生物统计学第一章.doc
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1、【精品文档】如有侵权,请联系网站删除,仅供学习与交流生物统计学第一章.精品文档.生物统计学教案授课教师:陈彦云宁夏大学生命科学学院课程名称中文名称生物统计学英文名称Biostatistics课程说明生物统计学是运用数理统计的原理和方法来分析和解释生物界各种现象和试验调查资料的一门学科,是生物学各专业的专业基础课。随着生物学的不断发展,对生物体的研究和观察已不再局限于定性的描述,而是需要从大量调查和测定数据中,应用统计学方法,分析和解释其数量上的变化,以正确制定试验计划,科学地对试验结果进行分析,从而作出符合科学实际的推断。生物统计学不仅提供如何正确地设计科学试验和收集数据的方法,而且也提供如何
2、正确地整理、分析数据,得出客观、科学的结论的方法。本课程系统地介绍了生物统计学的基本原理和方法,在简要叙述了生物统计学的概念、产生、发展和作用、生物学研究中试验资料的整理、特征数的计算、概率和概率分布、抽样分布基础上,着重介绍了平均数和频率的假设检验、 X 2 检验、方差分析、试验设计的原理和常用试验设计及其统计分析。本课程主要任务是: 1 、培养学生掌握正确收集、整理试验资料的方法。 2 、培养学生掌握数据资料的基本统计分析方法。 3 、培养学生掌握生物统计基本理论、基本技术和常用方法。 4 、培养学生掌握常用的生物学试验设计方法并能对试验资料进行正确的统计分析。 5 、培养学生掌握必要的计
3、算技术,包括现行统计软件的使用方法。本课程的主要目的是培养学生具有生物学试验设计的能力和对试验资料进行统计分析处理的能力。对教师的要求1、教师必需严肃认真地备课。每位老师都有一份本教案的电子版,要求教师在使用时结合自身知识结构和教学经验,备课时,结合生物学实际。2、教师必需深入研究教学法,以学生的统计知识应用能力,充分发挥学生的主体作用,激发其求知欲望,培养学生的自学能力。3、在教学过程中,教师应注重学生综合分析、解决问题能力的培养,注重学生创新意识和思想品德的培养。教材选用生物统计学(第三版)李春喜主编 科学出版社参考书籍参考书籍: 生物统计学,杜荣骞主编,2002,高等教育出版社生物统计学
4、,陆建身等编,2003,高等教育出版社生物统计学,董时富 主编2002,科学出版社授课章节第一章 绪论授课对象生物科学本科授课时数2学时授课时间第三学年下学期授课地点教学楼教学目的与要求目的:初步明确生物统计学的重要作用和常用术语的概念。要求:掌握生物统计学基本概念、内容及作用;常用统计术语,熟悉统计学习的目标与方法,了解生物统计学的发展史教学重点与难点重点知识: 1 生物统计学的内容及作用2 常用统计术语难点知识:生物统计学的内容与作用。教学方法与组织安排教学方法:课堂讲授为主。 时间安排:教师讲授本次课内容90分钟。教学方法讲授、课件、举例 。教具多媒体教学提纲、课堂小结与课后练习一、教学
5、提纲1.通过第一节介绍生物统计学的定义及其重要性2.重点介绍第二、四节生物统计学的内容与作用及常用术语:通过第三节介绍生物生统计学的发展史 二、课堂小结1 统计学的定义及其重要性2生物统计学中的若干概念:总体与样本、误差与错误、准确性与精确性、参数与统计量。3.学习生物统计学的方法 三、思考题1、什么是生物统计?它在科学研究中有何作用?2、什么是总体、个体、样本、样本容量?统计分析的两个特点是什么?3、什么是参数、统计量?二者有何关系?4、什么是试验的准确性与精确性?如何提高试验的准确性与精确性?5、什么是随机误差与系统误差?如何控制、降低随机误差,避免系统误差?6、统计学发展的概貌可分为哪几
6、种形态?拉普拉斯、高斯、高尔敦、毕尔生、哥塞特、费雪各对统计学有何重要贡献?教学内容与组织安排:第一章 绪论讲述本章教学目标、概述本课时主要内容摘要:生物统计学是数理统计学的原理和方法在生命科学领域的具体应用,它是运用统计的原理和方法对生物有机体开展调查和试验,目的是以样本的特征来估计总体的特征,对所研究的总体进行合理的推论,得到对客观事物本质和规律性的认识。生物统计学主要内容包括试验设计和统计分析两大部分,其作用主要有四个方面:提供整理、描述数据资料的可行方法并确定其数量特征;判断试验结果的可靠性;提供由样本推断总体的方法;提供试验设计的原则。生物体计学的发展概况及六组统计学常用术语。重点内
7、容:生物统计学的概念、内容及作用,常用术语。第一节、生物统计学的概念及其重要性统计学(Statistics)是把数学的语言引入具体的科学领域,把具体科学领域中要待研究的问题抽象为数学问题的过程,它是收集、分析、列示和解释数据的一门艺术和科学,目的是求得可靠的结果。它有许多分支,如工业统计、农业统计、卫生统计等等。生物统计学是数理统计在生物学研究中的应用,它是应用数理统计的原理和方法,分析、推断和解释生命过程中的各种现象和试验调查资料的科学。属于生物数学的范畴第二节 生物统计学的主要内容及作用生物体计学主要内容包括试验设计和统计分析两大部分。在试验设计中,主要介绍试验设计的有关概念、试验设计的基
8、本原则,试验设计方案的制定,常用试验设计方法,其中主要有对比试验设计、随机区组设计、拉方设计,正交设计等;在统计分析中,主要包括数据资料的搜集与整理、数据特征数的计算、统计推断、方差分析、回归和相关分析等。生物统计学的作用主要有四个方面:1提供整理、描述数据资料的可行方法并确定其数量特征;2判断试验结果的可靠性;3提供油样本推断总体的方法;4提供试验设计的一些重要原则。第三节 统计学的发展概况 由于人类的统计实践是随着计数活动而产生的,因此,统计发展史可以追溯到远古的原始社会,也就是说距今足有五千多年的漫长岁月。但是,能使人类的统计实践上升到理论上予以概括总结的程度,即开始成为一门系统的学科统
9、计学,却是近代的事情,距今只有三百余年的短暂历史。统计学发展的概貌,大致可划分为古典记录统计学、近代描述统计学和现代推断统计学三种形态。一、古典记录统计学古典记录统计学形成期间大致在十七世纪中叶至十九世纪中叶。统计学在这个兴起阶段,还是一门意义和范围不太明确的学问,在它用文字或数字如实记录与分析国家社会经济状况的过程中,初步建立了统计研究的方法和规则。到概率论被引进之后,才逐渐成为一项较成熟的方法。最初卓有成效地把古典概率论引进统计学的是法国天文学家、数学家、统计学家拉普拉斯(P.S. Laplace,17491827)。因此,后来比利时大统计学家凯特勒指出,统计学应从拉普拉斯开始。(一)拉普
10、拉斯的主要贡献1、发展了概率论的研究 拉普拉斯第一种关于概率论的表述发表于1774年。从1812年起,先后出过四版概率分析理论,是他的代表作。书中,拉普拉斯最早系统地把数学分析方法运用到概率论研究中去,建立了严密的概率数学理论。2、推广了概率论在统计中的应用 由于拉普拉斯是通过结合天文学、物理学的研究来从事概率研究的,所以,他能相当自觉、相当明确地指出:概率论能在广泛范围中应用,能解决一系列的实际问题。他在实际推广中的成绩是多方面的,主要表现在人口统计、观察误差理论和概率论对于天文问题的应用。18091812年,他结合概率分布模型和中心极限思想来研究最小二乘法,首次为统计学中这项后来最常用的手
11、段奠定了理论基础。3、明确了统计学的大数法则 拉普拉斯认为:“由于现象发生的原因,是为我们所不知或知道了也因为原因繁复而不能计算;发生原因又往往受偶然因素或无一定规律性因素所扰乱,以至事物发展发生的变化,只有进行长期大量观察,才能求得发展的真实规律。概率论则能研究此项发展改变原因所起作用的成份,并可指明成份多少。”这是他通过天文学上的研究后所得的体会。他发现在观察天体运动现象中,当次数足够多时,能使个体的特征趋于消失,而呈现出某种同一现象。他指出这其中一定存在着某些原因,而非出于偶然。4、进行了大样本推断的尝试 在统计发展史上,人口的推算问题,多少年来成为统计学家耿耿于怀的难题。直到十九世纪初
12、,拉普拉斯才用概率论的原理迈出了关键的一步。在理论上,1781年拉普拉斯在“论概率”一文中,建立了概率积分,为计算区间误差提供了有力手段。17811786年提出“拉普拉斯定理”(中心极限定理的一部分),初步建立了大样本推断的理论基础。在实践上,拉普拉斯于1786年写了一篇关于巴黎人口的出生、婚姻、死亡的文章,文中提出根据法国特定地方的出生率来推算全国人口的问题。他抽选了30个市县,进行深入调查,推算出全国总人口数。尽管其方法和结果还相当粗糙,但在统计发展史上,他利用样本来推断总体的思想方法,为后人开创了一条抽样调查的新路子。(二)高斯的主要贡献德国大数学家高斯(C.F.Gauss,177718
13、55)对概率论与统计学的结合研究作出贡献1、建立最小二乘法 在学生时代,高斯就开始了最小二乘法的研究。1794年,他读了数学家兰伯特(J.H. Lambert,17281777)的作品,讨论如何运用平均数法,从观察值(Yi ,xi )中确定线性关系Yx中的二个系数。1795年,设想了以残差平方和(Yi abxi )2 为最小的情况下,求得的a与b来估计与。1798年完成最小二乘法的整个思考结构,正式发表于1809年。2、发现高斯分布 调查、观察或测量中的误差,不仅是不可避免的,而且一般是无法把握的。高斯以他丰富的天文观察和在18211825年间土地测量的经验,发现观察值x与真正值的误差变异,大
14、量服从现代人们最熟悉的正态分布。他运用极大似然法及其他数学知识,推导出测量误差的概率分布公式。“误差分布曲线”这个术语就是高斯提出来的,后人为了纪念他,称这分布曲线为高斯分布曲线,也就是今天的正态分布曲线。高斯所发现的一般误差概率分布曲线以及据此来测定天文观察误差的方法,不仅在理论上,而且在应用上都有极重要的意义。二、近代描述统计学近代描述统计学形成期间大致在十九世纪中叶至二十世纪上半叶。由于这种“描述”特色由一批原是研究生物进化的学者们提炼而成,因此历史上称他们为生物统计学派。生物统计学派的创始人是英国的高尔登(F. Galton,18221911),主将是高尔登的学生毕尔生(K.Pears
15、on,18571936)。(一) 高尔登的主要贡献 1、初创生物统计学 为了研究人类智能的遗传问题,高尔登仔细地阅读了三百多人的传记,以初步确定这些人中间多少人有亲属关系以及关系的大致密切程度。然后再从一组组知名人士中分别考察,以便从总体上来了解智力遗传的规律性。为了获得更多人的特性和能力的统计资料,高尔登自1882年起开设“人体测量实验室”。在连续六年中,共测量了9337人的“身高、体重、阔度、呼吸力、拉力和压力、手击的速率、听力、视力、色觉及个人的其它资料”,他深入钻研那些资料中隐藏着的内在联系,最终得出“祖先遗传法则”。他努力探索那些能把大量数据加以描述与比较的方法和途径,引入了中位数、
16、百分位数、四分位数、四分位差以及分布、相关、回归等重要的统计学概念与方法。1901年,高尔登及其学生毕尔生在为生物计量学(Biometrika)杂志所写的创刊词中,首次为他们所运用的统计方法论明确提出了“生物统计”(Biometry)一词。高尔登解释道:“所谓生物统计学,是应用于生物学科中的现代统计方法”。从高尔登及后续者的研究实践来看,他们把生物统计学看作为一种应用统计学,其研究范围,既用统计方法来研究生物科学中的问题,更主要的是发展在生物科学应用中的统计方法本身。 2、对统计学的贡献 (1) 关于变异 变异是进化论中的重要概念,高尔登首次以统计方法加以处理,最终导致了英国生物统计学派的创立
17、。1889年,高尔登把总体的定量测定法引入遗传研究中。高尔登通过总体测量发现,对动物或植物的每一个种别都可以决定一个平均类型。在一个种别中,所有个体都围绕着这个平均类型,并把它当作轴心向多方面变异。这就是他在遗传的天赋一书中提出的“平均数离差法则”。 (2)关于“相关” 统计相关法是由高尔登创造的。关于相关研究的起因,最早是他因度量甜豌豆的大小,觉察到子代在遗传后有“返于中亲”的现象。1877年他搜集大量人体身长数据后,计算分析高个子父母、矮个子父母以及一高一矮父母的后代各有多少个高个子和矮个子子女,从而把父母高的后代高个子比较多、父母矮的其后代高个子比较少这一定性认识具体化为父母与子女之间在
18、身长方面的定量关系。1888年,高尔登在“相关及其主要来自人体的度量”一文中,充分论述了“相关”的统计意义,并提出了高尔登相关函数(即现在常用的相关系数)的计算公式。 关于“回归” 1870年,高尔登在研究人类身长的遗传时发现:高个子父母的子女,其身长有低于他们父母身长的趋势;相反,矮个子父母的子女,其身长却往往有高于他们父母身长的趋势,从人口全局来看,高个子的人“回归”于一般人身长的期望值,而矮个子的人则作相反的“回归”。这是统计学上“回归”的最初涵义。1886年,高尔登在论文“在遗传的身长中向中等身长的回归”中,正式提出了“回归”概念。(二)毕尔生的主要贡献对生物统计学倾注心血,并把它上升
19、到通用方法论高度的是毕尔生。毕尔生的一生是统计研究的一生,他对统计学的主要贡献有: 1、变异数据的处理 生物统计中所取得的数据常常是零乱的,很难看出其所以然。为此,毕尔生首先探求处理数据的方法,他所首创的频数分布表与频数分布图如今已成为统计方法中最基本的手段之一。 2、分布曲线的选配 十九世纪以前,人们认为以频数分布描述变异值,最终都表现为正态分布曲线。但是,毕尔生从生物统计资料的经验分布中,注意到许多生物上的度量不具有正态分布,而常常呈偏态分布,甚至倾斜度很大;也不一定都是单峰,也有非单峰的。说明“唯正态”信念并不可靠。1894年,他在“关于不对称频率曲线的分解”一文中首先把非对称的观察曲线
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- 生物 统计学 第一章
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