基因工程(研究生)-精品文档资料整理.ppt
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1、 基因工程(基因工程(genetic engineering) 20世纪世纪70年代以来,分子生物学、生物化学、免疫学形成了一项年代以来,分子生物学、生物化学、免疫学形成了一项 融科研、生产、开发为一体的新兴科技领域融科研、生产、开发为一体的新兴科技领域-生物技术生物技术 (biotechnology), 基因工程基因工程 四大工程四大工程 细胞工程细胞工程 蛋白质工程蛋白质工程 酶工程酶工程 基因工程技术基因工程技术 两大技术两大技术 单克隆抗体技术单克隆抗体技术 一、基因工程的定义一、基因工程的定义 基因工程是在分子水平上,用人工方法提取或制备基因工程是在分子水平上,用人工方法提取或制备D
2、NA 通过载体通过载体 在体外切割、拼接和重新组合在体外切割、拼接和重新组合 把重组把重组DNA分子导入分子导入 受体细胞受体细胞 使外源使外源DNA在受体细胞中进行复制、表达在受体细胞中进行复制、表达 生产出人们所需要的产物,或定向创造生物的新性状,并使生产出人们所需要的产物,或定向创造生物的新性状,并使 之稳定传给下一代之稳定传给下一代.二、克隆(二、克隆(clone) 基因工程中基因工程中 最重要的工作是进行分子克隆最重要的工作是进行分子克隆 (molecular cloning) clone:通过通过无性无性繁殖所产生的与繁殖所产生的与亲代完全相同的子代群体亲代完全相同的子代群体 (
3、A clone is a large population of identicalA clone is a large population of identical molecules, bacteria, or cells that arise molecules, bacteria, or cells that arise from a common ancestor. from a common ancestor.) 来自同一始祖的相同副本或拷贝来自同一始祖的相同副本或拷贝(copy)(copy)的集合的集合. . clone技术有三个层次技术有三个层次 整体水平整体水平:克隆羊多莉
4、的出现:克隆羊多莉的出现 细胞水平细胞水平:制备单克隆抗体时:制备单克隆抗体时 分子水平(即分子克隆)分子水平(即分子克隆):即制备:即制备 DNA片段,通过载体导入受体细片段,通过载体导入受体细 胞,在受体细胞中复制、扩增,以胞,在受体细胞中复制、扩增,以 获得单一获得单一DNA分子的大量分子的大量copy. 我国,上海,我国,上海,TaoTao(牛),它的乳汁中含有人血清白蛋白,(牛),它的乳汁中含有人血清白蛋白, 实质是乳腺生物发生器,即把人血清白蛋白基因整合到牛受精卵实质是乳腺生物发生器,即把人血清白蛋白基因整合到牛受精卵 染色体与染色体与泌乳泌乳相关基因上。再如:牛肉味的番茄相关基因
5、上。再如:牛肉味的番茄 现在,人们将现在,人们将 DNA重组技术重组技术 同义词无本质区别同义词无本质区别 基因工程技术基因工程技术 分子克隆技术分子克隆技术大西洋鮭魚體內有無額外表現大西洋鮭魚之大西洋鮭魚體內有無額外表現大西洋鮭魚之生長激素生長激素之之比較圖比較圖A組組:無額外表現者無額外表現者; B組組:具有額外表現者具有額外表現者 (圖片源圖片源於自然雜誌西元於自然雜誌西元2000第第406卷卷)ABB. 食用魚類食用魚類Genetic engineering mice基因工程之產物基因工程之產物-置入生長激素置入生長激素C. 醫學用途醫學用途(基礎研究基礎研究) 第一节、工具酶第一节、
6、工具酶 (Tool Enzyme) 基因工程中许多工作都涉及到对基因工程中许多工作都涉及到对DNA进行切割、重进行切割、重 组、修改、合成,这些都是通过酶的作用来完成的。组、修改、合成,这些都是通过酶的作用来完成的。一、限制酶(一、限制酶(restriction enzyme)1、定义:是一类能、定义:是一类能识别识别和和切割双链切割双链DNA分子分子内内特定碱基特定碱基 序列序列的的核酸内切酶核酸内切酶。所谓限制(。所谓限制( restriction ),就),就 是指切割(是指切割(cleavage) 许多细菌具有免疫的防卫系统,即限制与修饰系统(许多细菌具有免疫的防卫系统,即限制与修饰系
7、统(R-M系系 统),该系统对外来统),该系统对外来非己非己DNA通过限制作用使其降解,对自己通过限制作用使其降解,对自己 DNA则加以修饰而不受限制作用的降解则加以修饰而不受限制作用的降解 限制:由限制酶来实现限制:由限制酶来实现 修饰:由甲基化酶实现修饰:由甲基化酶实现2、多数限制酶是从细菌中发现,分为、多数限制酶是从细菌中发现,分为3类类 、:同时有限制、修饰功能:同时有限制、修饰功能 :特异性强、无修饰作用,被誉为分子生物学:特异性强、无修饰作用,被誉为分子生物学家家的手术刀的手术刀 3、限制酶的命名、限制酶的命名 第一个字母:该酶的细菌属名第一个字母:该酶的细菌属名 第二、三个字母:
8、该酶的细菌种名,小写第二、三个字母:该酶的细菌种名,小写 第四个字母:该酶的株名第四个字母:该酶的株名4 4、类限制酶的作用特点:类限制酶的作用特点: 1 1)有严格的识别、切割序列,以内切的方式水解双链)有严格的识别、切割序列,以内切的方式水解双链DNADNA中磷中磷 酸二酯键。酸二酯键。 2 2)识别序列通常为)识别序列通常为4-6 bp4-6 bp的回文结构(的回文结构(palindrome),palindrome),即即180180 GGGCCC GGGCCC 旋转对称的结构。旋转对称的结构。 CCCGGGCCCGGG 3)切割后产生三种不同的切口:)切割后产生三种不同的切口: A 平
9、头末端或钝性末端(平头末端或钝性末端(blunt end): 在识别序列的对称轴在识别序列的对称轴 上,对双链上,对双链DNA同时切割。同时切割。 如:如: 5-GGCC-3 Hae 5-GG CC-3 + 3-CCGG-5 3-CC GG-5 B 5端突出的粘性末端(端突出的粘性末端(cohesive end or sticky end) 在识别序列的两个对称点上切开在识别序列的两个对称点上切开DNA链,产生带单链尾巴链,产生带单链尾巴 的粘性末端。的粘性末端。 如:如:5-GAATTC-3 EcoR 5-G + AATTC-3 3-CTTAAG-5 3-CTTAA G-5 C. 3端突出的
10、粘性末端:从端突出的粘性末端:从3端切割端切割 如:如:5-CTGCAG-3 Pst 5-CTGCA + G-3 3-GACGTC-5 3-G ACGTC-55、 同功异源酶:来源不同,但识别和切割位点相同的酶同功异源酶:来源不同,但识别和切割位点相同的酶 如:如:BamHI 和和 Bst(GGATCCGGATCC)6 6、同、同尾尾酶:识别序列不同、但可产生相同的粘性末端酶:识别序列不同、但可产生相同的粘性末端 如:如: BamHI(GGATCC)和)和San3AI(NGATCC)7、不同限制酶作用时所需要的盐浓度不同,应使用相应的缓冲液、不同限制酶作用时所需要的盐浓度不同,应使用相应的缓冲
11、液 二、二、 修饰酶修饰酶(一)(一)DNA 聚合酶聚合酶(DNA polymerase ) 来源于来源于E.coli, Mr 109KD,有三种酶活性(多功能酶):有三种酶活性(多功能酶): 1、 5 3聚合酶活性:以聚合酶活性:以DNA为模板,为模板,dNTP为原料,使为原料,使 DNA链从链从5-3 延伸延伸 2、5 3外切酶活性,外切酶活性,5 3 3、3 5外切酶活性:外切酶活性: 5 3 应用:应用: 缺口平移法(缺口平移法(nick translation)标记)标记DNA探针探针 Klenow 片断片断:是是DNA pol的一个大片断,的一个大片断,Mr 76KD,去掉,去掉5
12、 3 外切酶活性,保留外切酶活性,保留5 3聚合酶活性,聚合酶活性, 3 5外切酶活性外切酶活性应用:应用: A、补齐双链、补齐双链DNA的的3 端端 B、通过补齐、通过补齐3-端使端使3 端标记端标记 C、在、在cDNA克隆中,用于克隆中,用于cDNA第二链的合成第二链的合成 D、DNA序列分析序列分析RNase Hklenow 大片段合成第二链AAAAAAAA.AAAAAAAA-3 mRNATTTTTTTT.TTTTTTTT-5Oligo dT 12-18 bp primerReverse TransciptaseMg2+, dNTPAAAAAAAA.AAAAAAAA-3mRNATTTTT
13、TTT.TTTTTTTT-5cDNA (二)逆转录酶(二)逆转录酶(reverse transcriptase) 是依赖于是依赖于RNA的的DNA聚合酶,用于将聚合酶,用于将mRNA反转录成反转录成cDNA 构建构建cDNA文库。常用的逆转录酶有两种:文库。常用的逆转录酶有两种: AMV:来源于禽成骨细胞性白血病病毒:来源于禽成骨细胞性白血病病毒 从病毒颗粒从病毒颗粒 MMLV:来源于小鼠白血病病毒:来源于小鼠白血病病毒 中得到。中得到。(三)(三)T4 DNA ligase 将两段将两段DNA分子拼接起来的酶,叫分子拼接起来的酶,叫DNA连接酶,连接酶, 催化催化5-P和和3-OH 形成磷酸
14、二酯键。形成磷酸二酯键。 (四)碱性磷酸酶(四)碱性磷酸酶(alkaline phosphatase) 作用:能去除作用:能去除DNA或或RNA 5-端的磷酸根端的磷酸根 用途:防止载体自身成环,提高重组效率用途:防止载体自身成环,提高重组效率 (五)末端脱氧核苷酰转移酶(五)末端脱氧核苷酰转移酶 (terminal deoxynucleotidyl transferase,TdT) 作用:催化作用:催化dNTP加到加到DNA的的3-OH 端端 用途:用途:A、3- 端标记,制备探针端标记,制备探针 B、给载体和待克隆的片段接上互补的同聚、给载体和待克隆的片段接上互补的同聚 物尾,造成便于重组
15、的人工粘性末端物尾,造成便于重组的人工粘性末端 第二节第二节 载载 体体 (vector)一、定义:用来携带目的基因片段进入受体细胞的一、定义:用来携带目的基因片段进入受体细胞的DNA 克隆载体:用来克隆和扩增克隆载体:用来克隆和扩增DNA片段的载体片段的载体 按功能分按功能分 表达载体:用来在宿主细胞中表达外源基因的载体表达载体:用来在宿主细胞中表达外源基因的载体 (表达载体比克隆载体复杂,多一些与(表达载体比克隆载体复杂,多一些与表达调控表达调控有关的元件)有关的元件)二、克隆载体应具备的条件:二、克隆载体应具备的条件:(一)能够在受体细胞中复制,并能携带重组(一)能够在受体细胞中复制,并
16、能携带重组DNA片段一同扩增片段一同扩增(二)带有遗传标志,便于筛选,如(二)带有遗传标志,便于筛选,如 Amp r 编码一个酶,可将氨编码一个酶,可将氨 苄青霉素的苄青霉素的-内酰胺环水解,解除其毒性。内酰胺环水解,解除其毒性。Tet r 编码一种膜编码一种膜 结合蛋白,阻止四环素进入细胞结合蛋白,阻止四环素进入细胞(三)带有多克隆位点(三)带有多克隆位点(multiple cloning site, MCS ),即,即限制限制性性 内切酶的识别、切割、位点。内切酶的识别、切割、位点。MCS是外源是外源DNA插入的部位。插入的部位。 (四)分子量相对较小,能在细菌内稳定存在(四)分子量相对较
17、小,能在细菌内稳定存在 表达载体表达载体除除了了有克隆载体的特点外,尚有启动子(在插入有克隆载体的特点外,尚有启动子(在插入 DNA片段的上游)、核糖体结合位点、转录起片段的上游)、核糖体结合位点、转录起始始信号和起始信号和起始 密码、插入密码、插入DNA片段的下游有转录终止信号和终止密码。片段的下游有转录终止信号和终止密码。 三、三、 常用的克隆载体:常用的克隆载体:(一)(一) 质粒(质粒(plasmid): plasmid): 是是细菌细菌染色体染色体以以外外的能的能自主复自主复 制制的的环状闭合双链环状闭合双链DNADNA分子分子。 如:如:PBR322PBR322质粒,质粒,PUCP
18、UC系列系列 包装容量(允许插入外源包装容量(允许插入外源DNADNA的长度,的长度,size)size): 10kb10kb (二)二)噬菌体(噬菌体(bacteriaphages,phages): 是感染细菌的是感染细菌的病毒病毒 溶源性(溶源性( lytic) 按其生活周期分为按其生活周期分为 溶菌性溶菌性(lysogenic(lysogenic) ) 噬菌体是噬菌体是48.5kb的双链线形的双链线形DNA分子分子 COS位点:分子两端各有位点:分子两端各有12个碱基的互补单链个碱基的互补单链 是天然的粘性末端,称是天然的粘性末端,称COS位点,可成环状位点,可成环状 包装容量:包装容量
19、:20kb+BamH IEcoR ISal IBamH IEcoR ISal IBamH IEcoR ISal IBamH IEcoR ISal I44 kb44 kbEMBL3EMBL421 kb13 kb10 kb图图8-2 EMBL 3和和 EMBL 4 结构简图结构简图 ( 三)粘性质粒三)粘性质粒( 柯斯质粒、柯斯质粒、cosmid vector ) 质粒质粒DNA:有抗药基因,:有抗药基因,MCS,自我复制,自我复制 组成组成 噬菌体噬菌体 :COS位点位点 包装容量:包装容量:40Kb+(四)四)M13 噬菌体:噬菌体: 单链单链闭合环状闭合环状DNA分子,感染细菌后可转变为分子
20、,感染细菌后可转变为双链双链的的 复制型复制型DNA(replicational form DNA, RF DNA) 包装容量:包装容量: 1kb( 五)酵母人工染色体载体(五)酵母人工染色体载体(yeast artificial chromosome vector,YAC) 酵母基因:着丝粒、端粒酵母基因:着丝粒、端粒 YAC组成组成 质粒质粒DNA:ori、Ampr 包装容量:包装容量:0.5-2Mb 细菌人工染色体(细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC) 包装容量:包装容量: 0.1- 0.4Mb 哺乳动物人工染色体(哺乳动物人工染色体(
21、mammalian artificial chromosome, MAC) 目前也在发展中。目前也在发展中。 二二 、表达载体(、表达载体(expressing vector) 用来在受体细胞中表达(转录和翻译)外源基因的载体用来在受体细胞中表达(转录和翻译)外源基因的载体 克隆载体所具备的条件克隆载体所具备的条件 具备条件具备条件 转录和翻译所必需的转录和翻译所必需的DNA序列序列(一)大肠杆菌表达载体(一)大肠杆菌表达载体 表达元件:启动子表达元件:启动子RBS克隆位点(外源克隆位点(外源DNA的插入的插入 位点)位点) 转录终止信号转录终止信号 1、 promoter: 常用常用tac、
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