酶学与酶工程重点总结.docx
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1、精品名师归纳总结其次章酶学基础否为活力所必需。优点:学习必备欢迎下载(2) 亲核攻击集团: -OH,-SH,-N (咪唑基)(3) 底物亲电中心:可编辑资料 - - - 欢迎下载精品名师归纳总结一、酶的活性中心active center, active site(一)活性中心和必需基团1、与酶活性显示有关的,具有结合和催化底物形成产物的空间区域, 叫酶的活性中心 ,又叫活性部位。2、活性中心可分为 结合部位 和催化部位 。3、结合部位 打算酶的 专一性 ,催化部位 打算酶所催化 反应的性质 。4、酶结构概述(1) 活性中心是一个三维实体。(2) 是有一些一级结构上可能相距较远的氨基酸侧链基团组
2、成,有的仍包含辅酶或辅基的某一部分基团。(3) 在酶分子表面呈裂缝状。(4) 酶活性中心的催化位点和结合位点可以不止一个。(5) 酶活性中心的基团都是必需基团,但必需基团仍包括活性中心以外的基团。5、酶分子中的氨基酸残基或其侧链基团可以分为四类1. 接触残基 2帮助残基 3结构残基 4非奉献残基(二)酶活性中心中的化学基团的鉴别1. 非特异性共价修饰:某些化学试剂能使蛋白质中氨基酸残基的侧链基团反应引起共价结合、氧化或仍原修饰反应,使基团结构和性质发生变化。假如某基团修饰后不引起酶活力的变化 ,就可初步认为此基团可能是非必需基团。反之,如修饰后 引起酶活力的降低或丢失 ,就此基团可能是酶的必需
3、基团。2. 亲和标记共价修饰剂 是底物的类似物,可专一性的引入酶的活性中心,并具有活泼的化学基团 如卤素 ,可与活性中心的基团形成稳固的共价键。因其作用机制是利用酶对底物类似物的亲和性而将酶共价标记的,故称为亲和标记。3. 差别标记在过量底物或可逆抑制剂遮挡活性中心的情形下,加入共价修饰剂, 使后者只修饰活性中心以外的有关基团。然后去除底物或可逆抑制剂,暴露活性中心, 再用同位素标记的向一修饰剂作用于活性中心的同类基团。将酶水解后分别带有同位素的氯基酸,即可确定该氨基酸参加活性中心。4. 蛋白质工程这是讨论酶必需基闭和活性中心的最先进方法,即将酶蛋白相应的 互补 DNAcDNA 定点突变,此突
4、变的 cDNA 表达出只有一个或几个氨基酸被置换的酶蛋白,再测定其活性,可以知道被置换的氨基酸是转变酶蛋白中任一氨基酸而不影响其他同类残基转变疏水残基,使其转变成亲水或另一疏水残基同时转变活性中心内外的几个氨基酸个或多个氨基酸的缺乏或插入转变酶蛋白的磷酸化位点或糖化位点不致引起立体障碍三 组成活性中心的重要化学基团丝氨酸、组氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸和赖氨酸二、酶的结构和功能的关系(一)酶的一级结构与催化功能的关系酶的一级结构是酶的基本化学结构,是催化功能的基础。(二)酶的二级和三级结构与催化功能的关系酶的二级、三级结构是全部酶都必需具备的空间构型。维护酶的活性 部位所必
5、需的酶蛋白的二级和三级结构完全转变,就会使酶遭受破坏而丢失其催化功能,这是蛋白质变性的依据。1. 酶的变性和失活2. 活性中心的挠性3. 酶分子的结构域(三)酶的四级结构与催化功能的关系具有四级结构的酶,按其功能可分为两类,一类与催化作用有关,另一类与代谢调剂关系亲密。三、酶催化作用的基本理论(一)酶底物复合物1. 酶底物复合物存在的证据1903 年, Henri 用蔗糖水解酶水解蔗糖提出的。E+S= ES= P+ E(S:substrate, P: product)在反应过程中,酶第一与底物形成酶 -底物中间复合物( ES, enzyme-substrate intermediate)s ,
6、再分解成酶( E)和产物( P),使反应沿一个低活化能的途径进行,降低反应所需活化能。2. 酶与底物形成复合物的作用力1) )离子键2) )氢键3) )范德华力(二)酶作用的专一性机制1. 锁钥学说( lock and key theory)2. 诱导契合学说( induced-fit hypothesis)(三)酶作用的高效性机制1. S 与 E 的靠近效应和定向效应 proximity and orientation靠近效应:指两个反应的分子,它们反应的基团需要相互靠近, 才能反应。2. 酸碱催化 acid or base catalysis酸碱催化是通过瞬时的向反应物供应质子或从反应物接
7、受质子以稳定过渡态、加速反应的一类催化机制。 由于 E 活性中心含有酸碱基团 , 它们可以与 S中的酸碱基团进行质子交换, 加强了 E 与 S 的相互作用, 减弱了 S 分子内部的化学键,使 S 由稳态不稳态狭义酸碱催化( specific acid-base catalysi)s: H和 OH广义酸碱催化( general acid-base catalysis: 质子供体和质子受体3. 共价催化 covalent catalysis(1)共价催化又称亲核催化( nucleophilic catalysis)或亲电子催化( electrophilic catalysis)磷酰基( P=O)酰
8、基( C=O) 糖基( Glu-C-OH)4. 金属离子催化 5多元催化 6微环境的影响注:活性中心可以防止水分子的干扰(在躲开水分子的干扰后,分子间的离子键才简洁产生)7. 底物的变形( distortion)与张力作用( tensility四、影响酶促反应速度的因素1. 底物浓度对酶反应速度的影响随着底物的增加,反应速率西先是符合一级反应,再到混合级反应, 最终当底物增加到肯定浓度是达到最大反应速度,此时为零级反应。2. 酶浓度的影响( 1)底物充分时,反应速度随酶浓度的增加而增加,反应速度与酶浓度成正比( 2)底物浓度不足时,起初反应速度与酶浓度成正比。( 3)底物中有不行逆抑制物存在时
9、,反应速领先成正比,当酶浓度达到肯定是反应速率不会成正比( 4)酶液中有可逆抑制剂存在时,反应速率最酶增加而增加,但是可编辑资料 - - - 欢迎下载精品名师归纳总结学习必备欢迎下载不符合正比,并且最初的反应速率变化最小。3.温度的影响:随温度增加反应速领先增加后减小4. pH 的影响2) 同工酶和个体发育及组织分化亲密相关3) 同工酶与代谢调剂4) 同工酶与癌基因的表达随 pH 增加反应速领先增加后减小pH 影响的机理:1)pH 影响 E 活性中心及邻近有关基团的解离,使之易或不易与S5) 同工酶分析法在农业上已开头用于优势杂交组合的猜测6) 临床上可作为疾病的诊断指标。三、别构酶和修饰酶1
10、.别构酶 allesteric enzyme可编辑资料 - - - 欢迎下载精品名师归纳总结结合。2) pH 影响 S 的极性基团,从而影响这些基团与E 的结合。3) 过酸、过碱可使酶变性失活。2)酶的抑制剂抑制作用与抑制剂( inhibition and inhibitor ):酶分子中的必需基团的性质受到某种化学物质的影响而转变, 导致酶活性的降低, 甚至丢失, 但并未引起酶变性的作用称 抑制作用 。可逆抑制 Reversible Inhibition通常以非共价键与酶和(或)酶 -底物复合物可逆性结合,使酶活性降低或消逝。 采纳透析或超滤等物理方法可将抑制剂除去,使酶复原活性。类型:竞争
11、性抑制( competitive inhibition )非竞争抑制( noncompetitive inhibition )其次节酶在生物体内的几种存在方式一、单体酶、寡聚酶、多酶复合体1. 酶蛋白是一条具有三级结构的多肽链, 相对分子量为 13000-35000, 不能再解离成更小的组成单位2. 寡聚酶具有四级结构,是由两个或两个以上的亚基组成的酶,这些亚基可以是相同的,也可以是不同的3. 多酶复合体多酶复合体是指几个酶联合而成的络合物, 其中酶以非共价键彼此嵌合在一起。一般由 26 个功能相关的酶组成,这样更有利于生化反应的连续进行,以提高酶的催化效率,同时也便于机体对酶的调控。 1 )
12、多酶复合体组成成分的结合强度可能差别很大2) )在催化活性上没有直接相关的酶也可以组成多酶复合体3) )在细胞内各种多酶复合物仍可能通过和细胞膜或细胞器结合在一起。从而通过相互邻近组成高效的物质和能量代谢系统。二、同工酶同工酶具有多种生物学功能:1) )同工酶作为遗传标志已广泛被遗传学家用于遗传分析的讨论。概念:具有别构调剂作用的酶称作别构酶。很多寡聚酶具有调剂亚基,催化亚基只结合底物,调剂亚基结合调剂剂,因此称别构酶,是调剂代谢的重要酶。2.修饰酶1修饰酶的类型 2修饰酶的特点1 绝大多数修饰酶具有无活性有活性 或低活性高活性 两种形式2耗能少3效率高四、结构酶和诱导酶 五、胞内酶和胞外酶
13、第三节 酶活力测定一、酶活力单位酶活力( enzyme activity, 也称酶活性):酶催化反应的才能,酶活力用在肯定条件下,它所催化的某一化学反应的反应速度来表示。酶的活力单位( IU, active unit )1 IU:指在最适反应条件下, 1 分钟内催化 1mol 底物转化为产物所需的酶量。酶的比活力( specific activity)指每 mg 蛋白质所具有的酶活力,一般用U/mg 蛋白质来表示。二、酶活力的测定方法酶活力测定时条件的挑选:1. 挑选合适的化学反应及检测指标 2底物浓度的挑选3其他条件的挑选( pH,温度,缓冲液,帮助因子或辅酶,激活剂,抑制剂)三、酶的纯度鉴
14、定酶产品质量评判 中常使用比活力。判定分别纯化方法的优劣,通常用两个指标来衡量: 总活力的回收:表示提纯过程中酶的缺失情形比活力的提高的倍数:表示提纯方法的有效性得率和纯化倍数的运算:总活力 =活力单位数 /mL 酶液 X 总体积( mL ) 比活力 =总活力/ 总蛋白( mg)可编辑资料 - - - 欢迎下载精品名师归纳总结得率=每步骤的总活力 / 第一步的总活力以百分比表示,第一步的得率为 100%纯化倍数 =每步骤的比活力 /第一步的比活力起始的纯化倍数为 1第四节酶促反应动力学酶促反应动力学 Kinetics of enzyme-catalyzed reaction :是讨论酶促反应的
15、速率以及影响此速率的各种因素的科学,是酶学的一个分支。2. 米氏常数的意义1)V = 1/2 Vmax, Km = S 。米氏常数的单位为mol/L 。Km 值的物理意义就是 Km 值是酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度。2) Km 是酶的一个特点常数。3) 假如一个酶有几种底物,就对每一种底物都有一个Km,Km 值最小的为这个酶的最适底物。4) Km 受温度、pH、的影响,Km 值是常数是指对于肯定底物在肯定温度、 pH 条件下是一常数。5依据米氏公式可以人为的把握反应速度V6) 依据抑制剂对 Vmax 、Km 的影响,可推断抑制剂的类型7) )催化可逆反应的酶,对正逆反应的底物的K
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