医学文献检索综合报告.doc

《医学文献检索综合报告.doc》由会员分享，可在线阅读，更多相关《医学文献检索综合报告.doc（15页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、医 学 文 献 检 索 综 合 报 告最后修订日期：2009年6月30日星期三一、拟检索课题的背景知识及总体检索思路1、课题背景知识简介帕金森病(Parkinson Disease, PD) 是一种以中脑黑质纹状体系统的多巴胺能神经元变性, 导致分泌的多巴胺递质降低, 引起静止震颤、四肢僵硬、运动迟缓及体位不稳为主的锥体外系疾病。目前临床以药物治疗为主。左旋多巴可以改善临床症状, 但仅是一种递质替代治疗, 不能中止或逆转病程, 而且服用时间长会出现剂末现象、开关现象等一系列并发症。近年来的研究进展显示，移植多巴胺能神经元替代已经变性的神经元, 恢复黑质纹状体多巴系统的完整性并改善其功能, 很可

2、能是一项非常有前途的治疗措施。但是成人的神经干细胞并不容易获得。胚胎的多巴能神经元移植可以减轻PD动物模型的行为学缺失, 但存在日益目的伦理学问题, 因此探索神经细胞的其它组织来源成为最重要的问题。骨髓基质干细胞（bone marrow stromal cells）或骨髓间充质干细胞（bone marrow mesenchymal stem cells，BMSCs）是间充质干细胞的一种，是具有多向分化潜能的成体干细胞。1998年，Azizi SA等将人的MSCs注入小鼠纹状体后能迁移并分化为星形胶质细胞、少突胶质细胞和神经元后，引起了人们广泛的关注。研究表明，在适宜的条件下, 骨髓基质干细胞经

3、过诱导在体内、外均可分化为神经元样细胞, 并表达一些神经标志性蛋白，将其注入帕金森病模型大鼠纹状体内，能形成表达神经标志性蛋白的神经元样细胞或星形胶质细胞, 产生的细胞可在受损部位周围存活甚至移行至全脑, 并明显恢复运动功能，并具有取材方便、来源充足、可在短时间内大量扩增、易被外源基因转染、能透过血脑屏障、可进行自体移植等优点，适合移植。因此，骨髓基质干细胞为帕金森病治疗带来了新的希望。本课题检索旨在通过查询相关文献，了解目前骨髓基质干细胞在帕金森病治疗中的应用。2、检索需求分析及基本策略制定检索概念分析：本课题涉及三个显性主题概念：骨髓基质干细胞、帕金森氏病、治疗。在实际操作中，发现骨髓基质

4、干细胞有一相近概念：骨髓间充质干细胞。通过多方资料搜寻和向该专业人士咨询（具体过程请见综合分析第二部分），最终确定两者为同一事物，由于命名尚未统一，因此不同文献使用不同的名称。因此在检索时分别以“骨髓基质干细胞”和“骨髓间充质干细胞”为检索词进行检索，可以拓展我们的检索内容，以获取更多、更全面的相关文献，确保查全率。另外对于“帕金森”这一提法亦有两个易混淆概念：帕金森病和帕金森综合症。经过调查，确定两者是不同事物，因此实际操作时只取“帕金森病” （研究型的中文文献极少使用“帕金森氏病”为关键词，具体分析过程请见后述）为检索词进行检索，以确保查准率。在确保查全率的基础上，使用“治疗”为限定词或副

5、主题词，进一步限定检索结果。初步认为无需要探究隐性概念。学科范围侧重：本课题目前仍处于基础研究阶段，主要使用动物为实验对象，临床上研究甚小，其学科范围侧重于基础。因此操作中主要选择多个生物医学数据库进行检索，如CBM、BP、PubMed等。另外在实际操作中可以发现，由于本课题具有非常巨大的应用前景，因此目前无论国内外，关于本课题的研究均十分热门。因此为了全面掌握该课题的相关信息，我们需要同时检索中文和外文数据库。检索年限： 根据课题背景知识的简介，我们理论上只需查询1998年以后的文献。由于为了保证能够尽快了解最新进展，并且考虑到可以从综述了解前一阶段研究的概况，初步考虑查询近 5-6年的文献

6、（即2004-2009）。查询范围： 包括我校购买的电子数据库以及网络信息检索。文章类型： 期刊论文，综述，会议论文等。检索关键词： 中文：“骨髓基质干细胞”或“骨髓间充质干细胞”、“帕金森病”、 “治疗”；外文：bone marrow stromal cells, bone marrow(marrow-derived) mesenchymal stem cells, mesenchymal stem cells，bone mesenchymal stem cells；Parkinson disease，therapy, therapeutic use;总体检索思路：先查询CBMDisc数据库

7、，了解各检索内容的中、英文主题词并且查询文献，可获得文献摘要及部分全文（与VIP链接）；再查询CNKI，VIP等全文数据库，利用主题词与自由词相结合的方法提高查全率和查准率。英文数据库计划先从MEDLINE或PubMed提供的主题词库中查询，并同时查询文献摘要；再查询 PubMed获取题录、摘要及部分全文。接着查询全文数据库如Elsevier Science数据库、OVID平台、SCI等；最后查询事实型数据库或循证医学数据库，以及网络信息资源。并从检出文献的相关文献中高效寻找所需信息。另外，可从馆藏书目及网络信息中检索。备注： 由于本次实习是为了回顾和检验所学的检索手段，因此每个数据库均尝试使

8、用多种的检索途径，鉴于篇幅，一些检索途径不作细述，敬请原谅。二、检索工具及检索过程1、中国生物医学文献数据库(CBMDisc)检索思路： 选择主题检索，利用其主题词功能先查找主题词，输入“骨髓基质干细胞”，无结果，减少要求，输入“干细胞”，出现多条结果，发现其中一个款目词为“干细胞, 骨髓”，对应的主题词为“骨髓祖代细胞”(Myeloid Progenitor Cells)。另外尝试输入“骨髓”，同样出现“骨髓祖代细胞”的主题词。输入帕金森氏病，无结果，减少要求，输入“帕金森病”，得到相应的主题词“帕金森病” （Parkinson Disease）利用主题词与自由词相结合的方法提高查全率；选择

9、限定检索，将年代范围设置为2004-2009；检索过程检索年限：2004-2009 检索途径: 主题检索 检索词： 骨髓祖代细胞、帕金森病 初步检索策略：#1 1797 主题词=骨髓祖代细胞/全部副主题/全部树限定：20042009#2 7381 主题词=帕金森病/全部副主题限定：20042009#3 4 #2 and #1 初步检索结果： 只检出4篇文献，且只有3篇较为符合检索需求 初步检索结果分析：可能由于“骨髓祖代细胞”的概念过于模糊，或CBM未将其与骨髓基质干细胞进行匹配，造成检索结果不佳。 检索策略调整：选择基本检索，检索词为骨髓基质干细胞和骨髓间充质干细胞，再进行逻辑组配#4 40

10、27 骨髓基质干细胞 OR 骨髓间充质干细胞#5 26 (#4 or #1) and #2 检索结果：26 篇文献，且均与检索课题相关度高，若使用“(骨髓基质干细胞 OR 骨髓间充质干细胞) AND 帕金森病”直接检索，则得到20篇再次调整：尝试限定主题词“帕金森病”的副主题词“治疗”#6 2591 主题词=帕金森病/DH/DT/NU/PC/RH/RT/SU/TH/AL/QL/ZJ/ZH/ZD/ZY#7 18 (#4 or #1) and #6 结果所得文献数和#5相近，且结果基本相同，可见目前国内骨髓基质干细胞在帕金森病方面的研究集中在治疗方面。 检出文献题录：1 吴立克, 王晓娟. 骨髓基

11、质干细胞治疗帕金森病的研究进展. 国外医学老年医学分册, 2008; 29(4): 181-1842 叶民; 陈生弟; 汪锡金; 陆国强; 梁梁; 徐洁懿. 体外诱导骨髓基质干细胞治疗帕金森病大鼠模型的研究. 中华神经科杂志, 2005.10.23; 38(10): 624-6273 陈欢意, 牛平. 骨髓基质干细胞的生物学特性与帕金森病的治疗. 解剖科学进展, 2006; 12(3): 248-2512、中国知网全文数据库（CNKI)检索思路：选择高级检索，考虑到CNKI不能进行检索史的组合，因此采用高级检索；检索项选择主题，CNKI中的关键词由作者提供，使用题名或关键词检索可能会遗漏部分结

12、果。为首先确保查全率，在检索项一栏选择“主题”，相当于以往版本中的“篇名/关键词/摘要”，将大部分涉及此课题的信息检出，再缩窄范围进行调整。另外，从CBM的检索结果可知，“骨髓祖代细胞”的标准概念不能代表我们需要查找的“骨髓基质干细胞”或“骨髓间充质干细胞”，因此舍弃此主题词。检索过程检索年限：2004-2009 检索途径: 高级检索，检索项选择“主题” 检索词： 骨髓基质干细胞、骨髓间充质干细胞、帕金森病 初步检索策略：首次检索条件：主题=帕金森病 从2004-2009二次检索条件：主题=骨髓基质干细胞+主题=骨髓间充质干细胞或直接将所有检索词输入3个检索框：主题=骨髓基质干细胞+主题=骨髓

13、间充质干细胞*主题=帕金森病 从2004-2009初步检索结果： 检出89条记录 初步检索结果分析：部分文献与待检课题相关度低，故需进一步提高查准率 检索策略调整：主题=骨髓基质干细胞+主题=骨髓间充质干细胞*关键词=帕金森病 从2004-2009检索结果：检出64条记录，发现仍有部分文献不符合检索意向，即使“帕金森病”不是关键词而只出现在文章中某一部分的文献亦被包括在内。结果不能令人满意再次调整：主题=骨髓基质干细胞+主题=骨髓间充质干细胞*题名=帕金森病 结果：检出36条记录，均与待检课题相关度高另外使用： 主题=骨髓基质干细胞+主题=骨髓间充质干细胞*主题=帕金森病*主题=治疗结果：检出

14、18条记录，均与待检课题相关度高，可以终止检索检出文献题录：1 顾平; 王坤; 王彦永; 骨髓基质干细胞和神经干细胞移植治疗帕金森病大鼠的效果比较. 中国组织工程研究与临床康复, 2008, 12(12):2221-22262 胡琦，康慧聪，刘晓艳，许峰，李巷,朱遂强.增强型绿色荧光蛋白标记骨髓间充质干细胞移植对帕金森病大鼠模型的治疗作用. 华中科技大学学报(医学版),2009,38(2):181-189 3王晓萃,李鑫,付文玉,王玉良.魏志新骨髓间充质干细胞源神经细胞移植治疗帕金森病大鼠模型. 中国实验动物学报, 2009,17(2):130-1343、PubMed数据库检索思路：利用Mes

15、H Database查询规范化的关键词，得到“帕金森病”的规范主题词为Parkinson disease，而骨髓基质（间充质）干细胞则查询不到相应主题词，因此选择从已得的中文文献的外文参考文献中确定搜索词，分别为：bone marrow stromal cells，bone marrow mesenchymal stem cells；同样，使用Medline数据库的主题词检索功能亦查询不到骨髓基质（间充质）干细胞的相应主题词选择基本检索，PubMed拥有自动词语匹配功能，将重要的词语结合在一起并转换成规范的用词，使结果更精确，因此不妨直接使用基本检索，再使用检索史进行逻辑组配。考虑到骨髓基质干

16、细胞的英文表达词形式多样，因此先不使用”进行限定；在检出文献的基础上用“”限定词组以提高查准率。CBMdisc数据库是参照PubMed数据库构建的，因此两者的检索方式大同小异。检索过程检索年限：2004-2009 检索途径: 基本检索 检索词： bone marrow stromal cells, bone marrow(marrow-derived) mesenchymal stem cells, mesenchymal stem cells，bone mesenchymal stem cells；Parkinson disease，therapy, therapeutic use 初步检索

17、策略：#1 Search bone marrow stromal cells OR bone mesenchymal stem cells OR mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cells 9251#2 Search parkinson disease 39744#3 Search (#2) AND (#1) Limits: published in the last 5 years 23初步检索结果： 检出23条记录 初步检索结果分析：检出文献较多，且与检索课题相关度较高。但通过观察发现，部分文献题名中使用Park

18、insons disease，因此尝试使用其为检索词，命中58条记录，检出文献数增多，并将前述记录包含在内，同时与检索课题相关度较高，提高了查全率 检索策略调整：使用主题检索#1 Search bone marrow stromal cells OR bone mesenchymal stem cells OR mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cells 9251#4 Search Parkinson DiseaseMesh 34145#5 Search (#4) AND (#1) Limits: published

19、 in the last 5 years 16检索结果：检出16条记录结果分析：检出文献均与课题相关度十分高，提高了查准率另外应用副主题词限定检索：#1 Search bone marrow stromal cells OR bone mesenchymal stem cells OR mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cells 9251#6 Search (Parkinson Disease/therapeutic useMesh OR) Parkinson 16425 Disease/therapyMesh#7

20、Search (#6) AND (#1) 15检出15条与前文相近的记录，表明目前国际范围内，骨髓基质干细胞在帕金森病方面的研究集中在治疗方面，与国内情况一致检出文献题录:1 Dezawa M. Systematic neuronal and muscle induction systems in bone marrow stromal cells: the potential for tissue reconstruction in neurodegenerative and muscle degenerative diseases. Med Mol Morphol,2008, 41(1):

21、14-92 Ye M, Wang XJ, Zhang YH, et al. Transplantation of bone marrow stromal cells containing the neurturin gene in rat model of Parkinsons disease. Parkinsonism Relat Disord, 2007, 13(1):44-93 Lee PH, Park HJ. Bone marrow-derived mesenchymal stem cell therapy as a candidate disease-modifying strate

22、gy in Parkinsons disease and multiple system atrophy. J Clin Neurol. 2009 Mar;5(1):1-10. Epub 2009 Mar 314、SCI数据库检索思路：进入WOK平台，选择Web of Science; 使用高级检索，检索史组配方式；使用“Parkinson* disease*”为检索词提高查全率，而bone marrow stromal cells, bone marrow mesenchymal stem cells等则不需要（实践证明）；按照规则，在SCI数据库，短语不需用”括起（实践证明两者还是有区别）

23、；尝试使用二次检索(therapy OR therapeutic use)精炼结果；检索过程检索年限：2004-2009 检索途径: 基本检索 检索词： bone marrow stromal cells, bone marrow(marrow-derived) mesenchymal stem cells, mesenchymal stem cells，bone mesenchymal stem cells；Parkinson disease，therapy, therapeutic use 初步检索策略：# 1 13117 TS=(bone marrow stromal cells OR

24、bone mesenchymal stem cells OR mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cells) Databases=SCI-EXPANDED Timespan=2004-2009# 2 28947 TS=(Parkinson* disease*) Databases=SCI-EXPANDED Timespan=2004-2009# 3 122 #2 AND #1 Databases=SCI-EXPANDED Timespan=2004-2009初步检索结果： 命中122条记录 初步检索结果分析：检出的文献

25、数量较多，此结果与使用逻辑运算式组配的结果一致，不再赘述 检索策略调整：使用二次检索# 4 72 #2 AND #1 Refined by: Topic=(therapy OR therapeutic use)Databases=SCI-EXPANDED Timespan=2004-2009 检索结果：命中72条记录，查准率更高,且绝大部分与检索意向相符检出文献题录：1 Kitada Masaaki, Dezawa Mari. Induction system of neural and muscle lineage cells from bone marrow stromal cells;

26、a new strategy for tissue reconstruction in degenerative diseases. Histology and Histopathology, 2009, 24(5), 631-6422 Wang Ting-Hua, Feng Zhong-Tang, Wei Peng,et al. Effects of pcDNA3-beta-NGF gene-modified BMSC on the rat model of Parkinsons disease. Journal of Molecular Neuroscience, 2008, 35 (2)

27、: 161-1693 Chopp Michael, Li Yi. Transplantation of bone marrow stromal cells for treatment of central nervous system diseases. Tissue Engineering, 2006, 585: 49-64 5、Elsevier Science数据库检索思路：根据经验，使用高级检索便于得到准确齐全的结果。检索过程检索年限：2004-2009 检索途径: 高级检索 检索词： bone marrow stromal cells, bone marrow(marrow-deriv

28、ed) mesenchymal stem cells, mesenchymal stem cells，bone mesenchymal stem cells；Parkinson disease，therapy, therapeutic use 初步检索策略：(pub-date 2003 and TITLE-ABSTR-KEY(bone marrow stromal cells OR bone mesenchymal stem cells) or TITLE-ABSTR-KEY(mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cell

29、s) and parkinson disease 初步检索结果： 命中97条记录 初步检索结果分析：命中文献大部分与检索意向十分符合，但部分相关性不高，因此重新检索 检索策略调整：(pub-date 2003 and TITLE(bone marrow stromal cells OR bone mesenchymal stem cells) or TITLE(mesenchymal stem cells OR bone marrow mesenchymal stem cells) and parkinson disease 检索结果：命中61条记录，基本满足所需。尝试使用布尔语言检索（高级检

30、索），所得结果相近，在此不再赘述 检出文献题录:1 Min Ye, Xi-Jin Wang, Yu-Hong Zhang, et al. Therapeutic effects of differentiated bone marrow stromal cell transplantation on rat models of Parkinsons disease. Parkinsonism & Related Disorders, 2007, 13(1):44-492 Sokreine Suon, Ming Yang, Lorraine Iacovitti. Adult human bone

31、 marrow stromal spheres express neuronal traits in vitro and in a rat model of Parkinsons disease. Brain Research, 2006,1106(1),:46-513 Dimitrios Karussis, Ibrahim Kassis, Basan Gowda S. Kurkalli, et al. Immunomodulation and neuroprotection with mesenchymal bone marrow stem cells (MSCs): A proposed

32、treatment for multiple sclerosis and other neuroimmunological/neurodegenerative diseases. Journal of the Neurological Sciences, 2008, 265(1-2):131-1356、OVID平台循证医学库检索思路：由于本课题绝大部分是基础研究，目前尚未能应用于临床治疗，因此在专门提供临床指导信息的循证医学数据库难以获得较多资料；通过合理外展搜索条件，尝试了解目前治疗PD的一些与本课题有可比性的原则和案例。检索过程检索年限：不限定检索年限以扩大搜索范围 检索途径: 关键词检索

33、 检索词： stem cells, Parkinson disease，transplantation 初步检索策略：”parkinson disease”AND “stem cells” 初步检索结果：0条记录 初步检索结果分析：由于干细胞治疗PD均应用移植手段，因此尝试使用transplantation为检索词 检索策略调整： ”parkinson disease”AND transplantation 检索结果：26条记录 检出文献题录：1 Transplantation of embryonic dopamine neurons for severe Parkinsons diseas

34、e. Freed CR, Greene PE, Breeze RE, Tsai WY, DuMouchel W, Kao R, Dillon S, Winfield H, Culver S, Trojanowski JQ, Eidelberg D, Fahn S. The New England journal of medicine, 2001, 344(10):710-92 Price LH, Spencer DD, Marek KL, Robbins RJ, Leranth C, Farhi A, Naftolin F, Roth RH, Bunney BS, Hoffer PB. Ps

35、ychiatric status after human fetal mesencephalic tissue transplantation in Parkinsons disease. Biological psychiatry, 1995, 38(8):498-5053 Schumacher JM, Ellias SA, Palmer EP, Kott HS, Dinsmore J, Dempsey PK, Fischman AJ, Thomas C, Feldman RG, Kassissieh S, Raineri R, Manhart C, Penney D, Fink JS, I

36、sacson. Transplantation of embryonic porcine mesencephalic tissue in patients with PD. Neurology, 2000, 54(5):1042-507、馆藏书刊目录馆藏书目资源站点网址：http:/202.116.65.88/cgi-bin/EnterIlasweb?v_src=IlaswebBib.html 检索途径：题名检索 检索词： 帕金森病 结果： 命中28条记录，均为临床诊疗或保健方面的书目，没有合符检索意向的项目 检出书目信息：无8、网络信息检索Google学术搜索：SCIRUS: 丁香园：中国干

37、细胞网： 等等三、综合分析1、 所学的中外文数据库特点（按讲授顺序介绍）CBMdisc数据库收录范围与资源数量：学科覆盖范围涉及了基础医学、临床医学、预防医学等生物医学的各个领域；收录了1978年以来1600多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录，年增长量约40余万篇，数据总量达350余万篇，是国内生物医学文献最重要的数据库。检索功能：有英汉对照医学主题词注释字顺表，检索方式灵活，可以用中英文主题词检索, 可进行主题词的扩展检索、预扩展检索、加权检索、主题词与副主题词的组配检索，可以进行分类号的扩展、概念复分及总论复分检索，可以通过文本词、著者、著者单位、刊名、年代、卷期、文献类型

38、等30 多个途径进行检索，可以进行截词检索、通配符检索, 及进行各种逻辑组配，可以自由词检索，也可以主题词搭配副主题词检索，可进行精 确检索和模糊检索，有二次检索功能，可以进行检索史的组合。输出特点：可与VIP全文数据库链接，页面简单，查询速度较快。PubMed数据库收录范围与资源数量：外文文摘型数据库，内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医学保健和情报科学等领域，涵盖了Medline和PreMedline数据库，收录了自1950年至今的全世界70多个国家和地区的3 900余种生物医学期刊，为当前最有国际权威的生物医学文献数据库；检索功能：有多种检索方式，可以自

39、动词语匹配，使检索结果更精确。可以很方便的进行逻辑组配和检索史组合。输出特点：PubMed系统有几种不同的格式显示检索结果，默认的为Summary格式，另外还有Brief、Abstract、Citation、Medline、XML等格式。具有强大的链接功能。可提供个体化服务，如储存个人检索式的My NCBI服务。提供部分免费和付费全文链接服务。更新周期：更新周期短，通过PubMed数据库的检索我们可以随时获取最新文献。出版商在期刊出版之前或同时，将期刊论文题录提供给PubMed，NLM每天把最新文献加入到PreMedline库中。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的正在印刷

40、出版过程中的文献摘要，所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，如H1N1流感等，从而大大有利于自己的临床和研究工作。SCI数据库收录范围与资源数量：外文引文检索型数据库。收录面广、综合性强，收录自然科学方面100余个学科的数据，是自然科学方面的大型综合性参考数据库。权威度高，选录的都是被引频次最高的期刊，均是自然科学各领域核心的质量较好的期刊。检索功能：有功能强大且独特的引文检索功能。可利用引文检索快速方便地了解某个研究的发展趋势，有突出表现的研究人员，从事这方面研究的机构，进展。还有WOK平台的个性服务。查询速度较其他外文数据库如PubMed等快。 输出特点：分别以被引频次和日期排序。先以题录格式显示检索结果，点击进入全记录。使用高级检索时搜得文献数只显示在下方的检索史中，使结果显示加快。