)（genome）：某生物体（完整单倍体）所含全部基因的总和。第100页/共195页 bpbp（碱基对（碱基对）103 104 105 106 107 108 109 1010 1011 1012人人两栖类两栖类鱼类鱼类藻类藻类酵母酵母细菌细菌E.ColiE.Coli病毒病毒质粒质粒各种细胞、病毒和细菌质粒中基因组的大小第101页/共195页（二）原核生物基因组的特点（二）原核生物基因组的特点1.DNA大部分为结构基因，每个基因出现频率低。大部分为结构基因，每个基因出现频率低。2.功能相关基因串联在一起，并转录在同一功能相关基因串联在一起，并转录在同一mRNA中。中。3.有基因重叠现象。有基因重叠现象。ABCDEFG第102页/共195页（三）真核生物基因组的特点（三）真核生物基因组的特点1.重复序列单拷贝序列：在整个DNA中只出现一次或少数几次，主要为编码蛋白质的结构基因。中度重复序列：在DNA中可重复几十次到几千次。高度重复序列：可重复几百万次高度重复序列一般富含A-T或G-C，富含A-T的在密度梯度离心时在离心管中形成的区带比主体DNA更靠近管口；富含G-C的更靠近管底，称为卫星卫星DNA（satellite DNA）富含A-T富含G-C主体DNA第103页/共195页2.有断裂基因mRNA1 872bp内含子（内含子（intron)：基因中不为多肽编码，不在：基因中不为多肽编码，不在mRNA中出现。中出现。ABCDEG7 700bpF外显子（外显子（exons）：为多肽编码的基因片段。）：为多肽编码的基因片段。：由于基因中内含子的存在。例外例外：组蛋白基因(histongene)和干扰素基因(interferon gene)没有内含子。transcription第104页/共195页DNA的功能DNA的的基基本本功功能能是是以以基基因因的的形形式式荷荷载载遗遗传传信信息息，并并作作为为基基因因复复制制和和转转录录的的模模板板。它它是是生生命命遗遗传传的的物物质质基基础础，也也是是个个体体生生命命活活动动的信息基础。的信息基础。基基因因从从结结构构上上定定义义，是是指指DNA分分子子中中的的特特定定区区段段，其其中中的的核核苷苷酸酸排排列列顺顺序序决决定定了了基基因的功能。因的功能。第105页/共195页第五节第五节 RNARNA的结构与功能的结构与功能RNA分子是含短的不完全的螺旋区的多核苷酸链。第106页/共195页 信使信使RNA（messenger RNA，mRNA）：在蛋白）：在蛋白质合成中起模板作用；质合成中起模板作用；核糖体核糖体RNA（ribosomal RNA，rRNA）：与蛋）：与蛋白质结合构成核糖体（白质结合构成核糖体（ribosome）,核糖体是蛋白质合核糖体是蛋白质合成的场所；成的场所；转移转移RNA（transfer RNA，tRNA）：在蛋白质）：在蛋白质合成时起着携带活化氨基酸的作用。合成时起着携带活化氨基酸的作用。第107页/共195页RNA的一级结构的一级结构 RNA分分子子中中各各核核苷苷酸酸之之间间的的连连接接方方式式（3-5磷磷酸酸二二酯酯键键）和和排排列列顺顺序序叫叫做做RNA的一级结构的一级结构OHOHOH53 RNA与与DNA的差异的差异 DNA RNA糖糖 脱氧核糖脱氧核糖 核糖核糖碱基碱基 AGCT AGCU 不含稀有碱基不含稀有碱基 含稀有碱基含稀有碱基第108页/共195页RNARNA的结构特点的结构特点RNARNA是是单单链链分分子子，因因此此在在RNARNA分分子子中中，嘌嘌呤呤的的总数不一定等于嘧啶的总数总数不一定等于嘧啶的总数。RNARNA分分子子中中，部部分分区区域域也也能能形形成成双双螺螺旋旋结结构构，不