2022年朱玉贤分子生物学讲义.docx
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1、精选学习资料 - - - - - - - - - 分子生物学课程教学讲义朱玉贤学习必备欢迎下载第一讲序论二、现代分子生物学中的主要里程碑分子生物学是讨论核酸、蛋白质等全部生物大分子的形状、结构特点及其重要性、规律性和相互关系的科学,是人类从分子水平上真正掀开生物世界的隐秘,由被动地适应自然界转向主动地改造和重组自然界的基础学科;当人们意识到同一生物不同世代之间的连续性是由生物体自身所携带的遗传物质所打算的,科学家为揭示这些遗传密码所进行的努力就成为人类战胜自然的一部分,具活力的科学;而以生物大分子为讨论对像的分子生物学就快速成为现代社会中最从 1847 年 Schleiden 和 Schwan
2、n 提出 细胞学说 ,证明动、植物都是由细胞组成的到今日,虽然不过短短一百多年时间,我们对生物大分子-细胞的化学组成却有了深刻的熟悉;孟德尔的遗传学规律最先使人们对性状遗传产生了理性熟悉, 而 Morgan 的基因学说就进一步将 性状 与基因 相耦联,成为分子遗传学的奠基石;Watson 和 Crick所提出的脱氧核糖酸双螺旋模型,为充分揭示遗传信息的传递规律铺平了道路;在蛋白质化学方面,继 Sumner 在1936 年证明酶是蛋白质之后,Sanger 利用纸电泳及层析技术于 1953 年首次阐明胰岛素的一级结构,开创了蛋白质序列分析的先河; 而 Kendrew 和 Perutz 利用 X 射
3、线衍射技术解析了肌红蛋白(myoglobin )及血红蛋白 ( hemoglobin )的三维结构,论证了这些蛋白质在输送分子氧过程中的特殊作用,成为讨论生物大分子空间立体构型的先驱;1910 年,德国科学家 Kossel 第一个分别了腺嘌呤,胸腺嘧啶和组氨酸;1959 年,美国科学家 Uchoa 第一次合成了核糖核酸,实现了将基因内的遗传信息通过 RNA 翻译成蛋白质的过程;同年, Kornberg 实现了试管内细菌细胞中 DNA 的复制;1962 年, Watson(美)和 Crick(英)由于在 1953 年提出 DNA 的反向平行双螺旋模型而与 Wilkins 共获 Noble生理医学
4、奖,后者通过 X 射线衍射证明白 Watson-Crick 模型;1965 年,法国科学家 Jacob 和 Monod 提出并证明白操纵子( operon)作为调剂细菌细胞代谢的分子机制;此外,他们仍首次估量存在一种与 DNA 序列相互补、能将它所编码的遗传信息带到蛋白质合成场所(细胞质)并翻译产生蛋白质的 mRNA (信使核糖核酸) ;1972 年, Paul Berg(美)第一次进行了 DNA 重组;1977 年, Sanger 和 Gilbert (英)第一次进行了 DNA 序列分析;1988 年, McClintock 由于在 50 岁月提出并发觉了可移动遗传因子(Nobel 奖;ju
5、mping gene 或称 mobile element )而获得1993 年,美国科学家 Roberts 和 Sharp 因发觉断裂基因(introns)而获得 Nobel 奖; Mullis 由于创造 PCR 仪而与加拿高校者 Smith(第一个设计基因定点突变)共享 Nobel 化学奖;此外, Griffith ( 1928)及 Avery(1944)等人关于致病力强的光滑型(S 型)肺炎链球菌 DNA 导致致病力弱的粗糙型( R 型)细菌发生遗传转化的试验;Hershey 和 Chase(1952)关于 DNA 是遗传物质的试验;Crick 于 1954年所提出的遗传信息传递规律(即中
6、心法就) :Meselson 和 Stahl(1958)关于 DNA 半保留复制的试验以及 Yanofsky和 Brener(1961)年关于遗传密码三联子的设想都为分子生物学的进展做出了重大奉献;我国生物科学家吴宪 20 世纪 20 岁月初回国后在协和医科高校生化系与汪猷、张昌颖等人一道完成了蛋白质变性理论、血液生化检测和免疫化学等一系列有重大影响的讨论,成为我国生物化学界的先驱;20 世纪 60 岁月、 70岁月和 80 岁月,我国科学家相继实现了人工全合成有生物学活性的结晶牛胰岛素,解出了三方二锌猪胰岛素的晶体结构,采纳有机合成与酶促相结合的方法完成了酵母丙氨酸转移核糖核酸的人工全合成,
7、在酶学讨论、蛋白质结构及生物膜结构与功能等方面都有世所瞩目的建树;三、分子生物学的主要讨论内容全部生物体中的有机大分子都是以碳原子为核心,并以共价键的形式与氢、氧、氮及磷以不同方式构成的;不仅如此,一切生物体中的各类有机大分子都是由完全相同的单体,如蛋白质分子中的 20 种氨基酸、 DNA 及 RNA中的 8 种碱基所组合而成的,由此产生了分子生物学的 3 条基本原理:1 构成生物体有机大分子的单体在不同生物中都是相同的;2 生物体内一切有机大分子的建成都遵循着各自特定的规章;3 某一特定生物体所拥有的核酸及蛋白质分子打算了它的属性;分子生物学讨论内容 : DNA 重组技术 - 基因工程基因表
8、达调控 - 核酸生物学名师归纳总结 - - - - - - -第 1 页,共 22 页精选学习资料 - - - - - - - - - 生物大分子结构功能- 结构分子生物学学习必备欢迎下载DNA 重组技术(又称基因工程)这是 20 世纪 70 岁月初兴起的技术科学,目的是将不同DNA 片段(如某个基因或基因的一部分)依据人们的设计定向连接起来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状;严格地说,DNA 重组技术并不完全等于基因工程,由于后者仍包括其他可能使生物细胞基因组结构得到改造的体系;DNA重组技术是核酸化学、蛋白质化学、酶工程及微生物学、遗传学、细胞学长
9、期深化讨论的结晶,而限制性内切酶DNA 连接酶及其他工具酶的发觉与应用就是这一技术得以建立的关键;DNA 重组技术有着宽阔的应用前景 :DNA 重组技术可用于定向改造某些生物基因组结构,使它们所具备的特殊经济价值或功能得以成百 上千倍的地提高;DNA 重组技术仍被用来进行基础讨论;假如说,分子生物学讨论的核心是遗传信息的传递和掌握,那么依据中心法就,我们要讨论的就是从DNA 到 RNA ,再到蛋白质的全过程,也即基因的表达与调控;在这里,无论是对启动子的讨论(包括调控元件或称顺式作用元件),仍是对转录因子的克隆 及分析,都离不开重组 DNA 技术的应用;基因表达调控讨论 由于蛋白质分子参加并掌
10、握了细胞的一切代谢活动,而打算蛋白质结构和合成时序的信息都由核酸(主要是脱 氧核糖核酸)分子编码,表现为特定的核苷酸序列,所以基因表达实质上就是遗传信息的转录和翻译;在个体生长发育过程中生物遗传信息的表达按肯定的时序发生变化(时序调剂)境调控);,并随着内外环境的变化而不断加以修正(环原核生物的基因组和染色体结构都比真核生物简洁,转录和翻译在同一时间和空间内发生,基因表达的调控主 要发生在转录水平;真核生物有细胞核结构,转录和翻译过程在时间和空间上都被分隔开,且在转录和翻译后都有 复杂的信息加工过程,其基因表达的调控可以发生在各种不同的水平上;基因表达调控主要表现在信号传导讨论、转录因子讨论及
11、 RNA 剪辑 3 个方面;转录因子是一群能与基因 5端上游特定序列专一结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表 达的蛋白质分子;真核基因在结构上的不连续性是近10 年来生物学上的重大发觉之一;当基因转录成pre-mRNA 后,除了在5端加帽及 3端加多聚 ApolyA 之外,仍要将隔开各个相邻编码区的内含子剪去,使外显子(编码区)相连后成为成 熟 mRNA ;讨论发觉,有很多基因不是将它们的内含子全部剪去,而是在不同的细胞或不同的发育阶段有挑选地剪 接其中部分内含子,因此生成不同的 mRNA 及蛋白质分子;结构分子生物学 生物大分子的结构功能讨论(又称结构分子生物学)一个生物大
12、分子,无论是核酸、蛋白质或多糖,在发挥 生物学功能时,必需具备两个前提 :第一,它拥有特定的空间结构(三维结构);其次,在它发挥生物学功能的过程 中必定存在着结构和构象的变化;它包括结 结构分子生物学就是讨论生物大分子特定的空间结构及结构的运动变化与其生物学功能关系的科学;构的测定、结构运动变化规律的探究及结构与功能相互关系的建立3 个主要讨论方向;最常见的讨论三维结构及其运动规律的手段是X 射线衍射的晶体学(又称蛋白质晶体学),其次是用二维核磁共振和多维核磁讨论液相结构,也有人用电镜三维重组、电子衍射、中子衍射和各种频谱学方法讨论生物高分子的空间结构;其次讲染色体与DNA 一、 DNA 的组
13、成与结构Avery 在 1944 年的讨论报告中写道:当溶液中酒精的体积达到9/10 时,有纤维状物质析出;如稍加搅拌,它就会象棉线在线轴上一样绕在硬棒上,溶液中的其它成份就呈颗粒状沉淀;溶解纤维状物质并重复数次,可提高其纯度;这一物质具有很强的生物学活性,初步试验证明,它很可能就是DNA (谁能想到! ) ;对 DNA 分子的物理化学讨论导致了现代生物学翻天覆地的革命,这更是 Avery 所没有想到;所谓 DNA 的一级结构, 就是指 4 种核苷酸的连接及其排列次序,表示了该 DNA 分子的化学构成; 核苷酸序列对 DNA 高级结构的形成有很大影响,如 B-DNA 中多聚( G-C)区易显现
14、左手螺旋 DNA (Z-DNA ),而反向重复的DNA 片段易显现发卡式结构等;DNA 不仅具有严格的化学组成,仍具有特殊的高级结构,它主要以有规章的双螺旋形式存在,其基本特点是:1、DNA 分子是由两条相互平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成的;名师归纳总结 - - - - - - -第 2 页,共 22 页精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备 欢迎下载2、DNA 分子中的脱氧核糖和磷酸交替连接,排在外侧,构成基本骨架,碱基排列在内侧;3、两条链上的碱基通过氢键相结合,形成碱基对,它的组成有肯定的规律;这就是嘌呤与嘧啶配对,而且腺嘌呤( A)只能与胸腺嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G
15、)只能与胞嘧啶(C)配对;如一条链上某一碱基是 C,另一条链上与它配对的碱基必定是 G;碱基之间的这种一一对应的关系叫碱基互补配对原就;组成 DNA 分子的碱基虽然只有 4 种,它们的配对方式也只有 A 与 T,C 与 G 两种,但是,由于碱基可以任何次序排列,构成了 DNA 分子的多样性;例如,某 DNA 分子的一条多核苷酸链有 100 个不同的碱基组成,它们的可能排列方式就是 4100;二、 DNA 聚合酶与 DNA 的合成The accuracy of translation relies on the specificity of base pairing. The actual ra
16、te in bacteria seems to be -10-8-10-10. This corresponds to -1 error per genome per 1000 bacterial replication cycles, or -10-6 per gene per generation. DNA polymerase might improve the specificity of complementary base selection at either or both of two stages: 1,It could scrutinize the incoming ba
17、se for the proper complementarity with the template base; for example, by specifically recongnizing matching chemical features. This would be a presynthetic error control. 2,Or it could scrutinize the base pair after the new base has been added to the chain, and, in those cases in which a mistake ha
18、s been made, remove the most recently added base. This would be a proofreading control. 三、 DNA 的生理意义及成分分析早在 1928 年英国科学家 Griffith 等人就发觉肺炎链球菌使小鼠残废的缘由是引起肺炎;细菌的毒性(致病力)是由细胞表面荚膜中的多糖所打算的;具有光滑外表的 S 型肺炎链球菌由于带有荚膜多糖而都能使小鼠发病,而具有粗糙外表的 R 型由于没有荚膜多糖而失去致病力(荚膜多糖能爱护细菌免受运动白细胞攻击);第一用试验证明基因就是 DNA 分子的是美国闻名的微生物学家 Avery; Av
19、ery 等人将光滑型致病菌(S 型)烧煮杀灭活性以后再侵染小鼠,发觉这些死细菌自然丢失了致病才能;再用活的粗糙型细菌(R 型)来侵染小鼠,也不能使之发病, 由于粗糙型细菌自然无致病力;当他们将经烧煮杀死的 S 型细菌和活的 R 型细菌混合再感染小鼠时,试验小鼠每次都死了;解剖死鼠,发觉有大量活的 S 型(而不是 R 型)细菌;他们估量,死细菌中的某一成分棗转化源( transforming principle )将无致病力的细菌转化成病原细菌;美国冷泉港卡内基遗传学试验室科学家Hershey 和他的同学Chase 在 1952 年从事噬菌体侵染细菌的试验;噬菌体特地寄生在细菌体内;它的头、尾外
20、部都有由蛋白质组成的外壳,头内主要是DNA ;噬菌体侵染细菌的过程可以分为以下5 个步骤:噬菌体用尾部的末端(基片、尾丝)吸附在细菌表面;噬菌体通过尾轴把DNA 全部注入细菌细胞内,噬菌体的蛋白质外壳就留在细胞外面;噬菌体的DNA 一旦进入细菌体内,它就能利用细菌的生命过程合成噬菌体自身的 DNA 和蛋白质; 新合成的 DNA 和蛋白质外壳, 能组装成许很多多与亲代完全相同的子噬菌体;子代噬菌体由于细菌的解体而被释放出来,再去侵染其他细菌;他们发觉被感染的细菌中带有 70%的噬菌体 DNA ,但只带有 20%的噬菌体蛋白质;子代噬菌体中带有 50%标记的 DNA ,却只有 1%的标记蛋白质;四
21、. C-value 和 Cot1/2 The total amount of DNA in the haploid genome is a characteristic of each living species known as C-value. Cot1/2 is the product of concentration and time required for 50% reassociation given in nucleotide-moles second/liter. 五、 染色体结构DNA molecules are the largest macromolecules in
22、 the cell and are commonly packaged into structures called “chromosomes ”, most bacteria & viruses have a single chromosome where as Eukaryotic cells usually contain many. 任何一条染色体上都带有很多基因,一条高等生物的染色体上可能带有成千上万个基因,一个细胞中的全部基因序列及其间隔序列统称为 genomes(基因组); 假如设想将人体细胞中的 DNA 分子绕地球一周,那么,每个碱基大约只占 15 厘米,而一个 23k
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