生物仪器分析期末重点.doc
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1、【精品文档】如有侵权,请联系网站删除,仅供学习与交流一、二、三、四、 生物仪器分析期末重点.精品文档.五、 名词解释1、 精密度(precision):是指用同样的方法所测得的数据相互一致性的程度,是表征数据随机误差大小的一个量,一般用标准偏差来度量,标准偏差越大,仪器精密度越低。2、 检出限(detection limit):指在适当的置信水平上被检出的组分的最小量。3、 灵敏度(sensitivity):物质单位浓度或单位质量的变化所引起的响应信号值变化的程度,也就是校正曲线的斜率,斜率越大,则灵敏度越大。4、 沉降系数:指单位离心力作用下颗粒的沉降速度。5、 沉降速度:在离心作用下颗粒在
2、单位时间内运动的距离。6、 生色团:指分子中能吸收紫外或可见光的基团,其含有非键轨道和分子轨道的电子体系。主要包括乙烯基、羧基、亚硝基、偶氮基、乙炔基、氰基。7、 助色团:指能使生色团吸收峰向长波方向移动并增强其强度的基团。8、 溶剂效应:指由溶剂极性不同造成的化合物吸收光谱的红移或蓝移现象。9、 蓝移:溶液极性增强,导致激发态能量下降,并且导致跃迁所需能量下降,最大吸收波长max发生红移。10、 红移:溶剂极性增强,导致跃迁所需能量增大,最大吸收波长max发生蓝移。11、 增色效应:由于助色团或生色团的引入,以及溶剂的影响,吸收强度增大。12、 减色效应:由于基团取代或溶剂的影响,吸收强度减
3、小。13、 溶剂效应:指由溶剂极性不同造成的化合物吸收光谱的红移或蓝移现象。14、 朗伯比尔定律:当一束平行单色光垂直照射到样品溶液时,溶液的吸光度与溶液的浓度及光程成正比关系。AlgT= kbc A : 吸光度,T : 透射比, K :比例常数,b : 光程(溶液厚度),c :溶液浓度15、 半峰宽:一半荧光强度时,所对应的发射波长范围,被称为荧光半峰宽。16、 荧光寿命():当激发光切断后荧光强度衰减至原强度的1/e所经历的时间,它表示荧光分子S1激发态的平均寿命。 在没有非辐射跃迁发生的情况下, = 1/kfkf : 荧光发射的速率常数,即单位时间内发射的光子数K:各种分子内的非辐射跃迁
4、过程的速率常数之和17、 荧光量子产率:荧光物质吸收后,所发射的荧光的光子数与所吸收的激发光的光子数的比值。荧光量子产率越大,单位浓度的荧光物质的荧光强度越大,荧光性能更加优越18、 荧光淬灭:荧光分子与溶剂分子或其它溶质分子的相互作用而引起的荧光量子产率降低的作用。19、荧光阈值:在荧光定量PCR扩增的指数期,画一条线,在此直线上,所有样品的荧光强度与其本底荧光强度的差值全部相同。20、CT值:PCR扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数。21、死时间(t M ):不被固定相吸附或溶解的物质经过色谱柱时,从进样到出现峰极大值所需的时间称为死时间。22、分配系数 (
5、K ):它是指在一定温度和压力下,组分在固定相和流动相之间分配达平衡时的浓度比。23、分配比 (kappa) :分配比又称容量因子,它是指在一定温度和压力下,组分在固定相和流动相之间分配达平衡时的质量比,即 :24、分离因子:也称为选择因子,是样品中两个最难分离组分(A和B)的相对保留值之比。25、亲和色谱:是利用生物分子和固定相表面存在的某种特异性的靶向性和亲和力,进行选择性分离的一种方法。26、固定相:通常是在担体表面键合具有生物识别能力的生物分子(配体),担体如果是凝胶,还可以实现“亲和尺寸排阻”双重作用。27、显微镜分辨率(resolution):指显微镜将近邻的两个质点分辨清楚的能力
6、,通常是用显微镜所能分辨清楚最近的相邻两点间的距离(即最小分辨距离)来表示。28、焦点深度:简称焦深,指在使用显微镜时,当焦点对准标本某一点时,不仅看清这一点,而且它的上下两侧也能同时看清楚,看到的物体不仅仅是一个平面,而且还能看到一定的厚度,这个清晰的厚度就是焦深。29、镜像亮度(image brightness):指显微镜中观察到的图像的明暗程度,在一定放大倍数下,与数值孔径的平方成正比。30、视场亮度(field brightness):指显微镜中观察到的整个视场的明暗程度。31、分离度:又叫分辨率,是相邻两组分(A和B)色谱峰保留值之差的两倍与两组分色谱峰底宽之和的比值。六、 填空、选
7、择、判断知识点1:1)玻璃匀浆器 原理:筒状套管和槌管之间的挤压作用 应用:动物细胞和组织 优点:温和、便捷 缺点:效率较低、不适合于植物组织和微生物细胞的破碎2)超声波细胞破碎仪原理:超声波在液体中的空化效应,压迫、挤碎细胞 应用:细菌细胞、动物细胞、以及组织破碎 优点:快速、高效缺点:作用剧烈,容易破坏蛋白质相互作用,厚壁细胞(如酵母和植物细胞)的破碎效率较低3)玻璃珠细胞破碎仪原理:在剧烈震荡中,通过玻璃珠的球磨作用破碎细胞应用:微生物细胞、动植物细胞、组织、尤其是某些厚壁细胞的破碎(如酵母细胞和植物细胞)优点:快速、高效缺点:样品处理量低,仪器噪音大,容易发热,对样品产生影响4)高压细
8、胞破碎仪原理:高压产生的挤压作用破碎细胞或组织应用:几乎所有微生物细胞、动植物细胞优点:快速、高效、处理量大、可低温控制缺点:价格相对昂贵5)高速组织捣碎机原理:通过叶片刀高速搅拌应用:较为坚硬的组织或样品,如骨骼、植物果实,一般用于细胞破碎前的组织样本预处理优点:处理质地坚硬的样品缺点:容易过热影响样品,并且不适合处理细胞样品6)高温消解仪原理:通过高温、强酸(硝酸)、强氧化剂(高锰酸钾)彻底破坏细胞或组织的结构应用:针对所有样本,为元素分析制备样品,如重金属含量的检测1、为了研究植物细胞内蛋白质相互作用,破碎较为坚硬的植物叶片,应该首选(B)制备得到细胞浆液后,再用(E)破碎细胞A 玻璃匀
9、浆器; B 高速组织捣碎机;C 超声波细胞破碎仪; D 高温消解仪;E 高压细胞破碎仪2、为了测定大米中重金属镉含量是否超标,应选用(D)制备样品A 玻璃匀浆器; B 高速组织捣碎机;C 超声波细胞破碎仪; D 高温消解仪;E 高压细胞破碎仪知识点2:颗粒最大、最沉的下沉的快,质量相同形状不同的,球形颗粒比不规则形状的颗粒要快,密度大的比密度小的快,水中的颗粒沉降比油中的颗粒沉降快。知识点3:知识点4:溶剂效应:指由溶剂极性不同造成的化合物吸收光谱的红移或蓝移现象,例如:*跃迁:溶液极性增强,导致激发态能量下降,激发态极性大于基态极性,下降更多,并且导致跃迁所需能量下降,最大吸收波长max发生
10、红移。n*跃迁:溶剂极性增强,基态n电子容易与极性溶剂形成氢键,从而降低基态能量,导致跃迁所需能量增大,最大吸收波长max发生蓝移。知识点5:代表性生物分子的紫外-可见吸收光谱1、 大多数氨基酸在可见光区(380-750 nm)和近紫外区(200-380 nm)范围内没有吸收,只有芳香族氨基酸(Phe、Tyr、Trp)具有近紫外区(280nm)的吸收,因为它们的R基带有苯环共轭 键系统。1、苯丙氨酸(Phe)max : 257 nm max : 200 Lmol-1 cm-1 2、酪氨酸(Tyr)max : 275 nm max : 1400 Lmol-1 cm-1 3、色氨酸(Trp)max
11、 : 280 nm max : 5600 Lmol-1 cm-1 2、 嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使得碱基、核苷、核苷酸和核酸分子在240-290 nm处具有强烈吸收,最大吸收值在260 nm附近。3、 核酸分子的紫外吸收与其碱基的相互作用具有很大关系,其中变性(单链)核酸分子的max 相对于双链核酸分子的max大,这是由于双链的形成导致碱基对的电子云发生重叠,产生减色效应,减少了对紫外光的吸收。DNA变性(增色效应);DNA复性(减色效应4、 最有用的吸收光谱往往是基于n*跃迁和*跃迁而产生的。5、核酸的定量和纯度检测纯DNA: OD260 / OD280 = 1.8;OD260 / OD
12、230 = 2.5 纯RNA: OD260 / OD280 = 2.0 ;OD260 / OD230 = 2.5 OD260 / OD280 1.8 或 2.0,则样品污染了蛋白质或苯酚类物质OD260 / OD230 2.5,则样品污染了糖类、无机盐和有机溶剂知识点6:荧光与磷光的比较:1) 产生过程:荧光是从S1 S0的辐射跃迁,磷光是从T1 S0的辐射跃迁2)寿命:荧光寿命较短10-710-9s,磷光寿命较长10-410s知识点7:生物样本自荧光的主要来源 苯丙氨酸Phe 酪氨酸Tyr 色氨酸Trp来源:蛋白质(由芳香族氨基酸引起)和一些小分子代谢物特点:荧光强度较弱,最大发射波长一般小
13、于500 nm还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)最大激发波长:340 nm;最大发射波长:450 nm知识点8:设计qPCR 实验的关键一步是选择监测目标序列扩增的化学方法,可用的荧光化学方法多种多样,被分为2 大类:1)DNA 结合染料(SYBR Green I),2)荧光探针(分子信标和TaqMan)这一类方法利用荧光共振能量传递(FRET),或一些其它荧光淬灭形式来保证仅在扩增产物出现时特异的荧光知识点9:优化的qPCR实验应该满足以下几方面的要求:1. 标准品、待检测的未知样品和阴性对照样品,在相同条件下和同一次qPCR实验环境中进行扩增;2. 每个样品至少具有3个平行重复,
14、且检测到的 CT 值波动范围在 0.1-0.2之内,表明各重复样品的数据具有良好的一致性;3. 标准曲线的相关系数(R2)大于0.98,表明各标准品具有一致的扩增效率;4. 标准曲线的斜率应在 -3 到 -3.5 之间,能够反映出标准品的10倍梯度稀释关系;5. 扩增效率应在 90-105%之间,表明反应体系具有良好的扩增性能;6. 如果是SYBR Green I 法,熔链曲线分析中,只出现单一峰,表明扩增过程具有良好的特异性,扩增产物仅为单一的目的片段,结果可靠;7. 通过熔链曲线分析,阴性对照中无扩增发生,既不会产生特异性产物,也不会产生非特异性产物,表明整个扩增体系和过程中,没有污染外源
15、DNA片段,并且不会产生非特异性优化方法:1、无扩增产物:降低退火温度, 增加模板用量, 增加镁离子浓度,减少dNTP用量,增加酶用量,重新设计引物2、非特异性:提高退火温度, 减少模板用量, 减少镁离子浓度,减少酶用量,重新设计引物3、扩增效率过高或过低:降低模板用量,重新稀释标准品,注意加样操作4、R2值过低:重新稀释标准品,注意加样操作5、污染发生:更换模板和实验用具知识点10:1、由于该物质不被色谱柱吸附或溶解,因此死时间可以被用来测定流动相的平均线速度2、相对保留值只与柱温和固定相性质有关,而与柱径、柱长、填充情况和流动相流速无关,因此是色谱分析方法中广泛使用的定性依据3、速率理论式
16、中 H为板高,u 为流动相线速度,A, B, C分别为涡流扩散项系数、分子扩散项系数、传质阻力扩散项系数4、分离度又叫分辨率,是相邻两组分(A和B)色谱峰保留值之差的两倍与两组分色谱峰底宽之和的比值,即知识点11:色谱方法的选择根据样品物理、化学性质选择色谱方法;各种气体、沸点5000C以下挥发性、热稳定的样品,一般采用气相色谱分析;非挥发性样品,包括有机物、无机物、高分子化合物等均可采用液相色谱分析。知识点12:正相色谱法:流动相极性小于固定相极性,即亲水的固定相选用疏水的流动相;在正相色谱法中:极性小的组分,保留时间短,先出峰;极性大的组分,保留时间长,后出峰。反相色谱法:流动相极性大于固
17、定相极性,即疏水的固定相选用亲水的流动相;在反相色谱法中:极性大的组分,保留时间短,先出峰;极性小的组分,保留时间长,后出峰知识点13:离子交换原理离子交换色谱法是利用不同离子对离子交换剂的亲和力差异实现分离;离子交换剂一般采用离子交换树脂,树脂上分布有固定的带电荷基团和游离的平衡离子,分析物质电离后产生的离子可与树脂上游离的平衡离子进行可逆交换;根据交换的对象,可分为阳离子交换树脂(带负电荷)和阴离子交换树脂(带正电荷),它们各自的交换反应过程分别如下:阳离子交换:阴离子交换:如果增加盐离子的浓度,则可降低样品离子的竞争吸附能力,从而降低其在固定相上的保留值PH视情况不同而定,增大pH值会使
18、酸的解离增加,使碱的解离减少;降低pH值,其结果相反;对于单纯的酸或碱,只要解离增加,就可以增大保留值;对于两性电解质,情况则要复杂一些蛋白质离子交换色谱蛋白质的等电点(isoelectric point IP)蛋白质所带正、负电荷相等,即总净电荷为零时,溶液对应的 pH 称该蛋白质等电点对于中性pH下,某种带有正电荷的蛋白质,可通过阳离子交换色谱进行纯化,知识点14:尺寸排阻色谱原 理:组分中,尺寸(流体力学体积)较大的分子由于不能进入凝胶颗粒的内部,而只能通过凝胶颗粒之间的缝隙,因此保留时间最短,最先流出;尺寸中等的组分,可以进入较大的凝胶颗粒的内部,同时经过凝胶颗粒之间的缝隙,因此,保留
19、时间较长,相对于大尺寸组分,后流出;尺寸最小的组分,可以进入所有凝胶颗粒的内部,并经过凝胶颗粒之间的缝隙,所经过路径最长,因此,保留时间最长,最后流出;此外,形状规则的分子比形状不规则的分子先流出尺寸排阻色谱的特点:1. 由于溶剂分子非常小,在绝大多数情况下,可被认为是试样中尺寸最小的组分,因此,最后流出这样试样中的待分离组分的保留时间均小于死时间,这与其他色谱是完全相反的;2. 组分不是通过两相之间的作用力差异来进行分离,而是按照组分的大小和形状进行分离知识点15:亲和色谱亲和色谱是利用生物分子和固定相表面存在的某种特异性的靶向性和亲和力,进行选择性分离的一种方法固定相:通常是在担体表面键合
20、具有生物识别能力的生物分子(配体),担体如果是凝胶,还可以实现“亲和尺寸排阻”双重作用流动相:一般选择离子强度较小、pH接近中性的缓冲液分离原理:组分首先与固定相上键合的配体进行作用,能够与配体进行特异性识别和相互作用的组分将被保留,而不能作用的组分则先被洗脱,然后通过高盐或者可溶性配体对与配体结合的组分进行洗脱,因此存在如下关系:不能与配体发生特异性亲和作用的组分:保留值小,先出峰;能够与配体发生特异性亲和作用的组分:保留值大,后出峰;常用的亲和识别对包括:抗原抗体;生物素(biotin)链合亲霉素(SA);组氨酸镍;酶底物(如,谷胱甘肽S转移酶谷胱甘肽);钙钙调蛋白等知识点16:数值孔径又
21、称为(numerical aperture NA),是物镜前透镜与被检测物体之间介质的折射率()和孔径角()半数的正弦之乘积,用公式表示如下:显微镜的有效放大倍数取决于其NA的大小,一般是NA的5001000 倍;可见,提高NA,可以提高有效放大倍数;焦深与放大率和NA成反比;NA越大,焦深越浅NA大的物镜,工作距离小,这是因为相应的孔径角较大视场直径与视场数成正比,与物镜倍率成反比前向散射(FSC)也称小角散射,该值的大小与细胞的直径成近似线性关系,即细胞尺寸越大,其FSC越大,反之亦然侧向散射(SSC)也称90散射,它对细胞膜、胞质和核膜的折射更加敏感,其散射强度几乎与细胞内颗粒结构的质量
22、成近似线性关系,即细胞内部颗粒结构越复杂、质量越大,其SSC越大,反之亦然七、 计算题1、 离心力与转速的换算:离心力: F m2r 习惯上F常以相对离心力(RCF)的大小来衡量:RCF m2r /mg 2r /g g980cm/s将上式中角速度用转速n (rpm;r/min)来表示: 2n/60 则 RCF ( 2n/60) 2r /g 1.11910-5n2r ( 单位:g)例如:文献中报道,对某样品的离心使用半径为23.5 cm的转头,12,000 r/min离心30 min可获得较好的离心结果,但是你的实验室中只有25 cm转头,请问如何重复出文献中的离心效果?RCF 1.11910-
23、5n2rRCF 3, 7866.96 g2、3、塔板理论如果色谱柱长度为 L,理论塔板数用n表示,则柱长度、理论塔板高度、理论塔板数的关系如下:但是,在上述公式中,由于死时间 tM 包括在保留时间 tR 内,但是流动相并不参与两相分配过程,计算出的理论塔板数比实际偏高,因此提出将死时间 tM 扣除,再来计算有效塔板数八、 论述题1、 朗伯比尔定律:当一束平行单色光垂直照射到样品溶液时,溶液的吸光度与溶液的浓度及光程成正比关系。AlgT= bc : 摩尔吸光系数 表示物质的浓度为1mol/L,液层厚度为1cm时溶液的吸光度,单位: (Lmol-1 cm-1) A=lg (I0 / It ) lg
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- 生物 仪器 分析 期末 重点
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