生物信息学 第1章-绪论.ppt

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1、生物信息学Bioinformatics,主讲人：刘顺会所在单位：生命科学与生物制药学院,第一章绪论,目录,背景与定义研究内容数据库与研究机构4期刊与教材5生物学、数学与计算机技术基础6展望,背景与定义,Nature171,737-734(1953)(C)MacmillanPublishersLtd.MolecularstructureofNucleicAcidsWATSON,J.D.李亦学,钱晓茵,张晓宁,校)2003.生物信息学:序列与基因组分析(影印版).北京:高等教育出版社.黄韧,薛成,等.2003.生物信息学网络资源与应用.广州:中山大学出版社.D.R.Westhead,J.H.Par

2、ish,R.M.Twyman.2003.Bioinformatics生物信息学(影印版).北京:科学出版社.皮埃尔巴尔迪,索恩布鲁纳克.(张东晖,黄颖,蔡军,孙应飞,夏慧煜,胡驰峰,计宏凯,朱宗涵,译;李衍达,朱宗涵,张东晖,审校).2003.生物信息学机器学习方法.北京:中信出版社.尚彤,国强华,景霞.2003.常用医学生物信息学数据库.北京:北京大学医学出版社.J.塞图宝,J.梅丹尼斯.(朱浩,等译).2003.计算分子生物学导论.北京:科学出版社.蒋彦,王小行,曹毅,王喜忠,等编著.2003.基础生物信息学及应用.北京:清华大学出版社.,4.2教材,2004年：郑珩,王非.2004.药物

3、生物信息学.北京:化学工业出版社.黄德双,张学工,田捷,刘湘军,主编.2004.生物信息学若干前沿问题的探讨.合肥:中国科学技术大学出版社.A.马尔科姆坎贝尔,劳里.J.海尔.(孙之荣,主译).2004.探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学.北京:科学出版社.P.A.帕夫纳.(王翼飞,等译).2004.计算分子生物学算法逼近.北京:化学工业出版社.DanE.Krane,MichaelL.Raymer.(孙啸,陆祖宏,谢建明,等译).2004.生物信息学概论.北京:清华大学出版社.李桂源,钱骏.2004.基于WWW的生物信息学应用指南.长沙:中南大学出版社.,4.2教材,2005年：S.米塞诺,

4、S.A.克拉维茨.(欧阳红生,阮承迈,李慎涛,等译).2005.生物信息学方法指南.北京:科学出版社.孙啸,陆祖宏,谢建明.2005.生物信息学基础.北京:清华大学出版社.伍欣星,赵旻.2005.生物信息学基础与临床医学应用指南.北京:科学出版社.,4.2教材,2006年：张革新.2006.简明生物信息学教程.北京:化学工业出版社.乔纳森.佩夫斯纳.(孙之荣,等译).2006.北京:化学工业出版社.王翼飞,史写华.2006.生物信息学智能化算法及其应用.北京:化学工业出版社.,4.2教材,2007年：陶士珩.2007年.生物信息学.科学出版社.孟朝晖.2007年.筒形蛋白质生物信息学.清华大学

5、出版社.,4.2教材,5生物学、计算机技术与数学基础,分子生物学,生理学,微生物学,植物学,动物学,生态学,地外生命研究,5.生物学、计算机技术与数学基础,进化生物学,遗传学,生物化学,细胞生物学,网络技术,数据库技术,数据处理和可视化,Windows、Linux及Unix操作系统,Perl语言、C+语言、Java语言,5.生物学、计算机技术与数学基础,DDBJ的数据储存及与EMBL、GenBank之间的数据互换,5.生物学、计算机技术与数学基础,5.生物学、计算机技术与数学基础,动态规划,隐马尔可夫模型,5.生物学、计算机技术与数学基础,图论,贝叶斯统计,5.生物学、计算机技术与数学基础,神

6、经网络模型,聚类分析,遗传算法,马尔可夫模型,5.生物学、计算机技术与数学基础,6展望,1.人（生物）基因转录的时间与空间2.人（生物）组织的RNA转录过程的调控3.人（生物）细胞对外界环境反应的预测4.蛋白质对DNA、蛋白质对RNA、蛋白质对蛋白质的识别5.人（生物）体内环境中的蛋白质结构预测,6.防治疾病的分子设计7.蛋白质的功能是如何进化的8.物种起源的分子机制9.人（生物）体中的蛋白质功能是怎样随人（生物）体发育而变化的10.中学、本科、研究生阶段的生物信息学教育,6.展望,当青年科学家问我，未来令人振奋的科学领域是什么时，我则多次对他们说：计算生物学是我首先推荐的领域。弗朗希斯克林斯美国国家卫生研究所人类基因组计划首席科学家,人类基因组计划的下一步就是要进行解释。我们必须发现这一切到底表示什么意思。J.克雷格温特塞罗拉基因公司负责人,6.展望,Presentations,生技第一组：用实例简述图论在生物信息学中的应用生制第一组：用实例简述什么是动态规划算法生科第一组：用实例简述神经网络模型的原理,谢谢大家!,