2022年微生物学第八章微生物遗传学 .pdf
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1、第十九授课单元一、教学目的:1.掌握遗传与变异的概念,了解遗传性变异与饰变的区别2.了解遗传变异的物质基础3.掌握质粒的定义、质粒的结构、检测方法、特性和主要类型二、教学内容:1.引言遗传与变异的概念,遗传性变异与饰变的区别2.第一节:遗传变异的物质基础1) .转化实验2) .噬菌体感染实验3) .植物病毒的重建实验3.第二节:质粒1).质粒的定义和特点2).质粒的分离和鉴定3).质粒的分类和典型质粒介绍4第三节基因突变的规律与类型一、突变三、教学重点、难点及处理:重点1.遗传变异的物质基础3 个经典实的微生物学验证实了DNA 和 RNA 是遗传物质。1)经典转化实验:证明DNA 是遗传变异的
2、物质基础。2)噬菌体感染实验:证明DNA 是遗传变异的物质基础。3)植物病毒的重建实验:说明病毒蛋白质的特性为它的核酸所决定,而不是由蛋白质所决定。证明核酸(RNA )是遗传的物质基础。2.质粒的定义质粒( plasmid) :一种独立于染色体外,能进行自主复制的细胞质遗传因子,主要存在于各种微生物细胞中。附加体: 指那些既可以整合到核染色体上,作为染色体的一部分而进行复制,又可以再游离出来或携带一些寄主的染色体基因游离出来,这类质粒被称为附加体。3质粒的分子结构通常以共价闭合环状(covalently closed circle , 简称 CCC)的超螺旋双链DNA 分子存在于细胞中;也发现
3、有线型双链DNA 质粒和 RNA 质粒;质粒分子的大小范围从1kb 左右到精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 1 页,共 26 页1000kb; (细菌质粒多在10kb 以内)4质粒的分离方法很多,主要介绍碱提取法,其步骤如下:菌体的培养和收集:一般采用丰富培养基对菌体进行培养,当细胞生长到指数期后期时,离心收集细胞。溶菌:一般用溶菌酶去壁以形成原生质体或原生质球。碱变性处理:在SDS 等表面活性剂存在下加NaOH 液使 pH 升至 12.4,可使菌体蛋白质、染色体DNA 以及质粒DNA 变性。质粒复性:加入pH4.8 的 KAc-HA
4、c缓冲液,将提取液调至中性,由于质粒分子量小而容易复性,并稳定存在于溶液中;染色体DNA 分子量太大,在复性过程中形成DNA 之间的交联导致其形成更大分子的不溶性物质。离心分离: 经高速离心可以使细胞碎片和已变性的菌体蛋白及染色体DNA 一起沉淀,上清液中主要是质粒DNA ,经乙醇沉淀后,可获得质粒DNA 。5质粒的检测提取所有胞内DNA 后电镜观察;超速离心或琼脂糖凝胶电泳后观察;对于实验室常用菌,可用质粒所带的某些特点,如抗药性初步判断。对于由于三种构型同时存在时造成的多带现象(提取质粒时造成或自然存在),可以进行特异性单酶切,使其成为一条带。6质粒的特性位于核基因组外;cccDNA (链
5、霉菌和酵母菌中发现了线状dsDNA 质粒和 RNA 质粒) ;自主复制;有的质粒可整合到核染色体上;可重组(质粒与质粒间,质粒与染色体间);人为消除(丫叮类,UV ,电离辐射,高于最适温度,利福平等)有的质粒可在细胞间转移(F 因子, R 因子) ;质粒所含的基因对宿主细胞一般是非必需的;有时能赋予宿主细胞以特殊的机能,从而使宿主得到生长优势7质粒的分类和主要类型7.1 分类6.1.1 根据质粒所编码的功能和赋予宿主的表型效来分:致育因子( Fertility factor ,F 因子)抗性质粒( Resistance factor,R 因子)产细菌素的质粒(Bacteriocin produ
6、ction plasmid )毒性质粒( virulence plasmid )代谢质粒( Metabolic plasmid )精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 2 页,共 26 页隐秘质粒( cryptic plasmid )2 m 质粒7.1.2 根据拷贝数或复制特点,质粒可分为:高拷贝数(high copy number) 质粒(每个细胞中可以有10100 个拷贝) 如 ColE1、 ColE2等 松弛型质粒 (relaxed plasmid) 低拷贝数 (low copy number )质粒(每个细胞中只有12 个拷贝)
7、如 F 因子, R100严谨型质粒 (stringent plasmid) 7.1.2 根据质粒复制的宿主范围,质粒可分为:窄宿主范围质粒(narrow host range plasmid) (只能在一种特定的宿主细胞中复制)广宿主范围质粒(broad host range plasmid)(可以在许多种细菌中复制)7.2主要类型主要讲解以下几种类型:即(1)致育因子 (Fertility factor ,F 因子 ) (参见P197)又称 F 质粒,其大小约100kb,这是最早发现的一种与大肠杆菌的有性生殖现象(接合作用)有关的质粒。携带 F 质粒的菌株称为F+菌株(相当于雄性) ,无 F
8、 质粒的菌株称为F-菌株(相当于雌性) 。F因子能以游离状态(F+)和以与染色体相结合的状态(Hfr) 存在于细胞中,所以又称之为附加体 (episome)。(2)抗性因子( Resistance factor,R 因子) (参见P197)包括抗药性和抗重金属二大类,简称R 质粒。抗性质粒在细菌间的传递是细菌产生抗药性的重要原因之一。R100 质粒 (89kb)可使宿主对下列药物及重金属具有抗性:汞(mercuric ion ,mer) 、四环素( tetracycline,tet ) 、链霉素 (Streptomycin, Str) 、磺胺 (Sulfonamide, Su) 、氯霉素(Ch
9、lorampenicol, Cm) 、夫西地酸( fusidic acid ,fus)负责这些抗性的基因是成簇地存在于抗性质粒上。(3)Col 质粒:产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid )细菌素:许多细菌都能产生某些代谢产物,抑制或杀死其他近缘细菌或同种不同菌株,因为这些代谢产物是由质粒编码的蛋白质,不象抗生素那样具有很广的杀菌谱,所以称为细菌素( bacteriiocin ) 。细菌素种类很多,都按其产生菌来命名,如大肠杆菌素、枯草杆菌素、乳酸菌素、根瘤菌素等。细菌素结构基因、涉及细菌素运输及发挥作用(processing)的蛋白质的基因、赋予宿主对
10、该细菌素具有“ 免疫力 ” 的相关产物的基因,一般都位于质粒或转座子上,因此, 细菌素可以杀死同种但不携带该质粒的菌株。精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 3 页,共 26 页细菌素抗生素抑制或杀死,甚至同种不同株的细菌较广的抗菌谱通过核糖体直接合成的多肽类物质一般是次级代谢产物编码细菌素的结构基因及相关的基因一般位于质粒或转座子上一般无直接的结构基因,相关酶的基因多在染色体上细菌素一般根据产生菌的种类进行命名:大肠杆菌( E. coli )产生的细菌素为colicins(大肠杆菌素) ,而质粒被称为Col 质粒。大肠杆菌素是产自大肠杆
11、菌的一种蛋白质,具有专一性地杀死其亲缘关系很近的、不具Col 质粒的其它肠道细菌的功能。由 G+细菌产生的细菌素或与细菌素类似的因子与colicins 有所不同,但通常也是由质粒基因编码,有些甚至有商业价值,例如一种乳酸细菌产生的细菌素NisinA 能强烈抑制某些 G+细菌的生长,而被用于食品工业的保藏。(4)毒性质粒( virulence plasmid )许多致病菌的致病性是由其所携带的质粒引起的,这些质粒具有编码毒素的基因,其产物对宿主(动物、植物)造成伤害。产毒素大肠杆菌是引起人类和动物腹泻的主要病原菌之一,其中许多菌株含有为一种或多种肠毒素编码的质粒。苏云金杆菌含有编码 内毒素 (伴
12、孢晶体中 )的质粒根癌土壤杆菌所含Ti 质粒是引起双子叶植物冠瘿瘤的致病因子(5)代谢质粒( Metabolic plasmid )质粒上携带有利于微生物生存的基因,如能降解某些基质的酶,进行共生固氮, 或产生抗生素(某些放线菌)等。降解质粒: 将复杂的有机化合物降解成能被其作为碳源和能源利用的简单形式,环境保护方面具有重要的意义。假单胞菌:具有降解一些有毒化合物TOL 质粒:含分解甲苯的基因;CAM-OCT质粒:含分解樟脑辛烷的基因(6)隐秘质粒( cryptic plasmid )隐秘质粒不显示任何表型效应,它们的存在只有通过物理方法,例如用凝胶电泳检测细胞抽提液等方法才能发现。在应用上,
13、很多隐秘质粒被加以改造作为基因工程的载体(一般加上抗性基因)(7)2m 质粒大多数酵母菌含有一种称为2m 的质粒 ,重点介绍2m 质粒的特征和意义。特征:它们是闭环的双链DNA 分子,周长约2m (6318bp) ,以高拷贝数存在于酵母精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 4 页,共 26 页细胞中,每个单倍体基因组含60100 个拷贝,约占酵母细胞总DNA 的 30;各约 600bp长的一对反向重复顺序。由于反向重复顺序之间的相互重组,使2m 质粒在细胞内以两种异构体( A 和 B)形式存在。该质粒只携带与复制和重组有关的4 种蛋白质的
14、基因,不赋予宿主任何遗传表型,属隐蔽性质粒。意义: 2m 质粒是酵母菌中进行分子克隆和基因工程的重要载体,因此以它为基础构建的克隆和表达载体已得到广泛的应用。另一方面, 该质粒也是研究真核基因调控和染色体复制的一个十分有用的模型难点:1.遗传性变异与饰变的区别:饰变( modification ) :表型的差异只与环境有关。不涉及遗传物质结构改变而只发生在转录、转译水平上的表型改变。特点:暂时性、不可遗传性、表现为全部个体的行为。变异: (遗传型变异, 基因突变)遗传物质改变,导致表型改变。特点:遗传性、群体中极少数个体的行为(自发突变频率通常为10-6-10-9) 。主要通过基因型、表现型、
15、环境等的相互联系进行介绍。2.质粒的特性质粒是存在于染色体之外的能进行自主复制的细胞质遗传因子。通过讲解质粒的结构、复制方式等来介绍其特征。四、教学方法与手段:这一节的内容十分抽象。对于三个经典的实验,可以通过遗传物质的探索过程以及实验方式的进步和对实验结果的分析揭示出来。变异与饰变可以通过环境与适应性来阐述。其余的内容可以课件展示和讲解来帮助理解。五、板书设计:1遗传与变异遗传( inheritance) :亲代与子代相似。变异( variation) :亲代与子代、子代间不同个体不完全相同。2遗传型和表型遗传型( genotype) :生物的全部遗传因子及基因(生物发育的可能性)。表型 (
16、 phenotype ):具有一定遗传型的个体,在特定环境条件下通过生长发育所表现出来的形态等生物学特征的总和。(具体化)3变异与饰变饰变( modification ) :表型的差异只与环境有关。不涉及遗传物质结构改变而只发生在转录、转译水平上的表型改变。特点:暂时性、不可遗传性、表现为全部个体的行为。精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 5 页,共 26 页变异: (遗传型变异, 基因突变)遗传物质改变,导致表型改变。特点:遗传性、群体中极少数个体的行为(自发突变频率通常为10-6-10-9) 。第一节遗传变异的物质基础一、 3 个经
17、典实验 (参见P193)1经典转化实验:证明DNA 是遗传变异的物质基础。2噬菌体感染实验:证明DNA 是遗传变异的物质基础。核酸是遗传的物质基础。3植物病毒的重建实验:RNA 是遗传变异的物质基础。二、遗传物质在细胞内存在的部位和方式(周德庆p192-197;自学)第二节质粒( P196)1.质粒的定义质粒( plasmid) :一种独立于染色体外,能进行自主复制的细胞质遗传因子,主要存在于各种微生物细胞中。附加体: 指那些既可以整合到核染色体上,作为染色体的一部分而进行复制,又可以再游离出来或携带一些寄主的染色体基因游离出来,这类质粒被称为附加体。2质粒的分子结构:主要是共价闭合环状的双链
18、DNA ,也发现有线型,RNA 质粒分子的大小范围从1kb 左右到 1000kb; (细菌质粒多在10kb 以内)3质粒的分离::碱提取法4质粒的检测5质粒的特性位于核基因组外;cccDNA (链霉菌和酵母菌中发现了线状dsDNA 质粒和 RNA 质粒) ;自主复制;有的质粒可整合到核染色体上;可重组(质粒与质粒间,质粒与染色体间);人为消除(丫叮类,UV ,电离辐射,高于最适温度,利福平等)有的质粒可在细胞间转移(F 因子, R 因子) ;质粒所含的基因对宿主细胞一般是非必需的;有时能赋予宿主细胞以特殊的机能,从而使宿主得到生长优势6质粒的分类和主要类型6.1 分类6.1.1 根据质粒所编码
19、的功能和赋予宿主的表型效来分:致育因子( Fertility factor ,F 因子)抗性质粒( Resistance factor,R 因子)产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid )精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 6 页,共 26 页毒性质粒( virulence plasmid )代谢质粒( Metabolic plasmid )隐秘质粒( cryptic plasmid )2 m 质粒6.1.2 根据拷贝数或复制特点,质粒可分为:高拷贝数(high copy number) 质粒(每个
20、细胞中可以有10100 个拷贝) 如 ColE1、 ColE2等 松弛型质粒 (relaxed plasmid) 低拷贝数 (low copy number )质粒(每个细胞中只有12 个拷贝) 如 F 因子, R100严谨型质粒 (stringent plasmid) 6.1.2 根据质粒复制的宿主范围,质粒可分为:窄宿主范围质粒(narrow host range plasmid) (只能在一种特定的宿主细胞中复制)广宿主范围质粒(broad host range plasmid)(可以在许多种细菌中复制)6.2主要类型主要讲解以下几种类型:即(1)致育因子 (Fertility fact
21、or ,F 因子 ) (参见P197)(2)抗性因子( Resistance factor,R 因子) (参见P197)包括抗药性和抗重金属二大类,简称R 质粒。(3)Col 质粒:产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid )细菌素:许多细菌都能产生某些代谢产物,抑制或杀死其他近缘细菌或同种不同菌株,因为这些代谢产物是由质粒编码的蛋白质,不象抗生素那样具有很广的杀菌谱,所以称为细菌素( bacteriiocin ) 。细菌素种类很多,都按其产生菌来命名,如大肠杆菌素、枯草杆菌素、乳酸菌素、根瘤菌素等。(4)毒性质粒( virulence plasmid )苏
22、云金杆菌含有编码 内毒素 (伴孢晶体中 )的质粒根癌土壤杆菌所含Ti 质粒是引起双子叶植物冠瘿瘤的致病因子(5)代谢质粒( Metabolic plasmid )假单胞菌:具有降解一些有毒化合物TOL 质粒:含分解甲苯的基因;CAM-OCT质粒:含分解樟脑辛烷的基因(6)隐秘质粒( cryptic plasmid )(7)2m 质粒意义:六、思考题:1.定义:基因型、表现型、质粒(cccDNA ) 、细菌素精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 7 页,共 26 页2.变异与饰变的区别3.质粒的特性及主要类型4. 2 m质粒的特征及意义。精
23、选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 8 页,共 26 页第二十授课单元一、教学目的:1.掌握基因突变的类型及几种特殊突变体的检出方法2.掌握艾姆斯试验的原理、方法、优点及实际应用。3.掌握紫外线诱变的原理和方法及实际应用。4.理解基因突变的分子机制5.理解基因突变的自发性和不对应性及其实验证明6.了解基因突变的特点7.了解一些常见的诱变剂的特点及诱变的分子机制。二、教学内容:第三节:基因突变的规律及类型1.基因突变的规律2.基因突变的自发性和不对性的实验证明3.突变类型第四节:基因突变的机制1.突变的分子基础2.诱变及致癌作用的检测 艾姆
24、斯试验3. DNA 损伤的修复三、教学重点、难点及处理重点及处理:1.基因突变 (gene mutation) (简称突变)广义上, 突变指细胞内遗传物质的分子结构或数量发生变化的现象。包括基因突变 (又称点突变)和染色体畸变。狭义的突变专指基因突变(点突变). 基因突变是重要的生物学现象,它是一切生物变化的根源,连同基因转移、 重组一起提供了推动生物进化的遗传多变性。2.基因突变的特点(规律)自发性:菌种衰退的根本原因不对应性:突变的性状与突变的原因无关系稀有性:自发突变几率低(10-610-10)突变率:每一个细胞在每一世代中发生某一性状突变的几率。(某一单位群体在每一世代中产生突变株的数
25、目)独立性:某基因的突变率不受它种基因突变率的影响精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 - - - - - - -第 9 页,共 26 页可诱变性:自发突变的频率可因诱变剂的影响而提高(10-310-6)稳定性:基因突变后的新性状是稳定的可逆性:野生型菌株某一性状可发生正向突变,也可发生反向的回复突变突变表型可以回复到野生型的2 种可能:真正的回复突变(突变体的核苷酸序列恢复到野生型的排列);抑制突变 (另一基因的突变或同一基因内发生第二次突变,可克服第一次突变的作用);3.基因突变的自发性和不对应性的实验证据三个经典实验:变量实验、涂布实验、影印实验证明突变的性状与
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