核酸的降解与核苷酸代谢.ppt
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1、核酸的降解和核苷酸代谢,(Degradationofnucleicacidandnucleotidesmetabolism),一、核酸和核苷酸的分解代谢二、核苷酸的生物合成,核酸营养与核酸代谢,NitrogenousBases,Planar,aromatic,andheterocyclicDerivedfrompurineorpyrimidine,StructureofNucleotideBases,Sugars,D-Riboseand2-Deoxyribose,*Lacksa2-OHgroup,Nucleosides,Resultfromlinkingoneofthesugarswithap
2、urineorpyrimidinebasethroughanN-glycosidiclinkagePurinesbondtotheC1carbonofthesugarattheirN9atomsPyrimidinesbondtotheC1carbonofthesugarattheirN1atoms,PhosphateGroups,Mono-,di-ortriphosphates,PhosphatescanbebondedtoeitherC3orC5atomsofthesugar,Nucleotides,Resultfromlinkingoneormorephosphateswithanucle
3、osideontothe5endofthemoleculethroughesterification,Nucleotides,DNA(deoxyribonucleicacid)isapolymerofdeoxyribonucleotidesBothdeoxy-andribonucleotidescontainAdenine,GuanineandCytosineRibonucleotidescontainUracilDeoxyribonucleotidescontainThymine,MonomersfornucleicacidpolymersNucleosideTriphosphatesare
4、importantenergycarriers(ATP,GTP)ImportantcomponentsofcoenzymesFAD,NAD+andCoenzymeA,FADNAD,CoenzymeA:3-磷酸-ADP-泛酰-巯基乙胺,巯基乙胺,泛酸,ADP,Nucleosides:Purinenucleosidesendin“-sine”Adenosine,GuanosinePyrimidinenucleosidesendin“-dine”Thymidine,Cytidine,UridineNucleotides:Startwiththenucleosidenamefromaboveandad
5、d“mono-”,“di-”,or“triphosphate”AdenosineMonophosphate,CytidineTriphosphate,DeoxythymidineDiphosphate,1909-1934年,美国生物化学家Owen证明,核酸的分解单位是核苷酸。,1961年,美国生化学家JoanOro模拟大气放电,在有氰化氢参加的反应体系中发现有氨基酸和腺嘌呤生成。,1963年,Ponnamperuma在类似的实验中也得到了腺嘌呤。后来,他又与RuthMariner、CarlSagan将腺嘌呤与核糖连接成为腺苷;再连接磷酸,得到了腺苷三磷酸(ATP)。,核酸分解与合成背景知识,早
6、在演绎核苷酸生物合成前,生物化学家就已经发现动物会排泄3种不同的含氮废物,即NH2、尿素和尿酸。尿酸就是嘌呤化合物的代谢产物。,在1950年间,JohnM.Buchanan和G.RobertGreenberg采用同位素示踪结合嘌呤核苷酸降解物尿酸分析证明,嘌呤分子的原子N1来自天冬氨酸,N3和N9来自谷氨酰胺等,完成了嘌呤生物合成过程的演绎。更为重要的是,他们还发现嘌呤不是以游离含氮碱,而是以核苷酸形式在体内合成的。,核酸分解与合成背景知识,1964年,科学家确定Lesch-Nyhan综合征与次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)缺陷有关。至今已发现,核苷酸的合成和分解代谢障碍与很多遗传
7、性、代谢性疾病有关。模拟核苷酸组成成分,如取代碱基、核苷和核苷酸的类似物已发展为在临床上常用、有效的抗代谢药物。,核苷酸的功能,核苷酸是核酸生物合成的前体核苷酸衍生物是许多生物合成的活性中间物,例如:UDP-葡萄糖和CDP-二酯酰甘油分别是糖原和磷酸甘油酯合成的中间物ATP是生物能量代谢中通用的高能化合物腺苷酸是三种重要辅酶的组分某些核苷酸是代谢的调节物质。如:cAMP和cGMP是许多激素引起的胞内信使,1核酸的酶促降解核糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶、限制性内切酶2核苷酸的降解3核苷酸的合成(1)核糖核苷酸的生物合成嘌呤核苷酸的合成:从头合成和补救途径嘧啶核苷酸的合成:从头合成和补救途径(2)脱氧
8、核糖核苷酸的生物合成核糖核苷酸的还原脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成,核酸的降解和核苷酸代谢,第一部分核酸的解聚作用,动物和异养型微生物可以分泌消化酶来分解核蛋白和核酸类物质,以获得各种核苷酸。,(核苷水解酶主要存在于植物和微生物体内,并且只能对核糖核苷起作用,对脱氧核糖核苷不起作用。),(核苷磷酸化酶存在广泛),核酸的酶促降解,核酸的酶促降解,磷酸单酯酶,核糖,核酸,核酸酶,单核苷酸,核苷,嘧啶/嘌呤,核苷水解酶,核苷磷酸化酶,嘧啶(嘌呤),核糖-1-磷酸,脱氧核糖-1-磷酸,核糖-5-磷酸,磷酸戊糖途径,醛缩酶,乙醛,甘油醛-3-磷酸,核酸酶,1、核酸酶的分类,(1)根据对底物的专一性分为,(2)
9、根据切割位点分为,核酸外切酶:作用于核酸链的末端(3端或5端),逐个水解下核苷酸。脱氧核糖核酸外切酶:只作用DNA核糖核酸外切酶:只作用于RNA核酸内切酶:从核酸分子内部切断3,5-磷酸二酯键。限制性内切酶:在细菌细胞内存在的一类能识别并水解外源双链DNA的核酸内切酶,可用于特异切割DNA,常作为工具酶。,核酸酶:作用于核酸的磷酸二酯酶,外切核酸酶对核酸的水解位点,5,OH,B,3,B,B,B,B,B,B,B,牛脾磷酸二酯酶(5端外切得3核苷酸),蛇毒磷酸二酯酶(3端外切得5核苷酸),2、核酸酶的作用特点,限制性内切酶,类型命名意义,原核生物中存在着一类能识别外源DNA双螺旋中4-8个碱基对所
10、组成的特异的具有二重旋转对称性的回文序列,并在此序列的某位点水解DNA双螺旋链的酶分子,产生粘性末端或平末端,这类酶称为限制性内切酶(restrictionendonuclease)。,限制性内切酶名称的第一个字母取自获得此内切酶的细菌属名的第一个字母,用大写名称的第二、三个字母取自该细菌种名的头二个字母,用小写字母如果该细菌还有不同的株系,则另加第四个代表株系的字母或数字;最后是用罗马字大写的数字,代表同一菌株中不同限制性内切酶的编号。,限制性内切酶的命名和意义,例:EcoRI,这是从大肠杆菌(E.coli)R菌珠中分离出的一种限制性内切酶,如Hind代表从流感噬血杆菌d株(Haemophi
11、lusinfluenzae)中分离到的第三种内切酶。,核苷酸的降解,核苷磷酸化酶普遍存在,催化反应是可逆的。核苷水解酶主要存在于植物与微生物中,并且只针对核糖核苷,对脱氧核糖核苷是无作用的,反应是不可逆的。,第二部分碱基的分解代谢,嘌呤碱的分解PurineCatabolism,不同动物嘌呤代谢的产物灵长类、鸟类:尿酸其他哺乳动物、软体动物:尿囊素硬骨鱼:尿囊酸软骨鱼和两栖类:尿素大多数海洋无脊椎动物:氨和CO2(如甲壳类动物)Allpurinedegradationleadstouricacid(butitmightnotstopthere),嘌呤碱的分解首先是在各种脱氨酶的作用下水解脱去氨基
12、。脱氨反应也可以在核苷或核苷酸的水平上进行,在动物组织中腺嘌呤脱氨酶的含量极少,而腺嘌呤核苷脱氨酶和腺嘌呤核苷酸脱氨酶的活性极高。,嘌呤碱的分解,嘌呤碱基的脱氨,嘌呤的降解,腺嘌呤鸟嘌呤H2OH2ONH3NH3次黄嘌呤黄嘌呤H2O+O2H2O2H2O+O2H2O2尿囊素尿酸H2OCO2+H2O22H2O+O2尿囊酸尿素+乙醛酸H2O4NH3+2CO2,腺嘌呤脱氨酶,鸟嘌呤脱氨酶,黄嘌呤氧化酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸氧化酶,尿囊素酶,尿囊酸酶,脲酶,嘌呤的分解代谢,黄嘌呤氧化酶,尿酸的进一步分解,尿酸氧化酶,AdenosineDegradation,ACASESTUDY:GOUT,A45-year-
13、oldmanawokefromsleepwithapainfulandswollenrightgreattoe.Onthepreviousnighthehadeatenamealoffriedliverandonions,afterwhichhemetwithhispokergroupanddrankanumberofbeers.Hesawhisdoctorthatmorning,“goutyarthritis”wasdiagnosed,andsometestswereordered.Hisserumuricacidlevelwaselevatedat8.0mg/L(NL7.0mg/L).Th
14、emanrecalledthathisfatherandhisgrandfather,bothofwhomwerealcoholics,oftencomplainedofjointpainandswellingintheirfeet.,ACASESTUDY:GOUT,ThedoctorrecommendedthatthemanuseNSAIDsforpainandswelling,increasehisfluidintake(butnotwithalcohol)andrestandelevatehisfoot.Healsoprescribedallopurinol(别嘌呤醇).Afewdays
15、latertheconditionhadresolvedandallopurinolhadbeenstopped.Arepeaturicacidlevelwasobtained(7.1mg/L).Thedoctorgavethemansomeadviceregardinglifestylechanges.,Gout,Impairedexcretionoroverproductionofuricacid尿酸排泄的削弱与过量产生Uricacidcrystalsprecipitateintojoints(GoutyArthritis),kidneys,ureters(stones)Xanthineo
16、xidase(黄嘌呤氧化酶)inhibitorsinhibitproductionofuricacid,andtreatgoutAllopurinoltreatmenthypoxanthineanalogthatbindstoXanthineOxidasetodecreaseuricacidproduction,ALLOPURINOLISAXANTHINEOXIDASEINHIBITORASUBSTRATEANALOGISCONVERTEDTOANINHIBITOR,INTHISCASEA“SUICIDE-INHIBITOR”,高嘌呤食物:豆苗、黄豆芽、芦笋、香菇、紫菜、动物内脏、鱼类,治疗痛
17、风新药研发,饮酒与痛风,酒精在体内代谢产生乳酸,而血液乳酸水平的提高将抑制肾脏对尿酸的排泄。啤酒中含有大量的嘌呤,饮酒相当于摄入了高嘌呤食物。饥饿状态下,体内代谢的调节可增加尿酸的形成进而影响尿酸的水平。,机理:,治疗:,采取有效的药物治疗合理控制饮食多吃碱性食物和蔬菜少喝啤酒多饮水,少喝汤(汤里存在大量的嘌呤)规律而健康的生活习惯适当参加体育及户外运动,AdenosineDeaminaseDeficiency,Inpurinedegradation,adenosineinosineEnzymeisAdenosineDeaminase(ADA)ADAdeficiencyresultsinSCI
18、DSevereCombinedImmunodeficiencySelectivelykillslymphocytesBothB-andT-cellsMediatemuchofimmuneresponse,腺苷脱氨酶缺乏症Adenosinedeaminasedeficiency(ADA):一种严重的免疫缺陷症,腺苷脱氨酶的缺乏可使T淋巴细胞因代谢产物的累积而死亡,从而导致严重的联合性免疫缺陷症(SCID)。通常导致婴儿出生几个月后死亡。,嘧啶的分解代谢,胞嘧啶和尿嘧啶的分解代谢,胞嘧啶,尿嘧啶,二氢尿嘧啶,-脲基丙酸,-丙氨酸,胸腺嘧啶的分解代谢,-脲基异丁酸-氨基异丁酸,二氢胸腺嘧啶,胸腺嘧啶
19、,胞嘧啶,NH3,尿嘧啶,二氢尿嘧啶,H2O,CO2+NH3,-丙氨酸,胸腺嘧啶,-脲基异丁酸,-氨基异丁酸,H2O,丙二酸单酰CoA,乙酰CoA,TCA,肝,尿素,甲基丙二酸单酰CoA,琥珀酰CoA,TCA,糖异生,胸腺嘧啶的分解代谢,甲基丙酰半醛,第三部分核苷酸的生物合成,嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Bases/Nucleosides/Nucleotides,Base,Base+Sugar=Nucleoside,Base+Sugar+Phosphate=Nucleotide,Adenine,Deoxyadenosine,Deoxyadenosine5-triphosphate(dATP),概
20、述:从头合成基本途径半合成(补救合成),(CO2/NH3/AA/戊糖)核糖核苷酸,分解的现成嘌呤、嘧啶,ATP,核苷酸合成的两条途径,核糖、氨基酸、CO2、NH3,核糖核苷酸,脱氧核苷酸,辅酶,RNA,核苷,碱基,脱氧核苷,DNA,补救途径从头合成,嘌呤核苷酸环上原子来源,嘌呤核糖核苷酸的合成,次黄嘌呤核苷酸的合成,各种嘌呤核苷酸的合成是先合成次黄嘌呤核苷酸,再转变成各种嘌呤核苷酸。此途径叫嘌呤核苷酸的从头合成途径(denovosynthesispathway)。次黄嘌呤核苷酸的合成是在核糖上合成次黄嘌呤的,而不是先合成次黄嘌呤,再与核糖结合的。,嘌呤核苷酸的合成,嘌呤核苷酸的合成代谢,谷氨酰
21、胺提供N9,甘氨酸提供C4,5和N7,嘌呤核苷酸的合成,嘌呤核苷酸的合成代谢,一碳单位提供C8,谷氨酰胺提供N3,N10-甲酰FH4,嘌呤核苷酸的合成代谢,CO2提供C6,天冬氨酸提供N1,一碳单位提供C2,嘌呤核苷酸的合成代谢,天冬氨酸提供C6上的氨基,谷氨酰胺提供C2上的氨基,ATP和GTP的合成,嘌呤核苷酸的合成代谢,核苷酸合成的补救途径,生物体内除了能以简单前体物质“从头合成”(denovosynthesis)核苷酸外,还能利用预先形成的碱基和核糖合成核苷酸。这个途径称为“补救途径”(salvagepathway)。,嘌呤核苷酸合成的补救途径,核苷磷酸化酶,腺苷激酶,磷酸核糖转移酶,磷
22、酸核糖转移酶,只有腺苷激酶,其他核苷酸只能按以下反应产生。,(A),(B),嘌呤核苷酸的合成代谢,PRPP,补救途径,5磷酸核糖焦磷酸,腺嘌呤,腺嘌呤磷酸核糖转移酶,嘌呤核苷酸合成特点,先形成IMP(次黄嘌呤核苷酸),然后在单磷酸的水平上转变成AMP、GMP。IMP合成从5-P-核糖开始的,在ATP参与下先形成PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)嘌呤的各个原子是在PRPP的C1上逐渐加上去的。由Asp、Gln、Gly、甲酸、CO2提供N和C,合成时先形成右环,再形成左环。四氢叶酸(FH4)是一碳单位的载体,嘌呤核苷酸生物合成的调节,别构酶:受终产物抑制;,受终产物抑制,受终产物抑制,Nucleoti
23、deMetabolism,PURINERIBONUCLEOTIDES:formeddenovoi.e.,purinesarenotinitiallysynthesizedasfreebasesFirstpurinederivativeformedisInosineMono-phosphate(IMP)ThepurinebaseishypoxanthineAMPandGMPareformedfromIMP,Denovosynthesis,5-磷酸核糖胺,PRA,甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨咪核苷酸,5-氨基咪唑核苷酸,5-氨基-4-羧酸咪唑核苷酸,5-氨基咪唑-4-(N-琥珀酸)
24、-氨甲酰核苷酸,5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,5-甲酰胺-4-氨甲酰咪唑核苷酸,SynthesisofAMPandGMP,延胡索酸,kinase,ADP,kinase,ADP,ATP,ATP,ADP,AMP,ATP,kinase,GDP,kinase,ADP,GTP,ATP,ADP,GMP,ATP,PurineSalvage,Adeninephosphoribosyltransferase(APRT)Adenine+PRPPAMP+PPiHypoxanthine-Guaninephosphoribosyltransferase(HGPRT)Hypoxanthine+PRPPIMP+PPiGu
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