2022年生物化学知识点总结2 .docx
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1、生物化学复习题第一章 绪论1. 名词说明生物化学:生物化学指利用化学的原理和方法,从分子水平争论生物体的化学组成,及其在体内的代谢转变规律,从而阐明生命现象本质的一门科学;其争论内容包括生物体的化学组成,生物分子的结构、性质及功能生物分子的分解与合成,反应过程中的能量变化生物信息分子的合成及其调控,即遗传信息的贮存、传递和表达;生物化学主要从分子水平上探究和说明生长、发育、遗传、记忆与思维等复杂生命现象的本质2. 问答题( 1)生物化学的进展史分为哪几个阶段?生物化学的进展主要包括三个阶段:静态生物化学阶段 (20 世纪之前):是生物化学进展的萌芽阶段,其主要工作是分析和争论生物体的组成成分以
2、及生物体的排泄物和分泌物动态生物化学阶段( 20 世纪初至 20 世纪中叶):是生物化学蓬勃进展的阶段,这一时期人们基本弄清了生物体内各种主要化学物质的代谢途径功能生物化学阶段(20 世纪中叶以后):这一阶段的主要争论工作是探讨各种生物大分子的结构与其功能之间的关系;( 2)组成生物体的元素有多少种?第一类元素和其次类元素各包含哪些元素?组成生物体的元素共28 种第一类元素包括 C、H、O、N 四中元素,是组成生命体的最基本元素;其次类元素包括S、P、Cl 、Ca、Na、Mg,加上 C、H、O、N 是组成生命体的基本元素;其次章 蛋白质1. 名词说明( 1)蛋白质:蛋白质是由很多氨基酸通过肽键
3、相连形成的高分子含氮化合物( 2)氨基酸等电点:当氨基酸溶液在某肯定pH 时,是某特定氨基酸分子上所带的正负电荷相等,称为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的pH 即为该氨基酸的等电点( 3)蛋白质等电点:当蛋白质溶液处于某一pH 时,蛋白质解离形成正负离子的趋势相等,即称为兼性离子,净电荷为0,此时溶液的 pH 称为蛋白质的等电点( 4)N 端与 C端: N 端(也称 N末端)指多肽链中含有游离- 氨基的一端, C端(也称 C末端)指多肽链中含有 - 羧基的一端(5) 肽与肽键:肽键是由一个氨基酸的- 羧基与另一个氨基酸的 - 氨基脱水缩合而形成的化学键,很多氨基酸以肽键形
4、成的氨基酸链称为肽(6) 氨基酸残基:肽链中的氨基酸不具有完整的氨基酸结构,每一个氨基酸的残余部分称为氨基酸残基( 7)肽单元(肽单位) :多肽链中从一个- 碳原子到相邻 - 碳原子之间的结构,具有以下三个基本特点肽单位是一个刚性的平面结构肽平面中的羰基与氧大多处于相反位置 - 碳和 -NH 间的化学键与 - 碳和羰基碳间的化学键是单键,可自由旋转(8) 结构域:多肽链的二级或超二级结构基础上进一步绕曲折叠而形成的相对独立的三维实体称为结构域;结构域具有以下特点空间上彼此分隔,具有肯定的生物学功能结构域与分子整体以共价键相连,一般难以分别(区分于蛋白质亚基)不同蛋白质分子中结构域数目不同,同一
5、蛋白质分子中的几个结构域彼此相像或很不相同(9) 分子病:由于基因突变等缘由导致蛋白质的一级结构发生变异,使蛋白质的生物学功能减退或丢失,甚至造成生理功能的变化而引起的疾病(10) 蛋白质的变构效应:蛋白质(或亚基)因与某小分子物质相互作用而发生构象变化, 导致蛋白质(或亚基)功能的变化,称为蛋白质的变构效应(酶的变构效应称为别构效应)( 11)蛋白质的协同效应:一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合才能的现象,称为协同效应,其中具有促进作用的称为正协同效应,具有抑制作用的称为负协同效应( 12)蛋白质变性:在某些物理和化学因素作用下,蛋白质分子的特定空
6、间构象被破坏, 从而导致其理化性质转变和生物活性的丢失,变性的本质是非共价键和二硫键的破坏,但不转变蛋白质的一级结构;造成变性的因素有加热、乙醇等有机溶剂、强碱、强酸、重金属离子和生物碱等,变形后蛋白质的溶解度降低、粘度增加,结晶才能消逝、生物活性丢失、易受蛋白酶水解( 14)蛋白质复性:如蛋白质的变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可部分复原其原有的构象和功能,称为复性2. 问答题(1) 组成生物体的氨基酸数量是多少?氨基酸的结构通式、氨基酸的等电点及运算公式?组成生物的氨基酸有 22 种,组成人体和大多数生物的为 20 种,结构通式如右图;氨基酸的等电点指当氨基酸溶液在某肯定 pH 时,
7、是某特定氨基酸分子上所带的正负电荷相等,称为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的 pH 即为该氨基酸的等电点,运算公式如下:甲硫氨酸(也称蛋氨酸)MetM中性氨基酸 pI1 pK 12pK 2 一氨基二羧基氨基酸pI二氨基一羧基氨基酸pI1 pK 1221 pK 2pK 2 pK 3 非极性氨基酸(疏水, 8 种)苯丙氨酸PheF( 2)氨基酸依据 R 基团的极性和在中性条件下带电荷的情形如何分类?并举例分类名称结构缩写色氨酸TrpW丙氨酸AlaA缬氨酸ValV非极性氨基酸(疏水, 8 种)亮氨酸LeuL异亮氨酸IleI脯氨酸ProP极性氨基酸(亲水,12 种)甘氨酸(中性氨
8、基酸,不带电)GlyG丝氨酸(中性氨基酸,不带电)SerS谷氨酸(酸性氨基酸,带负电)GluE苏氨酸(中性氨基酸,不带电)ThrT半胱氨酸CysC(中性氨基酸,不带电)酪氨酸极性氨基酸(亲水,12 种)赖氨酸(碱性氨基酸,带正电)LysK(中性氨基酸,不带电)TyrY天冬酰胺(中性氨基酸,不带电)AsnN精氨酸(碱性氨基酸,带正电)ArgR极性氨基酸(亲水,12 种)谷氨酰胺(中性氨基酸,不带电)GlnQ组氨酸(碱性氨基酸,带正电)HisH天冬氨酸AspD(酸性氨基酸,带负电)(3) 蛋白质中氮含量是多少,如何测定粗蛋白的氮含量?各种蛋白质的氮含量很接近,平均为16%;生物样品中,每得得1g
9、氮就相当于100/16=6.25g蛋白质;通常采纳定氮法测量蛋白质含量,其中较为经典的是凯氏定氮法 (粗蛋白测定的经典方法)(4) 蛋白质的二级结构有哪几种形式?其要点包括什么?蛋白质的二级结构包括 - 螺旋、 - 折叠、 - 转角和无规卷曲四种; - 螺旋要点:多肽链主链环绕中心轴形成右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧;每圈螺旋含 3.6 个氨基酸,螺距为 0.54nm;每个肽键的亚胺氢和第四个肽键的羰基氧形成的氢键保持螺旋稳固,氢键与螺旋长轴基本平行 - 折叠要点:多肽链充分舒展,相邻肽单元之间折叠形成锯齿状结构,侧链位于锯齿的上下方;两段以上的- 折叠结构平行排列,两链间可以顺向平行,也可以反向
10、平行; 两链间肽键之间形成氢键,以稳固- 折叠,氢键与螺旋长轴垂直 - 转角要点:肽链内形成180回折;含 4 个氨基酸残基,第一个氨基酸残基与第四个氨基酸残基形成氢键;其次个氨基酸残基常为Pro(脯氨酸)无规卷曲要点:没有确定规律性的肽链结构;是蛋白质分子的一些没有规律的松散的肽链构象,对蛋白质分子的生物功能有重要作用,可使蛋白质在功能上具有可塑性( 5)一个螺旋片段含有 180 个氨基酸残基,该片段中共有多少圈螺旋?运算该片段的轴长螺旋数为 180/3.6=50 ,轴长为 0.54 50=27nm( 6)维护蛋白质一级结构的作用力有哪些?维护空间结构的作用力有哪些?维护蛋白质一级结构的作用
11、力(主要的化学键):肽键,有些蛋白质仍包括二硫键维护空间结构的作用力:氢键、疏水键、离子键、范德华力等(统称次级键)非化学键和二硫键( 7)简述蛋白质结构与功能的关系蛋白质的一级结构:一级结构是空间构象的基础;同源蛋白质(在不同生物体内的作用相同或相像的蛋白质) 的一级结构的种属差异揭示了进化的历程,如细胞色素 C;一级结构的变化引起分子生物学功能的减退、丢失,造成生理功能的变化,甚至引起疾病;肽链的局部断裂是蛋白质的前体激活的重要步骤蛋白质的空间结构:变构蛋白可以通过空间结构的变化使其能够更充分、更和谐地发挥其功能,完成复杂的生物功能;蛋白质的变性与复性与其空间结构关系亲密;蛋白质的构象转变
12、可影响其功能,严峻时导致疾病的发生(蛋白质构象病,如疯牛病)( 8)简述蛋白质的常见分类方式依据分子外形分类:球状蛋白质、纤维状蛋白质、膜蛋白质依据化学组成分类:简洁蛋白质、结合蛋白质 结合蛋白质 =简洁蛋白质 +非蛋白质组分(辅基) 依据功能分类:酶、调剂蛋白、贮存蛋白、转运蛋白、运动蛋白、防备蛋白和毒蛋白、受体蛋白、支架蛋白、结构蛋白、反常蛋白( 9)简述蛋白质的主要性质两性解离和等电点:蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团在肯定的溶液pH 条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团;当蛋白质溶液处于某一 pH 时,蛋白质解离成正负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电
13、荷为0,此时溶液的 pH 为蛋白质的等电点蛋白质的胶体性质:蛋白质属生物大分子,其分子直径可达1-100nm 之间,为胶粒范畴之内,因而具有胶体的性质蛋白质的变性、沉淀和凝固:在某些物理和化学因素作用下,蛋白质分子的特定空间构象被破坏,从而导致其理化性质转变和生物活性的丢失,称为变性;如变性程度较轻, 除去变性因素后蛋白质仍可复原或部分复原其原有的构象及功能,称为复性;在肯定条件 下,蛋白疏水侧链暴露在外,肽链因相互缠绕继而集合,因而从溶液中析出,称为蛋白质的沉淀,变性的蛋白易于沉淀,有时蛋白质发生沉淀,但并不变性;蛋白质变性后的絮状物加热可变成比较坚固的凝块,此凝块不易溶解于强酸和强碱中,称
14、为蛋白质的凝固作用蛋白质的紫外吸取:由于蛋白质分子中含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm处有波长的特点性吸取峰,其吸取率和蛋白质浓度成正比(用来测含量)蛋白质的显色反应:经水解产生的氨基酸可发生于茚三酮的反应;蛋白质和多肽分子中的肽键在稀碱溶液中与硫酸铜共热,出现紫色或红色(称为双缩脲反应,用以检测水解程度)第三章 核酸1. 名词说明(1) 核苷:核苷是由戊糖与含氮碱基经脱水缩合而生成的化合物,在大多数情形下,核苷是由核糖或脱氧核糖的C1 - 羟基与嘧啶碱或嘌呤碱的N1 或 N9 进行缩合(生成的化学键称为 , N糖苷键)(2) 核苷酸:核苷酸是由核苷与磷酸经脱水缩合后生成的磷酸酯类
15、化合物,包括核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸两类,由于与磷酸基团羧基缩合的位置不同,分别生成 2 - 核苷酸、3- 核苷酸和 5 - 核苷酸(最常见为 5- 核苷酸)(3) 核酸的一级结构: 核苷酸通过 3 ,5 - 磷酸二酯键连接成核酸(即多聚核苷酸) ,DNA 的一级结构就是指 DNA分值中脱氧核糖核苷酸的排列次序及连接方式,RNA的一级结构就是 指 RNA分子中核糖核苷酸的排列次序及连接方式(4) DNA的复性与变性:核酸的变性指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,形成单链结构的过程,使之是失去部分或全部生物活性,但其变性并不涉及磷酸二酯键的断裂, 所以其一级结构并不转变;能够引起核酸变性
16、的因素很多,升温、酸碱度转变、甲醛和尿素都可引起核酸变性; 留意, DNA的变性过程是突变性的; 复性指变性核酸的互补链在适当的条件下重新地和成双螺旋结构的过程(5) 分子杂交:在退火条件下,不同来源的DNA互补链形成双链,或 DNA单链和 RNA单链的互补区域形成 DNA-RNA杂合双链的过程称为分子杂交(6) 增色效应:核酸变性后,260nm处的紫外吸取明显增加,这种现象称为增色效应(7) 减色效应:核酸复性后,紫外吸取降低,这种现象称为减色效应(8) 基因与基因组:基因指遗传学中DNA分子中最小的功能单位,某物种所含有的全部遗传物质称为该生物体的基因组,基因组的大小与生物的复杂性有关(
17、9)Tm(熔解温度):通常把加热变形使 DNA的双螺旋结构失去一半时的温度或紫外光吸取值达到最大值的 50%时的温度称为 DNA的解链温度,又称熔解温度或熔点( 10)Chargaff 定律:全部的 DNA分子中 A=T,G=C,即 A/T=G/C=1嘌呤的总数等于嘧啶的总数相等即 A+T=G+C含氮基与含酮羰基的碱基总数相等 A+C=G+T 同一种生物的全部体细胞 DNA的碱基组成相同,与年龄、健康状况、外界环境无关,可作为该物种的特点,用不对称比率( A+T)/ ( G+C)衡量亲缘越近的生物,其 DNA碱基组成越相近,即不对称比率越相近( 11)探针: 在核酸杂交的分析过程中,常将已知次
18、序的核苷酸片段用放射性同位素或荧光标记,这种带有肯定标记的已知次序的核酸片段称为探针2. 问答题( 1)某 DNA样品含腺嘌呤 15.1%(按摩尔碱基计) ,运算其余碱基的百分含量由已知 A=15.1%,所以 T=A=15.1%,因此 G+C=69.8%,又 G=C,所以 G=C=34.9%( 2)DNA和 RNA在化学组成、分子结构、细胞内分布和生理功能上的主要区分是什么?化学组成: DNA的基本单位是脱氧核糖核苷酸,每一分子脱氧核糖核苷酸包含一分子 磷酸,一分子脱氧核糖和一分子含氮碱基,DNA的含氮碱基有腺嘌呤( A)、鸟嘌呤( G)、胞嘧啶( C)、胸腺嘧啶( T)四种; RNA的基本单
19、位是核糖核苷酸,每一分子核糖核苷酸包含一分子磷酸、一分子核糖和一分子含氮碱基,RNA的含氮碱基有腺嘌呤( A)、鸟嘌呤( G)、胞嘧啶( C)、尿嘧啶( U)四种;分子结构: DNA为双链分子,其中大多数是是链状结构大分子,也有少部分呈环状;RNA为单链分子;细胞内分布:DNA90%以上分布于细胞核,其余分布于核外如线粒体、 叶绿体、 质粒等; RNA在细胞核和细胞液中都有分布;生理功能: DNA分子包含有生物物种的全部遗传信息;RNA主要负责 DNA遗传信息的翻译和表达, 分子量要比 DNA小得多,某些病毒 RNA也可作为遗传信息的载体( 3)简述 DNA双螺旋结构模型的要点及生物学意义DN
20、A双螺旋结构的要点: DNA 分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(DNA单链)组成;两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构;螺旋中两条链的方向相反,其中一条链的方向为 5 3 ,另一条链的方向35;碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱 氧核糖位于螺旋外侧,碱基环平面与轴垂直,糖基环平面与碱基环平面呈90角;螺旋横截面的直径为 2nm,每条链相邻碱基平面之间的距离为0.34nm,每 10 个核酸形成一个螺旋,其螺距高度为 3.4nm;维护双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键,碱基的相互结合具有严格的配对规律,嘌呤碱基的总数等于嘧啶碱基的总数生物学意义:双螺旋结构模型供应了DNA复制的机理,说明了遗传
21、物质自我复制的机制;模型是两条链,而且碱基互补;复制之前,氢键断裂,氢键断裂,两条链彼此分开,每条链作为一个模板复制除一条新的互补链,这样就得到了两对链,解决了遗传复制中样板的分子基础(4) DNA的三级结构在原核生物和真核生物中各有什么特点?绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋,假如再进一步盘绕就形成麻花 状的超螺旋三级结构;真核生物中,双螺旋的DNA分子环绕一蛋白质八聚体进行盘绕,从而形成特别的串珠状结构,称为核小体,属于DNA的三级结构(5) 细胞内含哪几种主要的RNA?其结构和功能是什么?细胞内的主要 RNA是 mRN、A tRNA 和 rRNA;mRN:A 单链 RNA,
22、功能是将 DNA的遗传信息传递到蛋白质合成基地核糖核蛋白体 tRNA:单链核酸,但在分子中的某些局部部位也可形成双螺旋结构,保守性最强;二级结构由于局部双螺旋的形成而出现三叶草形,三级结构由三叶草形折叠而成,呈倒L 型;功能是将氨基酸活化搬运到核糖体,参与蛋白质的合成rRNA:细胞中含量最多(RNA总量的 80%),与蛋白质组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所;在原核生物中,有5S、16S、23S,16S 的 rRNA 参与构成蛋白体的小亚基,5S 和23S 的 rRNA参与构成核蛋白体的大亚基; 在真核生物中, rRNA有四种 5S、5.8S 、18S、28S, 其中 18S 参与构成核蛋
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