基因表达调控 (2).ppt
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1、关于基因表达调控关于基因表达调控 (2)(2)课件课件现在学习的是第1页,共86页第第 一一 节节基本概念与原理基本概念与原理Basic Conceptions and Principle现在学习的是第2页,共86页一、基因表达的概念一、基因表达的概念* * 基因组基因组(genome)(genome)一个细胞或病毒所携带的全部遗传信一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。息或整套基因。它也是指含有一个生物体生存、发育、活动和它也是指含有一个生物体生存、发育、活动和繁殖所需要的全部遗传信息的整套核酸繁殖所需要的全部遗传信息的整套核酸。 现在学习的是第3页,共86页n细胞器DNA通常是环状
2、DNA分子,位于核外,基因结构与原核相似n 真核生物中,包括一套完整单倍体DNA(染色体DNA)和细胞器DNA的全部序列现在学习的是第4页,共86页是指储存遗传信息的是指储存遗传信息的基因经过一系列步骤表现基因经过一系列步骤表现出其生物功能的整个过程出其生物功能的整个过程。典型的基因表达是基典型的基因表达是基因经过转录、翻译,产生因经过转录、翻译,产生有生物活性的蛋白质的过有生物活性的蛋白质的过程。程。基因表达基因表达(gene expression)(gene expression)现在学习的是第5页,共86页基因表达是受调控的基因表达是受调控的 不是所有的基因表达都产生蛋白质,不是所有的基
3、因表达都产生蛋白质,rRNArRNA或或tRNAtRNA的基因经转录和转录后加工产生成熟的的基因经转录和转录后加工产生成熟的rRNArRNA或或tRNA,tRNA,也是也是rRNArRNA或或tRNAtRNA的基因表达,因为的基因表达,因为rRNArRNA或或tRNAtRNA就就具有在蛋白质翻译方面的功能。具有在蛋白质翻译方面的功能。 但是但是基因表达转录翻译基因表达转录翻译现在学习的是第6页,共86页 人的基因组中通常只有一部分人的基因组中通常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状态基因表达,多数基因处在沉静状态,典型的哺乳类细胞中开放转录的,典型的哺乳类细胞中开放转录的基因约在基因约在1
4、1万个上下,即使蛋白质合成万个上下,即使蛋白质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般也只有不超过胞,一般也只有不超过20%20%的基因处于的基因处于表达状态。表达状态。 生物基因组的遗传信息生物基因组的遗传信息并不是同时全部都表达出来的并不是同时全部都表达出来的现在学习的是第7页,共86页二、基因表达的时间性及空间性二、基因表达的时间性及空间性(一)时间特异性(一)时间特异性(temporal specificity)按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间顺序发生,称之为基因表
5、达的时间特异性时间特异性。 多细胞生物基因表达的时间特异性又称多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性阶段特异性(stage specificity)(stage specificity)。现在学习的是第8页,共86页(二)空间特异性(二)空间特异性(spatial specificity)又称又称细胞或组织特异性细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)(cell or tissue specificity)在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的组织空间顺序出现,称之为基因表达的
6、空间特异性空间特异性。现在学习的是第9页,共86页三、基因表达的方式三、基因表达的方式按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:(一)组成性表达(一)组成性表达某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为表达,通常被称为管家基因管家基因。管家基因管家基因(housekeeping gene)现在学习的是第10页,共86页无论表达水平高低,管家基因无论表达水平高低,管家基因较少受环境因素较少受环境因素影响影响,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。
7、区别于其他全部组织中持续表达,或变化很小。区别于其他基因,这类基因表达被视为基因,这类基因表达被视为组成性基因表达组成性基因表达(constitutive gene expression)(constitutive gene expression)。基本的基因表达只受到启动序列或者启动子基本的基因表达只受到启动序列或者启动子与与RNARNA聚合酶相互作用的影响聚合酶相互作用的影响 组成性基因表达也是相对的,而不是一成不变组成性基因表达也是相对的,而不是一成不变的,其表达强弱也是受一定机制调控的。的,其表达强弱也是受一定机制调控的。 现在学习的是第11页,共86页(二)诱导和阻遏表达(二)诱导和
8、阻遏表达适应性表达适应性表达(adaptive expression)(adaptive expression)指环境的变化指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达容易使其表达水平变动的一类基因表达。 诱导诱导 阻遏阻遏 现在学习的是第12页,共86页 是指在特定环境因素刺激下,可诱导基因被激是指在特定环境因素刺激下,可诱导基因被激活,从而使基因的表达产物增加。活,从而使基因的表达产物增加。 如如:DNA:DNA发生损伤时,修复酶的诱导激活。发生损伤时,修复酶的诱导激活。 诱导表达(诱导表达(inductioninduction) 在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,基在特定环境信号
9、刺激下,相应的基因被激活,基因表达产物增加,这种基因称为因表达产物增加,这种基因称为可诱导基因可诱导基因。现在学习的是第13页,共86页如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基因如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基因是是可阻遏基因可阻遏基因。可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为阻遏阻遏。阻遏阻遏(repression)(repression)如:如:周围有充足的葡萄糖,细菌就可以利用葡周围有充足的葡萄糖,细菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖类的酶类,如乳糖操纵子被阻遏、关闭糖类的酶类,如乳糖操纵子
10、被阻遏、关闭现在学习的是第14页,共86页在一定机制控制下,功能上相关的一组基因,在一定机制控制下,功能上相关的一组基因,无论其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达无论其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达,即为,即为协调表达协调表达(coordinate expression)(coordinate expression),这种调这种调节称为协调调节节称为协调调节(coordinate regulation)(coordinate regulation)。现在学习的是第15页,共86页四、基因表达调控的生物学意义四、基因表达调控的生物学意义(一)适应环境、维持生长和增殖(一)适应环境、维
11、持生长和增殖(二)维持个体发育与分化(二)维持个体发育与分化现在学习的是第16页,共86页基因激基因激活活转录起始转录起始 转录后加工转录后加工mRNAmRNA降解降解蛋白质降解等蛋白质降解等蛋白质翻译蛋白质翻译翻译后加工修饰翻译后加工修饰转录起始转录起始(一)基因表达的多级调控(一)基因表达的多级调控五、基因表达调控的基本原理五、基因表达调控的基本原理转录水平的基因表达调控最重要转录水平的基因表达调控最重要 现在学习的是第17页,共86页(二)基因转录激活调节基本要素(二)基因转录激活调节基本要素基因表达的调节与基因表达的调节与基因基因的结构、性质,生物个的结构、性质,生物个体或细胞所处的内
12、、外体或细胞所处的内、外环境环境,以及细胞内所存在的,以及细胞内所存在的转录转录调节蛋白调节蛋白有关。有关。1. 1. 特异特异DNADNA序列和调节蛋白质序列和调节蛋白质现在学习的是第18页,共86页原核生物原核生物 蛋白质因子蛋白质因子 操纵子操纵子(operon)(operon) 机制机制特异特异DNADNA序列序列 编码序列编码序列 启动序列启动序列 操纵序列操纵序列 其他调节序列其他调节序列(promoter)(promoter)(operator)(operator)现在学习的是第19页,共86页是是RNARNA聚合酶结合并启动转录的聚合酶结合并启动转录的特异特异DNADNA序列。
13、序列。1) 1) 启动序列启动序列RNA转录起始转录起始-35区区-10区区TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrp tRNATyrlacrecAAra BAD TTGACA TATAAT共有序列共有序列现在学习的是第20页,共86页共有序列共有序列(consensus sequence)(consensus sequence) 决定启动决定启动序列的转录活性大小。序列的转录活性大小。某些特异因子(蛋白质)某些特异因子(蛋白质)决定决定RNARNA聚
14、合酶聚合酶对对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。现在学习的是第21页,共86页阻遏蛋白阻遏蛋白(repressor)(repressor)的结合位点的结合位点当操纵序列结合有当操纵序列结合有阻遏蛋白阻遏蛋白时,会阻碍时,会阻碍RNARNA聚聚合酶与启动序列的结合,或是合酶与启动序列的结合,或是RNARNA聚合酶不能沿聚合酶不能沿DNADNA向前移动向前移动 ,阻碍转录。,阻碍转录。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol阻遏蛋白阻遏蛋白2 2 操纵序列操纵序列 现在学习的是第22页,共86页3) 3) 其他调节序列、调节蛋白
15、其他调节序列、调节蛋白例如例如激活蛋白激活蛋白(activator)(activator)可结合启动序列邻近可结合启动序列邻近的的DNADNA序列,促进序列,促进RNARNA聚合酶与启动序列的结合,增聚合酶与启动序列的结合,增强强RNARNA聚合酶活性。聚合酶活性。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白现在学习的是第23页,共86页有些基因在没有激活蛋白存在时,有些基因在没有激活蛋白存在时,RNARNA聚合酶聚合酶很少或完全不能结合启动序列。很少或完全不能结合启动序列。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白现在学习的是
16、第24页,共86页真核生物真核生物1) 1) 顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)(cis-acting element)可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表达活性的DNADNA序列序列 顺式作用元件并非都位于转录起始点的上游顺式作用元件并非都位于转录起始点的上游(5(5端端) ) 启动子启动子 增强子增强子 沉默子沉默子RNA聚合酶聚合酶BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点mRNARNA聚合酶聚合酶BADNA转录起始点转录起始点mRNA现在学习的是第25页,共86页顺式作用元件通常是基因的非编码序列。顺式作用元件通常是基因的非编码序列。不同真核生物的
17、顺式作用元件中也会发现一些不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列共有序列 ,如,如TATATATA盒、盒、CAATCAAT盒等,这些共有序盒等,这些共有序列是列是RNARNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。聚合酶或特异转录因子的结合位点。现在学习的是第26页,共86页2) 2) 真核基因的调节蛋白真核基因的调节蛋白由某一基因表达产生的蛋白质因子,通过与另由某一基因表达产生的蛋白质因子,通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用,调节其表达一基因的特异的顺式作用元件相互作用,调节其表达。 反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)(trans-acting fa
18、ctor) 这种调节作用称为这种调节作用称为反式作用反式作用。 aDNA反式调节反式调节BA mRNA蛋白质蛋白质AA现在学习的是第27页,共86页cDNAC顺式调节顺式调节 mRNA C蛋白质蛋白质C还有蛋白质因子可特异识别、结合自身还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列,调节自身基因的表达,称基因的调节序列,调节自身基因的表达,称顺式作用顺式作用。现在学习的是第28页,共86页指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的特指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的特异识别及结合。通常是异识别及结合。通常是非共价非共价结合,被识别的结合,被识别的DNADNA结合位点通常呈对称、或不完全对称结
19、构。结合位点通常呈对称、或不完全对称结构。2. DNA - 2. DNA - 蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质- -蛋白质蛋白质的相互作用的相互作用现在学习的是第29页,共86页DNA-binding protein can facilitate interaction between DNA-binding proteins at a distance现在学习的是第30页,共86页绝大多数调节蛋白质结合绝大多数调节蛋白质结合DNADNA前,需通过蛋白质前,需通过蛋白质- -蛋白质相互作用,形成蛋白质相互作用,形成二聚体二聚体(dimer)(dimer)或或多聚体多聚体(polymer)(polyme
20、r)。(。(同质或异质同质或异质)也有的是在结合也有的是在结合DNADNA前,需要蛋白质与蛋白质之前,需要蛋白质与蛋白质之间的解聚过程间的解聚过程 真核生物中由于蛋白质因子真核生物中由于蛋白质因子的浓度等的不同,会造成不同细的浓度等的不同,会造成不同细胞中同一基因表达程度的不同胞中同一基因表达程度的不同现在学习的是第31页,共86页 Action at a Distance and DNA Looping. 一些蛋白彼此相互作用,即使它们结合在DNA上的位点彼此分开现在学习的是第32页,共86页3. RNA3. RNA聚合酶聚合酶 原核启动序列原核启动序列/ /真核启动子与真核启动子与RNAR
21、NA聚合酶活性聚合酶活性 启动子有强弱只分。启动子有强弱只分。 真核的真核的RNA-polRNA-pol活性除与启动子序列有关,和转录因活性除与启动子序列有关,和转录因子的存在与否有关子的存在与否有关现在学习的是第33页,共86页 调节蛋白与调节蛋白与RNARNA聚合酶活性聚合酶活性启动序列决定基础转录频率,一些特异调节蛋启动序列决定基础转录频率,一些特异调节蛋白在适当环境信号(如诱导剂和阻遏剂等)刺激下白在适当环境信号(如诱导剂和阻遏剂等)刺激下在细胞内表达,然后通过在细胞内表达,然后通过DNA-DNA-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质- -蛋白蛋白质相互作用影响质相互作用影响RNARNA聚合酶
22、活性,使基础转录频率发聚合酶活性,使基础转录频率发生变化,从而引起表达的变化。生变化,从而引起表达的变化。热休克反应热休克反应细菌的细菌的RNARNA聚合酶聚合酶 7070 (启动常规基因表达)被(启动常规基因表达)被 3232取取代,从而启动另一套基因的表达。代,从而启动另一套基因的表达。现在学习的是第34页,共86页第第 二二 节节 原核基因转录调节原核基因转录调节Regulation of Prokaryotic Gene Transcription现在学习的是第35页,共86页调节的主要环节在调节的主要环节在转录起始转录起始一、原核基因转录调节特点一、原核基因转录调节特点(一)(一)因
23、子决定因子决定RNARNA聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性 只有一种只有一种RNA-polRNA-pol,但是有很多种,但是有很多种因子因子(二)操纵子模型的普遍性(二)操纵子模型的普遍性(三)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性(三)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性现在学习的是第36页,共86页 存在于原核生物中的一种主要的调控模式是操存在于原核生物中的一种主要的调控模式是操纵子(纵子(operonoperon)调控模式,该模式也见于低等真核生)调控模式,该模式也见于低等真核生物中。物中。 在原核生物中,若干结构基因可串联在一起,其在原核生物中,若干结构基因可串联在一起,其表达受到同一调控系统的调控,这种基
24、因的组织形式表达受到同一调控系统的调控,这种基因的组织形式称为操纵子(称为操纵子(operonoperon) 操纵子操纵子现在学习的是第37页,共86页n典型的操纵子可分为控制区和信息区两部分。控制区由各种调控基因所组成,而信息区则由若干结构基因串联在一起构成。 调调节节基基因因(R Re eg gu ul la at to or ry y g ge en ne e)为为阻阻抑抑蛋蛋白白编编码码基基因因 控控制制区区 启启动动基基因因(P Pr ro om mo ot te er r)为为 c cA AM MP P 受受体体蛋蛋白白(C CR RP P)和和 R RN NA A 聚聚合合酶酶结
25、结合合区区。 操操纵纵基基因因(0 0p pe er ra at te er r)为为阻阻抑抑蛋蛋白白结结合合位位点点。 信信息息区区由由一一个个或或数数个个结结构构基基因因串串联联在在一一起起组组成成。 操纵子的结构操纵子的结构现在学习的是第38页,共86页可诱导和可阻遏的操纵子可诱导和可阻遏的操纵子类型类型 结合结合 O O 方式方式 O O 的开放方的开放方式式 结构基因产结构基因产物功能物功能 可诱导可诱导 i i 基因产物基因产物 由代谢底物由代谢底物开放通常开开放通常开放放 分解代谢分解代谢 可阻遏可阻遏 i i 基因产物加基因产物加上代谢终产物上代谢终产物 由代谢终产由代谢终产物
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