不同铁源及导电材料的添加对Shewanlla puterfaciens CN32铁还原过程的影响-毕业论文.docx
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1、目录摘要1Abstract2第一章 绪论31.1研究背景31.2国内外研究现状及研究意义31.3 研究内容5第二章 Shewanella puterfaciens CN32及测试指标标线52.1 CN32菌准备52.1.1 收菌方法52.1.2测收菌后OD值62.1.3接菌62.2铁标线62.3菌体生长标准曲线72.4 SMP蛋白标准曲线8第三章 不同铁源及电材料对Fe(III)的还原效果的影响93.1引言93.2材料与方法103.2.1 培养基准备103.2.2 实验材料113.2.3仪器123.3 实验设计123.3.1 数据处理133.3.2 测定周期133.4实验分析方法133.4.1
2、分析指标133.4.2 Fe(II)浓度133.4.3黄素143.5 结果与讨论143.5.1 针铁矿及电材料对Fe(III)的还原效果的影响143.5.1.1 溶解态Fe(II)143.5.2 NTA-Fe及电材料对Fe(III)的还原效果的影响193.5.2.1 溶解态Fe(II)193.6 本章小结24第四章 不同条件下细菌分泌蛋白的差异264.1引言264.2材料与方法264.2.1 培养基准备264.2.2 实验材料274.2.3仪器274.3 实验设计284.3.1 数据处理294.3.2 测定周期294.4 实验分析294.4.1分析指标294.4.2菌体生长情况294.4.3分
3、泌蛋白浓度304.5结果与讨论304.5.1 菌体生长304.5.2 细菌分泌蛋白32第五章结论与展望345.1结论345.2展望34第六章 致谢35不同铁源及导电材料的添加对Shewanlla puterfaciens CN32铁还原过程的影响摘 要:异化铁还原菌还原Fe(III)是铁循环及能量流动的重要环节,在微生物的氧化还原反应中,铁氧化物充当电子载体,能够有效的加快微生物对有机物的降解。有研究表明通过补充外源微量元素可以有效提高厌氧微生物活性,铁元素便是外来元素之一。在自然界中有很多细菌可以通过还原矿物中的高价铁以获取能量,其中奥奈达湖希瓦氏菌Shewanella oneidensis
4、是研究最多的异化铁还原菌之一。所以本文以Shewanella puterfaciens CN32为微生物,研究的内容包括:1.考察了添加导电材料对Fe(III)还原效果的影响,结果显示:以针铁矿为铁源时,添加石墨及CNTs对Fe(III)还原有抑制作用。以NTA-Fe为铁源时,添加石墨及CNTs能够刺激Fe(III)还原。2.考察了不同铁源下对Fe(III)还原效果的影响,实验结果表明游离态NTA-Fe的Fe(III)还原效果较固定态针铁矿的还原效果好。3.考察了不同的条件下细菌分泌蛋白的差异,结果表明添加石墨对分泌蛋白有促进作用,添加CNTs对分泌蛋白有抑制作用。关键词:Shewanella
5、 puterfaciens CN32;Fe(III)还原;不同铁源;导电材料;分泌蛋白The impact of adding different types of iron and conductive material on Shewanlla puterfaciens CN32 iron reductionAbstract:Bacteria reduction of iron oxide Fe (III) is an important part of iron circulation and energy flow in the oxidation-reduction reaction
6、 of microorganisms, the iron oxide acts as an electron carrier, can effectively accelerate the microbial degradation of organic matter.it is shown that by supplementing exogenous trace elements can effectively improve the anaerobic microbial activity, iron is one of foreign elements.There are many b
7、acteria by reduction of ferric minerals for energy in nature, where the Oneida Lake Shewanella Shewanella oneidensis is one of the most studied alienation iron-reducing bacteria.So this paper use Shewanella putrefaciens CN32 as microorganisms, the study include:1.The effect of adding a conductive ma
8、terial to Fe (III) reduction effect, the results show: the goethite iron source, adding graphite and CNTs to Fe (III) reduction of inhibition. In NTA-Fe is iron source, adding graphite and CNTs can stimulate the Fe (III) reduction.2.The effects of different iron sources under on Fe (III) reduction e
9、ffect, the experimental results show that the free state NTA-Fe of Fe (III) reduction effect than the reduction effect of fixed goethite good.3.The effects of differences in bacterial secreted proteins under different conditions, the results showed that addition of graphite can promote secretion of
10、the protein, adding CNTs to inhibit the secretion of the protein.Keywords:Shewanella puterfaciens CN32;Fe (III) reduction;secreted proteins; different iron source; a conductive material第一章 绪论1.1研究背景 在土壤、沉积物及浅埋藏的环境中,存在着丰富的铁的氧化物(如水铁矿、赤铁矿及针铁矿等)1,2,这些铁的氧化物是地球表层中最重要的铁资源。控制了地表系统中的Fe(II)-Fe(III)的氧化还原就等于掌握了
11、铁循环过程及能量流动的重要环节3.4,其中含铁矿物的微生物氧化-还原作用越来越受到人们的关注4,5 。部分异养厌氧型微生物在进行呼吸作用的同时还可以通过还原 Fe(III)来获得能量,这种铁的异化还原能力在许多生物、地球及化学循环中都起着举足轻重作用6-10,也能显著影响重金属污染的生物修复、金属腐蚀的控制及生物质能转化等11-14 。所以,Fe(III)的还原是铁的生物、地球及化学循环过程的重要环节。 目前已经发现了自然界中有许多细菌可以通过还原矿物中的高价铁以获取能量 4 ,其中奥奈达湖希瓦氏菌Shewanella oneidensis是研究最多的异化铁还原菌之一15-19 。Shewan
12、ella属常见于土壤、沉积物、地表水和地下水,为革兰氏阴性异化金属还原菌,能利用氧气、高价金属以及变价无机盐类作为终端电子受体,获取生长所需能量 20-23。从细菌与针铁矿反应过程的研究中显示,在厌氧环境下 Shewanella puterfaciens在针铁矿表面的吸附远强于有氧条件,并且由于细菌表面的还原酶多,可促进电子由细菌向矿物的表面有效转移 24,25。对比针铁矿与 +3 价游离铁离子的微生物还原作用,发现细菌易于直接还原游离态的Fe 3+ 离子,而结晶态铁矿物的溶解还原则相对比较困难 26。有研究表明在蓝藻厌氧发酵产沼气是资源化的过程中,通过补充外源微量元素可以有效提高厌氧微生物活
13、性,铁元素便是外来元素之一28。亚铁子能够有效的提高产甲烷菌酶的活性,而且铁氧化物是自然界中一种广泛存在且价廉易得的矿物,可以作为一种外源添加物在蓝藻的厌氧发酵中使用。Kato S 研究认为,在微生物的氧化还原反应中,铁氧化物充当电子载体,能够有效的加快微生物对有机物的降解29。1.2国内外研究现状及研究意义在上世纪70年代国外就已经开始了有关异化Fe(III)还原的研究,研究Fe(III)还原菌的分类、分离、分子机制及极端环境条件下异化Fe(III)还原菌,在研究生命起源及进化中起到重要的意义,异化Fe(III)还原菌应用于放射性核素、石油等碳氢化合物和垃圾渗滤液污染的地下水的原位修复,异化
14、Fe(III)还原菌还在产生微生物燃料电池方面作了大量的原创性工作。虽然目前对Fe(III)还原菌的研究已经做了大量的工作,但是国内在这方面的研究还比较少;国外大多数是关注于海洋、湖泊和沼泽等生态系统的研究,对蓝藻中的Fe(III)还原菌研究却比较少。Fe(III)还原菌的形态多异,营养类型多样。但是目前还没有获得能够为Fe(III) 还原菌通用的功能性基因,这就极大的阻碍了Fe(III) 还原菌在生态系统中的原位研究;如果能够借助于日益先进的生物分子学技术找到功能性基因,这将会大大促进Fe(III)还原菌的研究和其在生物修复方面的应用。我国拥有大面积的湖泊资源,但很多湖泊及河流都受到了蓝藻的
15、污染,所以十分有必要深入了解蓝藻中的Fe(III)还原菌的多样性;且蓝藻是湖泊河流中的一种微生物,是由于大量氮、磷等营养元素的排入而产生的蓝藻爆发。Fe(III)还原菌既在生态系统中既是碳循环的驱动者,同时又是氮循环的参与者。Fe(III)还原菌如Geobacter除了参与还原铁氧化物外,还参与了NO3 、依赖型铁Fe(III)还原和Fe(III) - NH+4 很可能也具有与氧化还原耦合的关联。此外,Fe(III)还原菌(Geobacter)还具有固氮酶,而固氮菌(Clostridia)同时也是一种异化Fe(III)还原菌。总之,Fe(III)还原菌与C、N代谢有着密切的联系。深入的研究微生
16、物介导的C-Fe-N耦合的机制,探究Fe(III)还原菌在生态系统中 C、N 代谢的生态意义将会推动整个生态系统的生物地球的化学循环30。Fe(III)还原菌在生物修复中有巨大的潜力,研究Fe(III)还原菌在生物修复中的应用,对开发出既经济又高效的修复途径在人类生态系统的健康发展方面具有重要时代意义。除了通过添加单一的电子供体来刺激Fe(III)还原菌的生长来提高污染物的去除率之外,添加导电材料在Fe(III)还原菌生物修复中的作用机制和应用同时也需要进一步研究。在自然界之中, Fe(III)能够被生物还原成 Fe2+。不管Fe3+是以溶解态还是固态的形式存在。微生物细胞与固体矿物之间的电子
17、传递是控制岩石圈能量交换的基本过程27。Fe(III)不可能与外周胞质蛋白直接结合,因为它们是以难溶的固体形式存在于细胞表面之外,并且在大多数条件下不能通过细胞外膜。但是有一些还原铁氧化物的细菌可以做到这一点,它们通过将相关细胞色素置于细胞外膜外表面使得其接触到氧化物表面从而实现传递电子27。还有其他的机制包括生物合成具有电子受体和电子供体特性的水溶性有机化合物充当电子梭促进电子传递31。2008 年,Von Canstein 等32,报道还原金属的希瓦氏菌属可以分泌核黄素(维生素B2)和黄素单核甘酸(FMN)充当电子梭促进结晶度低的 Fe3+氧化物的还原。1.3 研究内容 本文采用希瓦氏奥奈
18、达菌(Shewanella puterfaciens CN32,简称 CN-32)CN-32 为研究菌株和人工合成的针铁矿、人工配置的Fe-NTA为两种不同的电子受体,并在不同电子受体的培养基中加入导电材料CNTs或石墨。构建营养充足的、pH 为中性的厌氧环境体系,研究了不同铁源及导电材料的添加对Shewanella puterfaciens CN32铁还原过程的影响研究,讨论了不同铁源及导电材料的添加对Fe(III)的还原效果的影响及不同条件下细菌分泌蛋白的差异。第二章 Shewanella puterfaciens CN32及测试指标标线2.1 CN32菌准备 所用菌种为奥奈达湖希瓦氏菌S
19、hewanella puterfaciens CN32由中国海洋微生物菌种保藏管理中心提供(MCCC,编号1A01706)。培养基:好氧培养基为LB培养基参考分子克隆实验指南33,pH 7.2。CN-32菌株的活化、传代和培养均在好养培养基中进行,使用 LB 培养基(10 g/L 蛋白胨,5 g/L 酵母膏,10 g/L NaCl)于室温下活化三代。然后进行洗菌和收菌。2.1.1 收菌方法 燃烧的酒精灯边,12000 rpm,5 min,洗涤3次。需要的仪器:预先灭菌:50mL压盖式离心管(保鲜袋装),1mL移液枪,200mL无机培养基;需提前准备但无需灭菌:冰盒(取冰用),废液缸,酒精灯,打
20、火机。 收菌及洗菌时重悬洗菌的操作方法:(操作必须在酒精灯边,并且每次使用都要用火焰轻燎,保证无菌)离心后弃去上清夜,燃烧的酒精灯边,菌体沉淀中用灭菌过的1mL抢打入5mL无机培养基,反复抽吸直至分散完全,将离心管盖及管口在火焰边轻晃后盖紧离心管进行离心,第3次洗菌可以将菌液用枪合并在一起后进行。2.1.2测收菌后OD值 取0.1mL浓缩菌,稀释至10mL后用紫外分光光度计测定,波长为600nm.2.1.3接菌将所需浓缩菌液按照收菌后的OD值算好,在无氧条件下,用1mL一次性针管取菌也注入灭好菌的厌氧瓶中。2.2铁标线试剂:(1)铁标准储备液:精确称量0.7020g硫酸亚铁铵((NH4)2Fe
21、(SO4).6H2O ),溶于50mL的(1+1)硫酸中,转移至1000mL的容量瓶中,加水至标线,然后摇匀。此时溶液中每升100g铁。 (2)铁标准使用液:精确移取25mL铁标准储备液于100mL的容量瓶中,加水至标线,摇匀,此时溶液中每升25g铁。 (3)(1+3)盐酸。 (4)10%盐酸羟胺溶液。 (5)缓冲溶液:40g乙酸铵加入50mL冰乙酸最后用水稀释到100mL。 (6)0.5%邻菲啰啉(1,10-phenanthroline)水溶液,加入浓盐酸帮助于溶解。步骤:依次移取铁标准使用液0、2.00、4.00、6.00、8.00、10.0置于150锥形瓶中,加入蒸馏水至50mL,再加入
22、1mL的(1+3)盐酸,1mL10%盐酸羟胺溶液,之后加入1-2粒玻璃珠。加热煮沸至溶液剩15mL左右,冷却至室温,定量转移至50mL具塞比色管中。加入一小片刚果红试纸,滴加饱和乙酸钠溶液至试纸刚变红,加入5mL缓冲溶液,2mL0.5%邻菲啰啉,加水指标线,摇匀。显色15min后,用10mm比色皿,以水为对照,在510nm处测吸光度。测得的标线为: 表2.1 铁标线浓度(mg/L)吸光度00.08310.29420.50430.67940.86951.068 图2.1 铁标线2.3菌体生长标准曲线Bradford蛋白含量检测法标准曲线建立采用牛清蛋白(生工)为蛋白质标准物质,设置10、20、4
23、0、80、100及200mg/L等不同浓度。移取0.1mL 0.5mol/L NaOH 溶液加入0.9 mL 蛋白质标准物质,121 下加热20 min 裂解细胞。待充分冷却后,离心悬液(12000rpm,5min),去0.2 mL 上清夜与1 mL Bradfor试剂(生工)混合(1.5 mL离心管内),利用分光光度计于595 nm 波段读取光度值。表2.2 菌体生长标线浓度(mg/L)吸光度00100.08200.142400.250800.4321000.524 图2.2菌体生长标线2.4 SMP蛋白标准曲线 Bradford蛋白含量检测法标准曲线建立采用牛清蛋白(生工)为蛋白质标准物质
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