分子生物学第五章基因突变和修复ppt课件.ppt
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1、Chapter 5 Gene mutation and DNA repairing 第五章 基因突变与修复第一节第一节 基因突变基因突变第二节第二节 顺反子和突变互补顺反子和突变互补第三节第三节 突变修复突变修复Mutations can be induced by chemical modification of a base. Mutations change the sequence of DNA突变改变突变改变DNADNA顺序顺序第一节第一节 基因突变基因突变 突变突变mutation: 在基因组的某一特定区域在基因组的某一特定区域核核苷酸序列发生改变苷酸序列发生改变而引起的基因型稳定
2、的可而引起的基因型稳定的可遗传改变。遗传改变。 突变体突变体mutant:带有某一特定突变基因的基:带有某一特定突变基因的基因组、细胞或个体。因组、细胞或个体。 染色体突变和基因突变、基因外突变染色体突变和基因突变、基因外突变一、基因突变的结构一、基因突变的结构 基因突变是指基因的一种等位形式变成另一基因突变是指基因的一种等位形式变成另一种等位形式种等位形式,突变是相对于正常而言的突变是相对于正常而言的 遗传学研究中,将自然界中普遍出现的性状遗传学研究中,将自然界中普遍出现的性状或指定实验用的某一品系的性状,作为或指定实验用的某一品系的性状,作为“野野生型生型”或或“正常正常”的性状。与这种性
3、状相关的性状。与这种性状相关的等位基因称为野生型等位基因,一般记为的等位基因称为野生型等位基因,一般记为+,或或a+,b+等。等。 任何不同于野生型等位基因的称为突变型等任何不同于野生型等位基因的称为突变型等位基因位基因 从野生型变为突变型,称为正向突变从野生型变为突变型,称为正向突变(forward mutation);反之,从突变型也可变;反之,从突变型也可变回成野生型,则称为回复突变回成野生型,则称为回复突变(back mutation)或逆向突变或逆向突变(reverse mutation)。野生型等位基因和突变型等位基因的适合野生型等位基因和突变型等位基因的适合度度fitness(生
4、存和繁殖的能力生存和繁殖的能力)不同不同二、基因突变的特点二、基因突变的特点 1、不对应性。、不对应性。突变的性状与引起突变的原因间无直接的对应突变的性状与引起突变的原因间无直接的对应关系关系 2、自发性。、自发性。在没有人为诱发因素的情况下,各种遗传性状的在没有人为诱发因素的情况下,各种遗传性状的改变可以自发地产生。改变可以自发地产生。 3、稀有性。、稀有性。自发突变的频率较低,而且稳定,一般在自发突变的频率较低,而且稳定,一般在10-610-9 间。间。 4、独立性。、独立性。某一基因的突变,即不提高也不降低其他任何基某一基因的突变,即不提高也不降低其他任何基因的突变率。突变不仅对某一细胞
5、是随机的,且对某一基因也因的突变率。突变不仅对某一细胞是随机的,且对某一基因也是随机的。是随机的。 5、可诱变性:、可诱变性:通过各种物理、化学诱变剂的作用,可提高突通过各种物理、化学诱变剂的作用,可提高突变率,一般可提高变率,一般可提高10105倍。倍。 6、稳定性:、稳定性:突变的根源是遗传物质结构上发生了稳定的变化,突变的根源是遗传物质结构上发生了稳定的变化,所以产生的新性状也是稳定的和可遗传的。所以产生的新性状也是稳定的和可遗传的。 7、可逆性:、可逆性:任何性状既有可能正向突变,也有可能发生回复任何性状既有可能正向突变,也有可能发生回复突变,两者发生的频率基本相同突变,两者发生的频率
6、基本相同 自然界的各种辐射自然界的各种辐射 环境中的化学物质环境中的化学物质 环境中的生物因素环境中的生物因素 生物体内的生物体内的DNA复制错误复制错误 DNA自发损伤和修复能力的缺陷自发损伤和修复能力的缺陷 转座因子的作用转座因子的作用三、自发突变三、自发突变(spontaneous mutataon)和和诱发突变诱发突变(induced mutation)(一)自发突变(一)自发突变(spontaneous mutataon)1、定义、定义指生物体在无人工干预下指生物体在无人工干预下自然自然发生的发生的低频率低频率基因突变基因突变 。2、产生原因:、产生原因:3、自发突变的机制、自发突变
7、的机制 (1) 背景辐射和自然环境因素的诱变背景辐射和自然环境因素的诱变。不少不少“自发突变自发突变”实质上是由一些原因不详的低剂量诱变因素长期的综实质上是由一些原因不详的低剂量诱变因素长期的综合效应导致。合效应导致。 (2) 微生物自身有害代谢产物的诱变微生物自身有害代谢产物的诱变。活性氧是普遍存活性氧是普遍存在于微生物体内的一种代谢产物,它们可能是自发突在于微生物体内的一种代谢产物,它们可能是自发突变中的一种内源诱变剂。变中的一种内源诱变剂。 (3)由由DNA复制过程中碱基配对错误引起复制过程中碱基配对错误引起。据统计,据统计,DNA链每次复制中,每个碱基对错误配对的频率是链每次复制中,每
8、个碱基对错误配对的频率是10-710-11,而一个基因平均约含,而一个基因平均约含1000 bp,故自发突变,故自发突变频率约为频率约为10-6。因此,若对细菌做一般液体培养时,。因此,若对细菌做一般液体培养时,因其细胞浓度常可达到因其细胞浓度常可达到108个个/ml,故经常会在其中产,故经常会在其中产生自发突变株。生自发突变株。DNA复制错误 A ATGTC TACAG ATGTC ATGTC TATAG TATAGA ATGTC TACAG ATGTC TACAG A ATGTC TACAG ATGTC TACAGa.环状突出效应环状突出效应 有人提出,在有人提出,在DNA的复制过程中,如
9、果其中某一单的复制过程中,如果其中某一单链上偶然产生一个小环,则会因其上的基因越过复链上偶然产生一个小环,则会因其上的基因越过复制而发生遗传缺失,从而造成自发突变。制而发生遗传缺失,从而造成自发突变。 如果是模板链出现环出现象,会产生缺失突变如果是模板链出现环出现象,会产生缺失突变 如果是正在合成的子链出现环出现象,会产生插入如果是正在合成的子链出现环出现象,会产生插入突变突变 新链 5 3 A G T TT C A A A A A C G 模板链 3 5 新合成链环出 5 3 5 T 3 A G T T A G T T T TT C A A A A C G T C A A A A A C G
10、 3 A 5 3 5 模板链环出 新链上插入一个碱基 新链上缺失一个碱基 5 3 5 T 3 A G T T T T G C A G T T T T T G CT C A A A A C G T C A A A A A C G 3 A 5 3 5 图214 在 DNA复制中由于 DNA的错误环出自发产生碱基的插入和缺失 (参考 Peter J. Russell: Genetics, 3rd ed.,Fig18-8) 1. Inherent chemical reactivity of the DNA2. The presence of normal, reactive chemical spe
11、cies within the cell 1. Deamination (脱氨作用): CU (may be removed by Uracil DNA glycosylase)methylcytosine m5C T (normal residue)(in CpG islands) 2. Depurination (脱瞟呤作用) : break of the glycosylic bond by hydrolytic reaction non-coding lesion.产生无瞟呤AP位点3. Depyrimidination (脱嘧啶作用) : raredeamination-ATGCTA
12、CG-TACGATGC-ATGUTACG-TACGATGC-ATG TACG-TACGATGC- U-ATGCTACG-TACGATGC-Uuracil DNA glycosylaseCytosine deamination and repair NH2 O H3C H3C H N N Deamination H N O H N O 5-methyleytosine (5mC) Thymine (T) Fig.21- Deamination of 5-methylcytosine to thymine. A ATGTC TACAG ATGTC ATGTC TACAG TACAG A ATGTC
13、 TACAG ATGGC TACCG A ATGGC TACAG ATGCC TACAG 脱嘌呤氧化损伤 过氧化物原子团(O2-) (H2O2),(-OH)等需氧代谢的副产物都是有活性的氧化剂, 它们可导致DNA的氧化损伤, T氧化后产生T乙二醇, G氧化后产生8-氧-7,8二氢脱氧鸟嘌呤、8-氧鸟嘌呤(8-O-G)或“ GO”, GO可和A错配,导致GT。The levels of oxidation can be increased by hydroxyl radicals from the radiolysis of H2O caused by ionizing radiation. 离
14、子辐射使水分解产生羟基,增加氧化作用离子辐射使水分解产生羟基,增加氧化作用Oxidation productsReactive oxygen species (ROS) presents in all aerobic需氧需氧cells.Superoxide过氧化物过氧化物hydrogen peroxide过氧化氢过氧化氢Hydroxyl radical (OH)羟基羟基Spontaneous mutations occur throughout the lacI gene of E. coli, but are concentrated at a hotspot. Mutations are
15、concentrated at hotspots自发突变具有突变热点,不同突变剂也有其各自的突变热点。5-mC是生物体内的突变热点?!5-甲基胞嘧啶氧化脱氨基反应胸腺嘧啶脲嘧啶脲嘧啶DNA糖苷酶,将脲嘧啶残基除去。修复系统”将一个C碱基插入与之配对保护系统无法识别这样的变化C突变为U不是生物体内的突变热点?! 所有能诱发基因突变的因子,称为所有能诱发基因突变的因子,称为诱变剂诱变剂(mutagen)。(二)诱发突变(二)诱发突变(spontaneous mutataon)1、定义、定义诱发突变诱发突变简称诱变,是指通过人为的方法,利用物理、简称诱变,是指通过人为的方法,利用物理、化学或生物因素
16、显著提高基因自发突变频率的手段。化学或生物因素显著提高基因自发突变频率的手段。2、诱发突变的机制、诱发突变的机制(1 1)碱基的置换)碱基的置换 转换转换transitiontransition:即:即DNADNA链中的一个嘌呤被另一个链中的一个嘌呤被另一个嘌呤或是一个嘧啶被另一个嘧啶所置换嘌呤或是一个嘧啶被另一个嘧啶所置换 颠换颠换transversiontransversion:即一个嘌呤被另一个嘧啶或是:即一个嘌呤被另一个嘧啶或是一个嘧啶被另一个嘌呤所置换。一个嘧啶被另一个嘌呤所置换。(2 2)移码突变移码突变 指诱变剂会使指诱变剂会使DNADNA序列中一个或少序列中一个或少数几个核苷酸
17、发生增添数几个核苷酸发生增添( (插入插入) )或缺失,从而使该部或缺失,从而使该部位后面的全部遗传密码发生转录和翻译错误的一类位后面的全部遗传密码发生转录和翻译错误的一类突变。突变。(3 3)染色体畸变染色体畸变 包括染色体结构上的缺失、重复、包括染色体结构上的缺失、重复、插入、易位和倒位,和染色体数目的变化。插入、易位和倒位,和染色体数目的变化。(4 4)转座因子)转座因子: : (1)碱基的置换)碱基的置换 a.转换转换transition:即:即DNA链中的一个嘌呤被链中的一个嘌呤被另一个嘌呤或是一个嘧啶被另一个嘧啶所置换另一个嘌呤或是一个嘧啶被另一个嘧啶所置换 b.颠换颠换trans
18、version:即一个嘌呤被另一个嘧:即一个嘌呤被另一个嘧啶或是一个嘧啶被另一个嘌呤所置换。啶或是一个嘧啶被另一个嘌呤所置换。 A G T C 转换 颠换 图 21-1 转换与颠换 碱基的置换 同义突变同义突变(same-sense or synonymous mutation):由于密码子具有兼并性,单个碱基置):由于密码子具有兼并性,单个碱基置换后并没有引起肽链中氨基酸序列的改变。同义突换后并没有引起肽链中氨基酸序列的改变。同义突变不易检出。变不易检出。 错义突变错义突变(missense mutation):):DNA分子中的分子中的核苷酸置换后改变了核苷酸置换后改变了mRNA上遗传密码
19、,导致合成上遗传密码,导致合成的多肽链中一个氨基酸被另一氨基酸所取代的多肽链中一个氨基酸被另一氨基酸所取代。 无义突变无义突变(non-sense mutation):当单个碱基置):当单个碱基置换导致出现终止密码子时,多肽链将提前终止合成,换导致出现终止密码子时,多肽链将提前终止合成,所产生的蛋白质(或酶)大都失去活性或丧失正常所产生的蛋白质(或酶)大都失去活性或丧失正常功能功能。 表 21-2 点突变的类型(以 Tyr 的密码子为例) 无义突变同义突变错义突变DNA TACTAA , TAG RNA UAC UAA UAG aa Tyr Och AmbTAC TAT UAC UAU Tyr
20、 TyrTAC TCC UAC UCC Tyr Ser碱基的置换 终止密码突变终止密码突变(termination codon mutation):当:当DNA分子中一个终止密码发生突变,成为编码氨基分子中一个终止密码发生突变,成为编码氨基酸的密码子时,多肽链的合成将继续进行下去,肽酸的密码子时,多肽链的合成将继续进行下去,肽链延长直到遇到下一个终止密码子时方停止,因而链延长直到遇到下一个终止密码子时方停止,因而形成了延长的异常肽链。也称为延长突变形成了延长的异常肽链。也称为延长突变(elongtion mutation)或通读突变)或通读突变(read-through mutation)。
21、抑制基因突变(抑制基因突变(suppressor gene mutation):当):当基因内部不同位置上的不同碱基发生了两次突变,基因内部不同位置上的不同碱基发生了两次突变,其中一次抑制了另一次突变的遗传效应其中一次抑制了另一次突变的遗传效应。直接引起置换的诱变剂直接引起置换的诱变剂 可直接与核酸的碱基发生化学反应的诱变剂可直接与核酸的碱基发生化学反应的诱变剂 在体内或离体条件下均有作用在体内或离体条件下均有作用 包括包括放射线放射线(紫外线紫外线、 X-射线、射线、 射线、射线、 宇宙射线宇宙射线)和和亚硝酸亚硝酸、羟胺羟胺和和各种烷化剂各种烷化剂,如硫酸二乙酯,如硫酸二乙酯(DES)、甲
22、基磺酸乙酯()、甲基磺酸乙酯(EMS)、)、N-甲基甲基-N-硝硝基基-N -亚硝基胍(亚硝基胍(NTG)、乙烯亚胺、环氧乙酸、)、乙烯亚胺、环氧乙酸、氮芥等氮芥等碱基的修饰剂碱基的修饰剂 它们可与一个或几个碱基发生生化反应,引起它们可与一个或几个碱基发生生化反应,引起DNA复制时发生转换。能引起颠换的诱变剂很少。复制时发生转换。能引起颠换的诱变剂很少。紫外线诱发胸苷二聚体紫外线诱发胸苷二聚体 O O UV O O H CH3 H CH3 H CH3 CH3 H N N N N O N H O N H O N H H N O Thymine Thymine Thymine dimer O O
23、4 5 4 5 3 6 6 2 1 Fig. 21- Production of thymine dimer by ultraviolet light irradiation. 碱基的修饰剂 (1) 亚硝酸(introus acid, NA)有氧化脱氨作用 HNO2胞嘧啶(胞嘧啶(C) 尿嘧啶(尿嘧啶(U) HNO2腺嘌呤(腺嘌呤(A) 次黄嘌呤(次黄嘌呤(H) HNO2鸟嘌呤(鸟嘌呤(G) 黄嘌呤(黄嘌呤(X) HNO2 A H G G A A T C C C U T HNO2 Nitrous acid (亚硝酸)(亚硝酸): deaminates C to produce U, resul
24、ting in GC AU (transition)Nitrous acid: deaminates A to produce G, resulting in AT GC (transition) (2)羟胺只特异地和胞嘧啶起反应,在第4个C原子上加-OH,产生4-OH-C,此产 物可以和A 配对,使C G转换成T A HA C 4-OH-C T G A A (3)(3)烷化剂烷化剂如如甲基黄酸乙脂甲基黄酸乙脂(EMS),氮芥氮芥(NM),甲甲基黄酸甲脂基黄酸甲脂(MMS),亚硝基胍亚硝基胍(NG)等,它们)等,它们的作用是使碱基烷基化,的作用是使碱基烷基化,EMS使使G的第的第6位烷化,位烷
25、化,使使T的第的第4位上烷化,结果产生的位上烷化,结果产生的O-6-E-G和和 O-4-E-T分别和分别和T、G配对,导致配对,导致G C对转换成对转换成A T对;对;T A对转换成对转换成C G G O-6-E-G A T O-4-E-T C C T T A G GAlkylation (烷基化作用)Electrophilic亲电子的亲电子的chemicals which readily add alkyl烷基烷基groups to various positions on nucleic acids(MMS)(ENU)Pair with TInterfere with unwinding,
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