生物化学知识点总结ppt课件.ppt
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1、我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物生物化学知识点总结生物化学知识点总结我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物第一章第一章 蛋白质化学蛋白质化学1、氨基酸的分类:、氨基酸的分类: 生物体中的生物体中的氨基酸氨基酸常见蛋白质氨基酸(常见蛋白质氨基酸(20种)种)不常见蛋白质氨基酸不常见蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?
2、但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物蛋白质氨基酸按侧链蛋白质氨基酸按侧链R R基的极性分为:基的极性分为:我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物记住:记住:20种蛋白质氨基酸的结构式,三字母符号种蛋白质氨基酸的结构式,三字母符号。例题:例题:1、请写出下列物质的结构式:、请写出下列物质的结构式: 赖氨酸,组氨酸,谷氨酰胺。赖氨酸,组氨酸,谷氨酰胺。 2、写出下列缩写符号的中文名称:、写出下列缩写符号的中文名称: Ala Glu Asp Cys 3、是非题:、是非题: 1)天然
3、氨基酸都有一个不对)天然氨基酸都有一个不对称碳原子。称碳原子。 2)自然界的蛋白质和多肽类物质均由)自然界的蛋白质和多肽类物质均由L氨氨基酸组成。基酸组成。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物2、氨基酸的酸碱性质、氨基酸的酸碱性质Henderson-Hasselbalch方程:方程:pH=pKa + lg 质子受体质子受体 质子供体质子供体 例题:例题:1、Henderson-Hasselbalch方程方程为为 。 2、当溶液中的、当溶液中的pH值大于某一可解离值大于某一可解离的的pKa值时,该
4、基团有一半以上被解离。值时,该基团有一半以上被解离。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物3、氨基酸的等电点(、氨基酸的等电点(pI):使氨基酸处于):使氨基酸处于净净电荷为零时电荷为零时的的pH。对于对于R基不解离和酸性氨基酸:基不解离和酸性氨基酸:pI=1/2(pK1+pK2)对于碱性氨基酸:对于碱性氨基酸:pI=1/2(pK2+pK3)我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物4、紫外光谱性质:三种
5、氨基酸具有紫外吸收、紫外光谱性质:三种氨基酸具有紫外吸收性质。最大吸收波长:酪氨酸性质。最大吸收波长:酪氨酸275nm;苯丙氨酸苯丙氨酸257nm;色氨酸;色氨酸280nm。一般考选择题或填空题。一般考选择题或填空题。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物5、化学反应:、化学反应: 与氨基的反应与氨基的反应:酰基化反应酰基化反应 氨基酸与氨基酸与 5 5一二甲氨基萘一二甲氨基萘-1-1-磺酰氯磺酰氯(dansyl chloride,DNS)的反应的反应 烃基化反应烃基化反应 与与2 2、4 4一二
6、硝基氟苯的反应一二硝基氟苯的反应 , ,与苯异硫氰酸(酯)的反应与苯异硫氰酸(酯)的反应 与羧基的反应与羧基的反应:成盐和成酯反应(保护羧:成盐和成酯反应(保护羧基);成酰氯反应和叠氮反应(活化羧基)基);成酰氯反应和叠氮反应(活化羧基)氨基和羧基共同参加的反应氨基和羧基共同参加的反应:与茚三酮反与茚三酮反应应,成肽键反应,成肽键反应我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物离子交换树脂离子交换树脂 阳离子交换树脂阳离子交换树脂:可以解:可以解 离出离出H+与混合物中的阳离子与混合物中的阳离子交换,使
7、之吸附在树脂上。交换,使之吸附在树脂上。阴离子交换树脂阴离子交换树脂:可以解:可以解离出离出OH-与混合物中的阴离与混合物中的阴离子交换,使之吸附在树脂子交换,使之吸附在树脂上上氨基酸在相同氨基酸在相同pH值所带电荷数目不同,可以用值所带电荷数目不同,可以用这种方法分离,在吸附到树脂上后,再改变洗脱这种方法分离,在吸附到树脂上后,再改变洗脱液的液的pH值和盐浓度将氨基酸从树脂上洗脱下来。值和盐浓度将氨基酸从树脂上洗脱下来。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物6、蛋白质的结构层次、蛋白质的结构层次
8、一级(一级(10)结构()结构(primary structure):指多肽链中以肽键相连的氨基酸序列。:指多肽链中以肽键相连的氨基酸序列。 二级(二级(20)结构()结构(secondary structure):指多肽链借助氢键排列成一些规则片断,:指多肽链借助氢键排列成一些规则片断,螺旋,螺旋,-折叠,折叠, -转角及无规则卷曲。转角及无规则卷曲。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物 三级(三级(3 30 0)结构()结构(tertiary structuretertiary struct
9、ure):指多肽链借助各种非共价键在二级结构的:指多肽链借助各种非共价键在二级结构的基础上进一步弯曲,折叠成具有特定走向基础上进一步弯曲,折叠成具有特定走向的紧密球状构象。的紧密球状构象。 四级(四级(4 40 0)结构)结构(quaternary struture)(quaternary struture):指寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相:指寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系和结合方式。互关系和结合方式。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物7、维持蛋白质各级结构的作用力:、维持蛋白
10、质各级结构的作用力:一级结构一级结构:肽键:肽键二,三,四级结构二,三,四级结构:氢键,范德华力,疏水:氢键,范德华力,疏水作用力,离子键和二硫键。作用力,离子键和二硫键。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物 肽平面(酰胺平面)肽平面(酰胺平面):参与肽键的:参与肽键的6个原子个原子被约束于一个平面上,与此相应的被约束于一个平面上,与此相应的-C-CO-NH-C-则称为肽单元。则称为肽单元。 肽的化学反应:双缩脲反应(产生蓝紫色物肽的化学反应:双缩脲反应(产生蓝紫色物质)质)我吓了一跳,蝎子是多
11、么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物测定多肽链的数目测定多肽链的数目拆分多肽链拆分多肽链断开多肽链内的二硫键断开多肽链内的二硫键测定每一肽链的氨基酸组成测定每一肽链的氨基酸组成鉴定多肽链的鉴定多肽链的N-末端和末端和C-末端末端裂解多肽链为较小的肽段裂解多肽链为较小的肽段测定各肽段的氨基酸序列测定各肽段的氨基酸序列利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构确定二硫键的位置确定二硫键的位置8、蛋白质一级结构的测定(、蛋白质一级结构的测定(9步)步)我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什
12、么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物酶裂解法:酶裂解法: 蛋白水解酶可以用于肽链的断裂。蛋白水解酶可以用于肽链的断裂。 最常用的酶:最常用的酶:胰蛋白酶胰蛋白酶,胰凝乳蛋胰凝乳蛋白酶(糜蛋白酶)白酶(糜蛋白酶),胃蛋白酶胃蛋白酶,嗜热嗜热菌蛋白酶菌蛋白酶,梭菌蛋白酶梭菌蛋白酶等等。等等。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物胰蛋白酶:胰蛋白酶: Lys和和Arg羧基所参加的反应羧基所参加的反应糜蛋白酶:糜蛋白酶:Phe,Tyr,Trp羧基端肽
13、键。羧基端肽键。梭菌蛋白酶:梭菌蛋白酶: Arg的羧基端的羧基端溴化氰:溴化氰:只断裂只断裂Met的羧基形成的肽键。的羧基形成的肽键。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物 螺旋结构要点:螺旋结构要点: (1)螺旋的每圈有)螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转,每个残基沿轴旋转100,上升,上升0.15nm。 (2)第)第n个肽键的羰基氧与远在第(个肽键的羰基氧与远在第(n+4)个氨基酸)个氨基酸氨基上的氢形成链内氢键(氨基上的氢形成链内氢键
14、(hydrogen bond),氢键),氢键的走向平行于螺旋轴,所有肽键都能参与链内氢键的的走向平行于螺旋轴,所有肽键都能参与链内氢键的形成。形成。R基伸向螺旋的外侧。基伸向螺旋的外侧。 (3)螺旋中每个)螺旋中每个-C-C的的和和分别在分别在4747和和5757。 (4)99是右手螺旋。是右手螺旋。 我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物超二级结构超二级结构(super-secondary structure):):由若由若干相邻的二级结构元件(主要是干相邻的二级结构元件(主要是螺旋螺旋和和折叠
15、折叠)组合在一起,彼此相互作用,)组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的有规则的二级结构组合形成种类不多的有规则的二级结构组合(combination)或二级结构串()或二级结构串(cluster)我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物结构域:结构域: 结构域是多肽链在二级结构或超二级结构结构域是多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是一个相对独立的紧密球状实体是一个相对独立的紧密球状实体我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么
16、把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物10080氧分压氧饱和度60609012015030氧合曲线氧合曲线血红蛋白氧合曲线血红蛋白氧合曲线肌红蛋白氧合曲线肌红蛋白氧合曲线我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物 波耳效应:波耳效应:当当H+离子浓度增加时,离子浓度增加时,pH值下降,氧饱和度右移,这种值下降,氧饱和度右移,这种pH对血红蛋对血红蛋白对氧的亲和力影响被称为波耳效应白对氧的亲和力影响被称为波耳效应(Bohr效应)。效应)。我吓了一跳,蝎
17、子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物第二章 核酸化学1、核苷酸:、核苷酸: 四种碱基的结构式,四种核苷酸的结构式,四种碱基的结构式,四种核苷酸的结构式,四种脱氧核苷酸的结构式,假尿嘧啶核苷四种脱氧核苷酸的结构式,假尿嘧啶核苷酸的结构式,环腺苷酸的结构式。酸的结构式,环腺苷酸的结构式。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物2、核酸的一级结构:核苷酸是核酸的基本结、核酸的一级结构:核苷酸是核酸的基本结构单位。核苷酸以
18、磷酸二酯键连接。构单位。核苷酸以磷酸二酯键连接。例题:核酸的基本结构单位是例题:核酸的基本结构单位是 。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物3、DNA的二级结构:双螺旋的二级结构:双螺旋 Watson双螺旋的结构特点,双螺旋类型,双螺旋的结构特点,双螺旋类型,双螺旋的维持力双螺旋的维持力我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物Watson的双螺旋结构要点:的双螺旋结构要点: 1、两条反向的多核苷酸链围
19、绕同一条中心轴呈、两条反向的多核苷酸链围绕同一条中心轴呈右手螺旋盘绕。右手螺旋盘绕。 2、磷酸和脱氧核糖链在螺旋的两侧,碱基在螺、磷酸和脱氧核糖链在螺旋的两侧,碱基在螺旋的中间,两条链的碱基两两配对,旋的中间,两条链的碱基两两配对,A与与T形成两形成两个氢键,个氢键,G与与C形成三个氢键。形成三个氢键。 3、双螺旋直径为、双螺旋直径为2nm,相邻两对碱基垂直距离,相邻两对碱基垂直距离为为0.34nm,每圈螺旋中有,每圈螺旋中有10对碱基每圈螺距为对碱基每圈螺距为3.4nm。 4、在双螺旋的表面形成大、小两个凹槽分别称、在双螺旋的表面形成大、小两个凹槽分别称为大沟、小沟。为大沟、小沟。 5、两条
20、链借碱基之间的氢键和碱基堆积力牢固、两条链借碱基之间的氢键和碱基堆积力牢固的连结起来,维持的连结起来,维持DNA双螺旋结构。双螺旋结构。 我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物DNA双螺旋结构的不同类型:双螺旋结构的不同类型: Watson双螺旋结构被称为双螺旋结构被称为BDNA。除。除此之外还有此之外还有A型和型和Z型等等。型等等。 Z型双螺旋是型双螺旋是左手螺旋。左手螺旋。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边
21、有一个活的生物DNA双螺旋结构的维持力:双螺旋结构的维持力: 氢键氢键 碱基堆积力碱基堆积力 离子键离子键 范德华力范德华力我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物4、tRNA的二级结构和三级结构的二级结构和三级结构 二级结构:三叶草形结构二级结构:三叶草形结构 三级结构:倒三级结构:倒L形。形。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物5、原核生物和真核生物、原核生物和真核生物mRNA的区别的区别 原核生
22、物原核生物mRNA为多顺反子为多顺反子mRNA。真。真核生物核生物mRNA具具5端帽子和端帽子和3端多聚腺苷酸端多聚腺苷酸结构,是单顺反子。结构,是单顺反子。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物6、限制性内切酶:限制性内切酶:在细菌中发现的,具有严在细菌中发现的,具有严格的碱基序列专一性,主要是降解外源的格的碱基序列专一性,主要是降解外源的DNA一类酶。一类酶。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物
23、7、核酸的紫外吸收、核酸的紫外吸收在在260nm处有最大光吸收处有最大光吸收DNA和和RNA的定量测定和纯度测定的定量测定和纯度测定 测定纯度:通过测定测定纯度:通过测定A260/A280的比值的比值鉴定纯度,纯鉴定纯度,纯DNA比值大于比值大于1.8,纯,纯RNA比比值大于值大于2.0 我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物8、 增色效应:增色效应:核酸的光吸收值比核苷酸光核酸的光吸收值比核苷酸光吸收值的和少吸收值的和少3040%,当核酸变性或降解,当核酸变性或降解时光吸收值显著增加(时光吸收值
24、显著增加(增色效应增色效应) 减色效应:减色效应:核酸复性后,光吸收值又回核酸复性后,光吸收值又回复到原有水平(复到原有水平(减色效应减色效应)。)。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物DNA的的Tm值大小与下列因素有关:值大小与下列因素有关:()()DNA的均一性的均一性()()GC之含量之含量 ()介质中的离子强度()介质中的离子强度 我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物9、定糖法、定糖法 原
25、理:根据原理:根据RNA中的核糖,中的核糖,DNA中的脱氧中的脱氧核糖的颜色反应可以对核糖的颜色反应可以对RNA和和DNA进行定量进行定量测定。测定。 DNA的测定用二苯胺法;的测定用二苯胺法;RNA的测定用的测定用地衣酚法。地衣酚法。我吓了一跳,蝎子是多么丑恶和恐怖的东西,为什么把它放在这样一个美丽的世界里呢?但是我也感到愉快,证实我的猜测没有错:表里边有一个活的生物第三章第三章 酶酶1、酶的概念、酶的概念 经典概念经典概念:是一类由活细胞产生的,:是一类由活细胞产生的,具有特殊催化能力,高度专一性的蛋白质。具有特殊催化能力,高度专一性的蛋白质。 目前的定义:目前的定义:是生物体内一类具有催
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