分子生物学考试复习资料.doc
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1、Four short words sum up what has lifted most successful individuals above the crowd: a little bit more.-author-date分子生物学考试复习资料分子生物学考试复习资料一、重要名词类(部分): DNA半保留复制(简称复制)(semiconservative replication):DNA复制时,亲代DNA双螺旋结构解开,分别以解开的两股单链为模板,以dNTP为原料,按照碱基互补的原则,合成与模板链互补的新链,从而形成两个子代DNA双链,其结构与亲代DNA双链完全一致。因子代DNA双链中的
2、一股单链源自亲代,另一股单链为合成的新链,形成的双链与亲代双链的碱基序列完全一致,故称为半保留复制。 复制叉:原核生物DNA的复制从单一起点开始,双螺旋结构被打开,分开的两股单链分别作为新DNA合成的模板,DNA合成从起点开始向两个方向进行,与单一起点相连的局部结构形状呈“Y”型,称复制叉结构。 复制子:基因组中能独立进行复制的DNA单位称为复制子或复制单位。它含有控制复制起始或终止的特定位点,从复制起始点到终止点的区域为一个复制子。 半不连续复制:复制过程中,催化DNA 合成的DNA聚合酶只能催化核苷酸从53方向合成,以3 5链为模板时,新生的DNA以53方向连续合成;而以53为模板只能合成
3、若干反向互补的岡崎片段,这些片段再相连成完整的新链,故称半不连续复制。(前导链、滞后链) 冈崎片段:DNA双链是反向平行的,复制时,亲代双链DNA在复制叉处打开,由于新链的合成具有方向性,即从53,以53DNA链为模板合成反向互补的新链时,只能合成小片段DNA,这些片段根据发现者命名为岡崎片断。 转录:是指以DNA为模板,合成RNA的信息传递过程。除了某些RNA病毒的基因组之外,所有的RNA都是转录产物。 反义链:在基因的DNA双链中,转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链。 上游顺式作用元件:在真核基因中存在着很多的位于转录起始点上游的顺式调控序列,这些DNA序列称之为上游顺
4、式作用元件。是指与结构基因表达调控相关、能够被调控蛋白特异性识别和结合的DNA序列,包括启动子、上游启动子元件等,它们是通过与反式作用因子的相互作用来调节基因转录活性。 启动子:是基因DNA中一段特定的核苷酸序列,是与启动机因表达相关的顺式作用元件,式RNA聚合酶在转录起始时对模板DNA的识别位点和结合位点,是基因转录的开始部位,也即是转录是否能起始的决定位点。 终止子:促进转录终止的DNA序列,在RNA水平上通过转录出的终止子序列形成茎-环结构而起作用。又可分为依赖于因子的终止子和不依赖于因子的终止子两类。 转录后加工:在转录中新合成的RNA往往是较大的前体分子,需要经过进一步的加工修饰,才
5、转变为具有生物学活性的、成熟的RNA分子,这一过程称为转录后加工。 多顺反子:在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA连在一起,相互之问由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种mRNA叫做多顺反子mRNA。 RNA编辑:某些mRNA的核苷酸序列,在生成转录产物后还需插入、删除或取代一些核苷酸残基,方能生成具有正确翻译功能的模板,遗传信息在mRNA水平上的改变过程,称为RNA编辑。 PCR:即聚合酶链式反应,扩增样品中的DNA量和富集众多DNA分子中的一个特定的DNA序列的一种技术。在该反应中,使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮DNA合成。其中包括DNA变性、引物退火和在Ta
6、qDNA聚合酶催化下的DNA合成。 基因:能够表达和产生蛋白质和RNA的DNA序列,是决定遗传性状的功能单位。 结构基因:指一类编码细胞结构和基本代谢活动所必要的RNA、蛋白质或酶。一般来说,它们不是调控因子。 调控基因:是指那些编码那些控制其他基因表达的RNA或蛋白质的基因。调控基因的表达产物是调控因子。调控基因也是结构基因,只是它的编码蛋白质具有基因调控的功能,是在基因水平上而不是蛋白质水平上的控制。基因组:细胞或生物体的一套完整单倍体的遗传物质的总和。 翻译(translation):以mRNA为模板,氨酰-tRNA为原料直接供体,在多种蛋白质因子和酶的参与下,在核糖体上将mRNA分子上
7、的核苷酸顺序表达为有特定氨基酸顺序的蛋白质的过程。 端粒:以线性染色体形式存在的真核基因组DNA末端都有一种特殊的结构叫端粒。该结构是一段DNA序列和蛋白质形成的一种复合体,仅在真核细胞染色体末端存在。 操纵子:是指数个功能上相关的结构基因串联在一起,构成信息区,连同其上游的调控区(包括启动子和操纵基因)以及下游的转录终止信号所构成的基因表达单位,所转录的RNA为多顺反子。 顺式作用元件:是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等。 反式作用因子:是指真核细胞内含有的大量可以通过直接或间接结合
8、顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子。 增强子:位于真核基因中远离转录起始点,能明显增强启动子转录效率的特殊DNA序列。它可位于被增强的转录基因的上游或下游,也可相距靶基因较远。 基因表达:是指生物基因组中结构基因所携带的遗传信息经过转录、翻译等一系列过程,合成特定的蛋白质,进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应的全过程。 分子克隆:在体外对DNA分子按照即定目的和方案进行人工重组,将重组分子导入合适宿主,使其在宿主中扩增和繁殖,以获得该DNA分子的大量拷贝。 DNA变性:在物理或化学因素的作用下,导致两条DNA链之间的氢键断裂,而核酸分子中的所有共价键则不受影响。 DNA复性:当促使变
9、性的因素解除后,两条DNA链又可以通过碱基互补配对结合形成DNA双螺旋结构 突变(mutation):基因组DNA顺序上的任何一种改变都叫做突变。分点突变和结构畸变。 点突变(Point mutation)是指一个或几个碱基对被置换(replacement),这种置换又分两种形式:转换(transition)一-指用一个嘌呤碱置换另一个嘌呤碱,一个嘧啶碱置换另一个嘧啶碱;颠换(transversion)一-指用嘌呤碱置换嘧啶碱或用嘧啶碱置换嘌呤碱。 错义突变:DNA分子中碱基对的取代,使得mRNA的某一密码子发生变化,由它所编码的氨基酸就变成另一种的氨基酸,使得多肽链中的氨基酸顺序也相应的发生
10、改变的突变。 无义突变:由于碱基对的取代,使原来可以翻译某种氨基酸的密码子变成了终止密码子的突变。 同义突变:碱基对的取代并不都是引起错义突变和翻译终止,有时虽然有碱基被取代,但在蛋白质水平上没有引起变化,氨基酸没有被取代,这是因为突变后的密码子和原来的密码子代表同一个氨基酸的突变。 同义密码子(synonym codon):为同种氨基酸编码的各个密码子,称为同义密码了。 移码突变:在编码序列中,单个碱基、数个碱基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突变位点之后的三联体密码阅读框发生改变,不能编码原来的蛋白质的突变。 管家基因:在生物体生命的全过程都是必须的,且在一个生物个体的几乎所有细
11、胞中持续表达的基因。 SD序列:转录出的mRNA要进入核糖体上进行翻译,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列与大肠杆菌16S rRNA3,末端富含嘧啶的序列互补,是核糖体的识别位点。 CAP:是大肠杆菌分解代谢物基因活化蛋白,这种蛋白可将葡萄糖饥饿信号传递个许多操纵子,使细菌在缺乏葡萄糖时可以利用其他碳源。 回文序列:DNA片段上的一段所具有的反向互补序列,常是限制性酶切位点。 蓝-白斑筛选:含LacZ基因(编码半乳糖苷酶)该酶能分解生色底物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-D-半乳糖苷)产生蓝色,从而使菌株变蓝。当外源DNA插入后,LacZ基因不能表达,菌株呈白色,以此来筛选重组细菌。称之为蓝-
12、白斑筛选。 DNA聚合酶(DNA polymerase):指以脱氧核苷三磷酸为底物,按5 3方向合成DNA的一类酶,反应条件:4种脱氧核苷三磷酸、Mg+、模板、引物。DNA聚合酶是多功能酶,除具有聚合作用外,还具有其它功能,不同DNA聚合酶所具有的功能不同。 拓扑异构酶(topoisomerase):是一类引起DNA拓扑异构反应的酶,分为两类:类型I的酶能使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量,类型的酶能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入超螺旋时,需要由ATP供给能量。 单链DNA结合蛋白(single-strand binding protein ,SSB):是一类特
13、异性和单链区DNA结合的蛋白质。它的功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶降解。 修复(repair):除去DNA上的损伤,恢复DNA的正常结构和功能是生物机体的一种保护功能。 光裂合酶修复(又称光复活)(photoreactivation):可见光将光裂合酶激活,它分解DNA上由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体,使它们恢复成两个单独的嘧啶碱。 切除修复(excision repair):在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤部分切除,以互补链为模板,合成出空缺的部分,使DNA恢复正常结构的过程。 重组修复(recombination repair):DNA在有损伤的情况
14、下也可以复制,复制时子代链跃过损伤部位并留下缺口,通过分子间重组,从完整的另一条母链上将相应的核苷酸序列片段移至子链缺口处,然后用再合成的多核苷酸的序列补上母链的空缺,此过程称重组修复。 诱导修复和应急反应(induction repair and SOS response)(SOS修复):由于DNA受到损伤或复制系统受到抑制所诱导引起的一系列复杂的应急效应,称为应急反应。 SOS反应主要包括两个方面:DNA损伤修复(SOS修复或称诱导修复)和诱变效应。SOS修复是一种易出差错的修复过程,虽能修复DNA的损伤而避免死亡。但却带来高的变异率。 DNA重组(recombination):DNA重组
15、是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中、病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。 基因工程(又称基因重组技术)(gene/genetic engineering):是将外源基因经过剪切加工,再插入到一个具有自我复制能力的载体DNA中,将新组合的DNA转移到一个寄主细胞中,外源基因就可以随着寄主细胞的分裂进行繁殖,寄主细胞也借此获得外源基因所携带的新特性。 转录(transcription):由依赖于DNA的RNA聚合酶催化,以DNA的一条链的一定区段为模板,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链互补的RNA链的过程。 模板链(template strand)又称负(-)链,反意义链(a
16、ntisense strand):转录过程中用作模板的这条DNA链,称模板链。非模板链(nontemplate strand)又称正(+)链,编码链(coding strand),有意义链(sense strand):与模板链互补的那条DNA链,称非模板链。 不对称转录(asymmetric transcription):因为RNA的转录只在DNA的任一条链上进行,所以把RNA的合成叫做不对称转录。 转录单位(transcription unit):RNA的转录只在DNA的一个片段上进行,这段DNA序列叫转录单位。 内含子(intron):真核生物基因中,不为蛋白质编码的、在mRNA加工过程中
17、消失的DNA序列,称内含子。 外显子(exon):真核生物基因中,在mRNA上出现并代表蛋白质的DNA序列,叫外显子。 转录加工(post-transcriptional processing):细菌中很多RNA分子和几乎全部真核生物的RNA在合成后都需要核内不均一RNA(hnRNA):是真核生物细胞核内的mRNA前体分子,分子量较大,并且不均一,含有许多内含子。 RNA的复制(RNA replication):某些病毒RNA既可以做为模板合成病毒蛋白质又可在 RNA复制酶(RNA replicase)的催化下,以自身RNA为模板,合成互补的RNA新链,合成方向53,这一过程叫RNA复制。 .
18、分子杂交:互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测 RNA编辑(RNA editing) 是某些RNA,特别是mRMA的一种加工方式,它导致了DNA 所编码的遗传信息的改变,是因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。 转座子 (transposon) 是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位。 基因簇( gene cluster) 真核生物中许多相关的基因常按功能成套组合,被称为基因家族,同一家族的成员有时紧密的排列在一起,成为基因簇。
19、回文序列:其中每条单链以53方向都是相同的,易形成发夹结构或十字形结构,限制性酶切位点。 上游启动子元件:包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等,包括增强子。 弱化子:在操纵区与结构基因之间的一段可以终止转录的序列。 DNA的转座 DNA的转座,或称移位(transposition),是由可移位因子(transposableelement)介导的遗传物质重排现象。已经发现转座这一命名并不十分准确,因为在转座过程中,可移位因子的一个拷贝常常留在原来位置上,在新位点上出现的仅仅是拷贝。因此,转座有别于同源重组,它依赖于DNA的复制。 二、填空类(部分): 原核生物中有三种起始因子分
20、别是(IF-1)、( IF-2 )和(IF-3 )。蛋白质的跨膜需要( 信号肽 )的引导,蛋白伴侣的作用是(辅助肽链折叠成天然构象的蛋白质)。启动子中的元件通常可以分为两种:(核心启动子元件 )和(上游启动子元件 )。分子生物学的研究内容主要包含(结构分子生物学 )、(基因表达与调控 )、( DNA重组技术 )三部分。证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是(肺炎球菌感染小鼠 )、( T2噬菌体感染大肠杆菌 )这两个实验中主要的论点证据是:(生物体吸收的外源DNA改变了其遗传潜能)。DNA重组技术也称为(基因克隆)或(分子克隆 )。最终目的是(把一个生物体中的遗传信息DNA转入另一个生物体)。典
21、型的DNA重组实验通常包含以下几个步骤:提取供体生物的目的基因(或称外源基因),酶接连接到另一DNA分子上(克隆载体),形成一个新的重组DNA分子。将这个重组DNA分子转入受体细胞并在受体细胞中复制保存,这个过程称为转化。对那些吸收了重组DNA的受体细胞进行筛选和鉴定。对含有重组DNA的细胞进行大量培养,检测外援基因是否表达。 PCR的反应体系要具有以下条件:a、被分离的目的基因两条链各一端序列相互补的 DNA引物(约20个碱基左右)。b、具有热稳定性的酶如:TagDNA聚合酶。 c、dNTP d、作为模板的目的DNA序列PCR的基本反应过程包括:(变性)、(退火)、(延伸 )三个阶段 RNA
22、聚合酶的基本转录因子有、TF-A、TF-B、TFII-D、TF-E他们的结合顺序是: ( D、A、B、E )。其中TFII-D的功能是(与TATA盒结合 )。 与DNA结合的转录因子大多以二聚体形式起作用,转录因子与DNA结合的功能域常见有以下几种( 螺旋-转角-螺旋 )、( 锌指模体 )、(碱性-亮氨酸拉链模体 )。 蛋白质的生物合成是以_ mRNA_为模板,以_氨酰-tRNA 为原料直接供体,以_ 核糖体_为合成杨所。 生物界共有_64_个密码子,其中_61_个为氨基酸编码,起始密码子为_;终止密码子为_、_、_。 原核生物中的释放因子有三种,其中RF-1识别终止密码子UAA、UAG;RF
23、-2识别UAA_、UGA_;真核中的释放因子只有RF一种。 氨酰-tRNA合成酶对_氨基酸和相应的_tRNA有高度的选择性。 基因突变单个碱基的改变,同类碱基之间取代称为(转换);否则称(颠换)。 基因的损伤,一切使DNA结构和功能发生改变的DNA,都可称为基因的损伤。突变也是DNA损伤的一种,此外还包括:(碱基损伤),(DNA链断裂)。 原核生物mRNA与基因是(共线的),顺反子是(多顺反子);真核mRNA与基因(不是共线),顺反子是(单顺反子)。 转录的不对称性是指在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。与mRNA序列相同的那条DNA链称为(编码链
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