新药设计与开发的基本途径和方法-先导化合物的优化ppt课件.ppt
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1、第四章第四章 新药设计与开发的新药设计与开发的基本途径和方法基本途径和方法内内 容容 引言引言 Introduction 先导化合物的发现先导化合物的发现 Lead discovery 先导化合物的优化先导化合物的优化 Lead optimization在新药研究过程中,确定了先导化合物后,进一步在新药研究过程中,确定了先导化合物后,进一步的工作就是对先导化合物进行优化,以得到与先导的工作就是对先导化合物进行优化,以得到与先导化合物类似结构的较好的药物。使其活性更强、选化合物类似结构的较好的药物。使其活性更强、选择性更好、毒副作用更小以及具有符合使用的药代择性更好、毒副作用更小以及具有符合使用
2、的药代动力学性质。动力学性质。先导化合物的优化先导化合物的优化Lead optimization先导化合物的优化先导化合物的优化Lead optimization 先导物优化的一般方法先导物优化的一般方法 生物电子等排原理生物电子等排原理 前药原理前药原理 软药原理软药原理 孪药原理孪药原理 抗体导向酶催化前药抗体导向酶催化前药 定量构效关系定量构效关系QSAR Topliss决策法决策法先导物优化的一般方法先导物优化的一般方法剖裂物剖裂物类似物类似物u同系物同系物u引入烯键引入烯键u合环和开环合环和开环u大基团的引入、去除或置换大基团的引入、去除或置换u改变基团的电性改变基团的电性u构型变换
3、构型变换剖裂物简化复杂结构剖裂物简化复杂结构当先导物为复杂结构如当先导物为复杂结构如天然产物天然产物时,常常用此方法时,常常用此方法来优化结构。来优化结构。普鲁卡因普鲁卡因(Procaine)是对天然生物碱)是对天然生物碱可卡因可卡因(Cocaine)进行结构改造获得的,其发现提供了)进行结构改造获得的,其发现提供了从从剖析活性天然产物分子结构剖析活性天然产物分子结构入手进行药物化学入手进行药物化学研究的一个经典例证。研究的一个经典例证。H2NOONCocaineNOOOOHProcaine可卡因可卡因普鲁卡因普鲁卡因剖裂物简化复杂结构剖裂物简化复杂结构OONH3CO2CCH3OONHOOH2
4、NNCocaineEucaineProcaine可卡因可卡因优卡因优卡因普鲁卡因普鲁卡因普鲁卡因普鲁卡因Procaine的发现的发现从从Cocaine到到Procaineu苯甲酸酯苯甲酸酯占有重要地位占有重要地位u甲氧羰基甲氧羰基并非活性所必须的基团并非活性所必须的基团u莨菪烷双环结构莨菪烷双环结构并不是必须的并不是必须的u氨基苯甲酸酯氨基苯甲酸酯具有局部麻醉作用具有局部麻醉作用u氨代烷基侧链氨代烷基侧链的重要性的重要性H2NOONCocaineNOOOOHProcaineProcaine的发现的发现 苯甲酸酯苯甲酸酯占有重要地位占有重要地位NOOOOHCocaineNOOHOHHEcgoni
5、neHOO+CH3OH可卡因可卡因爱康宁爱康宁 Procaine的发现的发现 甲氧羰基甲氧羰基并非活性所必须的基团并非活性所必须的基团NOOHTropacocaine托哌可卡因托哌可卡因 Procaine的发现的发现 莨菪烷双环结构莨菪烷双环结构并不是必须的并不是必须的HNOONOOOO -优卡因 -Eucaine -优卡因 -EucaineProcaine的发现的发现氨基苯甲酸酯氨基苯甲酸酯具有局部麻醉作用具有局部麻醉作用A (Cocaine)NH2OOBenzocaineNOOHOOOrthoform newOrthocaineOOHOH2NOOH2NHO苯佐卡因苯佐卡因 可卡因可卡因 奥
6、索卡因奥索卡因新奥索仿新奥索仿 .HClH2NOONProcaine的发现的发现氨代烷基侧链氨代烷基侧链的重要性的重要性剖裂物简化复杂结构剖裂物简化复杂结构OHONHOHCH3HHABCDEDCBAHONCH3HHABDCH3HONCH2CH=C(CH3)2HCH3CNCH3OOC2H5DAANCH3CH3H3CCOCH2CH3MorphineLevorphanolPentazocinePethidineMethadone吗啡吗啡羟甲左吗喃羟甲左吗喃 喷他佐新喷他佐新哌替啶哌替啶美沙酮美沙酮类似物局部结构变化类似物局部结构变化同系物同系物引入烯键引入烯键合环和开环合环和开环大基团的引入、去除或
7、置换大基团的引入、去除或置换改变基团的电性改变基团的电性同系物变换同系物变换 Homology principleA-(CH2)n-B 彼此互为同系物彼此互为同系物同系物变换同系物变换同系物变换同系物变换同系物变换同系物变换同系物变换同系物变换肾上腺素(肾上腺素(RMe)同系物变换同系物变换 Homology principle A-(CH2)n-B 彼此互为同系物彼此互为同系物 同系物的理化性质及生物活性的变化无统一规同系物的理化性质及生物活性的变化无统一规律律u 递变递变 gradationu 交替交替 alternationu 翻转翻转 inversionGradationnEEn活性递
8、增活性递增CH3CH3HNCONR0102030405060708090100C1 C2 C3 C4 C5 C6HRDuration of Anaesthesia (min)H11CH323C2H534C3H749C4H993吡咯卡因(吡咯卡因(RH,酰胺类局麻药)酰胺类局麻药)活性递增活性递增050100150200250300350400450500C1 C2 C3 C4 C5 C6HRSpasmolytic activityCH38C2H512C3H724C4H998C5H11240C6H13410C7H15490C7NOOHO后马托品(M受体拮抗剂, 滴眼剂)OOHOR血小板激活因子血
9、小板激活因子酰醚同系物的抗凝作用酰醚同系物的抗凝作用OOOO-(CH2)n-CH3PON+O-O020040012006008001400100059 11 15 17 193Chain length血小板激活因子血小板激活因子(platelet-activating factor,PAF-acether)是在是在70年代初期年代初期发现的。其结构在发现的。其结构在70年代后期已被阐年代后期已被阐明,是第一个被发现有生物活性的明,是第一个被发现有生物活性的醚醚键磷脂键磷脂。GABA受体拮抗剂与受体拮抗剂与GABAA受体受体的亲和性的亲和性NNNH2(CH2)n-CO2H010206030407
10、050n=2n=3n=5n=4n=1AlternationnEnEincompletecomplete氨基喹啉类的抗疟活性氨基喹啉类的抗疟活性02040608010045768910 EffectnNHNN氯喹(n = 3)nCl羟苯乙酮衍生物的白三烯拮抗活羟苯乙酮衍生物的白三烯拮抗活性性10203040506045763nOHH3CH3COO-(CH2)n-CCH3CH3NHNNNInversionOHHOHNOHRR血压升高血压升高血压降低血压降低HCH3C2H5C3H7i-C3H7C4H9i- C4H9肾上腺素(肾上腺素(RMe)InversionH2NOON+CH3H3CCH3NOON
11、+H3CCH3CH3Bu-nn-Bu卡巴胆碱卡巴胆碱 Carbachol拟胆碱药拟胆碱药地布托林地布托林 Dibutoline抗胆碱药抗胆碱药引入烯键引入烯键插烯原理插烯原理(Vinylogy principle):插烯物):插烯物 A-(CH=CH)n-B,A、B 之间的电性可通过共轭双之间的电性可通过共轭双键传递。键传递。可应用于其他共轭体系:亚胺、乙炔基、苯环、可应用于其他共轭体系:亚胺、乙炔基、苯环、芳杂环等。芳杂环等。H3CCOCH2CHOH3CCOCHCHOHH3CCOOH引入烯键引入烯键在饱和碳链上引入双键,在饱和碳链上引入双键,分子的构型和构象改分子的构型和构象改变较大,生物活
12、性变化也较大变较大,生物活性变化也较大。插烯物与原药物相比,通常插烯物与原药物相比,通常易代谢降解、活性易代谢降解、活性降低和毒性可能增大降低和毒性可能增大(共轭双键的反应性)。(共轭双键的反应性)。插烯物变换时,插烯物变换时,A-(CH=CH)n-B,改变了改变了A、B间的距离间的距离。引入烯键引入烯键NNOOCH2CH2CH2CH3保泰松 PhenylbutazoneStyrylbutazoneNNOOCH2CH2CH2CH3作用相似,时间缩短作用相似,时间缩短吡唑酮类非甾体抗炎药吡唑酮类非甾体抗炎药合环和开环合环和开环合环使构象固定合环使构象固定,影响药效学性质影响药效学性质u药效不变药
13、效不变u药效增强药效增强u药效降低药效降低u产生新药效产生新药效u活性构象的研究活性构象的研究改变药动学性质,可用于设计前药改变药动学性质,可用于设计前药合环和开环合环和开环氧氟沙星 Ofloxacin培氟沙星 PefloxacinNOCOOHFNNH3COCH3NOCOOHFNNH3C合环后合环后,构象限制构象限制,作用增强作用增强喹诺酮类抗菌药喹诺酮类抗菌药合环和开环合环和开环OHHOOOHOHOHHOOHHOHHOOHO辛伐他汀普伐他汀辛伐他汀辛伐他汀结构中含有的结构中含有的内酯环内酯环,改造为,改造为羟基酸羟基酸,形成形成普伐他汀普伐他汀,使之,使之成为水溶性药物成为水溶性药物,效果更
14、好。,效果更好。n羟甲戊二酰辅酶羟甲戊二酰辅酶A还原酶抑制剂(调血脂药)还原酶抑制剂(调血脂药)合环和开环合环和开环OON(C2H5)2OOON(C2H5)2O奥昔拉定 Oxeladin喷托维林 Pentoxyverine止咳止咳止咳合环和开环合环和开环CHOHCHNHCH3CH3OHNH3CEphedrine芬 美 曲 秦 Phenmetrazine食 欲 抑 制 剂麻黄素麻黄素 麻黄素麻黄素属于生物碱类物质,是属于生物碱类物质,是拟交感神经药拟交感神经药,主治支气管哮,主治支气管哮喘、感冒、过敏反应、鼻粘膜充血、水肿及低血压等疾病。喘、感冒、过敏反应、鼻粘膜充血、水肿及低血压等疾病。 合环
15、和开环合环和开环Cycloguanil (antimalarial)Proguanil (antimalarial)NHNHNHClHNNHCH3H3CNNH2NClNCH3H3CNH2氯胍(抗疟药)氯胍(抗疟药)环氯胍(抗疟药)环氯胍(抗疟药) 合环和开环合环和开环雌激素及孕激素类药雌激素及孕激素类药 抗肿瘤药抗肿瘤药 大基团的引入、去除或置换大基团的引入、去除或置换引入大基团引入大基团往往往往造成生物活性很大变化造成生物活性很大变化,甚至,甚至造成造成作用翻转作用翻转在易变结构附近在易变结构附近引入障碍基团引入障碍基团,可,可稳定易变部稳定易变部位位将稳定基团将稳定基团换以易变基团换以易变
16、基团,可使,可使作用限于局部作用限于局部或迅速代谢失活,减轻副作用或迅速代谢失活,减轻副作用引入极性或离子性基团引入极性或离子性基团,可,可限制药物分布限制药物分布引入大基团往往造成生物活性引入大基团往往造成生物活性很大变化很大变化Propantheline bromide 溴丙胺太林AcetylcholineOCOOCH2CH2N+(C3H7)2CH3CH3COOCH2CH2N+(CH3)3Diphenhydramine 苯海拉明HistamineCHOCH2CH2N(CH3)2HNNNH2氨基醚类氨基醚类H1受体拮抗剂受体拮抗剂M受体拮抗剂受体拮抗剂引入大基团往往造成生物活性引入大基团往往
17、造成生物活性很大变化很大变化Propranolol 普萘洛尔IsoprenalineOOHNHCH(CH3)2HOHOOHNHCH(CH3)2Moxisylyte 莫西赛利NorepinephrineH3CCH3COOOCH(CH3)2N(CH3)2HOHOOHNH2-受体拮抗剂受体拮抗剂-受体激动剂受体激动剂-受体拮抗剂受体拮抗剂 -受体激动剂受体激动剂在易变结构附近引入障碍基团,在易变结构附近引入障碍基团,可稳定易变部位可稳定易变部位药物分子中某些基团易受代谢影响而使分子失去活药物分子中某些基团易受代谢影响而使分子失去活性。性。为了使这些药物保持活性,常改变一些结构,在易为了使这些药物保持
18、活性,常改变一些结构,在易变结构附近变结构附近引入障碍基团引入障碍基团,使其,使其难于代谢失活难于代谢失活。在易变结构附近引入障碍基团,在易变结构附近引入障碍基团,可稳定易变部位可稳定易变部位OxacillinMethicillin,NOCH3OCH3OCH3R =NSCH3CH3COOHHNORO甲氧西林苯唑西林青霉素类抗生素青霉素类抗生素耐酶青霉素的设计原理耐酶青霉素的设计原理人们发现侧链含人们发现侧链含三苯甲基三苯甲基时,对青霉素酶稳定。时,对青霉素酶稳定。人们设想可能是由于三苯甲基有人们设想可能是由于三苯甲基有较大的空间位阻,较大的空间位阻,阻止了化合物与酶活性中心的结合阻止了化合物与
19、酶活性中心的结合。又由于空间阻碍又由于空间阻碍限制酰胺侧链限制酰胺侧链R与羧基间的单键旋与羧基间的单键旋转转,从而,从而降低了青霉素分子与酶活性中心作用的适降低了青霉素分子与酶活性中心作用的适应性应性,加之加之R基比较靠近基比较靠近-内酰胺环内酰胺环,也可能有保护作用。,也可能有保护作用。 苯唑西林的研究苯唑西林的研究 苯唑西林是利用苯唑西林是利用生物电子等排生物电子等排原理原理发现的。发现的。以异噁唑取代甲以异噁唑取代甲氧西林的苯环,同时在氧西林的苯环,同时在C-3和和C-5分别以苯基和甲基取代分别以苯基和甲基取代,其中苯基兼有吸电子和空间位其中苯基兼有吸电子和空间位阻的作用。因此侧链含有苯
20、甲阻的作用。因此侧链含有苯甲异噁唑环的青霉素的发现,认异噁唑环的青霉素的发现,认为是耐酶青霉素的一大进展,为是耐酶青霉素的一大进展,这类化合物不仅能耐酶,还能这类化合物不仅能耐酶,还能耐酸,抗菌作用也比较强。耐酸,抗菌作用也比较强。 OxacillinMethicillin,NOCH3OCH3OCH3R =NSCH3CH3COOHHNORO甲氧西林苯唑西林在易变结构附近引入障碍基团,在易变结构附近引入障碍基团,可稳定易变部位可稳定易变部位1289OHO1520HO21OHOPGE1 (前列地尔)OOOHHOO米索前列醇16米索前列醇是米索前列醇是PGE1PGE1类似物类似物,与,与PGE1不同
21、的是不同的是将将C-15C-15羟基移位至羟基移位至C-16C-16,同时增加同时增加C-16C-16甲基甲基。天然。天然PGE1因为随血液经过肺和肝一次失活因为随血液经过肺和肝一次失活80,半,半衰期只有衰期只有1分钟。主要原因是在分钟。主要原因是在15-羟前列腺素脱氢酶的作用下羟前列腺素脱氢酶的作用下C-15的羟基被氧的羟基被氧化成酮基而失活。进而在化成酮基而失活。进而在13还原酶的作用下使双键还原,再经还原酶的作用下使双键还原,再经及及氧化成氧化成代谢产物从尿中排泄。代谢产物从尿中排泄。米索前列醇是为了防止米索前列醇是为了防止PGE1PGE1在体内代谢快而进行的结构改变在体内代谢快而进行
22、的结构改变,当,当C-15羟基位移到羟基位移到C-16之后,同时又引入了甲基,使该碳上的羟基因位阻增加,之后,同时又引入了甲基,使该碳上的羟基因位阻增加,C-16羟基已不可能受酶的影响而氧化。不但代谢失活的时间变慢,作用时间羟基已不可能受酶的影响而氧化。不但代谢失活的时间变慢,作用时间延长而且口服有效,这是米索前列醇的突出优点。延长而且口服有效,这是米索前列醇的突出优点。构型变换构型变换沙利度胺沙利度胺(thalidomide),商品名,商品名反应停反应停,R构型对构型对映体具有镇静作用,可作为缓解妊娠反应的药物,映体具有镇静作用,可作为缓解妊娠反应的药物,而而S构型对映体则是一种强烈致畸剂,
23、导致孕妇产构型对映体则是一种强烈致畸剂,导致孕妇产生畸形婴儿。生畸形婴儿。R 催眠镇静催眠镇静 S 强致畸作用强致畸作用 构型变换构型变换抗高血压药物,仅抗高血压药物,仅S构型有效构型有效 止喘药,止喘药,R活性活性S活性活性先导化合物的优化先导化合物的优化Lead optimization 先导物优化的一般方法先导物优化的一般方法 生物电子等排原理生物电子等排原理 前药原理前药原理 软药原理软药原理 孪药原理孪药原理 抗体导向酶催化前药抗体导向酶催化前药 定量构效关系定量构效关系QSAR Topliss决策法决策法电子等排体的概念电子等排体的概念 Isosterism 狭义的电子等排体是指原
24、子数、电子总数以及电子排列状狭义的电子等排体是指原子数、电子总数以及电子排列状态都相同的不同分子或基团。态都相同的不同分子或基团。 如N2与CO;N2O与CO2;CH2=C=O与CH2=N=N;N3-与NCO 等 广义的电子等排体是指具有相同数目价电子的不同分子或广义的电子等排体是指具有相同数目价电子的不同分子或基团,不论其原子及电子总数是否相同。基团,不论其原子及电子总数是否相同。 如F、OH、NH2、CH3;O、CH2、NH;N、CH;Ne、HF、H2O、NH3。 更为广义的电子等排体是由内外层电子数决定的。更为广义的电子等排体是由内外层电子数决定的。 如CHCH与S是电子等排体,所以苯与
25、噻吩是电子等排体; O与NH是电子等排体,所以呋喃与吡咯是电子等排体; CH3与Br是电子等排体,所以甲苯与溴苯是电子等排体,等等。生物电子等排体(生物电子等排体(Bioisosterism)的提出与发展的提出与发展1919, Langmuir,无机化学,无机化学u原子总数相同,电子总数相同,电子的排列状态相同的原子总数相同,电子总数相同,电子的排列状态相同的分子或原子团,叫做电子等排体分子或原子团,叫做电子等排体 Isosteres,或译同电异,或译同电异素物素物u同电异素物的物理性质有惊人的相似之处同电异素物的物理性质有惊人的相似之处 N2CO, N2OCO2, NO3-CO32- 生物电
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