2022年分子诊断学复习资料简答题部分 .pdf
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1、简答基因组的特点:?(大题)人类基因组的特点:1、人类基因组具有23 对染色体,基因组序列大约2.9 亿个核苷酸,含有蛋白质编码基因大约20, 000-25, 000个。其中大量基因与中枢神经系统,特别是脑部发育相关;2、绝大多数基因为断裂基因,且分布不均(每条染色体具有基因富集区和基因稀疏区)。除蛋白质编码基因外,其他大量基因为RNA 编码基因;3、基因内和基因附近中存在大量短序列调控元件,发挥基因的调控表达和协调表达的作用;4、基因组(基因内)中存在大量功能未知的其他序列(“非编码DNA”),如串联重复序列、转座元件。5、序列突变是人类基因突变的重要来源,序列/基因多态性是研究人类遗传突变
2、的重要手段。6、线粒体DNA(mtDNA )是人类母系遗传疾病的重要来源基础。真核基因组特点:1. 真核基因组结构庞大:人:3109bp 。几、十、百倍于原核。2.线性双链DNA,多条染色体和二倍体(Diploid ): DNA 和组蛋白质形成染色体,存在于核膜内。人:23 对, 46条;3.单顺反子 (Monocistron) :一个结构基因转录生成一条mRNA。4. 功能基因不连续性,内含子与外显子并存(断裂基因):转录后需剪接(Splicing) 5. 非编码区多于编码序列(9:1) 6.含有大量重复序列(Repetitive Sequences): 重复次数可达数百万次,序列多态性是真
3、核生物基因组的重要特征。原核生物基因组的特点:1.基因组呈共价闭合环状双链状态,散布在细胞中,有时相对集中形成类核/拟核( Nucleoid )2.基因组 DNA 小,基因数目少(1500-5900 个),种间DNA 大小差异大, GC含量差异大 (菌种鉴定和分类标准),基因多为单拷贝基因(编码rRNA 、tRNA 基因多拷贝,利于核糖体的快速组装和蛋白质合成)3.基因组只有一个复制起始点,功能相关的基因大多成簇地串联排列(操纵子结构)在染色体上,结构基因无内含子,基因连续分布,为多顺反子。4.除主基因组外,原核生物往往还具有质粒基因组5.转座元件 /基因是原核生物基因组的重要特征(转座元件(
4、Tranposable Element)是指可移动的基因成分,即能在一段 DNA 分子内部或两段DNA 分子之间移动的DNA 片段,又称跳跃基因。)6.致病基因是致病原核生物基因的重要特征病毒基因组的特点:1.基因组大小相差很大(HBV:3.2kb ,痘病毒: 300kb )2.结构分子具有多样性(DNA 病毒 /RNA 病毒,单链DNA/RNA 病毒,双链DNA/RNA 病毒,环状分子/线性分子)3.基因组多数是连续性(单一分子基因组),但RNA 病毒往往不连续(呼肠孤病毒:10 条节段双链RNA,甲乙流感病毒: 8 条单链节段RNA,丙型流感病毒:7 段单链节段RNA 。包装在同一个病毒颗
5、粒内,或在不同病毒颗粒内,只有全部基因组序列都存在,才具备感染能力)4.编码序列占基因组的90% 以上,间隔区序列很少;5.多为单拷贝(单倍体),即每个基因只出现一次(除逆转录病毒基因组有两个拷贝);6.相关基因丛集(功能上相关的基因排列在一起)、有重叠基因和不规则基因结构序列。1、试述点突变(基因背景清楚和未知)的主要检测方法。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 1 页,共 13 页 - - - - - - - - - 答:对基因背景清楚或部分清楚的点突变,可以采取直接
6、检测基因点突变的方法,如等位基因特异性寡核苷酸杂交(allele specific oligonucleotide ,ASO) 、PCR-ELISA 、等位基因特异性扩增(allele specific amplification ,ASA) 、PCR-RFLP、基因芯片技术等进行诊断,例如 地中海贫血,可以使用ASO、PCR-RFLP 联合基因芯片技术进行诊断。对于一些基因背景未知的点突变,可以采用单链构象多态性(single-strand conformational polymorphism,SSCP)、变性梯度凝胶电泳 (denaturing graient gel electroph
7、oresis ,DEEG) 、异源双链分析(heteroduplex analysis,HA) 、DNA 序列测定、蛋白截短测试(protein truncation test ,PTT)等方法,如Hopkins 大学医学院的研究人员设计了47 对 PCR 引物,分段扩增血友病A 因子 基因片段,进行DGGE 分析,发现多态性片段后再进行DNA 序列分析,几乎查清了所有临床轻中度病人的点突变。2、试述限制性内切酶Mst切割法诊断镰状细胞贫血的原理并图示。答:在F基因区域内,有一种A 基因存在三个拷贝,其功能不详,其中一个A 基因位于F基因的第22 号内含子内 (A1),另外两个位于X 染色体的
8、末端 (A2 、A3)。A1 基因可以与其上游的两个A 基因拷贝中的一个发生同源重组,引起F基因的1-22 外显子片段倒位,这种倒位导致F功能完全丧失而发生严重的血友病(图 15-5)。其中与A2 发生的重组称为近端重组,约占倒位的15;与 A3 发生的重组称为远端重组,约占倒位的85。3、试述近端重组、远端重组概念。答:在 F基因区域内,有一种A 基因存在三个拷贝,其功能不详,其中一个A 基因位于F基因的第22 号内含子内 (A1),另外两个位于X 染色体的末端(A2、A3)。A1 基因可以与其上游的两个A 基因拷贝中的一个发生同源重组,引起F基因的1-22 外显子片段倒位,这种倒位导致F功
9、能完全丧失而发生严重的血友病(图 15-5)。其中与A2 发生的重组称为近端重组,约占倒位的15;与 A3 发生的重组称为远端重组,约占倒位的85。4、简述 TGGE/DGGE 的基本原理答:在 TGGE 中,随着温度的逐渐升高时,DNA 分子会呈阶梯式逐步发生解链。部分解链的双链DNA 分子表现出一种复杂的分枝构像,使得其电泳迁移率大大下降。DNA分子的解链决定于该分子的解链温度(Tm),而 Tm 有强烈的序列依赖性,如在单取代突变中,若是A:T (两个氢键)被G:C(三个氢键)取代,将增加该双链DNA 分子的 Tm 值。而整个DNA 分子序列对解链温度也有影响,若A:T 被 T:A 替代,
10、或G:C 被 C:G 替代,分子的解链温度也会发生改变。因此不同的DNA 分子由于其Tm 不同,将于不同凝胶位置(温度不同)产生分枝(解离)使电泳迁移率降低,从而在凝胶上的不同位置形成条带。DGGE 的变性条件为热(一般为60的恒定温度)和固定比率的甲酰胺(040)、尿素( 07M )。这些梯度变性的功能就相当于TGGE 中的温度梯度的功能,使不同DNA 分子在不同的凝胶部位发生解链,引起迁移率下降,从而将不同的DNA 分子分离。5、简述变性高效液相色谱法检测基因变异的优点答: DHPLC 突变检测技术与其它方法相比,具有更高的准确性和敏感性。(1)DHPLC 与各种电泳法的比较SSCP 分析
11、片段长度105。根据卫星DNA 的长度,又可分成3种:卫星DNA 、小卫星DNA 、微卫星DNA 。(二)中度重复序列这类重复序列主要由比较大的片段(由100bp 到几千 bp)串联重复组成,分散在整个基因组中,重复频度不等,如 Alu 家族、 rRNA 、tRNA 和组蛋白等。20、简述质粒的概念和特性,常用的质粒载体有哪几种?质粒为细菌染色体外一些双链、共价闭合环状DNA 分子,是能够进行独立复制并保持稳定遗传的复制子。质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主的进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。质粒一般具有以下特性:自主复制性,它能独立于宿主细胞的染色体DNA 而自主复
12、制;质粒不相容性;可扩增性;可转移性。理想质粒载体应具备具有松弛型复制子;在复制子外存在几个单一的酶切位点;具有插入失活的筛选标记;分子量相对较小,有较高的拷贝数。常见的质粒载体有:pBR322 质粒、 pUC 质粒载体、 pGEM 系列载体等。21、试述举 2种质粒 DNA 提取的方法及应用。 答案 质粒 DNA 提取的方法包括碱裂解法、煮沸裂解法和SDS 裂解法。1)碱裂解法:在NaOH 存在的强碱性(pH12.014.0)的条件下,用强阳离子去垢剂SDS 破坏细胞壁和裂解细胞,并使宿主细胞的蛋白质与染色体DNA 发生变性,释放出质粒DNA 。它是一种适用范围很广的方法,能从所有的大肠杆菌
13、( E.coli )菌株中分离出质粒DNA ,制备量可大可小。2)煮沸裂解法:是将细菌悬浮于含Triton X-100 和溶菌酶的缓冲液中,Triton X-100 和溶菌酶能破坏细胞壁,再用沸水浴裂解细胞,使宿主细胞的蛋白质与染色体DNA 发生变性。对CCC 质粒 DNA 因结构紧密不会解链,当温度下降后,CCC 质粒 DNA 可重新回复其超螺旋结构,通过离心去除变性的蛋白质和染色体DNA ,然后回收上清液中的质粒DNA 。本法只能用于小质粒DNA (小于 15kb)的小量或大量制备,适用于大多数从大肠杆菌(E.coli)菌株中分离出质粒 DNA 。3)SDS 裂解法:它是将细菌悬浮于等渗的
14、蔗糖溶液中,用溶菌酶和EDTA 处理以破坏细胞壁,再用SDS 裂解去壁细菌,从而温和地释放出质粒DNA 到等渗溶液中,然后用酚/氯仿抽提。适用于大质粒DNA 的提取。22、简述哺乳动物细胞基因组DNA 抽提的主要方法有哪几种?名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 5 页,共 13 页 - - - - - - - - - 本题答案 哺乳动物细胞基因组DNA 抽提的主要方法有:酚提取法、甲酰胺解聚法、玻棒缠绕法和异丙醇沉淀法、磁珠吸附法等。23、 简述从琼脂糖凝胶中回收DNA
15、片段的主要方法有哪几种? 本题答案 从琼脂糖凝胶中回收DNA 片段的方法主要包括DEAE- 纤维素膜插片电泳法、电泳洗脱法、低熔点琼脂糖凝胶挖块回收法、冷冻挤压法及现在有试剂盒供应的以硅为基础的纯化系统等。24、简述磁性球珠分离法分离mRNA 的原理。 本题答案 磁性球珠分离法是基于寡聚(dT)与 poly(A) 的互补配对特性、用生物素标记寡聚(dT),通过寡聚 (dT)与mRNA 3 端 poly(A) 形成杂交体,这种杂交非常迅速,在12 分钟内就可完成,可有效地除去rRNA, tRNA以及其他RNA, 而后通过生物素与链亲和素顺磁性磁珠之间的相互作用来捕获这些杂交物而达到分离纯化。25
16、、描述质粒DNA 的结构特点。多数细菌来源的质粒核酸是环状双链DNA 分子,没有游离的末端,每条链上的核苷酸通过共价键头尾相连。质粒DNA 分子通常具有三种不同的构型。当其两条核苷酸链均保持完整环形结构时,为共价闭合环状DNA 分子,这样的DNA 常以超螺旋状态存在;如果两条链中只有一条链保持完整环形结构,另一条链出现一至数个缺口时,为半开环DNA ;若两条链均有缺口并发生断裂则成为线性DNA 分子。26、试述质粒的类型有哪些?根据细菌染色体对质粒复制的控制程度是否严格可将质粒分为:严紧型质粒和松弛型质粒。按转移方式分为:接合型质粒、可移动型质粒、自传递型质粒。按质粒大小分为:小型质粒、大型质
17、粒。按质粒的宿主范围分为:窄宿主谱型质粒、广宿主谱型质粒。按质粒的功能分为:F 质粒、 R 质粒、 Col 质粒。27、线粒体 DNA 与核 DNA 有哪些不同之处?(一)非孟德尔的母系遗传。mtDNA 因位于细胞质中,表现为严格的母性遗传, 不服从孟德尔遗传,绝大部分mtDNA 是通过卵细胞遗传。(二)高突变率。mt DNA 突变率约为nDNA 的 10 100 倍,此外 mtDNA 与有毒物质的结合频率比核DNA 高数倍至数十倍。(三)异质性和复制分离。异质性即突变mtDNA 与野生型 mtDNA 以不同的比例共存于一个细胞内的现象。复制分离即在细胞分裂的复制过程中,突变的和野生型的mtD
18、NA 随机进入子细胞的过程,复制分离的结果使突变mtDNA 杂合体向突变纯合或野生纯合方向转变,但因突变复制具有优势,故易产生突变积累,突变积累的程度不同,突变mtDNA 在群体中的多态性程度也不同。(四)阈值效应。每个细胞的mt DNA 有多种拷贝,而一个细胞mt DNA 编码基因的表现型依赖于一个细胞内突变型 mt DNA 和野生型mt DNA 的相对比例, mtDNA 突变导致氧化磷酸化水平降低,当能量降低到维持组织正常功能所需能量的最低值时即达到了mtDNA 表达的能量阈值,可引起某组织或器官的功能异常而出现临床症状,这就是阈值效应。(五)半自主复制与协同作用。mt DNA 虽有自我复
19、制、转录和编码功能,但该过程还需要数十种nDNA 编码的酶参加,因此mt DNA 基因的表达同时也受nDNA 的制约,两者具有协同作用。28、何谓线粒体病?简述线粒体病的遗传学分类。线粒体病( mitochondriopathy )是指由于线粒体呼吸链功能不良所导致的临床表现多样化的一组疾病。临床表现常见为眼睑下垂、外眼肌麻痹、视神经萎缩、神经性耳聋、痉挛或惊厥、痴呆、偏头痛、类卒中样发作等。从核基因缺陷和线粒体基因缺陷的角度对线粒体病进行遗传学分类可分为三种类型:点突变,mtDNA 的大规模缺失或插入和源于核DNA 缺陷引起 mtDNA 缺失。29、病毒的基本结构成份主要有哪些?毒没有完整的
20、细胞结构,由四种基本结构成份组成:由一种核酸(DNA或 RNA) 组成的病毒基因组。由病毒基因组编码的衣壳蛋白组成的衣壳。来源于宿主细胞质膜系统(细胞膜、内质网膜或高尔基体膜)的包膜。病毒颗粒中的其它内容物,包括酶、核酸结合蛋白及金属离子等。30、国际病毒分类委员会(ICTV )将病毒分成哪几类?名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 6 页,共 13 页 - - - - - - - - - 国际病毒分类委员会(ICTV )制定了国际病毒分类 与命名原则。根据病毒的基因组 组
21、成及复制方式,可将病毒分为如下几类:DNA病毒(DNA Viruses )第一组: 双链 DNA 病毒 (Group I: dsDNA Viruses )第二组: 单链 DNA 病毒 (Group II: ssDNA Viruses )RNA病毒(RNA virus es)第三组: 双链 RNA 病毒 (Group III: dsRNA Viruses )第四组: 正链 RNA 病毒 (Group IV: (+)ssRNA Viruses)第五组: 负链 RNA 病毒 (Group V: (-)ssRNA Viruses )DNA与 RNA 逆转录病毒 (DNA and RNA Reverse
22、 Transcribing Viruses)第六组: RNA逆转录病毒 (Group VI: RNA Reverse Transcribing Viruses)第七组: DNA逆转录病毒 (Group VII: DNA Reverse Transcribing Viruses)亚病毒因子 (Subviral Agents )卫星 (Satellites)类病毒 (Viroids )朊病毒( Prions)31、简述长病毒末端重复序列的特点和作用。逆转录病毒基因组RNA 在逆转录后生成的双链DNA 中,两端有长末端重复序列(long terminal repeat ,LTR )结构。 LTR 在
23、结构与功能上与上述重复序列不同。LTR 中的重复序列只占一部分,另外还包括单一序列。5端的 LTR包含许多特定的基因表达调控区域,是一组真核生物增强子和启动子单位,而3端的 LTR 具有转录终止的作用。另外,逆转录病毒基因组利用LTR 中的重复序列形成环状结构,在整合酶作用下整合入宿主细胞基因组内。53 蛋白质组学的研究特点有哪些? 整体性 揭示生命的动态性过程 体现生命现象的复杂性32、等电聚焦凝胶电泳的原理是什么?依据蛋白质分子的净电荷或等电点进行分离的技术。在等电聚焦过程中,电场所采用的载体两性电解质含有脂肪族多氨基多羧酸,可在电场中形成正极为酸性,负极为碱性的连续pH 梯度,蛋白质分子
24、在一个载体两性电解质(ampholyte)形成的连续而稳定的线性pH 梯度中电泳,当蛋白质迁移到其等电点位置时,净电荷为零,在电场中不再移动,因此可将各种不同等电点性质的蛋白质分离开来33、简述酵母双杂交系统的优缺点。酵母双杂交系统所具有的优点:蛋白质作为被研究的对象不用被纯化;检测在活细胞内进行,可以在一定程度上反映体内(细胞内)的真实情况;由于这一系统可以反映基因表达产物的累积效应,因而可检测存在于蛋白质之间微弱或短暂的相互作用;采用不同组织、器官、细胞类型和分化时期材料构建cDNA 文库,可用于分析多种不同功能的蛋白。局限性:双杂交系统分析蛋白间的相互作用定位于细胞核内,而许多蛋白间的相
25、互作用依赖于翻译后加工如糖基化、二硫键形成等,这些反应在核内无法进行。由于某些蛋白本身具有激活转录功能或在酵母中表达时发挥转录激活作用,从而引起报告基因的表达,产生“假阳性”结果。双杂交只是反映蛋白质间能发生作用的可能性,这种可能还必须经过其他实验验证,尤其要与生理功能研究相结合,否则可能会误入歧途。34、蛋白质间互作鉴定:(1)蛋白质亚基的聚合:线性、环状、螺旋、球状、交叉聚合(2)分子识别:抗原与抗体、配体与受体、酶与底物(3)分子的自我装配:核糖体、细菌鞭毛、病毒的自动装配(4)多酶复合体:丙酮酸脱氢酶复合体包括丙酮酸脱氢酶、二氢硫辛酸转乙酰基酶和二氢硫辛酸脱氢酶。蛋白质间作用力:名师资
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