聚类之层次聚类基于划分的聚类(共22页).doc
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1、精选优质文档-倾情为你奉上5聚类之层次聚类基于划分的聚类(k 一、层次聚类1、层次聚类的原理及分类1)层次法(Hierarchicalmethods)先计算样本之间的距离。每次将距离最近的点合并到同一个类。然后,再计算类与类之间的距离,将距离最近的类合并为一个大类。不停的合并,直到合成了一个类。其中类与类的距离的计算方法有:最短距离法,最长距离法,中间距离法,类平均法等。比如最短距离法,将类与类的距离定义为类与类之间样本的最短距离。层次聚类算法根据层次分解的顺序分为:自下底向上和自上向下,即凝聚的层次聚类算法和分裂的层次聚类算法(agglomerative和divisive),也可以理解为自下
2、而上法(bottom-up)和自上而下法(top-down)。自下而上法就是一开始每个个体(object)都是一个类,然后根据linkage寻找同类,最后形成一个“类”。自上而下法就是反过来,一开始所有个体都属于一个“类”,然后根据linkage排除异己,最后每个个体都成为一个“类”。这两种路方法没有孰优孰劣之分,只是在实际应用的时候要根据数据特点以及你想要的“类”的个数,来考虑是自上而下更快还是自下而上更快。至于根据Linkage判断“类”的方法就是最短距离法、最长距离法、中间距离法、类平均法等等(其中类平均法往往被认为是最常用也最好用的方法,一方面因为其良好的单调性,另一方面因为其空间扩张
3、/浓缩的程度适中)。为弥补分解与合并的不足,层次合并经常要与其它聚类方法相结合,如循环定位。 2)Hierarchical methods中比较新的算法有BIRCH(BalancedIterative Reducingand Clustering Using Hierarchies利用层次方法的平衡迭代规约和聚类)主要是在数据量很大的时候使用,而且数据类型是numerical。首先利用树的结构对对象集进行划分,然后再利用其它聚类方法对这些聚类进行优化;ROCK(AHierarchical ClusteringAlgorithm for Categorical Attributes)主要用在ca
4、tegorical的数据类型上;Chameleon(A Hierarchical Clustering AlgorithmUsing Dynamic Modeling)里用到的linkage是kNN(k-nearest-neighbor)算法,并以此构建一个graph,Chameleon的聚类效果被认为非常强大,比BIRCH好用,但运算复杂度很高,O(n2)。2、层次聚类的流程凝聚型层次聚类的策略是先将每个对象作为一个簇,然后合并这些原子簇为越来越大的簇,直到所有对象都在一个簇中,或者某个终结条件被满足。绝大多数层次聚类属于凝聚型层次聚类,它们只是在簇间相似度的定义上有所不同。 这里给出采用最
5、小距离的凝聚层次聚类算法流程:(1) 将每个对象看作一类,计算两两之间的最小距离;(2) 将距离最小的两个类合并成一个新类;(3) 重新计算新类与所有类之间的距离;(4) 重复(2)、(3),直到所有类最后合并成一类。 聚类的效果如下图,黑色是噪音点:另外我们可以看出凝聚的层次聚类并没有类似基本K均值的全局目标函数,没有局部极小问题或是很难选择初始点的问题。合并的操作往往是最终的,一旦合并两个簇之后就不会撤销。当然其计算存储的代价是昂贵的。3、层次聚类的优缺点优点:1,距离和规则的相似度容易定义,限制少;2,不需要预先制定聚类数;3,可以发现类的层次关系;4,可以聚类成其它形状缺点:1,计算复
6、杂度太高;2,奇异值也能产生很大影响;3,算法很可能聚类成链状 r语言中使用hclust(d,method = complete, members=NULL) :进行层次聚类。d为距离矩阵;method表示类的合并方法,single最短距离法,complete最长距离法,median中间距离法,mcquitty 相似法,average 类平均法,centroid重心法,ward离差平方和法;members为NULL或d长度的矢量。二、划分聚类法k-means基于划分的方法(Partition-based methods):其原理简单来说就是,想象你有一堆散点需要聚类,想要的聚类效果就是“类内的
7、点都足够近,类间的点都足够远”。首先你要确定这堆散点最后聚成几类,然后挑选几个点作为初始中心点,再然后依据预先定好的启发式算法(heuristicalgorithms)给数据点做迭代重置(iterativerelocation),直到最后到达“类内的点都足够近,类间的点都足够远”的目标效果。Partition-based methods聚类多适用于中等体量的数据集,但我们也不知道“中等”到底有多“中”,所以不妨理解成,数据集越大,越有可能陷入局部最小。1、Kmeans算法的原理k-means算法以k为参数,把n个对象分成k个簇,使簇内具有较高的相似度,而簇间的相似度较低。k-means算法的处
8、理过程如下:首先,随机地选择k个对象,每个对象初始地代表了一个簇的平均值或中心,即选择K个初始质心;对剩余的每个对象,根据其与各簇中心的距离,将它赋给最近的簇;然后重新计算每个簇的平均值。这个过程不断重复,直到准则函数收敛,直到质心不发生明显的变化。通常,采用平方误差准则,误差的平方和SSE作为全局的目标函数,即最小化每个点到最近质心的欧几里得距离的平方和。此时,簇的质心就是该簇内所有数据点的平均值。选择K个点作为初始质心 repeat 将每个点指派到最近的质心,形成K个簇 重新计算每个簇的质心 until 簇不发生变化或达到最大迭代次数 时间复杂度:O(tKmn),其中,t为迭代次数,K为簇
9、的数目,m为记录数,n为维数空间复杂度:O(m+K)n),其中,K为簇的数目,m为记录数,n为维数K-Means 算法的详细过程从上图中,我们可以看到,A, B, C, D, E 是五个在图中点。而灰色的点是我们的种子点,也就是我们用来找点群的点。有两个种子点,所以K=2。然后,K-Means的算法如下:随机在图中取K(这里K=2)个种子点。然后对图中的所有点求到这K个种子点的距离,假如点Pi离种子点Si最近,那么Pi属于Si点群。(我们可以看到A,B属于上面的种子点,C,D,E属于下面中部的种子点)接下来,我们要移动种子点到属于他的“点群”的中心。(见图上的第三步)然后重复第2)和第3)步,
10、直到,种子点没有移动(我们可以看到图中的第四步上面的种子点聚合了A,B,C,下面的种子点聚合了D,E)。 聚类的效果如下图,折线是历次循环时3个簇的质心的更新轨迹,黑点是初始质心: 我们查看基本K均值算法实现步骤及上面的聚类效果可以发现,该聚类算法将所有数据点都进行了指派,不识别噪音点。另外选择适当的初试质心是基本K均值过程的关键。2、k均值的优缺点及分类优点:1,简单,易于理解和实现;2,时间复杂度低缺点:1)kmeans要手工输入类数目,对初始值的设置很敏感;所以有了k-means+、intelligent k-means、genetic k-means;2)k-means对噪声和离群值非
11、常敏感,所以有了k-medoids和k-medians;3)k-means只用于numerical类型数据,不适用于categorical类型数据,所以k-modes;4)k-means不能解决非凸(non-convex)数据,所以有了kernel k-means。5)k-means主要发现圆形或者球形簇,不能识别非球形的簇。3、k-means与DBSCAN的区别k-means聚类算法的初始点选择不稳定,是随机选取的,这就引起聚类结果的不稳定。k-means属于动态聚类,往往聚出来的类有点圆形或者椭圆形。kmeans对于圆形区域聚类效果较好,dbscan基于密度,对于集中区域效果较好。对于不规
12、则形状,kmeans完全无法用,dbscan可以起到很好的效果。4、k-means注意问题1)K如何确定 kmenas算法首先选择K个初始质心,其中K是用户指定的参数,即所期望的簇的个数。这样做的前提是我们已经知道数据集中包含多少个簇,但很多情况下,我们并不知道数据的分布情况,实际上聚类就是我们发现数据分布的一种手段。如何有效的确定K值,这里大致提供几种方法:与层次聚类结合2 经常会产生较好的聚类结果的一个有趣策略是,首先采用层次凝聚算法决定结果粗的数目,并找到一个初始聚类,然后用迭代重定位来改进该聚类。稳定性方法3 稳定性方法对一个数据集进行2次重采样产生2个数据子集,再用相同的聚类算法对2
13、个数据子集进行聚类,产生2个具有k个聚类的聚类结果,计算2个聚类结果的相似度的分布情况。2个聚类结果具有高的相似度说明k个聚类反映了稳定的聚类结构,其相似度可以用来估计聚类个数。采用次方法试探多个k,找到合适的k值。系统演化方法3 系统演化方法将一个数据集视为伪热力学系统,当数据集被划分为K个聚类时称系统处于状态K。系统由初始状态K=1出发,经过分裂过程和合并过程,系统将演化到它的稳定平衡状态Ki,所对应的聚类结构决定了最优类数Ki。系统演化方法能提供关于所有聚类之间的相对边界距离或可分程度,适用于明显分离的聚类结构和轻微重叠的聚类结构。使用canopy算法进行初始划分4 基于CanopyMe
14、thod的聚类算法将聚类过程分为两个阶段 Stage1、聚类最耗费计算的地方是计算对象相似性的时候,CanopyMethod在第一阶段选择简单、计算代价较低的方法计算对象相似性,将相似的对象放在一个子集中,这个子集被叫做Canopy,通过一系列计算得到若干Canopy,Canopy之间可以是重叠的,但不会存在某个对象不属于任何Canopy的情况,可以把这一阶段看做数据预处理; Stage2、在各个Canopy内使用传统的聚类方法(如K-means),不属于同一Canopy 的对象之间不进行相似性计算。从这个方法起码可以看出两点好处:首先,Canopy 不要太大且Canopy 之间重叠的不要太多
15、的话会大大减少后续需要计算相似性的对象的个数;其次,类似于K-means这样的聚类方法是需要人为指出K的值的,通过Stage1得到的Canopy 个数完全可以作为这个K值,一定程度上减少了选择K的盲目性。 其他方法如贝叶斯信息准则方法(BIC)可参看文献5。2)初始质心的选取 选择适当的初始质心是基本kmeans算法的关键步骤。常见的方法是随机的选取初始质心,但是这样簇的质量常常很差。处理选取初始质心问题的一种常用技术是:多次运行,每次使用一组不同的随机初始质心,然后选取具有最小SSE(误差的平方和)的簇集。这种策略简单,但是效果可能不好,这取决于数据集和寻找的簇的个数。 第二种有效的方法是,
16、取一个样本,并使用层次聚类技术对它聚类。从层次聚类中提取K个簇,并用这些簇的质心作为初始质心。该方法通常很有效,但仅对下列情况有效:(1)样本相对较小,例如数百到数千(层次聚类开销较大);(2)K相对于样本大小较小 第三种选择初始质心的方法,随机地选择第一个点,或取所有点的质心作为第一个点。然后,对于每个后继初始质心,选择离已经选取过的初始质心最远的点。使用这种方法,确保了选择的初始质心不仅是随机的,而且是散开的。但是,这种方法可能选中离群点。此外,求离当前初始质心集最远的点开销也非常大。为了克服这个问题,通常该方法用于点样本。由于离群点很少(多了就不是离群点了),它们多半不会在随机样本中出现
17、。计算量也大幅减少。 第四种方法就是上面提到的canopy算法。3)距离的度量 常用的距离度量方法包括:欧几里得距离和余弦相似度。两者都是评定个体间差异的大小的。欧几里得距离度量会受指标不同单位刻度的影响,所以一般需要先进行标准化,同时距离越大,个体间差异越大;空间向量余弦夹角的相似度度量不会受指标刻度的影响,余弦值落于区间-1,1,值越大,差异越小。但是针对具体应用,什么情况下使用欧氏距离,什么情况下使用余弦相似度? 从几何意义上来说,n维向量空间的一条线段作为底边和原点组成的三角形,其顶角大小是不确定的。也就是说对于两条空间向量,即使两点距离一定,他们的夹角余弦值也可以随意变化。感性的认识
18、,当两用户评分趋势一致时,但是评分值差距很大,余弦相似度倾向给出更优解。举个极端的例子,两用户只对两件商品评分,向量分别为(3,3)和(5,5),这两位用户的认知其实是一样的,但是欧式距离给出的解显然没有余弦值合理。4)质心的计算 对于距离度量不管是采用欧式距离还是采用余弦相似度,簇的质心都是其均值,即向量各维取平均即可。5)算法停止条件 一般是目标函数达到最优或者达到最大的迭代次数即可终止。对于不同的距离度量,目标函数往往不同。当采用欧式距离时,目标函数一般为最小化对象到其簇质心的距离的平方和。 当采用余弦相似度时,目标函数一般为最大化对象到其簇质心的余弦相似度和。6)空聚类的处理 如果所有
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- 层次 基于 划分 22
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