引物探针设计记录.docx
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1、宁波匠神生物科技引物探针设计记录工程名称工程编号流行病学调查病原微生素生物学分类描述口电子版/截图见附页流行病学特点口电子版/截图见附页分子生物学特征口电子版/截图见附页临床病理学电子版/截图见附页病原体代表株系的全 基因组序列比拟NCBI同源性比对电子版/截图见附页代表株系的全基因组序列比拟电子版/截图见附页靶基因序列选择/确定口电子版/截图见附页靶基因序列同源性比拟电子版/截图见附页靶序列数据库内特异性验证 (NCBI&clustal)口电子版/截图见附页利用 NCBI Nucleotide BLAST 对该段核苜酸序列进行排除法 比对分析口电子版/截图见附页截图上游引物截图探针 截图下游
2、引物基于靶序列设计引物和探针序号名称名称位置长度(bp)碱基序列1引物上游引物128420ACGCGCAGCTGGCCTCTTAC2上游引物246420ACGGTCTTGTGAGGGTGCTG3探针 40422CCACCGACACCGTGATGAGCGT4探针下游引物140422CCACCGACACCGTGATGAGCGT5探针下游弓1物240422CCACCGACACCGTGATGAGCGT6探针下游引物340422CCACCGACACCGTGATGAGCGT7探针 种内保守性评价病原体代表株系的全 基因组序列比拟利用NCBI Primer BLAST对上下 游引物进行序列比对口电子版/截图见附页引物、探针序列确定及外送合成电子版/截图见附页引物、探针序列确定及外送合成序号名称名称位置长度(bp)碱基序列1引物上游引物128420ACGCGCAGCTGGCCTCTTAC2上游引物246420ACGGTCTTGTGAGGGTGCTG3探针 40122CCACCGACACCGTGATGAGCGT4探针下游引物140422CCACCGACACCGTGATGAGCGT5探针下游引物240422CCACCGACACCGTGATGAGCGT6探针下游引物340422CCACCGACACCGTGATGAGCGT
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