检索系统.ppt

《检索系统.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《检索系统.ppt（25页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、三、数据库检索工具简介,EntrezSRS,1、Entrez,Entrez的特点链接的数据库多使用方便实际匹配、相近匹配、查询结果按匹配程度排列,http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi,Entrez集成的各种数据库,核酸序列蛋白质序列生物大分子结构基因组数据生物分类数据库孟德尔人类遗传学数据（OMIM）Pubmed,Entrez,http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/,Entrez的查询方式,快速查询限定查询其他查询方式批处理查询交叉引用的信息查询Email查询,Entrez基本查询功能,主题词（Subject）

2、搜索短语（phrase）搜索文献作者（Authous）搜索序列独特识别信息（UniqueIdentifiers）搜索序列分子量搜索区域搜索通配符搜索,2.SRS,SRS（SequenceRetrievalSystem）是EMBL研制的一个基于WEB的查询系统,是目前生物信息界应用最为广泛的数据库系统。SRS在中国的镜像站点建立在北京大学生物信息中心。,SRS采用全菜单驱动方式包括EMBL、EMBL_NEW、SwissProt、PIR等一级数据库还包括许多二级数据库如蛋白质家族和结构域数据库Prosite、限制酶数据库ReBase、PDB序列子集数据库NRL_3D、真核基因启动子数据库EPD、E.coli数据库ECD、酶名称和反应数据库ENZYME、生物计算文献数据库SEQANALREF等，还有与功能、疾病相关的数据库，总共有80个数据库。,SRS与ENTREZ的区别,http:/bioinfo.biosino.org/srs71bin/cgi-bin/,