质粒电泳,质粒DNA电泳三条带.docx
质粒电泳,质粒DNA电泳三条带2022质粒电泳,质粒DNA电泳三条带正文内容质粒DNA电泳的三条带质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA 重组的常用载体.作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色 体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表 现相应的性状.在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒 载体可通过连接外源 基因构成重组体.从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实 验技能.分离质粒DNA有三个步骤:1,培养细菌使质粒扩增2,收集和裂解细 菌3,分离和纯化质粒DNA碱裂解法是较常用的提取的方法.其优点是得率高, 适合于大多数的和菌株,所得产物经纯化后可满足多数的DNA重组操作.此法 采取酸碱度高达Phl2. 6的碱溶液使DNA发生变性.由于质粒和主染色体的拓 扑结构不同,变性时前者虽然两条链分离,但仍然缠绕在一起不分开;而后者完 全变性分,甚至出现断裂.因此,当加入中和液时,溶液Ph值恢复较低的近中性 水平,此时,质粒的两条小分子单链可迅速复性,恢复双链结构,但是主染色体 DNA则无法复性.在离心时,大部分主染色体与细胞碎片,杂质等缠绕一起被沉淀, 而可溶性的质粒DNA留在上清夜中.在质粒提取过程中,由于机械力,酸碱度, 试剂等的原因,可能使质粒DNA链发生断裂.所以,多数 质粒粗提取物中含有 三种构型的质粒:共价闭合环状DNA(cccDNA):质粒的两条链没有断裂;超螺旋 开环DNA(ocDNA):质粒的一条链断裂;松弛的环状分子 线形DNA(IDNA):质粒 的两条链均断裂;线性分子质粒DNA琼脂塘凝胶电泳模式图质粒DNA的分子构型由于琼脂糖中加有嵌 入型染料漠化乙锭,因此,在紫外线照射下DNA电泳带成橘黄色.(a)松弛线性 的DNA; (a)道中的SC DNA走在最前沿,0C DNA则位于凝(b)松弛开环的0C 构型;(c)超螺旋的SC构型 胶的最后边;(b)道中的LDNA是经核酸内切限制 酶切割质粒之后产生的,它在凝胶中的位置介于OC DNA和SC DNA之间三,材 料,试剂及器具1,材料E. coliDH 5a (pUC 19 vector) 2,试剂1)LB培养基 2)TE缓冲液3)裂解液:溶液I ,溶液H,溶液HI 4)酚:氯仿:异戊醇解5:24:1) 5)无水乙醇6)70%乙醇7)氨羊青霉素50mg/mL器具 离心机,离心管,吸嘴 四, 操作步骤以设比例把E. coliDH5a (含PUC接种于含氨节青霉素 (Amp)100iig/nil)的LB培养基 中372振摇过夜(12-18h) I取1.5ml培养 物置离心管中I lOOOOrpm,离心Imin,或4000rpm,离心5-10min !去上清, 倒扣干净吸收纸上吸干I沉淀+100UL溶液I I加或不加入少量溶菌酶粉 末;混匀,室温放置lOmin ; +加200 Li L溶液11(新鲜配置);温和颠倒数次, 混匀,冰上放置5min I +150 u 1溶液Hlf颠倒混匀,冰上放置15min I离心12000rpm, 15min !上清液+等体积酚:氯仿:异戊醇振匀,12000rpm,离心 5min I小心转移上层至一新的离心管弃下层有机相和中层蛋白质I上清液 +2倍体积无水乙醇混匀,室温5min-10min 3 12000rpm, 5min-15min I弃上清 沉淀+lmL70%乙醇I 12000rpm离心5min-15min I弃上清;并倒扣离心管使液 体流干1+自然干燥或真空抽干(看不到液滴为宜)I加50 u 1TE缓冲液 (20ug/mlRNaseA)溶解质粒粗取物I -20。(3保存 六,实验报告 检查,保存提取 的质粒,要求记录实验现象并说明原因.七,思考题 分析以下试剂的作用原理: 溶液I :50mmol/L葡萄糖5mmol/Ltris HCL (Ph 8. 0) 10mmol/L EDTA(PH8. 0)溶液 II : 0. 4mol/L NaOH 2% SDS 使用前新鲜配制溶液HI: 5moi/L Kac 60 mL冰醋酸IL 5 mL水28.5 mL RNase A 酶:将粉末溶于 10mmol/L tris HCL (Ph7. 5), 15mmol/L NACL 中,配成 10 mg/mL浓度的酶液,于100水浴加热15 min,缓慢冷却至室温,-20保存 氯 仿无水乙醇质粒电泳,质粒DNA电泳三条带正文内容结束。