Internet生物医学信息资源及其检索.ppt

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1、Internet生物医学信息资源及其检索 Four short words sum up what has lifted most successful Four short words sum up what has lifted most successful individuals above the crowd: a little bit more. individuals above the crowd: a little bit more. -author -author -date-date主要内容主要内容 概述概述 类型类型 特点特点 指南及引擎指南及引擎2.Internet2

2、.Internet生物医学数据库及其检索生物医学数据库及其检索1.Internet1.Internet生物医学信息资源生物医学信息资源 INTERNET概述概述Internet上的信息资源极其丰富，内容及表现上的信息资源极其丰富，内容及表现形式多样化；形式多样化；Internet上的生物医学信息资源占上的生物医学信息资源占30左右；左右；Internet上的信息资源的分布方式：上的信息资源的分布方式： E-mail、 WWW 、 FTP及及Gopher INTERNET类型类型根据以下四种分类标准进行划分：根据以下四种分类标准进行划分：1 1按内容的组织和表现形式分：按内容的组织和表现形式分：

3、2 2按提供网络服务的方式分：按提供网络服务的方式分：3 3按信息资源的来源分：按信息资源的来源分：4 4按生物医学主题（学科或疾病）划分：按生物医学主题（学科或疾病）划分： INTERNEThttp:/ INTERNETInternet信息资源检索的方法 人 们 已 经 考 虑 到 了 网 络 资 源 的 特 点 ， 在人 们 已 经 考 虑 到 了 网 络 资 源 的 特 点 ， 在InternetInternet上建立了各类资源导航或指南或专门帮助上建立了各类资源导航或指南或专门帮助用户查找网上资源的搜索工具用户查找网上资源的搜索工具搜索引擎搜索引擎(Search (Search eng

4、ines)engines)。 搜索引擎：是一种能够通过搜索引擎：是一种能够通过InternetInternet接受用户接受用户的查询指令，并向用户提供符合其查询要求的信息的查询指令，并向用户提供符合其查询要求的信息资源网址的系统。资源网址的系统。 INTERNET一般主题指南及引擎 大部分搜索引擎既允许用户按它们对WWW资源的分类一层一层地浏览网上信息，还允许用户输入任意检索词检索网站及文献，所以这些搜索引擎兼备导航和检索的双重功能。1.Alta Vista (http:/)2.Yahoo (http:/)3.Google (http:/)4.SCIRUS (http:/ 6.搜狐(SOHU)

5、(http:/)7.天网 (http:/ (http:/) INTERNET医学主题指南及引擎Internet上除提供大量的一般主题指南和搜索引擎外，还有许多站点专门提供医学主题指南和搜索引擎。当然，一般主题指南和引擎也可用于检索或浏览Internet上的医学信息资源的站点。1.MedScape(http:/ Natural healthweb (http:/ MedExplorer(http:/)5.Medwebplus(http:/) INTERNETGoogle简介由两个斯坦福大学博士生Larry Page与Sergey Brin于1998年9月发明。约搜索30亿张网页，包括35个国家和

6、地区的资源。已占有全球搜索市场的80%。Google 在中国的搜索市场的市场份额也已突破30%，并且增长速度迅猛，在中文搜索市场有举足轻重的作用。-(mcculloch pitts 1943)文献类型Google特点布尔逻辑：+；-；OR高级搜索：site，link，intitle，allintitle ， inurl，allinurl 。查找PDF文件，filetype:pdf每日要点、本地搜索、查询优化、参考工具、按数字搜索、选择关键字使用帮助中借助“Google大全”Google Scholar学术搜索 Google 学术搜索提供可广泛搜索学术文献的简便方法。Google 学术搜索可帮助

7、您在整个学术领域中确定相关性最强的研究。 优点：学科范围广、检索方便灵活、链接功能强 缺点：检索功能比不上数据库。http:/.hk/Google Scholar文献类型 期刊论文学位论文专业图书预印本文摘技术报告Google Scholar检索方法 简单检索 高级检索简单检索高级检索高级操作符 “+” 操作符：操作符：确保您的搜索结果中包括 Google 学术搜索技术通常忽略的普通字词、字母或数字，如+de knuth； “-” 操作符：操作符：排除所有包括搜索字词的结果，如 Flowers -作者:Flowers ； 短语搜索：短语搜索：包括这一确切短语的结果，如 “非小细胞肺癌； “OR

8、” 操作符操作符：包括搜索字词之一的结果，如 哮喘 OR 咳嗽； “标题标题”操作符：操作符：如在标题：mars 得到的结果只包括文件名中的搜索字词。 Google Scholar其它检索功能判断文献的学术参考价值判断学科的研究现状及趋势追踪学者的科研活动，对其学术地位进行评价INTERNET生物医学数据库Internet生物医学数据库q一次文献数据库：电子期刊全文数据库q二次文献数据库：PubMedq循证医学数据库：Cochrane libraryq生物信息学数据库： INTERNETPubMed数据库概况数据来源数据库检索原理检索方法及技巧 INTERNETPubMed概况1.创建机构：美

9、国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)2.类型：Web数据库3.网址：http:/pubmed.gov4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。5.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。 INTERNETPubMed数据来源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as suppli

10、ed by Publisher。 INTERNETPubMed检索机制1 1自动转换匹配功能自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)(Automatic Term Mapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊名表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author Index)。如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，

11、检索时各个词之间是AND逻辑关系。2 2短语检索短语检索(Phrase Searching)(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 INTERNET1.逻辑运算符： 逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。3.双引号：“ ”，表示对引

12、号中的短语进行检索。4.检索字段标识符：tag，tag为字段名称。 ti，au，ta，so，la，pt。PubMed检索运算符 INTERNET常用字段组成标识符 字段名称TI TitleAU AuthorAD AffiliationAB AbstractDP Publication DateEDAT Entrez DateSO SourceTA Journal Title AbbreviationMH MeSH TermsPT Publication Type INTERNET检索界面基本检索界面高级检索界面 INTERNET高级检索附加功能PubMed检索方法1.基本检索：在基本检索界面下

13、完成的检索方法2.高级检索：主要完成特定文献、限定检索、特定字段、其他资源的检索方法 INTERNET基本检索1.关键词、词(词组)或短语：2.作者：Smith JS 或 Smithau3.期刊刊名：GENE THERAPYTA，JAMATA4.截词：CHEMO*5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY INTERNET基本检索 INTERNET INTERNET1.修改检索式：（1）直接在检索词输入框中换检索词（2）在检索结果右侧区， 区来进行修改后，再检索高级检索1.检索历史显示2.特定文献检索3.限定检索4.特定字段索引检索5.其它资源 INTERNET检索历史显示特定文献检

14、索限定检索1.全文、摘要的限定2.特征词（人类、动物、性别、年龄）3.文献类型4.语种5.数据库子集 INTERNET限定检索限定检索日期没有限定选项，可通过字段标识符实现 Date of publicationDP原始文献出版日期Entrez DateEDAT文献首次录入PubMed日期MeSH DateMHDA文献被MeSH词条标引日期 INTERNET特定字段索引检索其他检索功能1.预检索及浏览索引检索：Preview/Index 2.主题词浏览检索：MeSH Database3.引文匹配器(Citation Matcher)4.临床查询(Clinical Queries) INTERN

15、ET预检索 INTERNET主题检索在线查找主题词主题词输入检索主题检索中-组配后检索检索结果主题检索小结1.可以同时选择多个主题进行逻辑组配检索2.每个主题词逐个检索，并可选择好福主题词进行组配，添加到检索框中3.有两个主题词组配检索时，注意选择Send to 4.点击 按钮才能进行主题检索 INTERNET检索结果 显示 保存 打印 INTERNET显示格式选择保存检索结果检索策略的存储和调用 使用My NCBI(Cubby) 首先要登记注册 保存检索策略 定期浏览新的检索结果 INTERNET其它功能 全文链接 相关文献链接 相关数据库的链接 RSS阅读器的使用 INTERNET检索练习

16、1.题目中有青霉素G的原文为英文的综述文献2.眼结核引起失明的文献（比较基本检索和主题词检索的结果）3. 微量元素缺乏与皮肤病发病关系研究4.查找韩济生老师发表在神经科学上发表的文章 INTERNETInternetInternet网免费的开放电子期刊开放获取的概念OPEN ACCESS（OA）的定义： 任何人都可以即时、免费、不受任何限制地通过互联网获取各类文献，包括经过同行评议的期刊文章、参考文献、技术报告、学位论文等等的全文信息，用于科研、教育及其他目的。学术论文的出版模式1.http:/ http:/highwire.stanford.edu/3.美国国家科学数字图书馆美国国家科学数字

17、图书馆(The National Science digital library，NSDL，http:/nsdl.org/) 4.法国国家图书馆的数字图书馆法国国家图书馆的数字图书馆Gallica 2000 (http:/gallica2.bnf.fr/?&lang=EN ) 5. 乌利希国际期刊指南乌利希国际期刊指南 http:/ http:/www.medical- 10. http:/ 11.科学公共图书馆科学公共图书馆(Public Library of Science，PLoS)12.瑞典瑞典Directory of Open Access(DOAJ)13.日本电子科学与技术信息集成

18、日本电子科学与技术信息集成JSTAGE（http:/www.jstage.jst.go.jp/browse/-char/en ）常用免费获取期刊全文的网址常用免费获取期刊全文的网址freemedicaljournals http:/ 收录了1825种期刊，按照学科分73个类目，字顺和语言进行查找文献。 斯坦福大学 http:/highwire.stanford.edu/ 检索方法：1.快速检索：作者、关键词及年、卷期页码2.学科分类浏览3.刊名字顺浏览美国国家数字图书馆美国国家数字图书馆法国国家图书馆数字图书馆项目法国国家图书馆数字图书馆项目乌利希期刊指南乌利希期刊指南科学公共图书馆医学类日本

19、开放获取期刊查阅全文的方法首先利用google来查询，方法：直接输入论文题目 1. Yurong Hu, Kun Li, Lei Wang, et al. Pegylated immuno-lipopolyplexes: A novel non-viral gene delivery system for liver cancer therapy .Journal of Controlled Release, Volume 144, Issue 1, 21 May 2010, Pages 75-81 2.An assessment of selective serotonin reuptake inhibitor discontinuation symptoms with citalopram.Int Clin Psychopharmacol. 2000 Nov;15(6):329-33.再利用图书馆馆藏查询，方法：输入期刊刊名全称谢谢 谢谢！