生物化学教学讲稿2wyc.doc
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1、【精品文档】如有侵权,请联系网站删除,仅供学习与交流生物化学教学讲稿2wyc.精品文档.生物化学讲稿 生物化学教学讲稿 第一章 绪论第二章 蛋白质的结构与功能第三章 维生素第四章 酶第五章 生物氧化第六章 糖代谢第七章 脂类代谢第八章 蛋白质分解代谢第九章 核酸的结构、功能与核苷酸代谢第十章 基因信息的传递第十一章 癌基因与抑癌基因第十二章 分子生物学常用技术及其应用第十三章 细胞信号转导第一章 绪论一、生物化学的的概念:生物化学(biochemistry)是利用化学的原理与方法去探讨生命的一门科学,它是介于化学、生物学及物理学之间的一门边缘学科。二、生物化学的发展:1叙述生物化学阶段:是生物
2、化学发展的萌芽阶段,其主要的工作是分析和研究生物体的组成成分以及生物体的分泌物和排泄物。2动态生物化学阶段:是生物化学蓬勃发展的时期。就在这一时期,人们基本上弄清了生物体内各种主要化学物质的代谢途径。3分子生物学阶段:这一阶段的主要研究工作就是探讨各种生物大分子的结构与其功能之间的关系。三、生物化学研究的主要方面:1人体的物质组成:人体主要由蛋白质、核酸、糖类、脂类以及水、无机盐等组成,此外还含有一些低分子物质。2生物分子的结构与功能:通过对生物大分子结构的理解,揭示结构与功能之间的关系。3物质代谢及其调节:物质代谢的基本过程主要包括三大步骤:消化、吸收中间代谢排泄。其中,中间代谢过程是在细胞
3、内进行的,最为复杂的化学变化过程,它包括合成代谢,分解代谢,物质互变,代谢调控,能量代谢几方面的内容。44基因信息传递及调控:研究DNA的结构与功能,DNA复制、RNA转录、蛋白质生物合成等及基因表达的调控。四、生物化学与医学: 生物化学的理论与技术为发病机制的阐明,疾病诊断、治疗、预防等提供了方法和手段。第二章 蛋白质的结构与功能一、氨基酸:1结构特点:氨基酸(amino acid)是蛋白质分子的基本组成单位。构成天然蛋白质分子的氨基酸约有20种,除脯氨酸为-亚氨基酸、甘氨酸不含手性碳原子外,其余氨基酸均为L-氨基酸。2分类:根据氨基酸的R基团的极性大小可将氨基酸分为四类: 非极性中性氨基酸
4、(8种); 极性中性氨基酸(7种); 酸性氨基酸(Glu和Asp); 碱性氨基酸(Lys、Arg和His)。二、 肽键与肽链:肽键(peptide bond)是指由一分子氨基酸的-羧基与另一分子氨基酸的-氨基经脱水而形成的共价键(-CO-NH-)。氨基酸分子在参与形成肽键之后,由于脱水而结构不完整,称为氨基酸残基。每条多肽链都有两端:即自由氨基端(N端)与自由羧基端(C端),肽链的方向是N端C端。三、肽键平面(肽单位):肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转;组成肽键的四个原子及其相邻的两个碳原子处在同一个平面上,为刚性平面结构,称为肽键平面。四、蛋白质的分子结构:蛋白质的分子结构可人为分为一级
5、、二级、三级和四级结构等层次。一级结构为线状结构,二、三、四级结构为空间结构。1一级结构:指多肽链中氨基酸的排列顺序,其维系键是肽键。蛋白质的一级结构决定其空间结构。2二级结构:指多肽链主链骨架盘绕折叠而形成的构象,借氢键维系。主要有以下几种类型:-螺旋:其结构特征为:主链骨架围绕中心轴盘绕形成右手螺旋;螺旋每上升一圈是3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm; 相邻螺旋圈之间形成许多氢键; 侧链基团位于螺旋的外侧。影响-螺旋形成的因素主要是: 存在侧链基团较大的氨基酸残基; 连续存在带相同电荷的氨基酸残基; 存在脯氨酸残基。-折叠:其结构特征为: 若干条肽链或肽段平行或反平行排列成片; 所有肽
6、键的C=O和NH形成链间氢键;侧链基团分别交替位于片层的上、下方。-转角:多肽链180回折部分,通常由四个氨基酸残基构成,借1、4残基之间形成氢键维系。无规卷曲:主链骨架无规律盘绕的部分。3三级结构:指多肽链所有原子的空间排布。其维系键主要是非共价键(次级键):氢键、疏水键、范德华力、离子键等,也可涉及二硫键。4四级结构:指亚基之间的立体排布、接触部位的布局等,其维系键为非共价键。亚基是指参与构成蛋白质四级结构的而又具有独立三级结构的多肽链。五、 蛋白质的理化性质:1两性解离与等电点:蛋白质分子中仍然存在游离的氨基和游离的羧基,因此蛋白质与氨基酸一样具有两性解离的性质。蛋白质分子所带正、负电荷
7、相等时溶液的pH值称为蛋白质的等电点。2蛋白质的胶体性质:蛋白质具有亲水溶胶的性质。蛋白质分子表面的水化膜和表面电荷是稳定蛋白质亲水溶胶的两个重要因素。3蛋白质的紫外吸收:蛋白质分子中的色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸残基对紫外光有吸收,以色氨酸吸收最强,最大吸收峰为280nm。4蛋白质的变性、沉淀和凝固:蛋白质在某些理化因素的作用下,其特定的空间结构被破坏而导致其理化性质改变及生物活性丧失,这种现象称为蛋白质的变性。引起蛋白质变性的因素有:高温、高压、电离辐射、超声波、紫外线及有机溶剂、重金属盐、强酸强碱等。绝大多数蛋白质分子的变性是不可逆的。5. 蛋白质的呈色反应: (1)双缩脲反应; (2)印三
8、酮反应; (3) folin-酚试剂反应。六、蛋白质的分类:1. 按组成成分分类:单纯蛋白质和结合蛋白质。2. 按分子形状分类:球状蛋白质和纤维状蛋白质3. 按功能分类:活性蛋白质和非活性蛋白质。第三章 维生素维生素(vitamin)是指一类维持细胞正常功能所必需的,但在许多生物体内不能自身合成而必须由食物供给的小分子有机化合物。维生素可按其溶解性的不同分为脂溶性维生素和水溶性维生素两大类。脂溶性维生素有VitA、VitD、VitE和VitK四种;水溶性维生素有VitB1,VitB2,VitPP,VitB6,VitB12,VitC,泛酸,生物素,叶酸等。1.TPP:即焦磷酸硫胺素,由硫胺素(V
9、it B1)焦磷酸化而生成,是脱羧酶的辅酶,在体内参与糖代谢过程中-酮酸的氧化脱羧反应。2.FMN和FAD:即黄素单核苷酸(FMN)和黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD),是核黄素(VitB2)的衍生物。FMN或FAD通常作为脱氢酶的辅基,在酶促反应中作为递氢体(双递氢体)。3.NAD+和NADP+:即尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+,辅酶)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+,辅酶),是Vit PP的衍生物。NAD+和NADP+主要作为脱氢酶的辅酶,在酶促反应中起递氢体的作用,为单递氢体。4.磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺:是Vit B6的衍生物。磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺可作为氨基转移酶,氨基酸脱羧酶,半
10、胱氨酸脱硫酶等的辅酶。5.CoA:泛酸(遍多酸)在体内参与构成辅酶A(CoA)。CoA中的巯基可与羧基以高能硫酯键结合,在糖、脂、蛋白质代谢中起传递酰基的作用,是酰化酶的辅酶。6.生物素:是羧化酶的辅基,在体内参与CO2的固定和羧化反应。7. FH4:由叶酸衍生而来。四氢叶酸是体内一碳单位基团转移酶系统中的辅酶。8. Vit B12衍生物:Vit B12分子中含金属元素钴,故又称为钴胺素。Vit B12在体内有多种活性形式,如5-脱氧腺苷钴胺素、甲基钴胺素等。其中,5-脱氧腺苷钴胺素参与构成变位酶的辅酶,甲基钴胺素则是甲基转移酶的辅酶。第四章 酶一、酶的概念:酶(enzyme)是由活细胞产生的
11、生物催化剂,这种催化剂具有极高的催化效率和高度的底物特异性,其化学本质是蛋白质。酶按照其分子结构可分为单体酶、寡聚酶和多酶体系(多酶复合体和多功能酶)三大类。二、酶的分子组成:酶分子可根据其化学组成的不同,可分为单纯酶和结合酶(全酶)两类。结合酶则是由酶蛋白和辅助因子两部分构成,酶蛋白部分主要与酶的底物特异性有关,辅助因子则与酶的催化活性有关。与酶蛋白疏松结合并与酶的催化活性有关的耐热低分子有机化合物称为辅酶。与酶蛋白牢固结合并与酶的催化活性有关的耐热低分子有机化合物称为辅基。三、辅酶与辅基的来源及其生理功用:辅酶与辅基的生理功用主要是: 运载氢原子或电子,参与氧化还原反应。 运载反应基团,如
12、酰基、氨基、烷基、羧基及一碳单位等,参与基团转移。大部分的辅酶与辅基衍生于维生素。四、金属离子的作用:1. 稳定构象:稳定酶蛋白催化活性所必需的分子构象;2. 构成酶的活性中心:作为酶的活性中心的组成成分,参与构成酶的活性中心;3. 连接作用:作为桥梁,将底物分子与酶蛋白螯合起来。五、酶的命名与分类:1酶的命名:主要有习惯命名法与系统命名法两种,但常用者为习惯命名法。2酶的分类:根据1961年国际酶学委员会(IEC)的分类法,将酶分为六大类: 氧化还原酶类:催化氧化还原反应;转移酶类:催化一个基团从某种化合物至另一种化合物;水解酶类:催化化合物的水解反应;裂合酶类:催化从双键上去掉一个基团或加
13、上一个基团至双键上;异构酶类:催化分子内基团重排;合成酶类:催化两分子化合物的缔合反应。六、酶促反应的特点:1具有极高的催化效率:酶的催化效率可比一般催化剂高1061020倍。酶能与底物形成ES中间复合物,从而改变化学反应的进程,使反应所需活化能阈大大降低,活化分子的数目大大增加,从而加速反应进行。2具有高度的底物特异性:一种酶只作用于一种或一类化合物,以促进一定的化学变化,生成一定的产物,这种现象称为酶作用的特异性。 绝对特异性:一种酶只能作用于一种化合物,以催化一种化学反应,称为绝对特异性,如琥珀酸脱氢酶。相对特异性:一种酶只能作用于一类化合物或一种化学键,催化一类化学反应,称为相对特异性
14、,如脂肪酶。立体异构特异性:一种酶只能作用于一种立体异构体,或只能生成一种立体异构体,称为立体异构特异性,如L-精氨酸酶。3酶的催化活性是可以调节的:如代谢物可调节酶的催化活性,对酶分子的共价修饰可改变酶的催化活性,也可通过改变酶蛋白的合成来改变其催化活性。七、酶的活性中心:酶分子上具有一定空间构象的部位,该部位化学基团集中,直接参与将底物转变为产物的反应过程,这一部位就称为酶的活性中心。参与构成酶的活性中心的化学基团,有些是与底物相结合的,称为结合基团,有些是催化底物反应转变成产物的,称为催化基团,这两类基团统称为活性中心内必需基团。在酶的活性中心以外,也存在一些化学基团,主要与维系酶的空间
15、构象有关,称为酶活性中心外必需基团。八、酶原酶原的激活:处于无活性状态的酶的前身物质就称为酶原。酶原在一定条件下转化为有活性的酶的过程称为酶原的激活。酶原的激活过程通常伴有酶蛋白一级结构的改变。酶原分子一级结构的改变导致了酶原分子空间结构的改变,使催化活性中心得以形成,故使其从无活性的酶原形式转变为有活性的酶。酶原激活的生理意义在于:保护自身组织细胞不被酶水解消化。九、同工酶:在同一种属中,催化活性相同而酶蛋白的分子结构,理化性质及免疫学性质不同的一组酶称为同工酶。同工酶在体内的生理意义主要在于适应不同组织或不同细胞器在代谢上的不同需要。因此,同工酶在体内的生理功能是不同的。乳酸脱氢酶同工酶(
16、LDHs)为四聚体,在体内共有五种分子形式,即LDH1(H4),LDH2(H3M1),LDH3(H2M2),LDH4(H1M3)和LDH5(M4)。心肌中以LDH1含量最多,LDH1对乳酸的亲和力较高,因此它的主要作用是催化乳酸转变为丙酮酸再进一步氧化分解,以供应心肌的能量。在骨骼肌中含量最多的是LDH5,LDH5对丙酮酸的亲和力较高,因此它的主要作用是催化丙酮酸转变为乳酸,以促进糖酵解的进行十、酶活性的调节:可以通过改变其催化活性而使整个代谢反应的速度或方向发生改变的酶就称为限速酶或关键酶。酶活性的调节可以通过改变其结构而使其催化活性以生改变,也可以通过改变其含量来改变其催化活性,还可以通过
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