实时荧光定量PCR详细操作步骤(3页).doc
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1、-实时荧光定量PCR详细操作步骤-第 3 页实时荧光定量PCR组织RNA提取:一般认为100mg肝组织提取RNA 500ng,100mg肺提取RNA 200ng,脑内的RNA丰度适中,100mg脑组织,提取RNA 5-200ng。所以一个10mg的海马可匀出RNA约为20ng。反转录反应 反转录反应参照TaKaRa RT-PCR说明书。反转录反应条件如下。 37C 15 min(反转录反应) 85C 5 sec(反转录酶的失活反应) Real Time PCR反应 选用脑源神经营养因子(BDNF)为目标基因,核糖体18S rRNA(18S rRNA)做为内参。基因引物序列扩增片段长度NR2BN
2、R2B(+)CCGCAGCACTATTGAGAACA213 bpNR2B()ATCCATGTGTAGCCGTAGCC18s rRNA18s rRNA(+)TTTGTTGGTTTTCGGAACTGA198 bp18s rRNA()CGTTTATGGTCGGAACTACGA1) 按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。 试剂 使用量 终浓度 SYBR Premix Ex TaqTM(2) 12.5 l1 PCR Forward Primer(10 M) 1 l0.4 MPCR Reverse Primer(10 M) 1 l0.4 M模板(cDNA溶液) ldH2O 10 lTotal 25 l 全班40人,分为5组,每组做8管。4管做BDNF,4管做18S rRNA。4管BDNF或者18S rRNA,采用相应的正反PCR引物。每种基因做两个模板,一个模板采用原液浓度,一个模板采用稀释一倍浓度,体积均为0.5 l。2)三步法PCR 首先95C 作用3 min。 PCR进行35个循环。步骤温度时间变性95C30 秒退火58C30 秒延伸72C30 秒融解曲线温度时间变温速度95C0秒20C/秒55C15秒20C/秒95C0秒0.1C/秒
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