溶剂重组能-推导和应用66660.pptx
李象远李象远四川大学化工学院2005.5.22山东烟台phone:+86-28-85405233Fax:+86-28-85407797Solvent effect and continuum modelSolvent effectSupermoleculeModelContinuumModelSupermolecule-ContinuumModel总的溶剂化能的表达式:包含四个部分的贡献:a.静电能b.溶剂中形成溶质空穴的空穴化能c.溶质溶剂耦合色散能d.溶质溶剂耦合排斥能连续介质模型基本思想：溶剂：视为连续介质无结构，各向同性或各向异性只用一个宏观参量表示其性质：介电常数存在外场时，介质发生极化，产生诱导偶极或极化电荷（导体近似时，称屏蔽电荷）极化电荷是束缚电荷.溶质:电荷分布视为自由电荷.溶质-溶剂相互作用长程静电相互作用平衡静电自由能计算模型1Bornmodel(1920)离子体系（单极子），球空穴溶剂化能：Q:溶质电荷;a0:空穴半径s2点偶极模型Onsagermodel(点偶极,球空穴)考虑静电势的多极展开:四极矩八极矩溶剂化能表达式:3.多级展开方法（球空穴）PCM(Tomasi,1981)I-PCM(Tomasi,1999)COSMO(Klamt,1983)GB(Cramer,1991)4任意形状空穴的数值解GB-推广Born方法(SM程序)gkk为原子之间距离,k为k原子有效波恩半径d为原子对之间距离参数.计算步骤:1.指定原子半径构建空穴.2.计算有效原子波恩半径和原子间距离3.计算原子电荷集居.4.利用公式计算溶剂化能.PCM从电磁场理论的角度建立其它电荷(自由Q和极化q)在P点的电场强度E与P点极化电荷的关系.严格解(场强和极化电荷密度之间的关系)spnE离散化处理离散化处理矩阵形式相互作用极化电荷真空电势C-PCM或称COSMO在积分方程公式化PCM即IEF-PCM的基础上,对介质引入类导体假设,即:孔穴表面电势处处相等为常数,在二元方程组中消去电势变量,极化电荷密度和溶质电荷密度之间的关系:离散化处理一个值得注意的问题:Onsager模型中溶质孔穴半径问题分子体积计算方法:1等电子密度面:分子等电子密度面(0.001elec/bohr3)包含体积;2COSMO方法:溶剂可接近表面(由原子范德华半径加rsolv0.5构建)3.PCM方法:溶剂可接近表面(由1.2倍原子范德华半径构建)一般采用分子体积来确定等效半径Gaussian程序推荐:?矛盾:对于简单的金属离子,溶剂可接近表面为球形.空穴半径为:PCM方法:1.2avdwCOSMO方法:avdw+(0.5)A晶体密度方法：因此,前三种方法得到的孔穴半径基本相当.Gaussian推荐半径:严重加大了孔穴半径.问题:SCRF计算采用何种半径?非平衡溶剂化理论简介电子转移双球模型光谱Lippert-Mataga公式Gaussian03DFT/PCM,CAS/PCMAguilar,Tomasi多级展开光诱导ETR-W公式溶剂化动力学Levich，OvchinikovTachiya，MarcusNewton溶剂重组能极化模型Klamt光谱COSMO理论 非平衡态平衡态溶质电荷：快溶剂极化：取向：不响应电子：快响应Hynes的溶剂化理论非平衡:平衡:平衡态正确的可逆功途径 不可逆途径电子转移双球模型光谱Lippert-Mataga公式Gaussian03DFT/PCM,CAS/PCMAguilar,Tomasi多级展开光诱导ETR-W公式溶剂化动力学Levich，OvchinikovTachiya，MarcusNewton溶剂重组能极化模型Klamt光谱COSMO理论 非平衡态平衡态溶质电荷：快溶剂极化：取向：不响应电子：快响应Hynes的溶剂化理论Publicationsonthistopic1.K.-X.Fu,X.-Y.Li,Q.Zhu,J.Mole.Struc.(Theochem).715(2005)157.2.X.-Y.Li,K.-X.Fu,J.Comput.Chem.25(2004)500.3.X.-Y.Li,K.-X.Fu,Q.Zhu,J.Comput.Chem.25(2004)835.4.Q.Zhu,K.-X.Fu,X.-Y.Li,J.-Y.Ma,J.Comput.Chem.26(2005)399.5.J.Tang,X.-Y.Li,K.-X.Fu,J.-F.Liu,S.-Z.Lu,Chem.Phys.312(2005)21.6.Q.Zhu,K.-X.Fu,X.-Y.Li,J.-F.Liu,J.Theor.Comput.Chem.,3(2004)609.7.X.-Y.Li,K.-X.Fu,Q.Zhu,M.-H.Shan,J.Mole.Struc.-Theorchem,671(2004)239.8.Q.Zhu,K.-X.Fu,X.-Y.Li,Q.Zhu,ChineseSci.Bull.2003,48,965.9.X.-Y.Li,K.-X.Fu,“ContinuousMediumTheoryforNonequilibriumSolvation:NewFormulationsandAnOverviewofTheoriesandApplications”,J.Theor.Comput.Chem,Reviewarticle,inpress结论:1.综述传统的平衡溶剂效应模型和数值解方法,与我们结论一致.2.溶质球空穴半径定义无统一的方法,我们认为应以溶剂可接近表面包含体积定义.3.Marcus采用错误可逆途径,得到错误的非平衡溶剂化能,采用正确可逆途径或者直接采用能量积分公式,均可得正确结论.4.各种涉及非平衡溶剂化的模型和计算方法应该重新修正.参加研究人员傅克祥(教 授)朱 权(博士生)何荣幸(博士生)吕申壮(博士生)刘继凤(博士生)单敏华(副教授)龚 珍(硕士生)马建毅(硕士生)黄 瑶(硕士生)Thankyouforyourattention9、静夜四无邻，荒居旧业贫。5月-235月-23Thursday,May4,202310、雨中黄叶树，灯下白头人。09:53:1709:53:1709:535/4/20239:53:17AM11、以我独沈久，愧君相见频。5月-2309:53:1809:53May-2304-May-2312、故人江海别，几度隔山川。09:53:1809:53:1809:53Thursday,May4,202313、乍见翻疑梦，相悲各问年。5月-235月-2309:53:1809:53:18May4,202314、他乡生白发，旧国见青山。04五月20239:53:18上午09:53:185月-2315、比不了得就不比，得不到的就不要。五月239:53上午5月-2309:53May4,202316、行动出成果，工作出财富。2023/5/49:53:1809:53:1804May202317、做前，能够环视四周；做时，你只能或者最好沿着以脚为起点的射线向前。9:53:18上午9:53上午09:53:185月-239、没有失败，只有暂时停止成功！。5月-235月-23Thursday,May4,202310、很多事情努力了未必有结果，但是不努力却什么改变也没有。09:53:1809:53:1809:535/4/20239:53:18AM11、成功就是日复一日那一点点小小努力的积累。5月-2309:53:1809:53May-2304-May-2312、世间成事，不求其绝对圆满，留一份不足，可得无限完美。09:53:1809:53:1809:53Thursday,May4,202313、不知香积寺，数里入云峰。5月-235月-2309:53:1809:53:18May4,202314、意志坚强的人能把世界放在手中像泥块一样任意揉捏。04五月20239:53:18上午09:53:185月-2315、楚塞三湘接，荆门九派通。五月239:53上午5月-2309:53May4,202316、少年十五二十时，步行夺得胡马骑。2023/5/49:53:1809:53:1804May202317、空山新雨后，天气晚来秋。9:53:18上午9:53上午09:53:185月-239、杨柳散和风，青山澹吾虑。5月-235月-23Thursday,May4,202310、阅读一切好书如同和过去最杰出的人谈话。09:53:1809:53:1809:535/4/20239:53:18AM11、越是没有本领的就越加自命不凡。5月-2309:53:1809:53May-2304-May-2312、越是无能的人，越喜欢挑剔别人的错儿。09:53:1809:53:1809:53Thursday,May4,202313、知人者智，自知者明。胜人者有力，自胜者强。5月-235月-2309:53:1809:53:18May4,202314、意志坚强的人能把世界放在手中像泥块一样任意揉捏。04五月20239:53:18上午09:53:185月-2315、最具挑战性的挑战莫过于提升自我。五月239:53上午5月-2309:53May4,202316、业余生活要有意义，不要越轨。2023/5/49:53:1809:53:1804May202317、一个人即使已登上顶峰，也仍要自强不息。9:53:18上午9:53上午09:53:185月-23MOMODA POWERPOINTLorem ipsum dolor sit amet,consectetur adipiscing elit.Fusce id urna blandit,eleifend nulla ac,fringilla purus.Nulla iaculis tempor felis ut cursus.感感 谢谢 您您 的的 下下 载载 观观 看看专家告诉
