麻类脱胶菌的木糖发酵性能改造及初步检验.docx
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1、麻类脱胶菌的木糖发酵性能改造及初步检验 农业科学院麻类探讨所选育的菌株。酮酸脱羧酶基因PDC和乙醇脱氢酶基因AdhB模板来源于KO11菌株基因组。双基因表达质粒载体pACYCDuet-1购于Voergen公司。 1.2 引物设计 利用Primer premier 5.0软件对PDC和AdhB基因的开放阅读框序列设计引物。以pACYCDuet-1的多克隆位点1中的Sal作为PDC基因的插入点,而多克隆位点2中的Xho作为AdhB基因的插入位点。PDC和AdhB基因引物加上酶切位点和爱护碱基,并设计1对针对MCS1和MCS2多克隆位点载体构建的检测引物,引物序列如表1所示。 1.3 PDC和Adh
2、B基因克隆 以KO11菌液为模板,进行PCR扩增。PCR反应体系为:模板菌液1 L,Buffer 2.0 L,dNTPs 0.4 L,引物A 0.5 L,引物B 0.5 L,DNA polymerase 0.2 L,ddH2O 15.4 L。PCR反应程序为:94 预变性4 min;35个循环;73 延长10 min。S-PDC-F和S-PDC-R引物退火温度54 ,X-AdhB-F和X-AdhB-R引物退火温度55 。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳,用凝胶回收试剂盒纯化。PDC和AdhB两个基因的纯化产物分别用Sal和Xho进行单酶切,回收产物-73 保存备用。 1.4 PDC和AdhB双基
3、因表达载体构建 将含有pACYCDuet-1质粒的DH5菌株经37 、173 r/min过夜培育后提取质粒,并用Sal单酶切后通过凝胶回收。PDC基因片段的Sal酶切回收产物和pACYCDuet-1质粒的Sal酶切回收产物按31的比例,用T4 DNA 连接酶进行连接,并转化大肠杆菌DH5感受态细胞9。然后将AdhB基因片段和pACYCDuet-1-PDC质粒的Xho酶切回收产物按浓度31的比例混合连接过夜。菌液PCR鉴定阳性菌,并将阳性菌种送至南京金斯瑞生物科技有限公司进行测序鉴定。 1.5 Ym68阳性菌株鉴定 依据噬夏孢欧文氏菌感受态的方法10制备Ym68菌株感受态细胞。从含有pACYCD
4、uet-1-PDC-AdhB质粒的大肠杆菌DH5菌株中提取质粒,参考Sambrook等11的转化方法。用含101 g/mL氯霉素的0.5%葡萄糖肉汤固体培育基进行筛选。随机挑取20个阳性菌落在0.5%葡萄糖肉汤液体培育基中扩繁。以MCS1-F和MCS2-R引物进行PCR鉴定阳性菌株。 1.6 木糖发酵及检测 将Ym68和PAP16菌株分别接种于肉汤培育基中,35 、180 r/min培育到OD600 nm为0.8左右时作为菌种。Ym68和PAP16菌株分别按5%的接种量接种到250 mL发酵培育基中,以不接种的发酵培育基作为比照,6个重复,35 、180 r/min进行发酵,73 h时进行还原
5、糖浓度和乙醇浓度检测。每个处理的6个重复样品中两两混合,形成3份混合样品,随后取每份样品进行总糖浓度检测;以未发酵过的发酵培育基为比照。按DNS显色法检测还原糖浓度12;以浓度为0、0.1%、0.2%、0.4%、0.8%和1.2%的木糖作标准曲线,随后对样品进行原糖浓度测定;混合样品经蒸馏后用酒精计法测定13。 1.7 苎麻脱胶 分别将初始菌株Ym68和工程菌株PAP16分别接种于肉汤培育基中,35 、180 r/min培育菌株过夜作为菌种。以加肉汤培育基为比照,分别用Ym68和PAP16菌种进行脱胶试验,称取每份15 g的苎麻放于500 mL三角瓶中用于脱胶试验,35 、150 r/min培
6、育8 h,每个处理3个重复。脱胶效果依据11分级14,经清水洗去可溶性物质并烘干后计算脱胶前后的干物质损失率。 1.8 菌液涂片显微视察 Ym68转化pACYCDuet-1空质粒的菌株命名为Ym68-K。将Ym68、Ym68-K和PAP16菌株分别接种于肉汤培育基中,35 、180 r/min转速恒温摇床培育过夜。培育好的菌液马上用于涂片,用结晶紫染色后用显微镜视察、拍照。 2 结果与分析 2.1 pACYCDuet-1-PDC-AdhB载体的构建 利用Xho单酶切位点在多克隆位点MCS2上插入的PDC基因长度为1 737 bp,而在多克隆位点MCS1上插入的AdhB基因为1 152 bp,如
7、图1所示。将两个基因插入pACYCDuet-1载体质粒后,提取质粒用Xho和Sal双酶切。结果表明,1 5002 000 bp间存在一条目的条带,而约1 000 bp处也存在一条目的条带,分别与PDC和AdhB基因大小相符,如图2所示。而在3 0005 000 bp间有一条较亮的条带,在约500 bp处还有一条弱带,这两条带与原始质粒双酶切位置大小相符。结果表明,pACYCDuet-1-PDC-AdhB表达载体构建胜利。 2.2 PAP16具有木糖发酵实力 对Ym68转化pACYCDuet-1-PDC-AdhB质粒后,随机对5号、6号、16号和20号阳性单菌落进行PCR鉴定。单菌落与带有pAC
8、YCDuet-1-PDC-AdhB质粒的大肠杆菌DH5扩增的条带大小一样,与预期载体构建后MCS1-F 和MCS2-R引物间的产物长度相符;而原始菌株Ym68则未扩增出该条带,如图3所示。结果表明,带有pACYCDuet-1-PDC-AdhB质粒的Ym68工程菌株构建胜利,16号菌株命名为PAP16。 用Ym68和PAP16菌株对含有5%木糖的发酵培育基进行发酵试验。从发酵后的还原糖浓度看,PAP16和Ym68对木糖的利用率基本相像。73 h发酵的Ym68菌株发酵液中还原糖浓度约为0.56%,而PAP16菌株发酵液的还原糖浓度约为0.23%;未经发酵的发酵培育基还原糖浓度为5.22%。从乙醇产
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