最新医学生物化学课件--02ppt课件.ppt

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1、进入夏天，少不了一个热字当头，电扇空调陆续登场，每逢此时，总会进入夏天，少不了一个热字当头，电扇空调陆续登场，每逢此时，总会想起那一把蒲扇。蒲扇，是记忆中的农村，夏季经常用的一件物品。记想起那一把蒲扇。蒲扇，是记忆中的农村，夏季经常用的一件物品。记忆中的故乡，每逢进入夏天，集市上最常见的便是蒲扇、凉席，不论男女老忆中的故乡，每逢进入夏天，集市上最常见的便是蒲扇、凉席，不论男女老少，个个手持一把，忽闪忽闪个不停，嘴里叨叨着少，个个手持一把，忽闪忽闪个不停，嘴里叨叨着“怎么这么热怎么这么热”，于是三，于是三五成群，聚在大树下，或站着，或随即坐在石头上，手持那把扇子，边唠嗑五成群，聚在大树下，或站着

2、，或随即坐在石头上，手持那把扇子，边唠嗑边乘凉。孩子们却在周围跑跑跳跳，热得满头大汗，不时听到边乘凉。孩子们却在周围跑跑跳跳，热得满头大汗，不时听到“强子，别跑强子，别跑了，快来我给你扇扇了，快来我给你扇扇”。孩子们才不听这一套，跑个没完，直到累气喘吁吁，。孩子们才不听这一套，跑个没完，直到累气喘吁吁，这才一跑一踮地围过了，这时母亲总是，好似生气的样子，边扇边训，这才一跑一踮地围过了，这时母亲总是，好似生气的样子，边扇边训，“你你看热的，跑什么？看热的，跑什么？”此时这把蒲扇，是那么凉快，那么的温馨幸福，有母亲此时这把蒲扇，是那么凉快，那么的温馨幸福，有母亲的味道！蒲扇是中国传统工艺品，在我国

3、已有三千年多年的历史。取材的味道！蒲扇是中国传统工艺品，在我国已有三千年多年的历史。取材于棕榈树，制作简单，方便携带，且蒲扇的表面光滑，因而，古人常会在上于棕榈树，制作简单，方便携带，且蒲扇的表面光滑，因而，古人常会在上面作画。古有棕扇、葵扇、蒲扇、蕉扇诸名，实即今日的蒲扇，江浙称之为面作画。古有棕扇、葵扇、蒲扇、蕉扇诸名，实即今日的蒲扇，江浙称之为芭蕉扇。六七十年代，人们最常用的就是这种，似圆非圆，轻巧又便宜的蒲芭蕉扇。六七十年代，人们最常用的就是这种，似圆非圆，轻巧又便宜的蒲扇。蒲扇流传至今，我的记忆中，它跨越了半个世纪，也走过了我们的扇。蒲扇流传至今，我的记忆中，它跨越了半个世纪，也走过

4、了我们的半个人生的轨迹，携带着特有的念想，一年年，一天天，流向长长的时间隧半个人生的轨迹，携带着特有的念想，一年年，一天天，流向长长的时间隧道，袅道，袅酶的研究历史酶的研究历史 1878年，年，Kuhne提出提出Enzyme. 1897年，德国科学家年，德国科学家Hans Buchner和和Eduard Buchner 成功地用不含细胞的酵成功地用不含细胞的酵母提取液实现了发酵母提取液实现了发酵. 1926年，美国生化学家年，美国生化学家Sumner第一次从第一次从刀豆分离到脲酶结晶，提出酶是蛋白质刀豆分离到脲酶结晶，提出酶是蛋白质. 1978年，年，Altman提出提出RNA有催化功能有催化

5、功能. 1982年，年，Cech证实证实RNA有催化功能有催化功能.v金属离子能与酶、底物形成各种形式的三元络金属离子能与酶、底物形成各种形式的三元络合物，保证了酶与底物的正确定向结合，而且合物，保证了酶与底物的正确定向结合，而且还可作为催化基团。还可作为催化基团。vFe、Cu及及Mo等金属离子可以通过氧化还原而等金属离子可以通过氧化还原而传递电子完成多种物质的氧化还原传递电子完成多种物质的氧化还原。如铁卟。如铁卟啉是很多血红素蛋白的辅基。啉是很多血红素蛋白的辅基。Fe3+Fe2+Cu+Cu2+2、小分子有机化合物：、小分子有机化合物：v小分子有机化合物小分子有机化合物主要参与酶的催化过程，在

6、主要参与酶的催化过程，在反应中传递电子、质子或一些基团，多为维生素。反应中传递电子、质子或一些基团，多为维生素。v维生素维生素：维持细胞正常功能所必需，但需要量：维持细胞正常功能所必需，但需要量很少，动物体内不能合成，必须由食物供给的一很少，动物体内不能合成，必须由食物供给的一类有机化合物。类有机化合物。水溶性维生素：水溶性维生素：VB1、VB2、Vpp、VB6、VC、VB12、泛酸、叶酸、肌醇、泛酸、叶酸、肌醇脂溶性维生素：脂溶性维生素：VA、VD、VE、VK维生素学名辅酶形式 作 用VB1硫胺素TPP-酮酸脱氢酶的辅酶VB2核黄素FMN、FAD脱氢酶的辅酶,传递氢原子.Vpp尼克酸NAD+

7、、NADP+不需氧脱氢酶的辅酶VB6吡哆醛磷酸吡哆醛转氨酶的辅酶泛酸遍多酸COA酰基载体叶酸四氢叶酸一碳单位的载体生物素羧化酶的辅酶硫辛酸传递氢VB12钴胺素甲基钴胺素转甲基酶的辅酶酶的种类：酶的种类：v单体酶单体酶（monomeric enzyme）：只有一条多）：只有一条多肽链构成的酶。肽链构成的酶。v寡聚酶寡聚酶（oligomeric enzyme）：由多个相同）：由多个相同或不同亚基以非共价键连接的酶。或不同亚基以非共价键连接的酶。v多酶体系多酶体系（multienzyme system）：细胞内存）：细胞内存在着许多由几种不同功能的酶彼此聚合形成的在着许多由几种不同功能的酶彼此聚合形

8、成的多酶复合物。多酶复合物。v多功能酶（多功能酶（multifunctional enzyme）：一些）：一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合，形成多酶体系在进化过程中由于基因的融合，形成由一条多肽链组成却具有多种不同催化功能的由一条多肽链组成却具有多种不同催化功能的酶。酶。第二节第二节 酶促反应的特点和机制酶促反应的特点和机制一、酶促反应的特点一、酶促反应的特点1、酶促反应具有极高的催化效率、酶促反应具有极高的催化效率 酶促反应速度比非催化反应高酶促反应速度比非催化反应高1081020倍，比一般催倍，比一般催 化反应高化反应高1071013。A+BABC+D初态过渡态终态从初态转化为过渡态

9、需要能量，即为从初态转化为过渡态需要能量，即为活化能活化能（Energy of activation，EACT），活化能越大，中），活化能越大，中间产物越难形成，反应越难进行。间产物越难形成，反应越难进行。n降低活化能、升高温度可以加速化学反应。降低活化能、升高温度可以加速化学反应。酶的催酶的催化作用有赖于降低反应的活化能。化作用有赖于降低反应的活化能。活化能稍有降低，活化能稍有降低，速度会显著增大。速度会显著增大。初态终态自由能活化过程催化反应活化能活化能阈非催化反应活化能自由能变化分子数分子的动能0Eact-2Eact-1活化能与有效碰撞有效碰撞百分数=e-Eact/RT活化能2 2、酶促

10、反应有高度的特异性或专一性、酶促反应有高度的特异性或专一性（specificityspecificity）一种酶只能作用于某一类或某一种特定的物质。一种酶只能作用于某一类或某一种特定的物质。v底物专一性底物专一性1、结构专一性：、结构专一性： （1）绝对专一性：只作用于一个底物。与底物结构类似）绝对专一性：只作用于一个底物。与底物结构类似 的化合物只能成为竞争性抑制剂或无影响。的化合物只能成为竞争性抑制剂或无影响。 （2）相对专一性：作用对象不只一种底物，要求略低一）相对专一性：作用对象不只一种底物，要求略低一 些。可分：些。可分： （1）基团专一性：对键两端的基团要求程度不同，）基团专一性：

11、对键两端的基团要求程度不同， 一个要求严，另一个不严；一个要求严，另一个不严； （2）键专一性：只作用于键，对键两端的基团无严）键专一性：只作用于键，对键两端的基团无严 格要求。格要求。2、立体异构专一性：、立体异构专一性： 底物的立体构型影响酶和底物的结合与催化。底物的立体构型影响酶和底物的结合与催化。（1）旋光异构专一性：当底物具有旋光异构体时，酶只）旋光异构专一性：当底物具有旋光异构体时，酶只作用于其中的一种。如精氨酸酶只能催化作用于其中的一种。如精氨酸酶只能催化L-精氨酸水解精氨酸水解,对对D-精氨酸则无作用精氨酸则无作用,这种立体异构专一性是由于酶活性这种立体异构专一性是由于酶活性中

12、心与相应底物的结合必须是二者在构型或构象上彼此中心与相应底物的结合必须是二者在构型或构象上彼此匹配才能建立。匹配才能建立。（2）几何异构专一性：当底物具有顺反几何异构体时，）几何异构专一性：当底物具有顺反几何异构体时，酶只作用于其中的一种。酶只作用于其中的一种。HOOCCHCCOOHCH2HOOCCHCOOHHO延胡索酸酶延胡索酸(反丁烯二酸)L(+)苹果酸v 酶作用专一性的假说酶作用专一性的假说 1、锁与钥匙学说：、锁与钥匙学说：Emil Fisher提出，认为底物分子或其中提出，认为底物分子或其中的部分专一地楔入到酶的活性中心部位，即底物分子的的部分专一地楔入到酶的活性中心部位，即底物分子

13、的化学部位与酶分子催化基团间有紧密互补的关系。化学部位与酶分子催化基团间有紧密互补的关系。2、三点附着学说：认为立体对映的一对底物虽然基团相同，、三点附着学说：认为立体对映的一对底物虽然基团相同，但空间排列不同，这样就存在这些基团与酶分子活性中心的但空间排列不同，这样就存在这些基团与酶分子活性中心的结合基团是否匹配的问题，只有三点都互补匹配时，酶才作结合基团是否匹配的问题，只有三点都互补匹配时，酶才作用于这个底物。用于这个底物。3、诱导楔合学说：、诱导楔合学说： Koshland提出，认为当酶分子与底提出，认为当酶分子与底物分子接近时，酶蛋白受底物分子的诱导，其构象发生物分子接近时，酶蛋白受底

14、物分子的诱导，其构象发生有利于底物结合的变化，酶与底物在此基础上互补楔合，有利于底物结合的变化，酶与底物在此基础上互补楔合，进行反应。进行反应。3、酶易失活、酶易失活凡易使蛋白质变性的因素都能使酶失去催化活性。凡易使蛋白质变性的因素都能使酶失去催化活性。4、酶的活性调控、酶的活性调控 有抑制调控、共价修饰调控、反馈调控、酶原有抑制调控、共价修饰调控、反馈调控、酶原调控、激素调控等。调控、激素调控等。5、 催化活力与辅酶、辅基、及金属离子有关。催化活力与辅酶、辅基、及金属离子有关。二、酶的活性中心二、酶的活性中心（active center） （一）概念：（一）概念：1、对于不需要辅酶的酶来说，

15、活性中心就是酶分、对于不需要辅酶的酶来说，活性中心就是酶分子在三维结构上比较靠近的少数几个氨基酸残子在三维结构上比较靠近的少数几个氨基酸残基或是这些残基上的某些基团，它们在一级结基或是这些残基上的某些基团，它们在一级结构上可能相距甚远，甚至位于不同的肽链上，构上可能相距甚远，甚至位于不同的肽链上，通过肽链的盘绕，折叠而在空间构象上相互靠通过肽链的盘绕，折叠而在空间构象上相互靠近；近；2、对于需要辅酶的酶来说，辅酶分子或其某一部、对于需要辅酶的酶来说，辅酶分子或其某一部分往往就是活性中心的组成部分。分往往就是活性中心的组成部分。（二）功能部位：（二）功能部位： 活性中心有两个功活性中心有两个功能

16、部位：能部位：1、结合部位：一定的、结合部位：一定的底物靠此部位结合底物靠此部位结合到酶分子上；到酶分子上；2、催化部位：底物的、催化部位：底物的键在此部位被打断键在此部位被打断或形成新的键，或形成新的键， 从从而发生一定的化学而发生一定的化学变化。变化。 （三）酶活性中心的特点：（三）酶活性中心的特点：1、活性部位在酶分子的总体中只占相当小的部分：往、活性部位在酶分子的总体中只占相当小的部分：往往只由几个氨基酸残基组成（往只由几个氨基酸残基组成（p.384，表，表10-1）；）；2、酶的活性部位是一个三维、酶的活性部位是一个三维实体实体：活性部位的三维结：活性部位的三维结构是由酶的一级结构所

17、决定的。活性部位的氨基酸构是由酶的一级结构所决定的。活性部位的氨基酸残基在一级结构上可能相距甚远，但在肽链的盘绕残基在一级结构上可能相距甚远，但在肽链的盘绕、折叠而在空间结构上相互靠近；、折叠而在空间结构上相互靠近；3、酶活性部位的诱导契合：酶的活性部位并不是和底、酶活性部位的诱导契合：酶的活性部位并不是和底物的形状正好互补的，而是在酶和底物结合过程中物的形状正好互补的，而是在酶和底物结合过程中，底物分子或，底物分子或/和酶分子构象发生一定变化后才互和酶分子构象发生一定变化后才互补的，即补的，即“诱导契合诱导契合”；4、酶活性部位是一个疏水区域：酶的活性部位是、酶活性部位是一个疏水区域：酶的活

18、性部位是位于酶分子表面的一个裂缝内，这是相当疏水位于酶分子表面的一个裂缝内，这是相当疏水区域，非极性基团较多，产生一个微环境，提区域，非极性基团较多，产生一个微环境，提高与底物的结合能力；而其内少量的极性氨基高与底物的结合能力；而其内少量的极性氨基酸残基可与底物结合而发生催化作用；酸残基可与底物结合而发生催化作用；5、底物通过次级键较弱的力结合到酶上：酶与底、底物通过次级键较弱的力结合到酶上：酶与底物结合成物结合成ES复合物主要靠次级键：氢键、盐复合物主要靠次级键：氢键、盐键、范德华力和疏水相互作用；键、范德华力和疏水相互作用；6、酶活性部位具有柔性或可运动性。、酶活性部位具有柔性或可运动性。

19、三、酶促反应机制三、酶促反应机制1、趋近效应和定向效应、趋近效应和定向效应趋近效应：指两个反应的分子，它们反应的基团需趋近效应：指两个反应的分子，它们反应的基团需 要互相靠近，才能反应。要互相靠近，才能反应。 酶促反应速度与底物浓度成正比。在反应系统酶促反应速度与底物浓度成正比。在反应系统的关键区域底物浓度增高，反应速度也增加。因此，的关键区域底物浓度增高，反应速度也增加。因此，底物与酶活性中心的靠近，提高活性中心的底物有底物与酶活性中心的靠近，提高活性中心的底物有效浓度能大大提高酶促反应速度。效浓度能大大提高酶促反应速度。定向效应定向效应: 指酶的催化基团与底物的反应基团之间的正确定指酶的催

20、化基团与底物的反应基团之间的正确定 向。向。 除了除了“靠近靠近”效率外，当底物与活性中心结合时，酶蛋效率外，当底物与活性中心结合时，酶蛋白经诱导而发生构象变化，底物反应部位（基团或键）与酶白经诱导而发生构象变化，底物反应部位（基团或键）与酶的催化部位发生楔合，即的催化部位发生楔合，即“定向定向”作用，从而造成活性中心作用，从而造成活性中心局部的底物浓度大大提高。局部的底物浓度大大提高。2、酶使底物分子的敏感键发生、酶使底物分子的敏感键发生“变形变形”（张力），使其易断裂张力），使其易断裂 底物分子受酶的作用也发生构象变化，使其敏感键中底物分子受酶的作用也发生构象变化，使其敏感键中的某些基团的

21、电子云密度发生变化，产生的某些基团的电子云密度发生变化，产生“电子张力电子张力”而而引起敏感键的一端更加敏感，发生反应（引起敏感键的一端更加敏感，发生反应（p.390，图，图10-3）。3、共价催化作用、共价催化作用 底物与酶形成一个反应活性很高的共价中间物，反应活底物与酶形成一个反应活性很高的共价中间物，反应活化能由此大大降低。化能由此大大降低。 酶的亲核基团（如羟基、巯基和咪唑基）对底物的亲电酶的亲核基团（如羟基、巯基和咪唑基）对底物的亲电子中心进行攻击。亲核基团含有可提供电子的原子，向底物子中心进行攻击。亲核基团含有可提供电子的原子，向底物亲电子的原子提供电子，由此形成不稳定的共价中间物

22、。但亲电子的原子提供电子，由此形成不稳定的共价中间物。但酶的亲核基团易变，所形成的共价中间物不稳定，在随后步酶的亲核基团易变，所形成的共价中间物不稳定，在随后步骤中会被水分子或第二种底物攻击而给出所需的产物，由此骤中会被水分子或第二种底物攻击而给出所需的产物，由此可加快中间物的分解而释放出产物（可加快中间物的分解而释放出产物（p.392，图，图10-7）。）。酶蛋白分子上的主要亲核基团：丝氨酸的羟基、半胱氨酸的酶蛋白分子上的主要亲核基团：丝氨酸的羟基、半胱氨酸的巯基、组氨酸的咪唑基。巯基、组氨酸的咪唑基。 R C ON H R R C OE+H2N R R C O O H+E H4 4、酸碱催

23、化作用、酸碱催化作用 酶活性中心上有的基团是质子供体，有的为质子酶活性中心上有的基团是质子供体，有的为质子受体，均可进行催化作用。受体，均可进行催化作用。质子供体质子受体pKa-COOHCOO-3.96(Asp)4.32(Glu)-N+H3-NH210.8-SH-S-8.3312.486.00NHCN+H2NH2N HCN HN H2N+HNHHNN（1）狭义酸碱催化剂：通过水分子的）狭义酸碱催化剂：通过水分子的H+与与OH-离离子进行的催化。由于酶反应的最适子进行的催化。由于酶反应的最适pH接近中接近中性，故作用不大；性，故作用不大；（2）广义酸碱催化剂：即质子供体和质子受体。）广义酸碱催化

24、剂：即质子供体和质子受体。在酶反应中有重要作用。在酶反应中有重要作用。v酶蛋白中起广义酸碱催化作用的功能基：氨基酶蛋白中起广义酸碱催化作用的功能基：氨基、羰基、羧基、硫氢基、酚羟基和咪唑基。、羰基、羧基、硫氢基、酚羟基和咪唑基。v组氨酸的咪唑基：既是很强的亲核基团，又是有组氨酸的咪唑基：既是很强的亲核基团，又是有效的广义酸碱功能基。效的广义酸碱功能基。1）其解离常数约）其解离常数约6.0，即其解离下来的质子浓度与，即其解离下来的质子浓度与水中的水中的H+相近，所以在中性条件下，有一半以酸相近，所以在中性条件下，有一半以酸形式存在，另一半以碱形式存在，即可作为质子供形式存在，另一半以碱形式存在，

25、即可作为质子供体，又可作质子受体而在酶反应中起催化作用；体，又可作质子受体而在酶反应中起催化作用；2）其供出和接受质子的速度十分迅速，且供出和）其供出和接受质子的速度十分迅速，且供出和接受的速度相等。接受的速度相等。 五、酶活性中心是低介电区域五、酶活性中心是低介电区域 某些酶的活性中心穴内相对是非极性的，催某些酶的活性中心穴内相对是非极性的，催化基团被低介电环境包围，并排除高极性的水分化基团被低介电环境包围，并排除高极性的水分子。这样，底物分子的敏感键和酶的催化基团之子。这样，底物分子的敏感键和酶的催化基团之间就会有很大的反应力。间就会有很大的反应力。 水会减弱极性基团间的相互作用。水的极性

26、水会减弱极性基团间的相互作用。水的极性和形成氢键的能力很大，水的介电常数极高。这和形成氢键的能力很大，水的介电常数极高。这种高极性使它在离子外形成定向的溶剂层，产生种高极性使它在离子外形成定向的溶剂层，产生自身的电场，从而大大减少了它所所包围的离子自身的电场，从而大大减少了它所所包围的离子间的静电作用或氢键作用。间的静电作用或氢键作用。六、金属离子催化六、金属离子催化（1）通过结合底物为反应定向；）通过结合底物为反应定向；（2）通过可逆地改变金属离子的氧化态调节）通过可逆地改变金属离子的氧化态调节 氧化还原反应；氧化还原反应；（3）通过静电稳定或屏蔽负电荷。）通过静电稳定或屏蔽负电荷。四、酶催

27、化反应机制的实例四、酶催化反应机制的实例一、溶菌酶一、溶菌酶 溶菌酶的生物学功能是催化细菌细胞壁多糖的水解。溶菌酶的生物学功能是催化细菌细胞壁多糖的水解。 这种细胞壁多糖是这种细胞壁多糖是N-乙酰氨基葡萄糖（乙酰氨基葡萄糖（NAG）-N-乙酰氨基乙酰氨基葡萄糖乳酸（葡萄糖乳酸（NAM）的共聚物，）的共聚物，NAG与与NAM以以-1,4糖苷键交糖苷键交替排列：替排列： 溶菌酶的最适小分子底物为溶菌酶的最适小分子底物为NAG-NAM交替的六糖，以交替的六糖，以A，B，C，D，E，F表示，其中表示，其中D是是NAM。 溶菌酶溶菌酶分子中有一个狭长的凹穴，正适合于小分子底分子中有一个狭长的凹穴，正适合

28、于小分子底物的嵌合。凹穴中的物的嵌合。凹穴中的Glu35和和Asp52是活性中心的氨基酸残是活性中心的氨基酸残基（见下图）。基（见下图）。作用原理：作用原理：v当酶与细胞壁接触时，与六个暴露在外的氨基糖残当酶与细胞壁接触时，与六个暴露在外的氨基糖残基结合。此时酶的构象发生变化，基结合。此时酶的构象发生变化，Glu35和和Asp52相相互靠近，并与底物的互靠近，并与底物的D糖起糖起“靠近靠近”和和“定向定向”效效应：应：Asp52羧基上的一个氧原子距离羧基上的一个氧原子距离D环上的环上的C1及及D环上的氧原子只有环上的氧原子只有0.3nm，Glu35羧基上的一个氧原羧基上的一个氧原子距离子距离D

29、糖的糖苷键上的氧原子也只有糖的糖苷键上的氧原子也只有0.3nm；同时；同时，在酶的作用下，在酶的作用下，D糖构象也发生变形，由正常的糖构象也发生变形，由正常的椅式变成能量较高的半椅式或船式构象。椅式变成能量较高的半椅式或船式构象。v结合后，结合后，Glu35由于处于非极性区，呈不解离状态由于处于非极性区，呈不解离状态-COOH，这样它可以起着广义酸碱催化作用，提供，这样它可以起着广义酸碱催化作用，提供一个质子给糖苷键的氧原子，使得氧原子与一个质子给糖苷键的氧原子，使得氧原子与D环环C1间的糖苷键断开，而间的糖苷键断开，而C1带上正电荷，成为正碳原子带上正电荷，成为正碳原子C1+。 v处于极性区

30、的处于极性区的Asp52在通常情况下呈离子化状态在通常情况下呈离子化状态-COO-，这样它就起着稳定，这样它就起着稳定C1+的作用，协调的作用，协调C1-O间间糖苷键的断裂，直到环境中水分子的糖苷键的断裂，直到环境中水分子的OH-与与C1+结合结合，H+与与Glu35结合，使两者恢复非离子化形式。由结合，使两者恢复非离子化形式。由此完成一次水解反应此完成一次水解反应 。二、胰凝乳蛋白酶二、胰凝乳蛋白酶 该酶的活性中心由该酶的活性中心由Ser195，His57和和Asp102组成，其中组成，其中Ser195是酶活性中心的底物结合部位，是酶活性中心的底物结合部位，His57是活性中心内的是活性中心

31、内的催化部位。在三维结构中这三个氨基酸残基是十分靠近的。催化部位。在三维结构中这三个氨基酸残基是十分靠近的。 作用原理：作用原理： 活性中心的活性中心的Ser195、His57及及Asp102构成一个氢键体系，使构成一个氢键体系，使His57的咪唑基成为的咪唑基成为Asp102羧基及羧基及Ser195羟基间的桥梁：羟基间的桥梁： Ser195由于由于His57及及Asp102的影响而成为很强的亲核基团的影响而成为很强的亲核基团，易于提供电子。这个氢键体系称为，易于提供电子。这个氢键体系称为“电荷中继网电荷中继网”。 在大部分情况下，网中在大部分情况下，网中Asp102以离子化形式以离子化形式-

32、COO-，Ser195以非离子化形式以非离子化形式-CH2OH存在。但也有另一种情存在。但也有另一种情况，即由于况，即由于Asp102从从Ser195吸引一个质子所造成，想接吸引一个质子所造成，想接力赛跑那样，质子先从力赛跑那样，质子先从Ser195传递到传递到His57上，再由上，再由His57传递到传递到Asp102上。上。 在此酶促反应中，在此酶促反应中，His57咪唑基起着广义酸碱催咪唑基起着广义酸碱催化作用：先促进化作用：先促进Ser195的羟基亲核地附着到底物敏感的羟基亲核地附着到底物敏感肽键的羰基碳原子上，形成共价的酰化中间物，再促肽键的羰基碳原子上，形成共价的酰化中间物，再促进

33、酰化的进酰化的ES中间物上的酰基转移到水或其他的酰基中间物上的酰基转移到水或其他的酰基受体（如醇，氨基酸等）上。其对多肽底物水解可分受体（如醇，氨基酸等）上。其对多肽底物水解可分两个阶段：两个阶段： 1、水解反应的酰化阶段：、水解反应的酰化阶段： Ser195羟基的氧原子对底物敏感键的羰基碳原羟基的氧原子对底物敏感键的羰基碳原子进行亲核攻击，形成了一个为时暂短的四联体子进行亲核攻击，形成了一个为时暂短的四联体过渡态。在这过渡态中，底物的酰基部分与过渡态。在这过渡态中，底物的酰基部分与Ser195的羟基、氨基部分与的羟基、氨基部分与His57的咪唑基相连接。在此的咪唑基相连接。在此过程中，通过电

34、荷中继网（丝氨酸向组氨酸提供过程中，通过电荷中继网（丝氨酸向组氨酸提供质子）发生反应，敏感肽键断裂，底物中的胺成质子）发生反应，敏感肽键断裂，底物中的胺成分通过氢键与分通过氢键与His57咪唑基相连，底物的羧基部分咪唑基相连，底物的羧基部分通过酯键与通过酯键与Ser195的羟基相连。的羟基相连。 2、水解反应的脱酰阶段：、水解反应的脱酰阶段： 首先胺从酶上释放出来，这样底物的羧基部首先胺从酶上释放出来，这样底物的羧基部分与酶就成了酰化酶，这是中间复合物。接着水分与酶就成了酰化酶，这是中间复合物。接着水分子进入活性中心，电荷中继网从水中吸收一个分子进入活性中心，电荷中继网从水中吸收一个质子，结果

35、质子，结果OH-立即攻击已连在立即攻击已连在Ser195上的底物上的底物羧基碳原子，也形成一个短暂的四联体过渡态。羧基碳原子，也形成一个短暂的四联体过渡态。然后然后His57供出一个质子到供出一个质子到Ser195的氧原子上，结的氧原子上，结果底物中的酸成分从果底物中的酸成分从Ser195上释放出来，酶又恢上释放出来，酶又恢复自由状态。复自由状态。三、羧肽酶三、羧肽酶 此酶是单链蛋白质，其中紧密地结合着一个此酶是单链蛋白质，其中紧密地结合着一个Zn2+离子。这个离子对酶的活性很重要。该酶是离子。这个离子对酶的活性很重要。该酶是一个外肽酶，催化肽链一个外肽酶，催化肽链C-末端的肽键水解。末端的肽

36、键水解。 在酶的三维结构中，在酶的三维结构中，Zn2+离子处于接近酶表离子处于接近酶表面的沟槽中，它与两个组氨酸（面的沟槽中，它与两个组氨酸（His196, 69）侧链和）侧链和一个谷氨酸（一个谷氨酸（Glu72）及一个水分子形成一个四面）及一个水分子形成一个四面体，体，Zn2+离子在此四面体中与这三个氨基酸以配离子在此四面体中与这三个氨基酸以配价键相连。价键相连。 离离Zn2+离子不远有一个离子不远有一个“裂缝裂缝”（见下图），（见下图），允许底物允许底物C-末端伸入。裂缝顶部还有一个口袋，可末端伸入。裂缝顶部还有一个口袋，可以接受以接受C-末端的末端的R基团，酶的基团，酶的Tyr248（黄

37、）、（黄）、Arg145（蓝）、（蓝）、Glu270 （绿）及（绿）及Zn2+将底物分子适当地定位将底物分子适当地定位于活性中心中。于活性中心中。作用原理：作用原理： 1、在底物诱导下，酶活性中心的结构发生巨大改、在底物诱导下，酶活性中心的结构发生巨大改变，底物的变，底物的“靠近靠近”和和“定向定向”效应十分显著；效应十分显著；2、酶的、酶的Glu270使底物的敏感肽键发生电子张力，使使底物的敏感肽键发生电子张力，使敏感肽键变得极易断裂。敏感肽键变得极易断裂。 底物结合的过程分五步：底物结合的过程分五步：1、酶侧链中、酶侧链中Arg145上的正电荷与底物上的正电荷与底物C-末端氨基酸末端氨基酸

38、残基上羧基的负电荷发生静电吸引作用；残基上羧基的负电荷发生静电吸引作用；2、该氨基酸残基进入酶的非极性口袋中；、该氨基酸残基进入酶的非极性口袋中；3、底物敏感键上羰基中的氧与、底物敏感键上羰基中的氧与Zn2+离子相接近；离子相接近；4、底物的末端氨基通过一个插入的水分子与酶中、底物的末端氨基通过一个插入的水分子与酶中Glu270的侧链建立氢键。的侧链建立氢键。 构象变化结果：构象变化结果：1、Arg145的胍基和的胍基和Glu270的羧基相向移动了的羧基相向移动了0.2nm；2、Arg145的结合，使底物末端从口袋中推走了的结合，使底物末端从口袋中推走了4个个水分子，并将结合在水分子，并将结合

39、在Zn2+离子上的水分子推开离子上的水分子推开（但留在附近）（但留在附近） ，底物自身结合到，底物自身结合到Zn2+离子上；离子上；3、由于、由于Arg145的移动带动了的移动带动了Tyr248的羟基移动的羟基移动1.2nm，从酶表面移到底物肽键附近，由此关，从酶表面移到底物肽键附近，由此关闭了活性中心的凹道，活性中心从充满水的状闭了活性中心的凹道，活性中心从充满水的状态转变为疏水区。态转变为疏水区。 酶与底物结合后，酶与底物结合后，Zn2+离子、离子、Glu270和和Tyr248的作用：的作用：（1）Zn2+离子：使敏感肽键产生电子张力。酶与底物靠近时离子：使敏感肽键产生电子张力。酶与底物靠

40、近时，敏感肽键指向，敏感肽键指向Zn2+离子，在该离子作用下，底物羰基碳原离子，在该离子作用下，底物羰基碳原子的电子云密度降低，呈正电性，这样羰基碳原子在亲核攻子的电子云密度降低，呈正电性，这样羰基碳原子在亲核攻击下更加脆弱。同时，击下更加脆弱。同时，Glu270负电荷靠近肽键加大了这种偶负电荷靠近肽键加大了这种偶极矩。因此极矩。因此Zn2+离子对底物造成的电子张力大大地促进了底离子对底物造成的电子张力大大地促进了底物的水解。物的水解。（2）Glu270和和Tyr248： 第一种说法：第一种说法：Glu270首先激活水分子，使其释放出首先激活水分子，使其释放出OH-，由由OH-直接攻击底物敏感

41、肽键的羰基碳原子，同时直接攻击底物敏感肽键的羰基碳原子，同时Tyr248提供提供一个质子，由此底物的肽键直接水解；一个质子，由此底物的肽键直接水解； 第二种说法：第二种说法：Glu270直接攻击羰基碳原子，并且直接攻击羰基碳原子，并且Tyr248向向该肽键的该肽键的-NH-提供一个质子，肽键断开，生成一个胺和一个提供一个质子，肽键断开，生成一个胺和一个Glu270与底物羰基相连的酸酐，最后水分子使酸酐水解，生与底物羰基相连的酸酐，最后水分子使酸酐水解，生成一个酸和复原的酶。成一个酸和复原的酶。注意：注意：（1）Tyr248参与底物与酶的结合过程，而在催化参与底物与酶的结合过程，而在催化过程中仅

42、仅是起提供质子的作用，并不是催化所过程中仅仅是起提供质子的作用，并不是催化所必需的；必需的；（2）在羧肽酶）在羧肽酶A中，底物有末端羧基，就能与中，底物有末端羧基，就能与Arg145的正离子基团形成盐键，触发的正离子基团形成盐键，触发Tyr248移至移至酶活性中心。如果底物没有末端羧基，就不发生酶活性中心。如果底物没有末端羧基，就不发生这种结合和移动，酶则不表现活性。这种结合和移动，酶则不表现活性。 第三节第三节 酶酶的活力的活力 酶的活力是指其在一定条件下催化某酶的活力是指其在一定条件下催化某一特定反应的能力。一特定反应的能力。一、酶活力与酶反应速度一、酶活力与酶反应速度 酶活力：一定条件下

43、催化某一化学反酶活力：一定条件下催化某一化学反应的反应速度。应的反应速度。 反应速度（反应速度（v）的单位：浓度）的单位：浓度/单位时单位时间，即单位时间内单位体积中底物的减少间，即单位时间内单位体积中底物的减少量或产物的增加量。量或产物的增加量。 产物浓度对反应时间作图，其曲线的产物浓度对反应时间作图，其曲线的斜率就是反应速度。反应速度只在最初一斜率就是反应速度。反应速度只在最初一段时间内保持恒定，随反应时间延长，反段时间内保持恒定，随反应时间延长，反应速度逐渐下降。因此研究酶反应速度应应速度逐渐下降。因此研究酶反应速度应该以初速度为准（通常以底物的变化在起该以初速度为准（通常以底物的变化在

44、起始浓度的始浓度的5%以内的速度为初速率）。以内的速度为初速率）。 二、酶的活力单位二、酶的活力单位 1个酶活力单位：指在特定条件（温度个酶活力单位：指在特定条件（温度25，pH和底物和底物浓度等均最适）下，在浓度等均最适）下，在1分钟内能转化分钟内能转化1mol底物的酶量，或底物的酶量，或是转化底物中是转化底物中1mol的有关基团的酶量。的有关基团的酶量。 习惯用法：如淀粉酶，以每小时催化习惯用法：如淀粉酶，以每小时催化1g可溶性淀粉液化可溶性淀粉液化所需的酶量为所需的酶量为1个酶活力单位；也可以每小时催化个酶活力单位；也可以每小时催化1ml 2%可可溶性淀粉液化所需的酶量表示。溶性淀粉液化

45、所需的酶量表示。三、酶的比活力三、酶的比活力 每每mg酶蛋白所具有的酶活力。酶蛋白所具有的酶活力。 单位：单位单位：单位/毫克蛋白（毫克蛋白（U/mg蛋白质）蛋白质） 也可：单位也可：单位/克克 或或 单位单位/毫升毫升 比活力可用来比较每单位重量酶蛋白的催化活力。比活力可用来比较每单位重量酶蛋白的催化活力。四、酶的转换数四、酶的转换数kcat 为每秒钟每个酶分子转换底物的微摩尔数（为每秒钟每个酶分子转换底物的微摩尔数（mol）。相）。相当于一旦底物当于一旦底物-酶中间物酶中间物ES形成后，酶将底物转换为产物的形成后，酶将底物转换为产物的效率（相当于米氏方程中的效率（相当于米氏方程中的k3）。

46、）。 第四节第四节 酶促反应动力学酶促反应动力学v研究酶催化反应过程与速率及各种影响酶催化研究酶催化反应过程与速率及各种影响酶催化速率的因素的关系速率的因素的关系.v酶促反应速度：单位时间内反应物的消耗或产酶促反应速度：单位时间内反应物的消耗或产物的增加（取其初速度）。物的增加（取其初速度）。一、底物浓度的影响一、底物浓度的影响1、“中间产物中间产物”假说与米氏方程假说与米氏方程 在一定的酶浓度下将初速度（在一定的酶浓度下将初速度（v）对底物浓度）对底物浓度S作图时：作图时： 一级反应：当底物浓度较低时，反应速度与底物浓度呈正比一级反应：当底物浓度较低时，反应速度与底物浓度呈正比关系；关系；混

47、合级反应：随着底物浓度的增加，反应速度不再按正比升混合级反应：随着底物浓度的增加，反应速度不再按正比升高；高；零级反应：继续增大底物浓度，反应速度递增为零，这时反零级反应：继续增大底物浓度，反应速度递增为零，这时反应速度已趋向一个极限，说明酶已被底物饱和。应速度已趋向一个极限，说明酶已被底物饱和。 Vmax底物浓度初速度Km 底物浓度对反应速度的影响 解释这种现象的是解释这种现象的是“中间产物中间产物”假说：酶与底假说：酶与底物先络合成一个络合物，它是作为过渡态物质，然物先络合成一个络合物，它是作为过渡态物质，然后络合物进一步分解，成为产物和游离态酶。后络合物进一步分解，成为产物和游离态酶。

48、这个假说的前提是酶与底物反应的这个假说的前提是酶与底物反应的“快速平衡快速平衡”，即在反应的开始阶段，两者反应速度很快，迅，即在反应的开始阶段，两者反应速度很快，迅速建立平衡关系。速建立平衡关系。 按按“稳态平衡稳态平衡”假说，酶促反应分两步进行：假说，酶促反应分两步进行：第一步：酶（第一步：酶（E）与底物（）与底物（S）作用，形成酶）作用，形成酶-底物底物中间产物中间产物 E+SES 第二步：中间产物分解，形成产物（第二步：中间产物分解，形成产物（P），释放出），释放出游离酶游离酶(E)： ESP+EE+SESE+P反应初期，V=K3ESK1K2K3稳态：ES生成=ES分解K1ES=K2ES

49、+K3ES ES(K2 K3)/K1+ ES=ES=ES/KmE=ET-ESES=（ET-ES）S/KmES=ETS/（S+Km）V=K3ES=K3ETS/（S+Km） =VmaxS/（S+Km）1913年，年，Michaelis与与Menten：米孟式方程：米孟式方程 v=VmaxS/(S+Km)v=酶促反应的速度，酶促反应的速度，Vmax=在在E与与ES相等时的酶促反应达相等时的酶促反应达到的最大速度，到的最大速度，Km=(k2+k3)/k1Km、Vmax意义意义（1）v=1/2Vmax时，时，Km=S。 Km不依赖于酶浓度，不依赖于酶浓度， Km就是酶促反应速度为最大速度一半时底物浓度。

50、就是酶促反应速度为最大速度一半时底物浓度。 Km的单位是的单位是mol/L.（2）Vmax=K3ET，Vmax与加入的酶量成正比。与加入的酶量成正比。（3） Km为酶的特征常数。每种酶都有其为酶的特征常数。每种酶都有其Km值，值， Km只只与酶的结构和酶的底物有关，与酶的浓度无关与酶的结构和酶的底物有关，与酶的浓度无关.（4） Km可表示酶与底物的亲和力。可表示酶与底物的亲和力。 Km越大，酶与底物越大，酶与底物的亲和力越小的亲和力越小。（5）一种酶催化几种底物时有不同的）一种酶催化几种底物时有不同的Km，其中，其中Km最小的最小的底物为该酶的天然底物或最适底物。多底物反应的酶底物为该酶的天然