细菌性病害检测的海水养殖研究论文(精品).docx
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1、细菌性病害检测的海水养殖研究论文1国内外海水养殖品种主要病害检测方法针对以上养殖鱼种主要细菌性病害,各国研究人员为开发快速、准确、有效的诊断方法广泛开展工作。笔者等将目前已报道的国内、国外主要海水养殖细菌性病害检测方法总结为下面几种类型进行叙述。1.1基于微生物生理生化检测的方法针对养殖鱼种细菌性病原的检测,最经典的鉴定方法是对病原进行分离纯化,基于形态学检测、生理学和通过一系列的生理生化实验实现对微生物的初步鉴定。然而,这种方法耗时长、操作繁琐,不利于细菌性病害的快速诊断。法国生物梅里埃公司于1970年开发出一系列微生物鉴定用生理生化检测试剂盒,使细菌鉴定更简单快速。该系列试剂盒已成为国际公
2、认的鉴定细菌的参考标准,目前在海水养殖鱼类细菌性病害的诊断中,已将API系列试纸条检测结果作为鉴定的辅助手段之一。Abdel-Aziz等采用API20NE生理生化检测试剂盒与分子鉴定相结合,对导致埃及沿海养殖金头鲷和欧洲海鲈大量死亡的病原进行了鉴定,确定了溶藻弧菌、副溶血弧菌和美人鱼发光杆菌杀鱼亚种造成病害的主要病原。潘晓艺等根据API20E结果结合16SrDNA和gyrB基因序列比对,确定从发病养殖中华鳖肝脏分离得到的一株致病菌为迟钝爱德华氏菌。除了API系列检测试剂盒,针对一些特殊的细菌性病原还能够采取更为简便的显色培养技术20。该技术在培养基中参加细菌特异性酶的显色底物,使菌落出现不同颜
3、色而到达分离鉴定的目的,如硫柠胆蔗琼脂thiosulfatecitratebilesaltssucroseagar,TCBSagar已经被广泛用于霍乱弧菌和副溶血弧菌的分离鉴定。近年来还有很多新型显色培养基被开发出来,如选择性显色弧菌培养基vibrio-biochromemedium,BCVM,副溶血弧菌在其上生长构成的菌落呈紫色,而其他弧菌则呈蓝绿色,能够更有效的将副溶血弧菌与其他致病性弧菌区分开来。目前这种方法不仅被广泛用于人类病原菌的初步分离鉴定,也越来越多地被应用到水产养殖业病害检测中。1.2基于分子生物学技术的检测方法基于分子生物学技术的养殖鱼类细菌性病害的检测方法在已有报道文献中占
4、到50%以上,该方法与传统的生理生化检测方法相比简洁、快速、灵敏度高、特异性强,可用于细菌性病害疾病的预警和诊断。1.2.1聚合酶链反响技术聚合酶链反响或称多聚酶链反响(polymerasechainreaction,PCR),是根据生物信息学等方法寻找特定病原菌特异性基因序列设计特异性引物,扩增后产生特异性片段进而到达检测病原菌的目的。目前多数文献针对不同细菌性病害的特异性基因序列设计引物,建立了灵敏有效的检测方法。Pinto等以toxR,tlh,tdh和trh作为目的基因实现了副溶血弧菌的检测;Lee等以创伤弧菌溶血素为靶标,设计特异性引物建立其PCR检测方法。随着PCR技术的成熟,基于多
5、种病菌的同时检测的多重PCR技术逐步发展起来。Kong等建立了一种以嗜水气单胞菌的气单胞菌溶素基因、弗氏志贺菌ipaH基因、鼠伤寒沙门氏菌ipaB基因、霍乱弧菌epsM基因和副溶血弧菌16S-23SrDNA为目的基因,设计六对扩增后可产生6种不同长度的片段的特异性引物来快速同时检测水产品中这6种致病菌。此检测方法可在12h内完成,检测限能够到达100102CFU/mL。1.2.2环介导等温扩增技术loop-mediatedisother-malamplification,LAMP由于传统的PCR技术需要准确控制扩增反响各阶段温度,一定程度上限制了其在水产养殖业中的应用。Notomi等于2000
6、年提出的一种只需在恒温条件下就能够进行核酸扩增的LAMP技术。LAMP通过设计两对十分的引物内引物和外引物在一种有链置换活性的DNA聚合酶作用下进行的一种自动链置换DNA合成反响。由于DNA在65左右处于动态平衡状态,任何一个引物向双链DNA的互补部位进行碱基配对延伸时,另一条链就会解离成为单链,所以该技术在恒温下就能够进行核酸扩增,已被用于多种水产养殖细菌性病害的检测。Yeh等根据鲶鱼爱德华氏菌eip18基因设计引物进行LAMP扩增,在65反响60min后可得到鲶鱼爱德华氏菌基因特异性条带,检测限可到达20CFU/mL,能够从养殖水体样本中实现鲶鱼爱德华氏菌的检出。Surasilp等将LAM
7、P与横向流动试纸条分析相结合,以rpoS基由于靶基因建立了一种LAMP-LFD方法来检测创伤弧菌,对于纯培养检测限可到达1.5103CFU/mL。1.2.3实时定量PCR技术quantitativereal-timepolymerasechainreaction,qRT-PCRqRT-PCR目前也被广泛用于水产养殖病害的定量检测。该技术特异性强、灵敏度高、重复性好,可同时检测同一样本中不同靶序列。Blackstone等以TaqMan探针为基础,采用qRT-PCR技术以副溶血弧菌特异性tdh基因来检测副溶血弧菌,检测限可到达每PCR体系1CFU。Panicker等针对vvh基因设计寡核苷酸引物,
8、建立了以SYBRGreenI染料为基础的qRT-PCR快速、特异性地检测牡蛎组织匀浆和墨西哥湾水体中的创伤弧菌。该方法对于纯基因组DNA的最低检测量为1pg,水体中检测限可达10CFU/mL。许龙岩等根据副溶血弧菌toxR基因和tdh基因设计引物对副溶血弧菌建立了一种基于TaqMan探针的双重荧光PCR检测法。该方法具有良好的特异性,水体中常见非副溶血弧菌细菌均呈阴性,副溶血弧菌的菌浓度与Ct值的反向线性关系良好,检测限为3.6102CFU/mL。1.2.4基因探针技术自1975年DNA探针杂交技术被初次提出,基因探针技术已得到了很大的进步和发展。该技术的基本根据是核酸杂交,针对决定病原菌生物
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