酶工程第十节酶与现代生命科学课件.ppt
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1、 一、一、酶是分子生物学研究的重要工具酶是分子生物学研究的重要工具 酶是分子生物学研究的重要工具。酶是分子生物学研究的重要工具。特别是限制性特别是限制性核酸内切酶核酸内切酶的发现提供了特异剪切的发现提供了特异剪切DNADNA的工具的工具, ,促进了促进了DNADNA重组技术诞生重组技术诞生, ,推动了基因工程发展推动了基因工程发展, ,成为分子生物成为分子生物学研究的不可缺少的工具学研究的不可缺少的工具. . Hind 的识别序列和切割位点的识别序列和切割位点 5 - GTPy PU AC - 3 3 - CAPU Py TG - 5 (genetic engineering),也叫基因操),
2、也叫基因操作、遗传工程,或重组体作、遗传工程,或重组体DNA技术。它是根据人们技术。它是根据人们预先设想,采用酶学的方法,将目的基因(所需要预先设想,采用酶学的方法,将目的基因(所需要的基因)重组到一个适宜的载体上组成重组子,再的基因)重组到一个适宜的载体上组成重组子,再将重组子转化到适当受体细胞中进行扩增表达,以将重组子转化到适当受体细胞中进行扩增表达,以达到改造生物细胞的目的的技术。达到改造生物细胞的目的的技术。 基因工程的整个过程由工程菌(细胞)基因工程的整个过程由工程菌(细胞)的设计构建和基因产物的生产两大部分组成。的设计构建和基因产物的生产两大部分组成。前者主要在实验室里进行,其单元
3、操作过程前者主要在实验室里进行,其单元操作过程如下:如下: 基因工程的单元操作过程如下:基因工程的单元操作过程如下:(1 1)从供体细胞中分离出基因组)从供体细胞中分离出基因组DNADNA,用限制性,用限制性核酸内切酶分别将外源核酸内切酶分别将外源DNADNA(包括外源基因或目的基因)和载(包括外源基因或目的基因)和载体分子切开。体分子切开。 (2 2)用)用DNADNA连接酶将含有外源基因的连接酶将含有外源基因的DNADNA片段接到片段接到 载体分子上,形成载体分子上,形成DNADNA重组分子。重组分子。(3 3)借助于细胞转化手段将)借助于细胞转化手段将DNADNA重组分子导入受重组分子导
4、入受 体细胞中。体细胞中。(4 4)短时间培养转化细胞,以扩增)短时间培养转化细胞,以扩增DNADNA重组分子重组分子 或使其整含到受体细胞的基因组中。或使其整含到受体细胞的基因组中。(5 5)筛选和鉴定转化细胞,获得使外源基因高)筛选和鉴定转化细胞,获得使外源基因高 效稳定表达的基因工程菌或细胞。效稳定表达的基因工程菌或细胞。 关于限制性内切酶关于限制性内切酶 Restriction endonueleases 限制性核酸内切酶简称限制性内切酶,是一限制性核酸内切酶简称限制性内切酶,是一类能识别双链类能识别双链DNADNA中特定核苷酸序列并具有专一切中特定核苷酸序列并具有专一切割位点的脱氧核
5、糖核酸水解酶。割位点的脱氧核糖核酸水解酶。 主要存在于细菌、霉菌中,至今已分离到主要存在于细菌、霉菌中,至今已分离到10001000种以上,搞清识别序列的有种以上,搞清识别序列的有300300种以上。种以上。 有关限制性内切酶发现的几个重要实验有关限制性内切酶发现的几个重要实验 5050年代初,年代初,LuriaLuria和和HumanHuman在研究在研究T4T4噬菌体感噬菌体感染作用、染作用、BertaniBertani和和WeigleWeigle在研究在研究 和和P2P2噬菌体与宿噬菌体与宿主细胞关系时,发现了细菌内限制与修饰现象。主细胞关系时,发现了细菌内限制与修饰现象。 发现了细菌内
6、存在限制修饰系统,在这两个系发现了细菌内存在限制修饰系统,在这两个系统中包括限制酶和修饰酶。限制酶能识别并降解与统中包括限制酶和修饰酶。限制酶能识别并降解与自身无关的外源自身无关的外源DNADNA,而修饰酶则可通过甲基化修,而修饰酶则可通过甲基化修饰自身饰自身DNADNA,免被限制酶降解。,免被限制酶降解。 Bertani和和Weigle大肠杆菌噬菌体感染实验大肠杆菌噬菌体感染实验Bertani和和Weigle在探在探索索 和和P2噬噬菌体与宿主菌体与宿主细胞关系时,细胞关系时,均提出了均提出了噬噬菌体感染大菌体感染大肠杆菌后,肠杆菌后,宿主细胞对宿主细胞对入侵的噬菌入侵的噬菌体体DNA表现表
7、现有特异的限有特异的限制作用。制作用。 CEcoli.CEcoli.CEcoli.K12大量繁殖受到抑制Meselson和和Yuan实验实验噬菌体噬菌体 K12和和 C的的DNA分别分别与由与由K12菌菌体制备的细体制备的细胞抽提物保胞抽提物保温,并藉蔗温,并藉蔗糖密度梯度糖密度梯度离心观察两离心观察两种种DNA沉降沉降速度的变化。速度的变化。 K12 DNA C DNA加入加入K12K12菌体制备的细菌体制备的细胞抽提物胞抽提物蔗糖密度梯度离心蔗糖密度梯度离心 实验表明,这种限制的本质是宿主细胞实验表明,这种限制的本质是宿主细胞K12中存在有能使外来中存在有能使外来DNA( CDNA)有限有
8、限降解的核酸水解酶。降解的核酸水解酶。 此后,又进一步证实了大肠杆菌此后,又进一步证实了大肠杆菌K12中中的修饰体系即为甲基化酶,该酶修饰了的修饰体系即为甲基化酶,该酶修饰了 K12 DNA上的特异部位,使其不被限制体上的特异部位,使其不被限制体系的酶切割。系的酶切割。结论表明:结论表明:n1965年年阿尔伯阿尔伯首次从理论上提出了生物体内存在着一种首次从理论上提出了生物体内存在着一种具有切割基因功能的限制性内切酶。并于具有切割基因功能的限制性内切酶。并于1968年成功分年成功分 离出离出I型限制性内切酶与修饰酶。证实在细菌内存在两种型限制性内切酶与修饰酶。证实在细菌内存在两种不同功能但又相关
9、的酶。不同功能但又相关的酶。n1970年年史密斯从史密斯从流感噬血杆菌流感噬血杆菌d株中株中分离出了分离出了II型限制性型限制性内切酶;同年内切酶;同年内森斯内森斯使用该酶降解猕猴肿瘤病毒使用该酶降解猕猴肿瘤病毒SV40的的DNA,首次完,首次完 成了对基因的切割,排列了酶切图谱。从成了对基因的切割,排列了酶切图谱。从此成为分子克隆技术中不可缺少的工具酶,推动了基因工此成为分子克隆技术中不可缺少的工具酶,推动了基因工程的发展。程的发展。n1978年,上述三人因对限制性内切酶的贡献获得诺贝尔年,上述三人因对限制性内切酶的贡献获得诺贝尔奖。奖。阿尔伯阿尔伯(1929) 瑞士微生物遗传瑞士微生物遗传
10、学家学家 H.O.史密斯史密斯(1931) 美国分子生物学家、美国分子生物学家、遗传学家遗传学家 内森斯内森斯(1928) 美美国微生物遗传学家国微生物遗传学家 限制性内切酶限制性内切酶命名规则命名规则 限制酶的命名从其来源微生物的拉丁名中摘限制酶的命名从其来源微生物的拉丁名中摘取,即由其属名的第一个字母取,即由其属名的第一个字母(大写大写)与种名的第与种名的第一、二两个字母一、二两个字母(小写小写)组成酶的基本命名,若酶组成酶的基本命名,若酶的产生菌有株系之分,则有的产生菌有株系之分,则有4个或个或4个以上拉丁字个以上拉丁字母组成,其第四个字母之后表示株系。母组成,其第四个字母之后表示株系。
11、 如如 EcoRI来源于来源于Echerichia.coli RY13 BamHI来源于来源于B.amyloliquefaciensH in d IIHaemophilus(属名属名)Influenzae(种名种名)d(株系株系)罗马数字罗马数字限制性内切酶命名举例限制性内切酶命名举例 限制性内切酶分类限制性内切酶分类 已发现的限制酶可以分为三类或称已发现的限制酶可以分为三类或称作三型:作三型:I、II、III型。他们在酶反应中型。他们在酶反应中所需要的所需要的辅因子辅因子和和切割切割DNA的位点的位点都不都不相同,而且酶蛋白分子的大小和组成上相同,而且酶蛋白分子的大小和组成上也有差别。也有差
12、别。 类别类别反应必须因子反应必须因子专一性专一性 活性活性 I型S-腺苷基蛋氨酸,ATP,Mg2+识别部位和切点不同,无特定切割位点内切内切甲基化甲基化 II型型Mg2+切断识别部位或其附近的特定部位只有限制酶只有限制酶活性活性 III型ATP,Mg2+识别部位和切点不同,但切断特定部位内切内切甲基化甲基化限制性内切酶分类限制性内切酶分类 II II型限制酶的识别特异性型限制酶的识别特异性 回文识别序列回文识别序列 II型限制酶的识别序列大多是具有型限制酶的识别序列大多是具有 双重对称结构性结构双重对称结构性结构,或称回文序列或称回文序列 (Palindromic Sequence) 非典型
13、回文识别序列非典型回文识别序列 回文识别序列被一至几个其他核苷酸(回文识别序列被一至几个其他核苷酸(N)所间隔,得到的是非典型的双轴对称性序列所间隔,得到的是非典型的双轴对称性序列。 Bgl I GCCNNNN NGGCMst II CC TNAGG 非回文识别序列非回文识别序列 也有些限制酶识别序列非回文结构,切割位也有些限制酶识别序列非回文结构,切割位点在距识别序列点在距识别序列5至至13个个bp处。处。5 GACGCNNNNN 33 CTGCGNNNNNNNNNN 5例:例:Hgn I GACGC 有些限制酶可识别多重序列。如:有些限制酶可识别多重序列。如:Hind II,识别,识别序列
14、为序列为GTPyPuAC,可识别,可识别种序列。种序列。GTPyPuACGTCAACGTCGACGTTAACGTTGAC嘌呤(Purine)嘧啶(Pyrimidine)类似的内切酶还有类似的内切酶还有 Acc I 、Ava I 、Ban I 、Hae I 等,它等,它们的特异性低于单一识别序列的酶。们的特异性低于单一识别序列的酶。 识别序列的长度与剪切频率识别序列的长度与剪切频率 大部分大部分II型限制性内切酶的识别序列长度为型限制性内切酶的识别序列长度为4-8个个核苷酸。识别长度决定了剪切核苷酸。识别长度决定了剪切DNA的频率(的频率(1/4n,n为识别的长度)。为识别的长度)。识别长度愈长
15、,则切点少、产生片识别长度愈长,则切点少、产生片段少而长度长,酶特异性高。段少而长度长,酶特异性高。限制酶剪切频率片断大小特点Sau3A I (GA TC)1/44250 bp片断数目多,长独短,特异性低Hinf I (GANTC)1/451 kbEcoR I (GAA TTC)1/464 kb片断较少,长度适中NotI (GCGGCCGC)1/4865 kb可提供很长的片断,特异性强限制酶的切割特异性和限制酶的切割特异性和酶切片段的末端结构酶切片段的末端结构 切割位点专一切割位点专一 作为工具酶的作为工具酶的限制性内切酶限制性内切酶有固定的切割位点;有固定的切割位点; 产物具有特定的末端结构
16、产物具有特定的末端结构 当一个当一个DNA分子被限制酶切开后形成两个末端,全部分子被限制酶切开后形成两个末端,全部产物具有相同的末端结构。即一种限制性内切酶切割任何产物具有相同的末端结构。即一种限制性内切酶切割任何DNA只产生一种固定形式的末端结构,只产生一种固定形式的末端结构,在在DNA连接酶的作连接酶的作用下,磷酸二酯键可以修复而成为一个重组的用下,磷酸二酯键可以修复而成为一个重组的DNA分子;分子;而不同限制酶则形成不同末端结构。而不同限制酶则形成不同末端结构。5 - G3 - CTTAA +AATTC - 3 G - 55 - GAATTC - 33 - CTTAAG - 5 5 -
17、GAATTC - 33 - CTTAAG - 5 任何一种任何一种限制酶切割限制酶切割DNA链时,总是水解核苷酸链时,总是水解核苷酸 3、5-磷酸双酯键的磷酸双酯键的3位磷酸酯键,使产物的位磷酸酯键,使产物的5端带磷端带磷 酸单酯基团,而酸单酯基团,而3为游离羟基。为游离羟基。 由于切割位点不同,由于切割位点不同,所有的限制酶可产生两类末端结构所有的限制酶可产生两类末端结构 平末端平末端(Blunt End)指酶切片段为齐头末端结构)指酶切片段为齐头末端结构 。 粘性末端粘性末端(Cohesive End)酶切后)酶切后DNA片段末端带有片段末端带有 1-4个核苷酸残基长度的单链结构个核苷酸残
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- 工程 第十节 现代 生命科学 课件
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