2022年埃博拉出血热实验室检测方案 .pdf
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1、1 附件 2 埃博拉出血热实验室检测方案(第二版)埃博拉出血热是一种严重的急性传染病,埃博拉出血热患者血液中有较高的病毒载量, 可能发生人 - 人传播和院内感染 , 病死率高。直接接触传播是本病最主要的传播途径。可以通过接触病人或被感染动物的体液、分泌物、排泄物及其污染物等而感染。埃博拉出血热的临床表现和其他一些病毒性出血热相似,需要通过实验室进行确诊。在目前阶段,以对病人血液标本检测为主。为及时检测和确认埃博拉出血热病例,规范实验室检测程序,提高检测质量,为指导病例的管理和出院提供依据,特制定本方案。一、 检测对象包括留观病例、疑似病例和确诊病例,病例定义参见国家卫生计生委制定的埃博拉出血热
2、相关病例诊断和处置路径。二、标本采集、保存和运输(一)标本采集用分离胶无菌真空促凝管采集静脉血,每管3mL ,标记后 4保存,填写标本采集登记表(附表 1)。留观病例、疑似病例采集4 管,其中 2 管送指定的具有埃博拉出血热检测资质的实验室进行埃博拉病毒检测,2 管保存于样本采集单位或所在省疾病预防控制机构,待排除埃博拉病毒感染后用于其他病原体的筛查;确诊病例采集恢复期血标本,送国家疾控中心病毒病所进行检测。(二)标本保存、运送未分离血清的全血标本应4保存,并尽快分离血清;血清标本长期保存应置于-70以下,标本保存不超过1 周可置 -20。标本运输应按照相关生物安全规定,采取A类包装,低温冷藏
3、运输,避免反复冻融(附件 1)。三、检测内容埃博拉病毒核酸检测、埃博拉病毒抗原检测和IgM、IgG 抗体检测。四、实验室检测方法(一)病原学检测名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 1 页,共 28 页 - - - - - - - - - 2 1核酸检测:为目前早期诊断、早期发现埃博拉出血热病例的主要检测方法。采用荧光定量 PCR 进行病毒核酸检测,患者标本中扩增到特异性核酸,可确诊埃博拉病毒感染(附件 2)。传统 RT-PCR 因易出现污染使用受限,但可以获得病毒基因序列
4、。发病后 3 天内,血标本中埃博拉病毒核酸检出率低, 检测阴性不能排除埃博拉病毒感染,应结合病例的流行病学史和临床表现进行综合判断。发病后 310 天血标本病毒核酸检出率高,检测阴性可排除埃博拉病毒感染。2. 病毒抗原检测:用酶联免疫法检测埃博拉病毒核蛋白抗原。病毒抗原检测阳性可确诊(附件 3)。发病后 3 天内,血标本中埃博拉病毒抗原检出率低,检测阴性不能排除埃博拉病毒感染,发病后310 天血标本病毒抗原检出率高。(二)血清学检测1. 血清特异性 IgM 抗体:采用捕获法 ELISA方法检测。 IgM抗体阳性可确诊 (附件4)。2. 血清特异性 IgG 抗体:目前采用间接法ELISA检测 I
5、gG 抗体。单份血清埃博拉病毒 IgG 抗体阳性提示曾感染埃博拉病毒,双份血清埃博拉病毒IgG 抗体阳转或恢复期滴度较急性期 4 倍或者以上增高者可确诊(附件5)。(三)结果的报告、复核和反馈埃博拉病毒检测机构应将所有阳性和部分阴性血清标本送中国疾病预防控制中心病毒病所进行复核检测。实验室检测结果应及时反馈标本送检单位,并尽快上报上级主管部门(附表 2)。五、生物安全按照病原微生物实验室生物安全管理条例等相关规定要求, 做好生物安全工作。(一) 实验室检测1 凡涉及埃博拉病毒的分离、 培养和动物实验, 需在生物安全 4 级 (BSL-4/ABSL-4)实验室内进行。涉及未经培养有感染性材料的实
6、验活动,需在BSL-3实验室内进行。血清学检测应在 BSL-3 实验室内,且标本需先601 小时灭活后,再进行后续实验操作。核酸检测时 , 需在 BSL-3 实验室内加入核酸提取裂解液, 完成病毒 RNA 提取,并对装有病毒 RNA 样品管的外表面进行彻底消毒后,可在BSL-3 实验室以外进行扩增检测。2在进行感染性材料操作时,每次标本份数不宜过多,每份标本量不宜过大。(二)生物安全防护名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 2 页,共 28 页 - - - - - - -
7、- - 3 在实验室处理感染性标本时,应严格按照操作规范在BSL-3实验室内进行。实验室工作人员应穿着遮盖全身的个人防护装备,包括防渗漏防护服、N95或以上口罩、防护目镜、防护面罩、乳胶手套等,当需进行感染性标本离心、较大量标本(10 mL)分装处理等时应使用正压头盔。实验人员有体表开放式伤口时不宜参加实验活动。涉及感染性材料的离心应使用有密封盖的离心桶或转头进行标本离心,应在生物安全柜内打开离心转头放入或取出装有标本的离心管。在标本的采集、包装和实验室检测等过程中所产生的医疗废物,可能具有生物危险性,应当按照医疗废物管理条例和医疗卫生机构医疗废物管理办法等相关规定及时处理。实验室检测埃博拉病
8、毒相关感染性标本的实验活动发生意外时,应及时启动相关应急预案(附件 6)。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 3 页,共 28 页 - - - - - - - - - 4 附件:附件 1. 埃博拉出血热相关标本采集、包装、运输技术指南附件 2埃博拉病毒核酸检测方法附件 3埃博拉病毒核蛋白抗原检测方法(双抗体夹心法ELISA)附件 4埃博拉病毒 IgM抗体检测方法(抗体捕捉法ELISA)附件 5埃博拉病毒 IgG 抗体检测方法(间接法ELISA)附件 6. 埃博拉出血热相关
9、标本实验活动意外应急预案附表:附表 1埃博拉出血热送检材料一览表附表 2埃博拉出血热实验室检测结果一览表名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 4 页,共 28 页 - - - - - - - - - 5 附件 1 埃博拉出血热相关标本采集、包装、运输技术指南埃博拉出血热 (Ebola hemorrhagic fever)是由埃博拉病毒 (Ebola virus)引起的一种急性出血性传染病。人主要通过接触病人或感染动物的体液、分泌物和排泄物等而感染,临床表现主要为突起发热、出
10、血和多脏器损害,病死率可高达50%-90% 。2014年,在几内亚、利比里亚和塞拉利昂等西非国家发生历史上最严重的埃博拉出血热暴发疫情。本病潜伏期为221 天,通常为 810 天。为使医疗机构疾病预防控制机构在埃博拉出血热患者或疑似患者的诊治过程中,指导埃博拉出血热相关标本的采集、包装和运输工作,保证生物安全,特制定本指南。一、生物安全防护所有样本的采集或处理应遵守医院感染管理规范和病原微生物实验室生物安全管理条例等相关生物安全规定,在标准预防的基础上采用飞沫和接触隔离的预防措施。2、样本采集时,应严格按照BSL-3 级实验室规定做好个人防护。应穿戴医用防护服、可遮盖口鼻的医用防护口罩(N95
11、)、双层乳胶手套、护目镜、头部面部保护罩、专用橡胶靴等。二、标本采集。(一)采集时间一般发病后 2 周内,可在患者血标本中检测到病毒核酸和抗原,发病后310 天的标本核酸和抗原的检出率高。在发病后数月内,可在特定分泌物中持续检出病毒。最早可从发病后 2 天的患者血清中检出特异性IgM 抗体,IgM 抗体可维持数月。发病后7-10天可检出 Ig G 抗体,康复者 Ig G 抗体可维持数年。发病10-14 天以后的标本病毒特异性抗体的检出率高。应根据不同检测目的确定采样时间,疑似患者排除埃博拉病毒感染需采集发病 3 天以后的血标本。(三)标本采集1. 采血场所应在相对独立的场所,病人房间和服务间及
12、外侧环境相比应符合负压要求,配备二级生物安全柜。如果不具备上述条件,可用相邻的房间提供足够的安全空间,备有除了病人常规护理的材料外应具备手套、防护服和防护面具等,同时要装备有洗手的设施和装有消毒液的桶。2. 采集埃博拉出血热患者血样会给医护人员带来风险,应由经过生物安全防护培训名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 5 页,共 28 页 - - - - - - - - - 6 的人员执行,采血时应2 人在场。3. 采用分离胶无菌真空促凝管采集静脉血,每管3mL ,采集后用封口
13、膜封闭管口,标记清楚后放入自封袋或50mL离心管内,并在自封袋或离心管外表面再清楚标记,4保存,填写标本采集登记表。4、留观病例和疑似病例应在发病3 天后,采集静脉血4 管,其中 2 管送指定的具有埃博拉出血热检测资质的实验室进行埃博拉病毒检测,2 管保存于样本采集单位或所在省疾病预防控制机构,待排除埃博拉病毒感染后用于其他病原体的筛查。5、确诊病例采集恢复期血标本,包括并不限于出院前标本2 份,每份 2 管,采集时间间隔不少于 48 小时。四、标本包装、运输。(一)所有疑似埃博拉病毒相关感染性标本的运输应按照病原微生物实验室生物安全管理条例和 人间传染的病原微生物名录 等相关规定,采取 A类
14、包装, 符合 UN2814要求。按照三重包装系统包装:第一层包装为自封袋或50mL离心管;第二层包装为防水、防漏的安全壳容器;第三层为运输包装组成。封在防漏自封袋或离心管内的样本应首先放置在耐用、防水防漏的第二层安全壳容器中,用吸水纸等填充物将封好的标本固定好。安全壳容器和外包装须与IATA 危险物品条例包装制度650 相符合。(二)写明标本的详细情况、运送者及预期接收者地址,并密封在塑料袋里,用胶布分别粘在外层容器里面和外面并留档以便追踪,方便实验室操作人员查对标本数量。(三)样本运输之前,应按相关生物安全规定先和样本接收单位相关生物安全负责人联系,办理相关手续,运送日确定后即通知接收实验室
15、标本运送的时间和运输方式。五、样本保存和销毁(一)实验室检测埃博拉病毒阳性血标本,应根据病原微生物实验室生物安全管理条例等相关生物安全规定保存在-70以下,实行“双人双锁”管理和取样“审批”制度。(二)实验室检测埃博拉病毒阴性血标本,应所采集疑似患者或密切接触者完全排除埃博拉病毒感染后,转入其他血清库保存或销毁。(三)所有血清销毁时, 均应在冰箱内取出后, 在生物安全柜内, 待其自然融化后,置于含有效消毒剂内浸泡,然后高压灭活。(四)所有销毁样本均应在相应数据库清单内标明,销毁的时间和操作人,阴性样本灭活记录保存 1 年以后可以清除,阳性样本的销毁记录应保存5 年以上。名师资料总结 - - -
16、精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 6 页,共 28 页 - - - - - - - - - 7 名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 7 页,共 28 页 - - - - - - - - - 8 附件 2 埃博拉病毒核酸检测方法1 目的埃博拉病毒核酸的提取及PCR 检测。2 适用范围适用于检测血标本中埃博拉病毒核酸。3 实验前准备核对被检样品(血清或血浆)患者的姓名、编号及
17、检测项目等。4 检测仪器设备和材料实时定量核酸扩增检测仪,常规核酸扩增检测仪,RNA提取试剂盒,一步法RT-PCR扩增试剂盒,一步法实时定量RT-PCR 扩增试剂盒等。5 实验步骤5.1 实验准备a. 提取埃博拉病毒 RNA 要求在 BSL-3 级实验室内操作。b. 进入实验场所之前,要事先准备好所需试剂,样品。预约实验场所。5.2 RNA的提取使用QIAampViral RNA Mini 试剂盒提取血清标本中病毒RNA (使用其他试剂盒或方法提取病毒 RNA 的应参照相应试剂盒说明书或实验室操作手册)。a. 吸取560l包含载体 RNA 的AVL 缓冲液 ( 核酸提取裂解液 ) 至1.5ml
18、 的 离心管中。b. 向上述的液体中加入 140l样品,脉冲涡旋式混匀 15秒,室温孵育 10分钟,简单离心使离心管顶端液体落到底部。c. 在样品中加入 560l 96 100的乙醇,混匀 15秒,再简单离心。d. 小心将 630l 液体加入未浸湿的 QIAamp 小柱中,盖好盖,离心8000rpm/min 1min,弃去收集管,将柱子置于一新的2ml收集管上。e. 打开QIAamp 小柱的盖子,重复步骤 6,直至样品全部离心。f. 打开盖子,向柱中加入 500l AW1 缓冲液,盖好盖,离心 8000rpm/min 1min ,弃去收集管,将柱子置于一新的2ml收集管上。名师资料总结 - -
19、 -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 8 页,共 28 页 - - - - - - - - - 9 g. 打开盖子,加入 500lAW2 缓冲液,盖好盖,离心 14 ,000rpm/min 3min 。将柱子置于一新的 2ml收集管上,空离 1min。h. 将柱子置于一新的1.5ml 离心管上,加入 50l AVE洗脱缓冲液,室温孵育1min,离心 8000rpm/min 1min 。离心液即为病毒RNA ,立即检测或 -70以下保存。 5.3 实时定量 RT-PCR 法分型检测埃博拉病毒核酸
20、5.3.1 引物与探针引物/ 探针序列荧光标记检测引物探针 1 ZEBOV-F CGCCGAGTCTCACTGAATCTG ZEBOV-R AGTTGGCAAATTTCTTCAAGATTGT ZEBOV-P FAM-CGGCAAAGAGTCATCCCAGTGTATCAAGTAA-BHQ1 FAM/BHQ-1 检测引物探针2 EBOGP1D-fwd TGGGCTGAAAAYTGCTACAATC EBOGP1D-rev CTTTGTGMACATASCGGCAC EBOGP1DZ-Prb FAM-CTACCAGCAGCGCCAGACGG-BHQ1 FAM/BHQ-1 5.3.2 实时荧光定量 RT-
21、PCR 扩增实时荧光定量 RT-PCR 扩增反应配置体系:RNA 模板 5 l ,酶(25x)1 l ,缓冲液 12.5 l ,引物(10uM )各 1 l ,探针(10uM )0.5 l ,加水至总体积 25 l 。推荐反应条件为 5030min,9510min,9515s、6045s 反应 40 个循环。5.3.3 结果判断以定量荧光 PCR 反应的前 315 个循环的荧光信号作为本底信号,以本底信号标准差的 10 倍作为荧光阈值,标本扩增产生的荧光信号达到荧光阈值时所对应的循环数为循环阈值(Ct 值) , 以 Ct35 荧光信号数据线性化处理后对应循环数生成的曲线图成“S”形的标本,可判
22、断为相应的埃博拉病毒核酸检测阳性。5.3.4 意义荧光定量 PCR是一种灵敏、特异、低污染的病毒RNA 检测方法,可以定性或定量检测标本中的埃博拉病毒。阳性具有确诊意义。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 9 页,共 28 页 - - - - - - - - - 10 5.4 一步法常规 RT-PCR 方法检测埃博拉病毒核酸5.4.1 引物:引物序列见下表引物序列片段大小方法 1 EBV-GPF 451-472 5 -TGGGCTGAAAACTGCTACAATC-3EBV
23、-GPR 1024-1003 5 -TTTTAGTTTCCCAGAAGGCCCA-3570bp 方法2 Filo-A ATCGGAATTTTTCTTTCTCATT Filo-B ATGTGGTGGGTTATAA TAATCACTGACATG 414bp Filo-A-nested GTCAAAGCA TTTCCTAGCAACATGATGG Filo-B-nested ATAATAA TCACTCACA TGCATATAACA 282bp 5.4.2 PCR 扩增用引物对 EBV-GPF 和 EBV-GPR 、FiloA 和 FiloB 进行 PCR 扩增。推荐反应条件为94预变性 2min,然
24、后 94变性 30秒,55退火 30秒, 72 延伸 1 分钟,反应40 循环,最后 72延伸 10 分钟。如为套式 PCR则开展第二轮扩增。第二轮分型 PCR 扩增体系配置采用正向引物Filo-A-nested与反向引物Filo-B-nested。推荐反应条件为94预变性 2min,然后 94变性 30 秒,55退火 30秒, 72 延伸 1 分钟,反应 30 循环,最后 72延伸 10 分钟。6.4.3 1.5% 浓度琼脂糖电泳分析。6.4.4 结果判读a,阳性:电泳显示相应大小DNA 片段。b,阴性:无特异性核酸片段扩增。6.4.5 意义阳性结果可以初步判断埃博拉病毒感染, 需排除交叉污
25、染。7 清场与消毒7.1 操作结束后,及时清理生物安全柜内的物品,用0.5%次氯酸钠溶液和 75% 乙醇擦试外表面后,移出生物安全柜放入冰箱中。7.2 未使用完的感染性生物材料销毁或放入BSL-3 级实验室 70冰箱,并如实填名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 10 页,共 28 页 - - - - - - - - - 11 写操作和处理记录。7.3 实验区内的污染材料高压处理(121高压 20min)后,再进行集中高压处理。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 -
- 配套讲稿:
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- 2022年埃博拉出血热实验室检测方案 2022 年埃博拉 出血热 实验室 检测 方案
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