T_CPMA 030-2023 病原微生物菌（毒）种国家标准株真菌菌株评价规范.docx

学兔兔标准下载ICS 11.020CCS C 04团体标准T/CPMA 0302023病原微生物菌（毒）种国家标准株真菌菌株评价规范National standard strains of pathogenic microorganism-Fungi specification evaluation2023 - 10  20 发布2023 - 10 - 20 实施中华预防医学会发 布准下载学兔兔标T/CPMA 0302023目次前言 . II1范围 . 12规范性引用文件 . 13术语和定义 . 14基本信息评价 . 15生物学特性评价 . 2培养信息 . 2形态学特征 . 2分子信息 . 2药敏信息 . 2生理生化特征 . 2致病性 . 26活性评价 . 27稳定性评价 . 2传代明确、可溯源 . 2培养条件稳定 . 2形态学特征稳定 . 2分子信息稳定 . 3药敏信息稳定 . 38质量控制评价 . 3数据质量控制 . 3菌株质量控制 . 3附录 A4（资料性） 病原微生物菌（毒）种国家标准株（真菌菌株）申请评价示例表 . 4参考文献 . 7I学兔兔标准下载T/CPMA 0302023前言本文件按照GB/T 1.12020标准化工作导则  第1部分：标准化文件的结构和起草规则的规定起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由中国医学科学院皮肤病医院（中国医学科学院皮肤病研究所）提出。本文件由中华预防医学会归口。本文件起草单位：中国医学科学院皮肤病医院（中国医学科学院皮肤病研究所）、中国疾病预防控制中心、北京大学第一医院、海军军医大学长征医院、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、济宁市第一人民医院。本文件主要起草人:刘维达、李筱芳、梅嬛、魏强、李若瑜、潘炜华、姜孟楠、龚杰、孔雪、郑海林、宋营改、方文捷、史冬梅。II学兔兔标准下载T/CPMA 0302023病原微生物菌（毒）种国家标准株真菌菌株评价规范1范围本文件规范了人间传染的真菌国家标准株评价的技术要求和质量控制规范。本文件适用于全国各级人间传染的病原微生物菌（毒）种保藏机构，以及涉及人间传染的真菌研究、教学、检测、诊断等相关活动的机构。2规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。GB/T 37864 生物样本库质量和能力通用要求GB/T 7408数据元和交换格式 信息交换 日期和时间表示法WS 315 人间传染的病原微生物菌（毒）种保藏机构设置技术规范WS/T 812 病原微生物菌（毒）种国家标准株评价技术标准T/CPMA 011病原微生物菌（毒）种保藏数据描述通则3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。病原微生物pathogenic microorganisms可以侵犯人、动物，引起其感染甚至传染病的微生物。注：包括病毒、细菌、真菌、立克次体等。来源：WS/T 812-2022，3.1真菌 fungi一类具有真核、可产孢、无叶绿体的，以寄生或者腐生方式进行异养生存，进行有性或/和无性繁殖，可以单细胞或分枝分隔的丝状体存在的微生物。国家标准株 national standard strains具有该菌（毒）种典型生物学特征，遗传学特性得到确认和保证、可追溯，且能反映该种及其亚种、型的代表性，由国家病原微生物保藏中心分中心复核、鉴定，并给予国家保藏编号的菌（毒）株。来源：WS/T 812-2022，3.4评价evaluation确定菌（毒）株是否符合国家标准株相关要求的过程。4基本信息评价国家标准株评价的基本要求应符合 WS/T 812。菌株相关基础信息完整，应包括菌株的原始编号、保藏编号、中文名称、拉丁名称、分离部位、分离时间、分离地点、来源历史、所致疾病名称等。注：已经明确为国际培养物保藏单位（International Depository Authorities，简称IDA）等机构收录菌种，其信1学兔兔标准下载T/CPMA 0302023息应溯源至该国际标准株保藏单位的菌株编号,如在原始编号处体现“=ATCC XXX”。菌株背景可溯源，可提供菌株其他相关信息：如患者情况、递送者、代次信息等。注：对于4.1及4.2中部分信息不完整，但具有重要保藏价值的菌（毒）株，根据具体情况确定。应根据人间传染的病原微生物目录，明确该菌株的危害程度分类级别。注：未在目录中的菌种不做要求。应经国家病原微生物保藏中心分中心全面鉴定，明确分类学地位，具备某种菌种的特性。应提供代表性信息，即该菌株典型的生物学特征或遗传学特性的描述，如临床首报、血清型、基因型、有性型、基因变异株、耐药性等。5生物学特性评价培养信息应具有菌株合适的培养条件，如培养温度范围、培养时间、适用培养基等（注明是否添加额外营养物质或抗生素等）。形态学特征应具有全面的形态学描述并配备典型图片，包括不同培养基或培养温度条件下菌落的形态、质地、颜色、菌落直径，镜下的菌丝形态、产孢特征、孢子形态等。分子信息应具有分子生物学鉴定信息，如全基因组序列信息，或系统分类鉴定时通用的靶基因序列信息等。药敏信息可具有该菌株的抗真菌药物谱敏感信息。如菌株为耐药株，应必须提供药敏信息且确保其稳定耐受单一或多种抗真菌药物。生理生化特征可具有该菌株生理生化反应的特征性数据，如糖同化试验、糖发酵试验、尿素酶试验等。致病性应明确菌株的致病性或标注所致疾病的名称，且附注支持性文献。6活性评价应具有生长、繁殖能力。应具有特定条件下长期、稳定存活的能力，且在保存周期内可复苏及扩增培养。培养后浓度能达到相应实验功能的需求。7稳定性评价传代明确、可溯源在提交保藏机构鉴定并记录生物学特性前，原则上传代不超过5代。传代信息应包含代次、传代时间、传代培养条件等信息。培养条件稳定不同代次的菌株在复苏及传代过程中所涉及的培养基、培养温度、pH值、氧需求程度等培养条件应一致。形态学特征稳定2学兔兔标准下载T/CPMA 0302023不同代次的菌株应保持形态特征相对稳定，如镜下结构、菌落形态、产色素等情况应落在文献支持的变化范围内。分子信息稳定不同代次的菌株其靶基因序列应一致。药敏信息稳定不同代次菌株的抗真菌药物敏感性数据应稳定。8质量控制评价数据质量控制8.1.1过程记录国家标准株的接收、鉴定、制备、保存等环节应可溯源，参照 GB/T 37864及WS 315执行 。8.1.2时间记录关键阶段的日期应按照标准时间格式进行记录，如保藏时间、传代时间，日期和时间记录参照国标GB/T 7408的规定。8.1.3数据受控数据的纸质记录和电子记录应受控，设置数据浏览和修改等级权限并具备溯源能力。8.1.4信息公布国家标准株相关信息应制定成文并有限公布。菌株质量控制8.2.1纯培养物菌株应是纯培养物，无杂菌等外源因子污染。8.2.2制备和保存的过程、方法受控制定菌株制备和保存过程的程序控制文件，鉴定、扩增、保存等技术方法应依据可循证方法（国际、国内公开共识的标准或方法）制定，进行必要的室间比对（能力验证）等。8.2.3多形式冗余备份国家标准株应采用2种及以上保藏形式进行冗余备份。8.2.4定期抽检需定期抽样检查，以确定菌株的活力和纯度，并记录抽查结果。3信息说明基本信息中文名称*马尔尼菲篮状菌拉丁名称*Talaromyces marneffei生物分类学*发菌科-篮状菌属（Trichocomaceae-Talaromyces）生物危害程度*第三类 BSL-2模式株*否背景信息原始编号*B33v分离时间*2017-01-11分离地点*中国江苏省南京市分离部位*患者，血液致病对象*人、动物所致疾病名称*马尔尼菲篮状菌病传播方式*接触传播、空气传播来源历史*中国医学科学院病原微生物菌（毒）种保藏中心医学真菌分中心东部战区总医院患者情况男，53岁，安徽籍，肾移植患者递送者基础医学实验室代次信息SDA培养基，2次传代，最后一次传代时间：2021-10-15保藏信息保藏编号*CAMS-CCPM-D 02998资源库编号NPRC 3.8.128保藏时间*2017-1-20保藏形式a£ 室温斜面保存        R -80°C深低温保存R 液氮冷冻保存        £ 冷冻干燥保存          £ 其他（            ）培养信息培养温度*2537均能生长；其中在25培养条件下为菌丝相，在37培养条件下为酵母相；培养时间*3d7d适用培养基*马铃薯葡萄糖琼脂培养基（PDA）、沙氏葡萄糖琼脂培养基（SDA）、麦芽浸膏琼脂培养基（MEA）生物学信息形态学特征菌落特征*在SDA/PDA培养基上37培养时呈白色酵母样菌落，48小时菌落直径约1cm-2cm。在27PDA培养基上形成平坦、紧密的丝状菌落，会产生红色、橘色等色素。菌丝形态b镜下部分菌丝螺旋状，分生孢子梗匍匐或呈束状，(70-150) µm ×(2.5-3.0 )µm。产孢特征及孢子形态*27PDA培养为帚状枝双轮生，分生孢子椭球形，壁光滑，(2.5-4.0) µm ×(2-3)m，单细胞，呈短链排列。37酵母态时形成椭圆形、长形孢子。形态图片*PDA，27孵育7d兔学兔标准下载T/CPMA 0302023A                    A附录A（资料性）病原微生物菌（毒）种国家标准株（真菌菌株） 申请评价示例表病原微生物菌（毒）种国家标准株（真菌菌株） 申请评价示例见表A.1表 A.1  病原微生物菌（毒）种国家标准株（真菌菌株）  申请评价示例表4信息说明PDA，27孵育7d，棉兰染色，×400分子信息*靶基因序列信息cITS区CTTCCCGGTTAAGGGTGACCTGCGGAAGGATCATTACCGAGTGCGGGCCCTCGCGGCCCAACCTCCCCCCCCTTGTCTCTATACACCTGTTGCTTTGGCGGGCCCACCGGGGCCACCCGGTCGCCGGGGGACGTTTGTCCCCGGGCCCGCGCCCGCCGAAGCGCCCTGTGAACCCTGATGAAGATGGACTGTCTGAGTACCATGAAAATTGTCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTTCTGCCCTCAAGCACGGCTTGTGTGTTGGGTGTGGTCCCTCCGGGGACCTGCCCGAAAGGCAGCGGCGACGTCCGTCTGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTCTGTCACTCGCTCGGGAAGGACCTGCGGGGGTTGGTCACCACCATATTTACCACGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAGTTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAAAAGCCCGGAGGAAABenA区TGGTAACCCAAAAACGGTGCTGCTTTCTGGTGAGTTTGGCTCTCAACAAACACATCACAACTTTCAGTCACTTGTCGCGACAACACGCTGACTCTTTTCCAGGCAAATCATCTCCGCCGAGCACGGCCTCGACGGCTCCGGTGTGTAAGTATTACACGATTCAAATCCAGCTACAATCCGACAATTATCTGATGATCAACAGCTACAATGGCTCCTCCGACCTCCAGTTGGAGCGTATGAACGTTTACTTCAACGAGGTGCGTCAGACCCTTCCACCTAATAAACCGAAGACGAACTCATCATCATCGATATAGGCTTCCGGCAACAAATATGTCCCCCGTGCTGTCCTCGTCGACTTGGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGCGCTGGTCCTTTTGGTCAGCTCTTCCGTCCCGACAACTTTGTTTTCGGTCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACAACTTTTGAAGGGTAA全基因组序列无生理生化特征无d药敏信息无代表性信息e临床首报无血清型无基因型无有性型/无性型无基因变异株无耐药性无其它特征血液分离株活性*生长、繁殖能力R是                                           £否      （备注：                                           ）保存周期内稳定存活能力R是                                           £否      （备注：                                           ）培养后浓度达到功能需求能力R是                                           £否      （备注：                                           ）稳定性*传代明确可溯源R是                                           £否      （备注：见背景信息部分            ）不同代次菌株培养条件稳定R是                                           £否      （备注：见培养信息部分            ）不同代次菌株形态学特征稳定R是                                           £否      （备注：见形态学特征部分        ）不同代次菌株分子信息稳定R是                                           £否      （备注：见靶基因序列信息部分）不同代次菌株抗真菌药物敏感信息d稳定£是                                           £否      （备注：未检测                              ）学兔兔标准下载T/CPMA 03020235信息说明致病性支持性文献*1 Wortman, P.D. Infection with Penicillium marneffei.Int J Dermatol.1996,Jun;35(6):393-3992 N Vanittanakom, T Sirisanthana.Penicillium marneffei infection in patients infected with humanimmunodeficiency virus.Curr Top Med Mycol.1997 Dec;8(1-2):35-423 S S Wong, T Y Ho, A H Ngan, P C Woo, T L Que, K Y Yuen. Biotyping of Penicillium marneffeireveals concentration-dependent growth inhibition by galactose.J. Clin. Microbiol.2001Apr;39(4):1416-21.4 N Yilmaz, C M Visagie, J Houbraken , J C Frisvad, R A Samson. Polyphasic taxonomy of the genusTalaromyces.Stud. Mycol.2014 Jun;78:175-341.5 Cunwei Cao, Liyan Xi, Vishnu Chaturvedi. Talaromycosis (Penicilliosis) due to Talaromyces(Penicillium) marneffei:insights into the clinical trends of a major fungal disease 60 years afterthe discovery of the pathogen.Mycopathologia,2019 Dec;184(6):709-720.6 Chi-Ching Tsang, Susanna K P Lau, Patrick C Y Woo. Sixty years from Segretain's description:what have we learned and should learn about the basic mycology of Talaromyces marneffei,Mycopathologia,2019 Dec;184(6):721-729.*为必填项，其余为非必填项a 至少选择两种保存方式b 酵母菌为非必填项，丝状菌或双向真菌为必填项c 根据菌种不同，选择合适靶基因区域及基因序列，至少填入一条序列信息d 如果是耐药菌株，该项即为必填项e 至少选填一栏学兔兔标准下载T/CPMA 03020236学兔兔标准下载T/CPMA 0302023参考文  献1 GB 19489-2008 实验室生物安全通用要求2 临床微生物检验程序验证指南CNAS-GL028:20183 刘剑君, 魏强病原微生物保藏管理与技术手册. 北京大学医学出版社，20194 王端礼.医学真菌学-实验室检验指南.人民卫生出版社，20045 吴绍熙.现代医学真菌检验手册.中国协和医科大学出版社，20056 全国科学技术名词审定委员会.感染病学名词.科学出版社，20197 全国科学技术名词审定委员会.微生物学名词.科学出版社，20128 国家药典委员会.中国药典.中国医药科技出版社，20207