生化复习资料25449(17页).doc
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1、-生化复习资料25449-第 17 页绪论生物化学(biochemistry):研究生物体内化学分子与化学反应的基础生命科学,从分子水平探讨生命现象的本质。研究内容主要包括生物分子的结构与功能,物质代谢及其调节,基因信息传递及其调控。第一章 蛋白质的结构与功能第一节 蛋白质的分子组成 组成人体蛋白质的20种氨基酸均属于L-氨基酸氨基酸的分类 氨基酸具有两性解离的性质共同或特异的理化性质 含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质 280 氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物 570蛋白质有许多氨基酸残基组成的多肽链 氨基酸残基的定义第二节 蛋白质的分子结构 定义一级结构 意义 定义 肽单元二级结构 螺旋
2、的定义,特点 折叠的定义 类型 -转角 无规卷曲 超二级结构定义 模体定义 侧链对二级结构的影响 结构域的定义 三级结构 定义 四级结构的定义 蛋白质的分类第三节 蛋白质的结构与功能的关系 一级结构是空间构象的结构基础 一级结构是高级结构和功能的基础 一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能 举例 氨基酸序列提供重要的生物进化信息 重要蛋白质的氨基酸序列改变可引起疾病 血红蛋白亚基与肌红蛋白结构相似 氧解离曲线蛋白质的功能依赖特定空间结构 血红蛋白亚基构想变化可影响氧结合 正|负协同效应 变构效应 两性电离性质 胶体性质蛋白质的理化性质 空间结构破环而引起变性 在紫外光谱区有特征吸收峰28
3、0 呈色反应可测定蛋白质溶液含量名词解释1. 氨基酸【蛋白质】的等电点(PI):在某一PH溶液中,氨基酸【蛋白质】解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的PH值称为该氨基酸【蛋白质】的等电点。【蛋白质溶液的PH大于等电点时,该蛋白质颗粒带负电荷,反之带正电荷】2. 蛋白质的一级结构(primary structure):蛋白质分子中,从端至端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构。一级结构的主要化学键是肽键,有的包含二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。3. 蛋白质的二级结构(secondary structure):指蛋白质分子中某一段肽链的局
4、部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。蛋白质二级结构包括螺旋,折叠,转角和无规卷曲。维持二级结构的化学键是氢键。4. 模体(motif):是具有特殊功能的超二级结构,它是由两个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象。一个模体总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊功能。如锌指节构,螺旋环螺旋。5. 蛋白质的三级结构(tertiary structure):指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。三级结构的形成与稳定主要靠次级键,如疏水键、盐键和范德华力等。6. 结构域(domai
5、n):在三级结构层次上,分质量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密的区域,并各行其功能,称为结构域。(结构域与分子整体以共价键相连,这是它与蛋白质亚基的区别)7. 分子伴侣(chaperon):蛋白质空间构象的形成由蛋白质的一级结构和分子伴侣决定,分子伴侣是帮助蛋白质正确折叠的一个蛋白质家族。8. 蛋白质的四级结构(quaternary structure):蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用。四级结构中各亚基间的结合力主要是氢键和离子键。9. 亚基(subunit):由两条或两条以上多肽链组成的蛋白质,每一条多肽链都有其完整的三级结构,称为蛋白质的亚基,各个亚基之
6、间以非共价键相连。10. 协同效应(cooperative effect):寡聚体蛋白中,一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合能力。如果是促进作用则称为正协同效应;反之则为负协同效应。11. 蛋白质变性(denaturation):在某些物理或化学因素的作用下,蛋白质的空间构象被破坏,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失。(一般认为蛋白质的变性主要发生在二硫键和共价键的破坏,不涉及一级结构氨基酸序列的改变。理化性质改变表现在:溶解度降低、黏度增加,结晶能力消失,生物活性丧失,易被蛋白酶水解等)12. 复性(renaturation):若蛋白质变性程度较轻,去除变性因
7、素后,有些蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性。13. 蛋白质沉淀:蛋白质变性后,疏水侧链暴露在外,肽链融汇相互缠绕继而聚集,因而从溶液中析出,这一现象称为蛋白质沉淀。(变性易于沉淀,沉淀不一定变性)问答题1. 组成蛋白质的20种氨基酸是如何分类的?20种氨基酸根据其侧链的结构和理化性质分为五类:非极性脂肪族氨基酸(Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro)极性中性氨基酸(Ser、Cys、Met、Asn、Gln、Thr)芳香族氨基酸(Phe、Trp、Tyr)酸性氨基酸(Asp、Glu)碱性氨基酸(Lys、Arg、His)2. 氨基酸具有的理化性质。 两性解离;含共轭双键的
8、氨基酸(Trp、Tyr)具有紫外吸收性质(280mm);氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物。3.简述谷胱甘肽(GSH)的结构和功能 GSH是由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸组成的三肽,第一个肽键由谷氨酸-羧基与半胱氨酸的氨基组成,GSH的SH代表半胱氨基酸残基上的巯基,是该化合物的组要功能基团。 功能:解毒功能:SH具有嗜核特性,能与外源嗜电子毒物如致癌剂或药物等结合从而阻断这些化合物与DNA、RNA或蛋白质结合,以保护机体免受损害。GSH是细胞内重要的还原剂,它保护蛋白质分子中的巯基免遭氧化,使蛋白质或酶处在活性状态。GSH上的氢,在GSH过氧化物酶的催化下,能还原细胞内产生的22,使其变成2,同
9、时GSH成为氧化性即GSSG,后者又在GSH还原酶的催化下,再生成GSH。因此GSH是细胞中极为重要的还原剂。4. 试述蛋白质二级结构的要点。 蛋白质的二级结构主要包括:-螺旋,-折叠,-转角,无规卷曲。-螺旋:1)多肽链的主链围绕中心轴成有规律的螺旋式上升,螺旋的走向为顺时针方向,即右手螺旋;2)氨基酸侧链伸向螺旋外侧;3)每个肽键的亚氨基氢和第4个肽键的羰基形成氢键,依此类推,肽链中的全部肽键都形成氢键,以稳固-螺旋的结构;4)每3.6个氨基酸残基螺旋上升一周,螺距为0.54mm。-折叠:多肽链充分伸展,每个肽单元以C为旋转点,依次折叠成锯齿结构;2)氨基酸侧链交替的位于锯齿结构的上下方;
10、3)2条以上肽链或一条肽链内的若干肽段平行排列,通过链间羰基氧和亚氨基氢形成氢键,从而稳固-折叠的结构;4)肽链有顺式平行和反式平行两种。-转角:1)常发生于肽链180回折时的转角上;2)通常由4个氨基酸残基组成,其第1个残基的羰基氧与地4个残基的亚氨基氢形成氢键,第2个残基常为脯氨酸。无规卷曲:用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。5. 简述蛋白质的理化性质。 蛋白质由氨基酸组成,又是生物大分子物质,所以其既有氨基酸的性质,又有其作为生物大分子的独特性质。(1) 两性电离:蛋白质是两性电解质,在某一PH溶液中,蛋白质解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的P
11、H值称为该蛋白质的等电点。(2) 胶体性质:蛋白质颗粒表面形成水化膜及带电荷,使蛋白质在溶液中稳定存在。(3) 蛋白质酸性、沉淀和凝固:某些理化因素可以破坏蛋白质的空间构象,使其变性,变形后的蛋白质容易发生沉淀,将变性后的蛋白质加热,使其不溶于强酸、强碱中,此即为蛋白质的凝固作用。(4) 蛋白质的紫外吸收:蛋白质分子中也有含共轭双键的酪氨酸和色氨酸,因此在280mm处,有特征性吸收峰,据此性质可作为蛋白质的定量测定。蛋白质的呈色反应:(1) 茚三酮反应:氨基酸+茚三酮水合物还原茚三酮+氨、还原茚三酮+茚三酮蓝紫色化合物,此性质可作为氨基酸定量分析方法。(2) 双缩脲反应:肽键+硫酸铜(加热、衡
12、碱溶液)紫色、红色物,氨基酸无此反应,此可作为检测蛋白质水解程度。附 第二章 核酸的结构与功能 第一节 核算的化学组成及一级结构 核糖的分类及化学结构 戊糖的分类核苷酸是构成核酸的基本单位 核苷的定义 核苷酸DNA是如何形成的RNA是如何形成的核酸一级结构的定义第二节 DNA的空间结构与功能 反向平行右手螺旋的双链结构DNA双螺旋结构模型的要点 双链之间形成了互补碱基对 疏水作用力和氢键的作用DNA是如何折叠的DNA是遗传信息的物质基础第三节 RNA的结构功能RNA的分类 帽结构的形成mRNA是蛋白质合成的模板 多聚A尾结构的形成 为蛋白质生物合成提供模板 成熟过程是hnRNA的剪接过程 rR
13、NA的组成 三个重要的部位 以rRNA为组分的核糖体是蛋白质的合成场所 是如何合成多肽链的 真核与原核的不同snmRNA的种类及各自的功能核酸表达在真|原核细胞中如何变现了不同的时空特性第四节 核酸的理化性质紫外吸收260变性的定义、增色效应、解链温度复性的定义、减色效应第五节 核酸酶第二节 掌握:1.Watson 和Crick提出的DNA双螺旋结构模型要点核小体的结构第三节掌握:2. mRNA的结构特点及生物学功能,三联体密码的概念第四节大纲:1.DNA变性的概念 常用方法,变性后的改变及变性的实质2.Tm ,增色效应的概念及与Tm间的关系3.变性DNA复性的概念、本质及主要改变(减色效应)
14、名词解释:1.DNA的一级结构:在多核苷酸链中,脱氧核糖核苷酸从5-末端到3-末端的排列顺序,称为DNA的一级结构。由于脱氧核糖核苷酸的差异主要是碱基不同,因此也称为碱基顺序。2.复性:当变性条件缓慢地除去后,两条解离的互补链可重新配对,恢复原来的双螺旋结构,这一现象称为复性。热变性的DNA经缓慢冷却后可以复性,这一过程也称为退火。3.解链温度:DNA的变性从开始解链到完全解链,是在一个相当窄的温度内完成的,在解链过程中,紫外吸光度的变化A260达到最大变化值的50%时所对应的温度称为解链温度。4.DNA变性:双链DNA(dsDNA)在变性因素(如过酸,过碱,加热,尿素等)影响下,双链互补碱基
15、对之间的氢键发生断裂,解离成单链DNA(ssDNA)的过程称之为DNA变性。DNA变性后,二级结构改变,生物活性丧失,但一级结构没有改变,所以在一定条件下仍可恢复双螺旋结构。.增色效应:DNA加热变性时,双链发生解链,由于有更多的共轭双键得以暴露,DNA在260nm处的吸光度A260随之增加,并与解链程度有一定的比例关系,这种现象称为DNA的增色效应。6.减色效应:除去变性因素后,单链DNA依碱基对规律恢复双螺旋结构,A260值减小,称之为减色效应。7.hnRNA:hnRNA是真核生物在细胞核内合成的mRNA初级产物,比成熟mRNA分子大得多,且分子大小不一,故称为不均一核RNA。8.核酸杂交
16、:热变性后的DNA在进行复性的过程中,不同来源的变性核酸(单链DNA或RNA)只要有一定程度的碱基配对关系(不必全部碱基互补),就可形成杂化的双链结构。这种不完全互补的双链在复性时的结合称为核酸杂交。9.三联体密码:从mRNA分子5-末端的第一个AUG开始,每三个核苷酸为一组定义了一个密码子,又称三联体密码。每个密码子编码了一个氨基酸。AUG被称为其实密码子。决定肽链终止的密码子则称为终止密码子。问答题.试述tRNA的一、二级结构要点及其与当前已知的分子结构与功能的关系tRNA的一级结构:由核糖核苷酸通过磷酸二酯键连成的单链分子tRNA的二级结构:核苷酸链中存在着一些局部互补配对的区域,可以形
17、成局部双链,进而形成一种发夹结构,局部配对的双链构成茎状,中间不配对的部分膨出成环状,故其二级结构成三叶草形,左右两侧稀有碱基环称二氢尿嘧啶环和假尿嘧啶环,位于下方的称反密码环,此环中间的3个碱基即为反密码子,3-端为CCA-OH末端。 与分子功能的关系:tRNA功能是在细胞蛋白质合成过程中作为各种氨基酸的载体并将其转呈给tRNA,具体来说靠其3-末端CCA-OH与氨基酸结合成氨基酰-tRNA,反密码子与mRNA上的密码子形成碱基互补,蛋白质生物合成时靠反密码子辨认mRNA上密码子,然后携带密码子编码的氨基酸至核糖体,参与蛋白质合成。2 .简述DNA双螺旋结构模式的要点DNA是一反向平行的双链
18、结构,脱氧核糖和磷酸骨架位于双链的外侧,碱基位于内侧,两条链的碱基之间以氢键相连接。A始终与T配对,形成两个氢键(A=T),G始终与C配对,形成三个氢键(GT)。碱基平面与线性分子结构的长轴相垂直。一条链的走向是5 3,另一条链的走向就一定是3 5。DNA是一右手螺旋结构。螺旋每旋转一周包含10bp,每个碱基的旋转角度为36。碱基平面之间相距0.34nm,螺距为2nm。DNA双螺旋分子存在一个大沟和一个小沟。维持双螺旋稳定的主要力是碱基堆积力(纵向)和氢键(横向)。3 .简述核小体的结构和功能核小体由DNA和组蛋白共同构成。组蛋白分子共有5种,分别称为H1、H2A、H2B、H3和H4。各两分子
19、的H2A、H2B、H3和H4共同构成了核小体的核心,DNA双螺旋分子缠绕在这一核心上构成了核小体的核心颗粒。核心颗粒之间再由DNA(约60bp)和组蛋白H1构成的连接区连接起来形成核小体,是真核细胞染色质的基本结构单位。核小体可以进一步旋转折叠,形成纤维状结构及襻状结构,最后形成棒状的染色体,将近1m长的DNA分子容纳于直径只有数微米的细胞核中。4.简述真核生物mRNA的结构特点大多数真核生物mRNA在5端以7-甲基鸟嘌呤三磷酸核苷为分子的起始结构,同时第一个核苷酸的G也是甲基化的,这种m7GpppN结构被称为帽子结构。帽子结构在mRNA作为模板翻译成蛋白质的过程中具有促进核糖体与mRNA的结
20、合,加速翻译起始速度的作用,同时可以增强mRNA的稳定性。在真核生物mRNA的3端,大多数有一段长短不一的多聚核苷酸结构,通常称为多聚A尾。一般由数十个至一百多个腺苷酸连接而成。因为在基因内没有找到它相应的结构,因此认为它是在mRNA生成后才加进去的。随着mRNA存在时间的延续,这段聚A尾巴慢慢变短。因此,目前认为这种3末端结构可能与mRNA从核内向胞质的转位及mRNA的稳定性有关。5.RNA分类及其主要功能种类 细胞核和细胞液线粒体功能核糖体RNA信使RNA转运RNA不均一核RNA核内小RNA核仁小RNA胞质小RNArRNAmRNAtRNAhnRNAsnRNAsnoRNAscRNAmt rR
21、NAmtmRNAmt tRNA核糖体组成成分蛋白质合成的模板转运氨基酸成熟mRNA的前体参与hnRNA的剪接和转运rRNA的加工和修饰蛋白质内质网定位合成的信号识别体的组成成分一.名词解释1.酶的活性中心:酶的必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异地结合并将底物转化成产物,这一区域称为酶的活性中心。辅酶参与酶活性中心的组成。2同工酶(isoenzyme):同一个种属中催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构,理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。3.酶的转换数:酶在被底物饱和的条件下,每个酶分子每秒钟将底物转化为产物的分子数。意义 可用来比较每单位酶的催化能力4.酶
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