厦门大学进化生物学第10章分子进化和分子系统学ppt课件.ppt
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1、1. 1. 原始生命出现之前的进化,进化主要表原始生命出现之前的进化,进化主要表现在分子层次上,即表现在生物分子的起现在分子层次上,即表现在生物分子的起源和进化上。源和进化上。2. 2. 细胞生命产生之后,进化发生在生物分细胞生命产生之后,进化发生在生物分子、细胞、组织、器官、个体、群体等各子、细胞、组织、器官、个体、群体等各种层次上,分子进化是生物在分子层次上种层次上,分子进化是生物在分子层次上的进化。研究议题为生物大分子结构变化的进化。研究议题为生物大分子结构变化以及这些变化和生物进化的关系等。以及这些变化和生物进化的关系等。YZXt=20 MaX: A C T G A T C G A A
2、 - T T C A G A T T T C A G G A 25Y: A C A G A T C G C A G T G C - G C T T G C A G G A 25Z: A C T G A A C G C A - T T C A G A T A T C A - G G 25dXY= 5 Ka=d/tN=5/2010-623=1.210-8dXZ= 4 Kb=d/tN=4/2010-623=1.010-8dYZ= 7 (而不是5+4) Kab=d/2tN=10/22010-623=1.010-8进化速率计算进化速率计算缺失、插入、替换缺失、插入、替换跳页返回返回灵长目灵长目偶蹄目偶蹄
3、目啮齿目啮齿目0.1370.1840.355dS灵长目灵长目偶蹄目偶蹄目啮齿目啮齿目0.0370.0470.062dN有害突变有害突变有利突变中性突变选择理论选择理论中性理论中性理论有利突变1. 选择理论揭示的是表型、种群进化的规律;选择理论揭选择理论揭示的是表型、种群进化的规律;选择理论揭示的是分子水平上的进化规律。示的是分子水平上的进化规律。2. 二者对突变类型的分类存在较大区别。二者对突变类型的分类存在较大区别。S1 AGACCTAGT S2 AGACTTGT S3 AGAACCTAGT S3 AGAACCTAGT S1 AGA-CCTTGT S2 AGA-CTAGT 主要方法:最大简约法(maximumparsimony method )邻接法(Neibohood-jointing method)最大似然法(maximum likelihood method)贝叶斯法(bayes method)Science, 2010 (328), 710-722
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