7基因芯片数据分析.pptx
( 4.5 )《7基因芯片数据分析.pptx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《7基因芯片数据分析.pptx（50页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、一、一、cDNA微阵列芯片微阵列芯片一、基因芯片数据提取与过滤一、基因芯片数据提取与过滤(一一) cDNA微阵列芯片微阵列芯片)22/()11(BCHICHBCHICHRatio(二二) Affymetrix公司的原位合成芯片公司的原位合成芯片定性信息提取：P/A/M(Present/Absent/Marginal） 定量信息提取：基于探针集汇总后的基因水平的荧光信号强度值 RG2log)/(log2GRM = log2R - log2GA = (log2R + log2G)/2cIxxf 实验条件下的表达值通常以2倍差异为阈值，判断基因是否差异表达22212121/nsnsxxt运用t检验法
2、可以判断基因在两不同条件下的表达差异是否具有显著性 2)(ijijxxSS总2)(xxnSSiii组间2)(ijiijxxSS组内组间组间组间vMSSS组内组内组内vMSSS组内组间MSMSF 方差分析可用于基因在两种或多种条件间的表达量的比较，它将基因在样本之间的总变异分解为组间变异和组内变异两部分。通过方差分析的假设检验判断组间变异是否存在，如果存在则表明基因在不同条件下的表达有差异。021ssxxdpdpEdPd1imiippHlog1基本思想基本思想：在不断的学习过程中，输出层的神经元根据输入样本的特点进行权重调整，最后拓朴结构发生了改变 21, 0, 0)(LLbxwxgT决策树分类算法output训练集决策树inputikiippNH12log)()()()(2211NHnnNHnnNHGainkjjpNGini121)()()()(2211NGininnNGininnNGiniGini
- 配套讲稿：
如PPT文件的首页显示word图标，表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制：
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片，仅作为作品整体效果示例展示，禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词：
- 基因芯片 数据 分析
淘文阁 - 分享文档赚钱的网站所有资源均是用户自行上传分享，仅供网友学习交流，未经上传用户书面授权，请勿作他用。
限制150内