微生物分类鉴定ppt课件.ppt
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1、有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。本章重点掌握本章重点掌握 1 1微生物的分类单位。微生物的分类单位。 2 2微生物学名的书写及意义。微生物学名的书写及意义。 3. 3. 菌种鉴定的方法。菌种鉴定的方法。 了解了解 1 1微生物的分类系统。微生物的分类系统。 2. 2. 菌种鉴定的条件。菌种鉴定的条件。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。微生物的分类(微生物的分类(classific
2、ationclassification): : 按照它们进化的亲缘关系,根据形态、生理性状的差异,把它们有次序地、分门别类地,排列成一个系统,这就是微生物的分类。 微生物的鉴定(微生物的鉴定(identificationidentification): : 对某个未知微生物,根据培养特征,与已知的菌种特征进行对比分析,按照“对号入座”的原则,设法从分类检索表中查找出具体的位置和“名字”。如是新种,则给以新的名称,补充到检索表中去。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。学习和掌握微生物的分类
3、鉴定知识,对生产实践和科学实验有着重要的意义:1、能够在较短时间内认识熟悉微生物界全貌,以利进一步开发和利用这一丰富的微生物资源。2、掌握了分类方面的知识,可以减少菌种筛选工作的盲目性,提高工作效率。3、有利于各国微生物学工作者之间的交流。4、有利于对未知菌种的鉴定。 由于微生物形体微小,发育过程简单,种类繁多,缺乏古生物资料,很多微生物的亲缘关系尚未搞清楚。到目前为止,微生物还没有一个统一的、完整的分类系统,而是几个不尽完善的、看法分歧的分类系统。这样的分类系统难免或多或少地带有“人为的因素”。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的
4、企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。 按照目前比较一致的看法,地球上的所有生物被分成六界: 病毒界病毒界、原核生物界原核生物界、真核原生生物界真核原生生物界、真菌界真菌界、植物界和动物界植物界和动物界。 据此,微生物的研究对象在六界生物分类系统中分属于病毒界、原核生物界、真核原生生物界和真菌界。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。一、微生物的分类单位一、微生物的分类单位 1 1、微生物的分类单位:、微生物的分类单位: 和高等动植物分类一样,微生物的分类单位也依和高等动植物分类一
5、样,微生物的分类单位也依次分为次分为界(界(KingdomKingdom)、)、门门( (PhylumPhylum)、)、纲纲(ClassClass)、)、目(目(orderorder)、)、科(科(FamilyFamily)、)、属属( (Genus)Genus)、种(种(SpeciesSpecies)。这是分类中所用的主要分这是分类中所用的主要分类等级单位。类等级单位。有时在两个主要分类单位之间,可添上次级分类有时在两个主要分类单位之间,可添上次级分类单位,如单位,如“亚门亚门”、“亚纲亚纲”、“亚亚 目目”、“亚亚科科”、“亚属亚属”等。在科与属之间有时还可有等。在科与属之间有时还可有“
6、族族”(TribeTribe)一级。一级。*人:动物-脊椎动物-哺乳动物-灵长目-人科有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是:以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是: 真菌门真菌门EumycophytaEumycophyta 子囊菌纲子囊菌纲AscomycetesAscomycetes 内孢霉目内孢霉目Endomycetales Endomycetales 内孢霉科内孢霉科E.domcetaceaeE.domcetaceae 酵母属酵母属Saccharomy
7、cesSaccharomyces 啤酒酵母啤酒酵母S SCerevisiae HansenCerevisiae Hansen有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。2 2、几个概念:、几个概念: 1 1)种)种:种是一个基本分类单位:种是一个基本分类单位, ,它是一大群表它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。其他种有着明显差异的菌株的总称。 种内的个体都是来自共同的祖先,有着相近的种内的个体都是来自共同的
8、祖先,有着相近的亲缘关系,同时在形态和生理特征上都表现出十亲缘关系,同时在形态和生理特征上都表现出十分相似。分相似。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。2 2)变种)变种:从自然界中分离得到的某一微生物的纯种,必须与文从自然界中分离得到的某一微生物的纯种,必须与文献上记载的典型种的特征完全一致,才能鉴定为同一个种。献上记载的典型种的特征完全一致,才能鉴定为同一个种。实际上有时分离到的纯种,除了大多数指标符合典型种的实际上有时分离到的纯种,除了大多数指标符合典型种的特征外,还有某一个显然不
9、同的特征,而此特征又是稳定特征外,还有某一个显然不同的特征,而此特征又是稳定的。我们就把这种微生物称为典型种的的。我们就把这种微生物称为典型种的“变种变种”。 例如,巨大芽孢杆菌是以巴氏例如,巨大芽孢杆菌是以巴氏18841884年原始报告为标年原始报告为标准。准。19531953年有人从土壤中分离到一株分解有机磷能力很强年有人从土壤中分离到一株分解有机磷能力很强的巨大芽孢杆菌,而且性状稳定,因此将它称为巨大芽孢的巨大芽孢杆菌,而且性状稳定,因此将它称为巨大芽孢杆菌变种,称之为杆菌变种,称之为巨大芽孢杆菌解磷变种巨大芽孢杆菌解磷变种 。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,
10、以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。3 3)亚种或小种()亚种或小种(subspeciessubspecies):在微生物学中,通常把在实验室中所获得的变在微生物学中,通常把在实验室中所获得的变异型菌株,称之为亚种或小种。异型菌株,称之为亚种或小种。 例如,例如,大肠杆菌野生型大肠杆菌野生型的一个菌株称的一个菌株称“ “ K K1212”,它不需要某种氨基酸。通过变异,可以从它不需要某种氨基酸。通过变异,可以从K K1212中获得中获得需要某种氨基酸的生化缺陷型菌株。那么该菌株就需要某种氨基酸的生化缺陷型菌株。那么该菌株就称为称为K K1212的亚
11、种或小种。的亚种或小种。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。 4 4)型()型(typetype):在自然界中,同一地区也可能有同一种微生物的在自然界中,同一地区也可能有同一种微生物的各种类型同时存在着。它们彼此之间的区别往往不象各种类型同时存在着。它们彼此之间的区别往往不象变种那样显著,一般往往表现在菌体的化学组分(抗变种那样显著,一般往往表现在菌体的化学组分(抗原等结构上)原等结构上) 例如例如伤寒杆菌伤寒杆菌应用噬菌体反应可分为应用噬菌体反应可分为2020多个型;多个型;结核分枝杆
12、菌结核分枝杆菌依其寄主的不同,可分为人型、牛型和依其寄主的不同,可分为人型、牛型和禽型。禽型。型常用于变种以下的细分。型常用于变种以下的细分。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。 5 5)菌株或品系()菌株或品系(strainstrain):): 它是指来源不同的同一个种的纯培养物它是指来源不同的同一个种的纯培养物。 由于世界上不存在两个绝对相同的个体,因而由于世界上不存在两个绝对相同的个体,因而从自然界中分离到的微生物纯培养物,尽管它们同从自然界中分离到的微生物纯培养物,尽管它们同属一个
13、种,但由于来源不同,总会表现出细微的差属一个种,但由于来源不同,总会表现出细微的差异。异。为了表现出这些细微的差异和工作方便,我们为了表现出这些细微的差异和工作方便,我们就采用菌株或品系这个名称来代表某个具体的微生就采用菌株或品系这个名称来代表某个具体的微生物纯培养物。这样,从自然界中分离到的每一个微物纯培养物。这样,从自然界中分离到的每一个微生物纯培养物都可以称为一个菌株或品系。生物纯培养物都可以称为一个菌株或品系。 一般地讲,自然界中的一般地讲,自然界中的“种种”应是有限的,但应是有限的,但菌株是无限的。菌株是无限的。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导
14、向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。 菌株的表示方法菌株的表示方法常在种名后面写上编号、字母、地址或其它常在种名后面写上编号、字母、地址或其它符号等。符号等。例如生产淀粉酶的枯草杆菌例如生产淀粉酶的枯草杆菌BF.7658BF.7658,生产生产蛋白酶的栖土曲霉蛋白酶的栖土曲霉3.9423.942等。在微生物研究工作等。在微生物研究工作中,有时虽然是相同的种但是中,有时虽然是相同的种但是由于所用的菌株不由于所用的菌株不同,其结果往往不完全同,其结果往往不完全一样。因此,我们在总结一样。因此,我们在总结科研、生产的成果或撰写论文时,保藏或索取菌科研、生产的成果或
15、撰写论文时,保藏或索取菌种时,通常种时,通常不但要写出种名,而且要注明菌株号不但要写出种名,而且要注明菌株号码码。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。类群(类群(group seriesgroup series)通常指属以下几个比较近似的种的集合。具体做法通常指属以下几个比较近似的种的集合。具体做法是选一些特征最为明显的典型菌株,再把和它近似的菌是选一些特征最为明显的典型菌株,再把和它近似的菌株放在一起归为一个类群。株放在一起归为一个类群。例如,抗生素的主要产生菌例如,抗生素的主要产生菌链
16、霉菌属,为了筛链霉菌属,为了筛选新种的方便,把该属中的近似的种,归纳为选新种的方便,把该属中的近似的种,归纳为1414个类群。个类群。又如,曲霉属内,根据属内近似的种,归纳为又如,曲霉属内,根据属内近似的种,归纳为1818个类群。个类群。有的时候,类群可用来表示两种微生物和介于这两有的时候,类群可用来表示两种微生物和介于这两种微生物之间的中间类型。例如大肠杆菌菌群就包括大种微生物之间的中间类型。例如大肠杆菌菌群就包括大肠杆菌、产气杆菌以及介于它们之间的中间类型。肠杆菌、产气杆菌以及介于它们之间的中间类型。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为
17、中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。二、微生物的命名规则二、微生物的命名规则 同一种微生物在不同的国家或地区常有不同的名称,这就是俗名。俗名在局部地区可以使用,但不便于交流,容易引起混乱。 学名(学名(scientific namescientific name):为在世界范围内便于交流为在世界范围内便于交流和开展工作,要求给每一种微生物取上一个为大家所公和开展工作,要求给每一种微生物取上一个为大家所公认的科学名称,这就是认的科学名称,这就是学名学名 。 有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相
18、互信任的合作环境。命名规则命名规则采用生物学中一贯沿用的林奈(采用生物学中一贯沿用的林奈(LinnaeusLinnaeus)氏的氏的“双名双名法法”。这种国际命名法的一般规则如下:。这种国际命名法的一般规则如下:(1 1)每一种具有显著区分的微生物,称之为)每一种具有显著区分的微生物,称之为“种种”。(2 2)每一个种给一个名字每一个种给一个名字。其学名通常是用。其学名通常是用2 2个拉丁词个拉丁词组成。例如组成。例如Bacillus subtilisBacillus subtilis(枯草芽孢杆菌)。枯草芽孢杆菌)。(3 3)第一个词是属名第一个词是属名,属名的第一个字母要大写属名的第一个字
19、母要大写。属名。属名是拉丁词或希腊词或拉丁化了的其它文字所构成。它是一个是拉丁词或希腊词或拉丁化了的其它文字所构成。它是一个名词,用以表示该属的主要特征。名词,用以表示该属的主要特征。例如芽孢杆菌(例如芽孢杆菌(BacillusBacillus)表示能形成芽孢的杆状菌。表示能形成芽孢的杆状菌。属名有时可用人名或地名来表示。例如属名有时可用人名或地名来表示。例如Pasteurella Pasteurella pestis pestis ( (鼠疫巴斯德氏菌鼠疫巴斯德氏菌), ),志贺氏杆菌属(志贺氏杆菌属(S Shigellahigella)。)。属名在属名在上下文重复上下文重复出现的情况下,出
20、现的情况下,可以缩写可以缩写。例如。例如BacillusBacillus可用可用BacBac表示。表示。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。(4)学名的第二个词为种名。种名是拉丁语中的种名是拉丁语中的形容词形容词,表示微生物的次要特征。,表示微生物的次要特征。例如金黄色葡萄球菌(例如金黄色葡萄球菌(Stophylococcns aureusStophylococcns aureus)中的中的aureusaureus是形容词,意思是是形容词,意思是“金黄色的金黄色的”。 种名也有用种名也有用
21、人名或地名来表示的。例如巴氏芽孢杆菌(人名或地名来表示的。例如巴氏芽孢杆菌(Bacillus Bacillus pasteuriipasteurii),),保加利亚乳杆菌(保加利亚乳杆菌(Lactobacteriurn Lactobacteriurn bulgaricusbulgaricus)。)。 种名首字母不大写种名首字母不大写。 学名在印刷时,要用斜体字表示学名在印刷时,要用斜体字表示,或者在正排字下,或者在正排字下面面加一条横线加一条横线表示。例如表示。例如Bacillus subtilisBacillus subtilis或者或者Bacillus subtilisBacillus s
22、ubtilis。 值得注意的是,在属以上的名称,例如门、纲、目、值得注意的是,在属以上的名称,例如门、纲、目、科等,其名称第一个字母要科等,其名称第一个字母要大写大写,而且不印成,而且不印成斜体字斜体字。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。(5 5)通常在种名的后面还跟着命名这个种的人的姓)通常在种名的后面还跟着命名这个种的人的姓以及命名时间。这是由于自然界中的种实在太多了,大家以及命名时间。这是由于自然界中的种实在太多了,大家都在命名,容易混淆误解,所以要在正式的拉丁名称之后都在命名,容
23、易混淆误解,所以要在正式的拉丁名称之后附上命名人的姓名和命名时间。附上命名人的姓名和命名时间。 例如例如S Saccharomyces cerevisiae accharomyces cerevisiae HansenHansen中第三个字中第三个字母就是命名者的姓。母就是命名者的姓。 如果对以前的命名有所改动,也有一定的规则。如果对以前的命名有所改动,也有一定的规则。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。例如例如: : 枯草芽孢杆菌,最早(枯草芽孢杆菌,最早(18381838年)由年)由E
24、hrenbergEhrenberg描述,定名为描述,定名为“Vibrio subtillisVibrio subtillis( (枯草弧枯草弧菌菌) )EhrenbergEhrenberg,1838”1838”。到了到了18721872年,年,CohnCohn认为弧认为弧状不是它的特征,提出转属,但保留其种名,更名状不是它的特征,提出转属,但保留其种名,更名为为“Bacillus subtilisBacillus subtilis(EhrenbergEhrenberg)CohnCohn1872”1872”。用括号把最初定名人保留下来,括用括号把最初定名人保留下来,括号外加上改名人的姓氏和改名时
25、间,借以标明这个号外加上改名人的姓氏和改名时间,借以标明这个种的命名演变过程。种的命名演变过程。有利于学习和创新的组织管理机制,创造充满活力的创新激励机制,以市场为导向,以顾客价值追求为中心的企业文化氛围,依赖既开放又相互信任的合作环境。 在这里,有一点需要指出,种名后附加的人名,并非在这里,有一点需要指出,种名后附加的人名,并非完全表示这个人是第一个发现和研究这种微生物的,而是完全表示这个人是第一个发现和研究这种微生物的,而是指该人首先给它定名。指该人首先给它定名。 命名人的命名人的姓一律用正体字印刷姓一律用正体字印刷。 综上所述,微生物学名的格式如下:综上所述,微生物学名的格式如下:学名学
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