苹果G蛋白偶联受体MdGCR1基因的克隆及遗传转化毕业论文.docx
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1、山東農業大學 学 士 学 位 论 文苹果G蛋白偶联受体MdGCR1基因的克隆及遗传转化Cloning and genetic transformation of MdGCR1 gene of apple G protein coupled receptor学生姓名: 专业班级:2012级园艺五班学号:20125772学院:园艺学院指导教师: 2016年 5 月 29日 目 录中文摘要 11前言12材料与方法22.1.1植物材料及仪器22.1.2菌株及载体22.1.3培养基22.1.4酶、试剂32.1.5引物32.1.6溶液和缓冲液32 .2试验方法42.2.1CTAB法提取RNA42.2.2T
2、rizol法提取RNA42.2.3RNA含量与纯度检测52.2.4植物RNA纯化(除DNA)方法52.2.5反转录cDNA第一链的合成62.2.6基因扩增62.2.7PCR产物的回收62.2.8连接反应62.2.9大肠杆菌感受态细胞的转化72.2.10农杆菌感受态细胞的制备72.2.11电击法转化农杆菌72.2.12质粒DNA的提取82.2.13质粒DNA的酶切82.2.14表达载体的构建92.2.15转化烟草92.2.16植物基因组DNA的提取102.2.17基因组DNA含量与纯度检测103结果与分析103.1苹果MdGCR1基因的克隆及进化树分析113.2MdGCR1的表达分析113.3苹
3、果MdGCR1基因植物过表达载体的构建及获得转基因烟草124讨论135参考文献146致谢15中文摘要 以嘎啦(Gala)苹果为材料,采用同源克隆和 PCR技术分离得到苹果G蛋白偶联受体基因MdGCR1。系统进化树分析显示,苹果MdGCR1与梨GCR1亲缘关系最近,同源性最高。基因表达分析显示MdGCR1主要在根、茎和叶中表达,在花和果实中的表达量相对较低;构建了MdGCR1植物过表达载体,并通过农杆菌介导的遗传转化获得了转MdGCR1基因的烟草过表达株系。这为深入揭示G蛋白偶联受体基因在植物逆境响应过程中的作用机制提供技术基础。关键词:苹果;G蛋白偶联受体;MdGCR11前言 G蛋白(G pr
4、otein)全称为GTP结合调节蛋白(GTP binding regulatory protein),又称偶联蛋白或信号转换蛋白,在细胞膜上受体接受胞外信号与膜内侧效应酶产生产生胞内信号之间,在信号传导中起着重要作用(Ji et al., 1998; Burg et al., 2015)。G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCRs)能感应胞外信号并将信号传递给G蛋白,后者又将信号传递到下游相应的效应器(Albert androbillard, 2002; 郭志云 等,2004)。植物GPCRs介导的G蛋白信号转导途径是一种非常保守的信号机制,在植物生长
5、发育中发挥重要作用(Jacoby et al., 2006)。GPCRs广泛存在于真核生物中,是已知最大的一类细胞表面受体(Lee et al., 2001; Pin et al., 2003)。GPCRs种类很多,但具有相似的蛋白结构,通常都是一条包含7个跨膜结构域的多肽链(Liebmann et al., 2004)。其肽链由N末端和C末端组成。N末端在细胞外,包含有7个跨膜螺旋,反复穿过细胞膜的脂双层,常常被糖基化修饰;C末端在细胞内,有3个胞外环和3-4个胞内环组成,常常发生磷酸化修饰(Pin et al., 2003)。G蛋白偶联的信号传导系统由G蛋白偶联受体GPCRs、异三聚体G蛋
6、白(三亚基)和效应器组成。当植物受到外界刺激时,细胞膜上的GPCRs受体与信号分子结合并活化,促使G-GDP转换成G-GTP,同时使异源三聚体-G蛋白复合体解离,通过G、G或者G将信号传递给下游的效应器,最终引起一系列的生理生化应答反应(Urano et al., 2013)。研究表明,GPCRs能够参与植物激素和抗逆反应,并在多种发育过程中发挥调节作用。Dymock等(1998)首先发现拟南芥GCR1基因失活将导致植株的根、茎对细胞分裂素不敏感,根、子叶和叶片的伸展受到抑制。Pandey和Assmann(2004)证明GCR1与GPA1偶联,调控ABA信号通路。最近,又有报道表明,拟南芥GC
7、R1参与多种生物和非生物胁迫响应,并在磷酸盐饥饿响应中发挥重要作用(Chakraborty et al., 2015)。水稻GPCRs研究较少,研究显示,编码G蛋白亚基的基因突变会导致植株矮化(Oki et al., 2009),周宇科等(2011)也证明超量表达水稻OsGPCR的植株对赤霉素反应更敏感。这些研究结果表明G蛋白偶联受体在植物生长发育、激素应答以及抗逆反应中发挥关键作用,但是G蛋白偶联受体的作用机制仍不清楚(Temple and Jones, 2007; Trusov and Botella, 2012)。目前G蛋白偶联受体的研究主要集中在拟南芥、水稻等草本植物中,作为木本植物中
8、重要的模式植物,G蛋白偶联受体在苹果中的功能研究尚未报道。为探明G蛋白偶联受体在苹果生长发育中的作用,本实验采用同源克隆的方法克隆了苹果G蛋白偶联受体基因MdGCR1,成功构建了MdGCR1超量表达载体,并通过农杆菌介导的遗传转化获得了转MdGCR1基因烟草。2 材料与方法2.1植物材料及仪器本实验所用到的植物材料有“嘎拉”(Malusdomestica Gala),烟草(Nicotiana benthamiana)。嘎啦果实以及检测MdGCR1基因表达所用的组织包括生长根、幼茎、新生叶、初花时的花和花后30天的幼果,都取自栽种在山东农业大学南校区国家苹果工程中心的果树。实验仪器:天平、恒温水
9、浴锅、恒温金属浴、BioRad PCR仪、农杆菌转化专用电穿孔仪、SDS-PAGE设备、电泳设备、无菌台、摇床、高温灭菌锅、离心机、烘箱等。2.1.2菌株及载体本实验所用的菌株为大肠杆菌DH5,农杆菌为LBA4404,载体为pMD18-T和pCAMBIA 1300。2.1.3 培养基 LB培养基成分:成分比例用量(g/L)胰蛋白胨(Tryp Tone)1.0%10氯化钠(Nacl)1.0%10琼脂粉Agar(固体)1.5%15酵母提取物(Yeast Extrhq)0.5%5 MS培养基成分用量(g/L) 蔗糖30 MS 4.74琼脂粉(Agar powder)7.5 YEP培养基成分:成分比例
10、用量(g/L)胰蛋白胨(Tryp Tone)1.0%10氯化钠(Nacl)0.5%5琼脂粉Agar(固体)1.5%15酵母提取物(Yeast Extrhq)1.0%10 抗生素氨苄青霉素 (Ampicillin)100 mg/ml卡那霉素 (Kanamycin)50 mg/ml利福平 (Rifampin)25 mg/ml2.14 酶、试剂限制性内切酶(BamH I、EcoR I)、Easy Taq酶、T4 DNA ligase、DNA Maker DM2000及质粒回收试剂盒、PCR回收试剂盒(PCR Fragment Recovery Kit)、反转录试剂盒购自宝生物(大连)公司、Trizo
11、l试剂盒为Invitrogen公司产品、Tris Base、DEPC等DNA和RNA提取试剂为上海生物工程公司试剂、质粒抽提试剂盒为UNIQ-10柱式质粒小量抽提试剂盒,购自上海生物工程公司、Amp、PVP 、-巯基乙醇、CTAB、Kan、DEPC、EB、琼脂粉、SDS、Tris、EDTA-Na22H2O、琼脂糖等为进口分析纯试剂,购于上海生物工程公司、国产分析纯试剂有:NaOH、浓盐酸、异戊醇、硫酸、氯仿、NaCl、水饱和酚、CaCl2、无水乙醇、异丙醇等。2.1.5 引物2.1.6溶液和缓冲液 2上样缓冲液:0.25 M Tris-HCl, pH 6.8,4% SDS,20%甘油,痕迹量溴
12、酚蓝 乙酰丁香酮:浓度为100 mM,在二甲基亚砜 (DMSO)中溶解 拟南芥侵染液:侵染液加入5%蔗糖,0.03-0.05% Silwet L-77 质粒提取溶液的配制:(1)STE缓冲液:包括0.1M NaCl,10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA。(2)Solution I包括50 mM Glucose,25 mM Tris-Cl(pH8.0),10 mM EDTA(pH8.0)。灭菌后,4保存。(3)Solution II包括0.2 M NaOH,1%SDS。需新鲜配制。 (4)Solution III(100 mL)包括5 M KAC 60 mL,HAC 11.5 mL,
13、ddH2O 28.5 mL。-20保存。 (5)TE溶液包括10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA。2.2 实验方法2.2.1 CTAB法提取RNA本实验步骤均需在冰上进行。1)取5g左右新鲜材料,放入提前处理好的无RNA酶的研钵中,液氮研磨后放入预先冷冻的50ml 离心管中。 2)将提取液预热到65,加入10ml预热好的提取液,涡旋均匀后,放入65水浴锅中30分钟;CTAB法RNA提取缓冲液:25 mmolL-1 EDTA(pH=8.0)、2%(w/v)CTAB、100 mmolL-1 Tris-HCl(pH=8.0)、2%(v/v)-巯基乙醇、2%(w/v)PVPK30、2.0
14、molL-1 NaCl。3)水浴之后加入等体积10ml水饱和酚和氯仿异戊醇(24:1),振荡30分钟,之后4离心机里、12,000 rpm条件下,离心15 min;取上清液,加入等体积10ml水饱和酚和氯仿异戊醇(24:1)再抽提一次。4)取上清,加入1/5体积4预冷的10 mol/L LiCl,4放置过夜。5)4离心机,12000 rpm条件下,离心20 min,弃去上清,70%乙醇洗涤两次。6)配制SSTE缓冲液1 mol/L NaCI、10mmol/L EDTA、0.5%(w/v)SDS用DEPC处理过的水定容到10 ml。7)500 l SSTE溶解沉淀,加入1.5 ml的离心管中,放
15、在冰上,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1,250 l)和水饱和酚(250 l)提取,离心10min,4、10,000rpm。8)取上清液,加入2.5倍体积的4放置的无水乙醇,-80沉淀1-2小时。9)用70%乙醇洗涤2次。10)4离心机,12000 rpm条件下,离心15 min,风干二到三分钟,加入30l DEPC处理水溶解RNA11)存放于-80。2.2.2 Trizol法提取RNA利用Trizol试剂盒提取苹果王林愈伤组织RNA,具体方法如下: 1)在1.5 mL Eppendorf 管中加入1 mL的Trizol试剂。 2)称取约100 mg的植物材料,液氮研磨,转至上述Eppend
16、orf管中。漩涡震荡混匀,室温静置5 min。 3)去除蛋白、脂肪,离心,12000g,10min,4,取上清。 4)分相A.加入200uL的氯仿,剧烈震荡15秒,在室温下静置2-3 min。B.12000g,离心10 min(勿超过12000g),4。 5)沉淀、去除多糖。 6)取上清(大约原初Trizol体积的60%,约600 L至一新的Eppendorf管中,切勿将中间杂质吸收到。 7)加0.25 mL异丙醇,0.25 mL高盐溶液,颠倒混匀,室温静置10 min。 8)离心10 min,12000 g(勿超过12000g),4,倾去上清。 9)清洗。离心机离心轻甩,加1mL预冷的70%
17、乙醇漂洗沉淀。 10)离心3min,12000g,4。 11)吸净乙醇,37挥发乙醇5min。切勿干燥彻底。 12)加适量的DEPC处理的ddH2O(一般20L),枪打数次溶解。如想彻底溶解RNA可置于55-60溶解5min。迅速冰浴3min,稍离心。 13)RNA提取完成后取1mL稀释至100mL,测定OD值,计算RNA浓度。然后再取2-4mg的总RNA电泳,鉴定RNA的完整性。2.2.3 RNA含量与纯度检测吸取1L总RNA溶液加入到100L水中,混匀后,吸取1L用Nanodrop进行测定,在A260/A280条件下测定溶液中RNA浓度(gml-1),结果乘以100得溶液中RNA浓度。2.
18、2.4 植物RNA的纯化(除DNA)方法利用去DNA试剂盒PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser去除植物总RNA中的基因组DNA。1)冰上操作,在0.5ml 无RNA酶的离心管中加入如下反应体系:5gDNA Eraser Buffer 2lgDNA Eraser1lTotal RNA1-2lRNase free ddH2OUp to 10l2) 42反应2min。3)4保存。2.2.5 反转录cDNA第一链的合成1)配制下列混合液:Oligo dT Primer (50uM) or Random 6 mers (50uM)1uL *1dNTP M
19、ixture (10mM each)1uL Total RNA (or Poly(A)+ RNA)Xug RNase free ddH2Oup to 10ul2) PCR仪上进行如下的反应:65,5min,然后放到冰上急冷。3) 在反应完的体系中继续配制另一反应液。上述变性、退火后反应液10uL5PrimeScriptTM Buffer4uLRNase Inhibitor (40 U/ul)0.5uLPrimeScriptTM RTase (200 U/ul)1uLRNase Free ddH2O4.5uLTotal20uL4)在PCR仪上按下列条件进行反转录反应:30 10min;42(50
20、),60min;70,15min;4。稍离心,保存于-20。2.2.6基因扩增使用25L反应体系,具体如下:cDNA模板1-2L;10PCR buffer(含Mg2+)2.5L;dNTP(2.5mM)2L;上游引物F(10M)和下游引物R(10M)各1L;Easy-Taq酶0.25L;ddH2O补齐至25L。反应体系应根据引物的退火温度以及目的片段的长度来设定。反应结束后,进行琼脂糖凝胶电泳,检测扩增条带是否为目的条带,大小合适切胶回收。2.2.7 PCR产物的回收在实验中目的片段的回收利用试剂盒TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit 1)
21、PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,电泳时使用新鲜的电泳缓冲液,在紫外线照射下快速切胶,置于离心管中;2) 将500l Buffer GM加入离心管中,室温放置融化胶块,期间应不间断震荡,以使胶块融化;3) 胶块完全融化后,观察期颜色,若是溶液呈橙色或粉色,则加入10l 3M醋酸钠溶液,使溶液恢复为黄色;4) 将Spin Column安置在Collection Tube上;5) 将融化好的溶液转移到上述Spin Column中,12,000rpm离心1min;6) 将离心下的液体重新倒入Spin Column中进行再次离心,12,000rpm离心1min后弃废液;7) 加入700l GW在12,00
22、0rpm条件下离心1min;8) 重复上述过程;9) 将废液弃掉,干燥1-2min;10)12,000rpm条件下离心1min。2.2.8连接反应 将目的基因连接到pMD18-T载体。pMD18-T载体来自Takara,插入片段与载体的摩尔数比为5-10:1,将反应体系混匀,置于16水浴锅中反应过夜连接,然后4保存。切胶回收产物2.0mLSolution I5.0mLpMD18-T Vector(50 ng)1.0mLddH2O2.0mL总体积10.0mL2.2.9大肠杆菌感受态细胞的转化 1) 将大肠杆菌感受态细胞从-70冰箱中取出,置于冰上。 2) 在超净工作台上进行转化反应,一般回收产物
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