基因克隆简介ppt课件.ppt
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1、采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物基因克隆简介基因克隆简介 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物一一. DNA分子克隆的基本原理分子克隆的基本原理v基
2、因克隆(基因克隆(gene cloning)或分子克隆或分子克隆,又称为重组又称为重组技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的的DNA分子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子通过酶切、连接等操作重新组装成杂合分子,并使之在适当的宿主细胞中进行扩增,形成分子,并使之在适当的宿主细胞中进行扩增,形成大量的子代大量的子代DNA分子的过程。分子的过程。v克隆(克隆(clone)一指含有单一的一指含有单一的DNA重组体的无性重组体的无性繁殖系,或指将繁殖系,或指将DNA重组体引入宿主细胞建立无性重组体引入宿主细胞建立无性繁殖系的过程繁殖系的过程(cloning)。
3、 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物一个完整的基因克隆过程包括以下步骤一个完整的基因克隆过程包括以下步骤 v.获得待克隆的获得待克隆的DNA片段(基因);片段(基因);.目的基因与载体在体外连接;目的基因与载体在体外连接;.重组重组DNA分子导入宿主细胞;分子导入宿主细胞;.筛选、鉴定阳性重组子;筛选、鉴定阳性重组子;.重组子的扩增与或表达。重组子的扩增与或表达。采用采用
4、PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1. 从生物有机体基因组中,分离出带有目的基因从生物有机体基因组中,分离出带有目的基因的的DNA片段。片段。2. 将带有目的基因的外源将带有目的基因的外源DNA片段连接到能够自片段连接到能够自我复制的并具有选择记号的载体分子上,形成重我复制的并具有选择记号的载体分子上,形成重组组DNA分子。分子。3. 将重组将重组DNA分子转移到适当的受体细胞(
5、亦称分子转移到适当的受体细胞(亦称寄主细胞)并与之一起增殖。寄主细胞)并与之一起增殖。4. 从大量的细胞繁殖群体中,筛选出获得了重组从大量的细胞繁殖群体中,筛选出获得了重组DNA分子的受体细胞,并筛选出已经得到扩增的分子的受体细胞,并筛选出已经得到扩增的目的基因。目的基因。5. 将目的基因克隆到表达载体上,导入寄主细胞,将目的基因克隆到表达载体上,导入寄主细胞,使之在新的遗传背景下实现功能表达,产生出人使之在新的遗传背景下实现功能表达,产生出人类所需要的物质。类所需要的物质。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边
6、旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物二二. 用于基因克隆的工具酶用于基因克隆的工具酶 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持
7、熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1.1、限制酶概念提出的背景、限制酶概念提出的背景 20世纪世纪30年代,微生物学家发现,微生物的噬菌体年代,微生物学家发现,微生物的噬菌体不能交叉感染,如不能交叉感染,如E coli K株的噬菌体只能感染株的噬菌体只能感染E coli K株,不能感染其他株,反之亦然。这种现象称为株,不能感染其他株,反之亦然。这种现象称为“限制现象限制现象”。 1962年,年,WArber提出一个假设来解释上述现象提出一个假设来解释上述现象。他认为这是细菌中有。他认为这是细菌中有2种以上功能不同的酶,
8、一种是种以上功能不同的酶,一种是核酸内切酶,能识别并切断外来核酸内切酶,能识别并切断外来DNA分子的某些部位分子的某些部位,使外来,使外来DNA失去活性,限制外来噬菌体的繁殖,另失去活性,限制外来噬菌体的繁殖,另一种是修饰酶,可对自生的一种是修饰酶,可对自生的DNA进行修饰。进行修饰。1. DNA限制性内切酶限制性内切酶采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物 能识别并切断外来
9、能识别并切断外来DNA分子的某些部位,使外来分子的某些部位,使外来DNA失去活性,限制外来噬菌体的繁殖,把这类酶称失去活性,限制外来噬菌体的繁殖,把这类酶称为为限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1.2、限制性核酸内切酶的限制性核酸内切酶的命名原则命名原则 限制酶的命名是采用限制酶的命名是采用Smith和和Athens提议的方案,提议的方案
10、,即名称的即名称的第个第个1字母取自它来源细菌属名的第字母取自它来源细菌属名的第1个字个字母,大写;第母,大写;第2,3二个字母取自它来源细菌的种名二个字母取自它来源细菌的种名的头的头2个字母,小写;如果它的来源菌还有株系,则个字母,小写;如果它的来源菌还有株系,则有第有第4个字母;最后用大写罗马数字,个字母;最后用大写罗马数字,代表同一菌株代表同一菌株中不同限制酶的编号。前三个字母用斜体表示。中不同限制酶的编号。前三个字母用斜体表示。 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位
11、干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物EcoR IEscherichia属名属名Coli种类种类Ry13株系株系编号编号 若种名头若种名头2 2个字母相同则其中一个可用种名的个字母相同则其中一个可用种名的第一和第三个字母。第一和第三个字母。如如Hind 代表从流感噬血杆菌代表从流感噬血杆菌(Haemophilus influenzac) d株中分离到的第株中分离到的第3个限制酶。个限制酶。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度
12、,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1.3、限制性核酸内切酶的限制性核酸内切酶的分类分类 根据其识别和切割序列的特性、催化条件及修饰根据其识别和切割序列的特性、催化条件及修饰活性等,一般将限制酶分为活性等,一般将限制酶分为I, 三大类。三大类。 I 类:不适用于基因工程。只在肠道菌中发现。类:不适用于基因工程。只在肠道菌中发现。类:基因工程的工具酶。类:基因工程的工具酶。类:切割位点不在识别位点,一般离识别位点类:切割位点不在识别位点,一般离识别位点25 bp27 bp,对分子克隆操作亦无实用意义。,对分子克隆操作
13、亦无实用意义。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物首先由首先由H.O. Smith和和K.W. Wilcox在在1970年从流年从流感嗜血菌中分离出来。感嗜血菌中分离出来。(1)识别位点序列)识别位点序列未甲基化修饰未甲基化修饰的的双链双链DNA上的特殊靶序列(多上的特殊靶序列(多数是回文序列)。数是回文序列)。与与DNA的来源无关。的来源无关。1.4 II类限制性内切酶类
14、限制性内切酶 分离的第一个酶是分离的第一个酶是 Hind 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物(2)切割位点)切割位点切开切开双链双链DNA。形成。形成粘性末端粘性末端(sticky end)或)或平齐末端平齐末端(blunt end)。如:)。如:从识别位点处从识别位点处 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂
15、直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物(3)粘性末端()粘性末端(sticky ends,cohensive ends)含有几个核苷酸含有几个核苷酸单链单链的末端。的末端。GAATTC CTTAA GG AATTCCTTAAG5-33-55-33-5采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口
16、面的圆度,保持熔接部位干净无污物 连接便利连接便利(4)粘性末端的意义)粘性末端的意义i)不同的)不同的DNA双链:双链:只要粘性末端碱基互补就可以连接。只要粘性末端碱基互补就可以连接。ii)同一个)同一个DNA分子内连接:分子内连接:通过两个相同的粘性末端可以连接成通过两个相同的粘性末端可以连接成环环形分子形分子。这比连接两个平齐末端容易的多。这比连接两个平齐末端容易的多。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保
17、证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物2. DNA 连接酶连接酶从细菌从细菌DNA环化现象推测,必定存在一种能环化现象推测,必定存在一种能把两条把两条DNA双链连接到一起的酶。双链连接到一起的酶。3.1 DNA连接酶(连接酶(ligase)的发现的发现DNA复制一定有断口。复制一定有断口。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件
18、:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物(1)大肠杆菌连接酶)大肠杆菌连接酶1. 两种两种DNA连接酶连接酶只能连接只能连接粘性末端粘性末端。3.2 DNA ligase的特点的特点(2)T4噬菌体的连接酶噬菌体的连接酶不但能连接粘性末端,不但能连接粘性末端,还能连接还能连接齐平末端齐平末端。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口
19、面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物(1)必须是两条)必须是两条双链双链DNA。(2)DNA3端有游离的端有游离的-OH, 5端有一个磷酸基团端有一个磷酸基团(P)。)。(3)需要)需要能量能量动物或噬菌体中:动物或噬菌体中:ATP大肠杆菌中:大肠杆菌
20、中: NAD+ +2. 连接条件连接条件采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物 基因载体是一类能自我复制的基因载体是一类能自我复制的DNADNA分子,其中的一分子,其中的一段段DNADNA被切除而不影响其复制,可用以置换或插入外被切除而不影响其复制,可用以置换或插入外源源( (目的目的) DNA) DNA而将目的而将目的DNADNA带入宿主细胞。带入宿主细胞。 三三. 分子克
21、隆的载体分子克隆的载体采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物v载体具以下特征:载体具以下特征:v1) 具有自主复制能力;具有自主复制能力;v2)有可选择的标记基因(如,抗药基因)有可选择的标记基因(如,抗药基因)v3)有多种限制酶切点,每种限制酶最好只有单一)有多种限制酶切点,每种限制酶最好只有单一切点;切点;v4)分子量小,便于携带较大的)分子量小,便于携带较大的DNA片段
22、,能进入片段,能进入宿主细胞并在其中增殖;被切割后的载体,插入外宿主细胞并在其中增殖;被切割后的载体,插入外源源DNA后,不影响其复制能力后,不影响其复制能力5)使用安全。克隆载体应只存在有限范围的宿主,)使用安全。克隆载体应只存在有限范围的宿主,在体内不进行重组,不发生转移,不产生有害性状,在体内不进行重组,不发生转移,不产生有害性状,并且不能离开宿主自由扩散。并且不能离开宿主自由扩散。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边
23、剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物polylinkerv常用的载体有:质粒,常用的载体有:质粒,噬菌体,粘粒,病噬菌体,粘粒,病毒,毒,BAC,YAC等。等。采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1.1.质粒质粒(plasmid(plasmid )载体载体 Plasmid Plasmid 独立于细菌染色体外的双链环独立于细菌染色体外的双链环DNADNA分子。
24、分子。 Plasmid chromosome 采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物1 1、质粒是细菌染色体外能、质粒是细菌染色体外能自主复制自主复制的的环形双链环形双链DNADNA分子。分子。2 2、编码、编码抗菌素抗性基因抗菌素抗性基因的质粒叫的质粒叫R R质粒。质粒。3 3、根据每个寄主细胞中质粒拷贝数的多少,把质、根据每个寄主细胞中质粒拷贝数的多少,把质粒分为粒分为严
25、紧型复制质粒严紧型复制质粒(拷贝数少,为(拷贝数少,为1-51-5个)与个)与松弛型复制质粒松弛型复制质粒(拷贝数多,可达(拷贝数多,可达10-20010-200个拷贝)。个拷贝)。4 4、质粒的、质粒的不亲和性不亲和性:两种亲缘关系密切的不同质:两种亲缘关系密切的不同质粒,不能够在同一个寄主细胞系中稳定地共存的现粒,不能够在同一个寄主细胞系中稳定地共存的现象。象。1) 质粒的一般生物学特性质粒的一般生物学特性采用采用PP管及配件:根据给水设计图配置好管及配件:根据给水设计图配置好PP管及配件,用管件在管材垂直角切断管材,边剪边旋转,以保证切口面的圆度,保持熔接部位干净无污物管及配件,用管件在
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