2022年分子生物学电子教案第十章.pdf
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1、第十章原核生物基因表达调控1课程教学内容(1) 原核生物基因表达调控的概述(2) 乳糖操纵子(3) 色氨酸操纵子的负调控(4) 阿拉伯糖的操纵子(5) 正调控系统和负调控系统2课程重点、难点原核生物基因表达调控的一般机制、乳糖操纵子、色氨酸操纵子的负调控。3课程教学要求(1)掌握原核生物表达调控的特点、方式和意义及相关概念;(2)掌握和理解乳糖操纵子和色氨酸操纵子的结构和作用机理;(3)了解其它调控方式。原核生物细胞的基因和蛋白质种类较少。如大肠杆菌基因组约为4.6106bp,假如每个基因长 1000bp,一个细菌就有4000 个左右的基因能合成4000 种左右的蛋白质,据估计一个细胞中总共含
2、有107 个蛋白质分子,如果每个基因等同翻译的话,任何一个多肽应有2500 个拷贝, 但是这些蛋白质并不是以相同拷贝存在于每个细胞中,有些蛋白质数目相当固定,另一些变化很大。例如,每个大肠杆菌细胞可以有约15000 个核糖体,与其结合的约50 种核糖体蛋白数量是十分恒定的,糖酵解体系的酶含量很大,其数目也极恒定,此外,如DNA聚合酶、 RNA 聚合酶等都是代谢过程中十分必需的酶或蛋白质,其合成速率不受环境变化或代谢状态的影响,这一类蛋白质的合成称为永久型,另一类型则称为适应型或调节型,这类蛋白质的合成速率明显地受环境的影响而改变。例如, 一般情况下, 一个大肠杆菌细胞中只有1-5 个分子的 -
3、半乳糖苷酶,但若将细胞培养在只含有乳糖的培养基中,每细胞中这个酶的量可高达几万分子,其他糖代谢的酶、氨基酸、核苷酸合成系统的酶类,其合成速度和总量都随培养条件的变化而改变。细菌中所利用的大多数基本调控机制执行下列规则,一个体系在需要时被打开,不需要时被关闭,这种“开-关”活性是通过调节转录来建立的,也就是说mRNA 的合成是可以被调节的。实际上,当我们说一个系统处于“off”状态时,也有本底水平的基因表达,常常是每世代每个细胞只合成1 或 2 个 mRNA 分子,因而合成少量蛋白质分子,为了方便,我们通常用“ off ”这一术语,但必须明白所谓“关”实际意思是基因表达是特别低,很难甚至无法检测
4、。所有生物的遗传信息,都是以基因的形式储藏在细胞内的DNA 分子中。随着个体的发育,DNA 分子能有序地将其所承载的遗传信息通过密码子反密码子实验,转变为蛋白质分子,执行各种生理生化功能完成生命的全过程。科学家把这个DNA 到蛋白质的过程称为基因表达,对这个过程的控制称为基因表达调控时间和空间概念,掌握了基因表达调控的秘密,我们手中就有了一把揭示生物学奥妙的金钥匙。基因表调控主要表现在以下几个方面(1)转录水平上的调控(2)mRNA 加工成熟水平上的调控(3)翻译水平上的调控基因调控的指挥系统也是多样的,不同的生物使用不同的信号来指挥基因调控。原核生物中,营养状况和环境因素对基因表达起着举足轻
5、重的影响。在真核生物尤其是高等真核生物中激精品资料 - - - 欢迎下载 - - - - - - - - - - - 欢迎下载 名师归纳 - - - - - - - - - -第 1 页,共 13 页 - - - - - - - - - - 素水平和发育阶段是基因表达调控的最得要手段,营养和环境因素的影响力大为下降。一、原核基因调控总论基因表达的第一步是遗传信息从DNA 分子转移到RNA 分子的转录过程, 这种 RNA 分子中一条反义链为模板,在依赖于DNA 的 RNA 聚合酶的催化作用下进行的一种聚合反应,转录的可靠性是一个十分复杂的问题,它包括以下几个方面(1)如何在复杂的核基因组内确定正
6、确的转录起始位点?(2)如何将核苷酸按照密码子序列插入新生的RNA 链中?(3)如何使 RNA 聚合反应进行到底即如何保证合成完整的RNA ?(4)如何确定转录的终止?这种在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA 的结构、 RNA 聚合酶的功能、 蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。在研究转录及转录调控以前,我们先来分析一下原核与真核生物转录与翻译的特点:因为细菌mRNA 在形成过程中与核糖体混合在一起,所以细菌的转录与翻译过程几乎发生在同一个时间间隔内,转录与翻译相偶联;真核生物中, 转录产物只有从核内运到核外,才能被核糖体翻译成蛋白质。(图解)(一)转录调节的类型根据某一体系代谢活性调节的
7、类型,转录水平上的调节可分为如下几种方式:( 1)代谢产物对基因活性的调节; (2)弱化因子对基因活性的影响;(3)降解物对基因活性的调节;(4)细菌的应急反应。1、 代谢产物对基因活性的调节在降解代谢途径中,起始端的酶 (一般指催化第一步反应的酶)的底物浓度往往决定是否合成这一途径中的其他各种酶。相反,在合成代谢中,最终产物则往往是调节物质。在单顺反子 mRNA 翻译出蛋白质的体系中,该蛋白质可以充当自我调节的角色,其浓度决定了启动子的转录活性, 每一调节类型的分子机理相差甚远。但一般可以分为负调节与正调节两种情况。在负调节体系中, 细胞中存在着抑制物,它使转录处于关闭状态,抗抑制物通常称为
8、诱导物,在转录的开启中发挥重要作用。在正调节体系中, 一个效应物分子激活启动子,而抑制物也在正调节中起作用,正负调节之间并不相互排斥,有些系统中既有正调节,也有负调节,因而需要两种调节物。调节类型及其特点调节物结合到DNA 上正调节负调节是开启关闭否关闭开启通过特殊代谢物调节的基因活性主要有可诱导和可阻遇两大类:(1)可诱导调节:是指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由原来关闭的状态转变为工作状态, 即在某些物质的诱导下使基因活化。这类基因中最突出的例子是大肠杆菌的乳核操纵子。大肠杆菌在含有葡萄糖的培养基中可以长得很好,在只含乳糖的培养基中,开始时生长不好,直到合成了利用乳糖的一系列酶,
9、具备了利用乳糖作为碳源的能力,才能在这一培养基中生存下来,细菌获得这一能力的原因就是因为在诱导物乳糖的诱导作用下,开动了乳糖操纵子,表达它编码的3 个酶: 半乳糖苷酶(使乳糖水解为半乳糖和葡萄糖);半乳糖苷透过酶(使乳糖进入细菌细胞内);半乳糖苷乙酰基转移酶(使半乳糖第6 位碳原子乙酰化)。这个操纵子开动的效果是十分明显的,以半乳糖苷酶为例在葡萄糖培养基中生长时,每个细胞只有几个酶分子,但若转移到乳糖培养基中,几分钟后,每个细菌细胞内可产生 3000 个酶分子,这一类基因称为可诱导基因,这类酶称为诱导酶,这种生化过程称精品资料 - - - 欢迎下载 - - - - - - - - - - -
10、欢迎下载 名师归纳 - - - - - - - - - -第 2 页,共 13 页 - - - - - - - - - - 为酶的诱导过程。(2)可阻遏调节:这类基因平时都是开启的,处在产生蛋白质或酶的工作过程中,但由于一些特殊代谢物或化合物的积累将其关闭,阻遏了基因的表达,所以称为可阻遏基因。如大肠杆菌色氨酸的合成,色氨酸为生活中必需的氨基酸,所以它的操纵子是一直开启着的。当细菌的培养基中加入色氨酸,于是细菌完全可以利用培养基中现成的色氨酸来维持,无需化力气来合成。这种基因称为阻遏基因,这些酶称为可阻遏酶,这个现象称为可阻遏现象,这些起阻遏作用的小分子称为抑制物。一般规律:(1)可诱导的操纵
11、子是一些编码糖和氨基酸水解代谢蛋白的基因,这些糖和氨基酸平时含量很少,因此, 细菌总是利用更一般的能源物质葡萄糖的水解来提供能量,所以这些操纵子常常是关闭的,但当生存条件发生变化,如葡萄糖缺乏而必须利用乳糖作为能源时,就要打开这些基因; (2)可阻遏基因情况恰好相反,它们是一些合成各种细胞代谢过程中所必需的小分子物质的基因,由于这些小分子物质在生命过程中的重要地位,这些基因总是打开着的,当这些小分子在细菌生活环境中含量较高时,就关闭这些基因,停止其合成。2、 弱化因子对基因活性的影响属这种调节方式的有大肠杆菌中的色氨酸操纵子、苯丙氨酸操纵子、苏氨酸操纵子、 异亮氨酸操纵子和缬氨酸操纵子,以及沙
12、门氏菌的组氨酸操纵子和亮氨酸操纵子、嘧啶合成操纵子等。在这种调节方式中,起信号作用的是有特殊负载的氨基酰tRNA 的浓度,如色氨酸操纵子中是色氨酰tRNA 浓度, 当操纵子被阻遏,RNA 合成被终止时, 起终止转录信号作用的那一段核苷酸称为弱化子,这种因为核糖体在基因转录产物的不同位置,决定了RNA 可以形成哪一种形式的二级结构,并由此决定基因能否继续转录的调节方式确定是异常巧妙的,起调节作用的信号分子是细胞中某一氨基酸或嘧啶浓度只要稍加变动就可影响整个体系的功能。3、 降解物对基因活性的调节操纵子学说的核心是使基因从表达抑制状态中解脱出来进行转录,是从负调节的角度来考虑基因表达调控的,那么有
13、没有从相反的角度进行调节,从而提高基因的转录水平,使它由原来的低水平表达变成高水平表达的呢?这就是降解物抑制作用的调节。有葡萄糖存在的情况下,即使在细菌培养基中加入乳糖、半乳糖、 阿拉伯糖或麦芽糖等诱导物,与其相对应的操纵子也不会启动,产生通过代谢这些糖的酶来,这种现象称为葡萄糖效应或称为降解物抑制作用的调节。添加葡萄糖后, 细菌所需要的能量便可从葡萄糖得到满足,葡萄糖是最方便能源,细菌无需开动一些不常用的基因去利用这些稀有的糖类。由于葡萄糖的存在会抑制细菌的腺苷酸环化酶,减少环腺苷酸(cAMP )的合成,与它结合的蛋白质(cAMP 受体蛋白)因找不到配体而不能形成复合物,这个复合物是一个正调
14、节物质,可以与操纵子上的启动区结合,起动基因转录,所以有葡萄糖存在时, 不易形成复合物cAMP CRP 形成复合物并与启动子结合,促进乳糖操纵子的表达,降解物抑制作用是通过促进基因转录来正调节基因表达的,这是一种积极的调节方式。4、 细菌的应急反应上面讲述的是细菌处于正常生活条件下的基因表达调节方式,所谓“正常” 也包括生活环境中缺少某一种或两种能源,但能找到其他代用物。可是细菌有时会碰到万分紧急的状况,比如氨基酸饥饿时,就不是缺少一、二个氨基酸,而是氨基酸的全面匮乏,为了紧缩开支,渡过难关,细菌将会产生一个应急反应,包括生产各种RNA ,糖脂肪和蛋白质在内的几乎全部生物化学反应过程均被停止,
15、实施这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(pppGpp)和鸟苷五磷酸( pppGpp) 。产生这两种物质的诱导物是空载tRNA 。精品资料 - - - 欢迎下载 - - - - - - - - - - - 欢迎下载 名师归纳 - - - - - - - - - -第 3 页,共 13 页 - - - - - - - - - - 当氨基酸饥饿时,细胞中便存在大量的不带氨基酸的tRNA ,这种空载的tRNA 会激活焦磷酸转移酶,使pppGpp 大量合成,其浓度可增加10 倍以上。 ppGpp 的出现会出现关闭许多基因,当然也会打开一些合成氨基酸的基因,以应付这种紧急状况,关于PPGpp 的作用原理还不太
16、清楚。据认为RNA聚合酶有不同的构型,这些构象可以识别不同的启动子区,ppGpp 与 RNA 聚合酶结合会使它的某些构象稳定下来,从而改变了基因转录的效率,或关闭,或减弱, 或增加; 也有人认为, 基因的转录起始附近有一些保守序列,它们可能是ppGpp或有关调节蛋白的结合位点,当这些信点上的启动子与ppGpp 结合后,就使它们不再与RNA聚合酶结合,基因被关闭,与的作用范围十分广泛,它不是只影响一个或几个操纵子,而是影响一大批,所以它们是超级调控因子。(二)环腺苷酸受体蛋白对转录的调控环腺苷酸( CAMP )受体蛋白(CRP)并称分解代谢激活蛋白(CAP ) ,当大肠杆菌生长在缺乏葡萄糖的培养
17、基中,CAMP 合成量增加,与CRP 结合后所形成的复合物具有激活半乳糖( gal) 、麦芽糖、乳糖(lac)等启动子的功能,它是由两个相同亚基组成的二聚体,每个亚基含有210 个氨基酸残基,分为两个结构域,氨基末端结构域与CAMP 结合,羧基末端结构域与 DNA 结合, cAMP 的结合能提高CRP 对双链 DNA 的亲和力, CRP 与启动子结合是激活转录的必需条件。根 据17个 能 与CRP结 合 只 启 动 子 序 列 进 行 分 析 的 结 果 表 明 , 存 在 以5 TGTGANNTNNNCANAT 3为特征的共同序列,其中TGTGA 保守性最强。一些依赖于CRP 的启动子缺乏一
18、般启动子所具有的典型的-35 区序列特征, 因此,大肠杆菌RNA 聚合酶难以与其结合,CRP 的存在能显著提高酶与启动子的结合常数,有研究证明,CRP 与Lac 启动子的最强结合区域达到2830bp,结合后能使DNA 做 90 180 的弯曲,为酶分子提供结合部位,另一方面,酶的存在又提高了CAMP CRP 与 lac 和 gal 启动子的亲和力,在 cAMP 存在的条件下, 酶能与 CRP 共沉淀, 这些事实说明, 酶与 CRP 可以发生相互作用,由此推想, CRP 通过改变启动子构象以及与酶的相互作用帮助酶分子正确定向以便与-10 区结合实际,起到了取代-35 区功能的作用。CRP 还能抑
19、制RNA 聚合酶与DNA 中其他位点的结合,从而提高与某一特定启动子结合概率。二、乳糖操纵子操纵子学说是, 关于原核生物基因结构及其表达调控的学说,它是由法国巴斯德研究所著名科学家 Jacob和 Monod 在 1961 年首先提出,并在10 年内经许多科学家的补充和修正得以逐步完善。大肠杆菌乳糖操纵子(lectose operon)包括 3 个结构基因: Z、Y 和 A,以及启动子、控制子和阻遏子等,转录时 RNA 聚合酶首先与启动区(P)结合, 通过操纵区 (O)向右转录,转录从 O 区的中间开始,按ZYA,每次转录出来的一条mRNA 上都带有这3 个基因,转录的调控是在启动区和操纵区进行
20、的。(图解)3 个结构基因各决定一种酶:Z 编码 -半乳糖苷酶; Y 编码 -半乳糖苷透过酶;A 编码 -半乳糖苷乙酰基转移酶。-半乳糖苷酶是一种-半乳糖苷键的专一性酶,除能将乳糖果水解成葡萄糖和半乳糖外,还能水解其他 -半乳糖苷, -半乳糖苷透过酶的作用是使外界的-半乳糖苷 (如乳糖) 能透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入细胞内,所以大肠杆菌如半乳糖为碳源和能源的话,以上两酶是必需的。-半乳糖苷乙酰基转移酶的作用是把乙酰辅酶A 上的乙酰基转移到 半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖,它在乳糖的利用中并非必须。精品资料 - - - 欢迎下载 - - - - - - - - - - - 欢迎下载 名师归纳
21、- - - - - - - - - -第 4 页,共 13 页 - - - - - - - - - - (一)酶的诱导Lac 体系受调控的证据1、 Lac 基因的诱导表达乳糖代谢体系的开启和关闭的过程如下:(1)在不含乳糖及-乳糖的培养基中,Lac+基因型大肠杆菌细胞内-半乳糖苷酶和透过酶的浓度很低,每个细胞内大约只有1-2 个酶分子,但是,如果在培养基中加入乳糖,酶的浓度很快达到细胞总蛋白量的6%或 7%,每个细胞中可有超过105 个酶分子。(2)有乳糖供应时,在无葡萄糖培养基中生长的Lac+细菌, -半乳糖苷酶和透过酶将同时合成,进一步用32P 标记的mRNA 与模板 DNA 进行定量分子
22、杂交,表明培养基中加入乳糖 12min 后,编码 -半乳糖苷酶和透过酶的LacmRNA 量就明显迅速增加,去掉乳糖后, LacmRNA 量立即下降到几乎无法检测,表明乳糖确定能激发LacmRNA 的合成,科学家对于这个操纵子诱导作用的机理奠定了我们对代谢调节认识的基石。实验室里通常使用含硫的乳糖类似物异丙基巯基半乳糖苷(IPTG)和巯甲基半乳糖苷(TMG ) ,另外,在酶活性分析中通常用生色底物O-硝基半乳糖苷(ONPG) 。研究发现,它们都是高效诱导物,因为这些都不是半乳糖苷酶的底物,所以又称为安慰性诱导物。(3)为了证实诱导物的作用是诱导新酶合成,而不是将已存在于细胞中的酶前体转化为有活性
23、的酶,设计了同位素示诱实验,把大肠杆菌细胞放在加有放射性35S 标记的氨基酸但没有任何半乳糖苷诱导物的培养基中,随着培养基中诱导物的加入,-半乳糖苷酶便开始合成,分离纯化-半乳糖苷酶,发现这种酶无35S 标记,说明酶的合成不是由前体转化而来的,而是加入诱导物后新合成的。2、 I 型和 O 型的发现及其意义已经分离到一种在有诱导物或没有诱导物的情况下都能产生LacmRNA 的突变体, 这种失去调节能力的突变体称为永久型突变体,Jacob和 Monod 用这两种突变体构建了各种局部二倍体细胞,并将这些突变株归纳为两类:I 型和 O 型,为了和野生型相区别,两类突变型分别以下列符号标记:I 型:野生
24、型为I+,突变型为I;O 型:野生型为O+,突变型为Oc。这样的突变往往是多效性突变,因为I+ I 或 O+Oc 后, Z、Y、A 结构基因均表现为永久表达,所以I 基因被称为调节基因(regnlatory gene) 。I 突变株的行为像大多数基因的隐性突变那样,当I+ 细胞停止LacmRNA 的合成时, I突变体中仍然有LacmRNA 合成,很显然,I 基因是一个产生抑制物的调节基因,其产物使体系关闭, I 突变体由于不能产生这种抑制物,细胞因此成为Lac 永久型,在I+/ I 的局部二位体中有一个正常的I 基因, Lac 操纵子的表达仍然可能被抑制。Jocob和 Monod 称I 基因产
25、物为Lac 阻遏物,最初人们还不清楚Lac 阻遏物究竟是一种蛋白质还是一种由I 基因转录形成的RNA 分子,后来发现此基因有琥珀突变体,初步证明了是一种蛋白质,1967年,人们首次分离到了阻遏物,并使之纯化。OC 突变体的一个显著特征是某些情况下表现出显性,这些 OC 突变体显性特征的重要意义在某些二倍体中更加清楚,这两种组合由于有功能正常Z 基因而表现为Lac+。但OCZ/O+Z+ ,尽管有 OC 突变存在, -半乳糖苷酶的合成仍然是可诱导型的两个组合的差异在于OC 突变存与Z突变处于同一个DNA 分子中,而7 种 OC 与 Z+在同一个DNA 分子上,所以只有当OC 与 Z+在同一个DNA
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- 2022 年分 生物学 电子 教案 第十
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