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1、“基因银行”,谁的霸权? 企业创建基因信息央行的大胆试验。 基因信息分行 随着人类基因组、植物基因组安排的实施,核酸、蛋白质等生物数据的数量正以前所未有的速度快速增加,GenBank 等数据库的容量均以几何级数的速度不断扩容。 基因探讨人员主要是通过手动操作在网上获得生物医学信息,加之对数据结构以及数据项含义的不熟识、网络硬件条件的限制,致使查询效率低。如何从海量的基因信息一级市场中钩吊出有效的数据,这成为了基因信息探讨的热点。 数据挖掘与生物信息学的结合技术, 使得从一级基因信息数据库中提取有用的序列、结构、功能等信息成为可能,使得二级基因信息数据库得以建构。这种二级生物信息数据库就相当于基
2、因信息分行。 2022年7月6日,华大基因和BioMed Central共同主办的GigaScience杂志的执行编辑Scott Edmunds正式对外宣布该杂志已经起先接收数据,该期刊主要采纳全文文献与大型数据库相结合的模式,为广阔科学工作者供应前沿、有效的数据以及生物学发觉等资源,并公开了首个可引用的数据库德国大肠杆菌数据库,包括了最近流行的德国致病性大肠杆菌O104菌株等的基因组序列和组装数据, 华大基因在其官网上指出:大肠杆菌O104菌株的基因组序列还存放在NCBI上 6。 明显,德国大肠杆菌数据库就属于基因信息分行。 中国多项科研基金支持基因信息数据挖掘技术,这可以说是基因信息分行建
3、设的试验。例如:中国科学院上海生科院系统生物学重点试验室生物信息中心的许庆炜等,在国家科技支撑安排课题的支持下,对生物医学文献热点数据自动化抽取工具HotDataSpider 进行了探讨 7;北京科技高校信息工程学院的杨炳儒等,在国家科技成果重点推广安排资助项目( 2003EC000001)和国家自然科学基金资助项目( 60675030) 的支持下,对生物信息数据挖掘技术的典型应用进行了探讨 8;江苏省农业科学院农业资源与环境探讨所的栾德琴等,在国家863安排(编号: 2022AA10Z1E7-1, 2022AA10Z243-3)和江苏省农业科学院科研基金(编号: 6510736) 的支持下,
4、对基因本体论在生物信息数据库中的应用进行了探讨 9;北京高校心血管基础探讨所的尚彤、 清华高校电子工程系的刘贝等,在国家重点基础探讨发展规划项目(G2000056907) 的支持下,以NCBI的GenBank 数据库和EBI维护的Swiss2Prot数据库分别作为一级和二级数据库的信息来源,编写了专用软件从网上获得数据,并且进行分类整理,建立了心衰/ 高血压相关基因和蛋白数据库 10。 基因信息的学问产权问题 基因信息一级数据库版权争议问题不严峻。由政府或由其它公共基金出资开发的Genbank、EMBL、DDBJ和蛋白质三维结构数据库PDB等一级生物信息数据库,免费为公众开放,以推动生物信息的
5、传播与沟通。但是,因经济惊慌的缘由,蛋白质序列数据库SWISS-PROT 已起先向商业用户每年收取数千至数万美元不等的费用。 基因信息二级数据库上的版权问题比较困难。基因信息二级数据库一般是利用生物信息软件对原始数据的创建性的再加工,具备独特的结构编排,在一般状况下享有版权爱护。有人认为对于政府出资兴建的基因信息二级数据库,不具备版权,也应当免费为公众开放。一旦基因信息二级数据库引用本身具有版权的文献和数据, 原始数据人的权利爱护是须要探讨的问题 11。 从生物信息的两级数据库上可以看出,中国在基因信息的获得、加工、利用上并没有太多优势,外国公司已经在利用其生物信息技术优势,通过专利来限制中国
6、的生物产业。美国孟山都公司利用我国上海的野生大豆,绘制了大豆的遗传连锁图谱,并提交国际PCT专利申请,在国际上进行跑马圈地 12。中国的大豆产业已经“沦陷”,这明显是外国公司变相收取的“基因铸币税”造成的后果。 对此,中国以专利法中规定披露遗传资源来源的条款来加以应对。专利法第5条第2款:对违反法律、行政法规的规定获得或者利用遗传资源,并依靠该遗传资源完成的独创创建,不授予专利权。但是,该条款在实践中原委能发挥多大的作用,这尚有待视察。 结语 因人才短缺、资金不足、配套不完善等种种困难,我国生物信息产业的发展与国际水平还存在不少差距,但是,当面对外国基因信息霸权的挑战,我国更要迎难而上,这须要
7、科技人员在基因测序、数据库建设、网络开发、网络平安等核心技术上驾驭自主学问产权,须要政府进行顶层设计建立中国基因信息央行。 国家级基因信息技术中心和数据服务中心中国基因信息央行是一项系统工程,横跨生物、信息、学问产权、国家平安、法律、资金运作等多个领域,并非个别企业或院校所能实现和完成的,更须要政府在人、财、物上进行统筹协调、大力扶持,才能胜利。 无论这个过程多么曲折,笔者认为:中国肯定要建立起自己的基因信息央行,要象独立发行人民币一样独立发布基因登记号,这才能完善中国基因信息管理体系,中国的科研单位才能摆脱为外国基因信息央行供应基因来源的尴尬地位,中国的生产单位才能摆脱给外国基因公司交纳“基因铸币税”的被动局面。 第5页 共5页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页
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