DNA复制生物化学ppt课件.ppt
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1、2022-8-61第三篇第三篇基因信息的传递基因信息的传递Biochemistry DepartmentDepartment of Basic Medical SciencesHangzhou Normal UniversityGuyisheng(flow of gene information)杭 医2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【2】基因基因(gene):为生物活性产物(蛋白质或各种RNA)编码的DNA功能片段。基因表达基因表达(gene expression):基因转录与翻译的过程。中心法则:中心法
2、则:复制DNA转 录RNA翻 译蛋白质逆转录基因的信息传递基因的信息传递2022-8-63第十章第十章生物化学BiochemistryDNA的生物合成(复制)的生物合成(复制)( DNA Biosynthesis,Replication )2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【4】第一节第一节 复制的基本规律复制的基本规律(Basic Rules of DNA Replication) l复制的方式半保留复制(semi-conservative replication)l复制的高保真性(high fidelit
3、y) l双向复制(bidirectional replication)l半不连续复制(semi-discontinuous replication)2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【5】一、半保留复制一、半保留复制(semiconservative replication)(一)概念(二)实验依据:密度梯度实验(三)生物学意义: 1.保证遗传信息传递的忠实性 2.遗传和变异的统一2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【6】DN
4、A的生物合成(复制)的生物合成(复制)遗传信息从亲代DNA传递到子代DNA分子上,称为复制。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【7】2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【8】DNA复制的最主要特征半保留复制:DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱
5、基序列一致。这种复制方式称为半保留复制半保留复制。半半 保保 留留 复复 制制2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【9】AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA 2022-8-6 Department of
6、Biochemistry,Hangzhou Medical College【10】半保留复制的意义半保留复制的意义uDNA的半保留复制保证了DNA在代谢上的稳定性,经过许多代的复制,DNA多核苷酸链仍可保持完整,存在于后代而不被分解,这种稳定性体现了DNA遗传过程的相对保守性。u遗传的保守性是相对的,而不是绝对的。自然界还 存在着普遍的变异现象。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【11】二、双向复制二、双向复制(bidirectional replication)u原核生物复制时,DNA从起始点(origin
7、)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【12】原核生物原核生物DNA的双向复制的双向复制oriterA B CA. 环状双链DNA及复制起始点B. 复制中的两个复制叉C. 复制接近终止点(termination, ter)2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【13】真核生物真核生物DNA的双向复制的双向复制u真核生物每个染色体
8、有多个起始点,是多复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个复制子(replicon) 。复制子是独立完成复制的功能单位。53oriorioriori532022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【14】真核生物的真核生物的多复制子多复制子形式形式53oriorioriori535533553复制子复制子32022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【15】三、半不连续复制三、半不连续复制(semi-discontinuous r
9、eplication)u顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链领头链。u另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链随从链。复制中的不连续片段称为岡崎片段岡崎片段(okazaki fragment)。 u领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【16】半不连续复制图解半不连续复制图解3 5 3 5 解链方向解链方向3 5 3 3 5 领头链领头链(leading strand)随从链随从链(l
10、agging strand)2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【17】四、需要四、需要RNA引物引物(primer)uDNA聚合酶不能直接聚合游离的dNTP,必须由一段核酸片段提供3OH末端。u由引物酶催化,由NTP为原料,合成RNA引物。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【18】第二节第二节 DNA复制的酶学复制的酶学(The Enzymology of DNA Replication)复制是在酶催化下的核苷酸聚合过程,需
11、要多种复制是在酶催化下的核苷酸聚合过程,需要多种物质参与物质参与:u底物:dNTP:dATP、dGTP、dCTP、dTTPu聚合酶:依赖DNA的DNA聚合酶u模板:解开成单链的DNA母链u引物:RNA,提供3-OH末端,使dNTP可以依次聚合u其他酶和蛋白因子:解螺旋酶、拓朴异构酶、引物酶、DNA连接酶、单链结合蛋白等2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【19】一、复制的化学反应一、复制的化学反应(形成磷酸二酯键)(形成磷酸二酯键)u新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 3 方向进行方向进行(dNMP)n + d
12、NTP (dNMP)n+1 + PPi 2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【20】全称:依赖DNA的DNA聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase)(DNA-pol,DDDP)催化活性: 53 的聚合活性 核酸外切酶活性二、 DNA 聚合酶聚合酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【21】 聚合酶I:对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。 聚合酶II:在无聚合酶I、III时起作用,功
13、能未完全搞清楚。参与DNA损伤的应急状态修复。 聚合酶III*:复制延长时真正催化新链核苷酸聚合的酶。(一)原核生物的(一)原核生物的DNA聚合酶聚合酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【22】 聚合酶*:在复制过程中起重要作用。具有引物酶活性。 聚合酶:参与低保真度复制(相当于原核生物DNA-pol II )。 聚合酶:存在于线粒体,参与线粒体DNA复制。 聚合酶*:在复制中起主要作用,延长子链(相当于原核生物的DNA-pol III) 。有解螺旋酶活性。 聚合酶:在复制中起校读、修复和填补缺口的作用(相当
14、于原核生物DNA-pol I )。(二)真核生物的(二)真核生物的DNA聚合酶聚合酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【23】DNA聚合酶除了有催化53核苷酸聚合的作用外,还有核酸外切酶活性。外切酶有方向性方向性:从5-端或3 -端把核苷酸从核酸链上水解下来。DNA聚合酶I有两种方向的外切酶活性。DNA聚合酶I活性较强,在复制过程中能辨认错配的碱基并加以切除。DNA聚合酶III只有3 5 外切酶活性。(三)核酸外切酶活性(三)核酸外切酶活性2022-8-6 Department of Biochemistry
15、,Hangzhou Medical College【24】DNA复制的保真性主要依赖三种机制:1、遵守严格的碱基配对规律 AT、CG2、聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能3、复制出错时有即时的校读功能 聚合酶III有35 核酸外切酶活性三、三、DNA复制的保真性复制的保真性2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【25】四、复制中的解链及四、复制中的解链及DNA 分子拓扑学变化分子拓扑学变化与DNA解旋和解链有关的酶和蛋白质: 解螺旋酶(helicase)等 DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase)
16、单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein,SSB) 引物酶(primase)2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【26】解螺旋酶的作用是利用ATP供能来解开DNA双链。DnaB蛋白-解螺旋酶DnaA蛋白-识别复制起始点DnaC蛋白-辅助解螺旋酶,使其( DnaB )在起始点上结合并打开双链(一)(一)DNA的解链的解链2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【27】DNA双螺旋链在复
17、制过程中旋转速度很快,易造成DNA分子打结、缠绕、连环现象。复制末期,母链DNA与新合成链也会相互缠绕,形成打结或连环。拓扑异构酶分为I型和II型两种。拓扑异构酶对DNA的作用是既能水解,又能连接磷酸二酯键。使复制中的DNA能解结,达到适度盘绕。(二)二)DNA 拓扑异构酶拓扑异构酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【28】作用机制:作用机制:拓扑异拓扑异构酶构酶 切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。 反应不需ATP。拓扑异拓扑异构酶构酶 切断DNA分子两股
18、链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。 利用ATP供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【29】 SSB的作用是在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整(免受核酸酶降解)。 SSB与DNA的结合具有协同效应(三)单链(三)单链DNA结合蛋白(结合蛋白(SSB)2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【30】DNA聚合酶没有催化两个游离dNTP聚合的能力。因此,复制是在RNA引物的基础上加进
19、脱氧核苷酸的。催化引物合成的是一种RNA聚合酶,它不同于转录过程的RNA聚合酶,所以称为引物酶(DnaG蛋白)。复制起始时,DnaA、 DnaB、 DnaC蛋白,还有其他复制因子,一起形成复合体,结合引物酶,形成较大的聚合体,再结合到模板DNA上,这种复合物称为引发体引发体。(四)引物酶和引发体(四)引物酶和引发体2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【31】DNA连接酶连接DNA链3-OH末端和相邻DNA链的5 -P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连成完整的链。复制中模板链是连续的,新链分段
20、合成,是不连续的,最后留有缺口,要靠连接酶接合。连接酶的催化作用需要消耗ATP。五、五、DNA 连接酶连接酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【32】连接酶的功能连接酶的功能DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。 在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。 也是基因工程的重要工具酶之一。2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【33】DNA聚合酶,拓扑酶和连接酶聚合酶,拓扑酶和连接酶催化催化3 ,5 -磷酸二酯键生成的比较磷
21、酸二酯键生成的比较提供核糖提供核糖3 -OH提供提供5 -P结果结果DNA聚合酶聚合酶引物或延长中的引物或延长中的新链新链游离游离dNTP去去PPi(dNTP)n+1连接酶连接酶复制中不连续的两条单链复制中不连续的两条单链不连续不连续连续链连续链拓扑酶拓扑酶切断、整理后的两链切断、整理后的两链改变拓扑状态改变拓扑状态2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【34】DNA合成从固定的起始点开始,同时向两个方向进行复制。(双向复制)真核生物的染色体庞大、复制,有多个复制起始点,同时形成许多复制的单位,两个起始点之间的D
22、NA片段,称为一个复制子复制子。复制是连续的过程,为描述方便,把它分为起始、延长、终止起始、延长、终止三个阶段。第三节第三节 DNA生物合成过程生物合成过程The Process of DNA Replication2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【35】(一)复制的起始(一)复制的起始:1、DNA解链 形成复制叉 DnaA、 DnaB、 DnaC蛋白、SSB等参与。2、形成引发体,合成引物 引发体的蛋白质部分在DNA链上可以移动,并需要ATP供给能量。引发体到达适当位置就可按照模板的配对序列,催化NTP的
23、聚合,生成引物。提供3-OH末端。一、原核生物一、原核生物DNA的合成过程的合成过程2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【36】DNA解链解链E.coli复制起始点复制起始点 oriC GATTNTTTATTT GATCTNTTNTATT GATCTCTTATTAG 1 13 17 29 32 1 13 17 29 32 44 44 TGTGGATTA-TTATACACA-TTTGGATAA-TTATCCACA58 66 166 174 201 209 237 24558 66 166 174 201 209
24、237 245 串联重复序列串联重复序列 反向重复序列反向重复序列5 3 5 3 2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【37】引发体和引物引发体和引物u含有解螺旋酶、含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和蛋白、引物酶和DNA复复制起始区域的复合结构称为引发体。制起始区域的复合结构称为引发体。 Dna A Dna B、 Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶SSB3 5 3 5 2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【38】
25、引物生成引物生成u引物是由引物酶催化合成的短链引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。分子。3 5 3 5 引物引物3 HO5引物引物酶酶2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical College【39】1、脱氧单核苷酸(dNTP)逐个加入而延长DNA新链,其化学反应本质是生成磷酸二酯键。催化此反应的酶,在原核生物为DNA-polIII,真核生物为DNA-pol和。 新链延长的方向:53(二)复制的延长(二)复制的延长2022-8-6 Department of Biochemistry,Hangzhou Medical Colle
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